Ubiquitin Family in Synaphobranchus kaupii

Ubiquitin families were mainly identified through HMM searches of data from iUUCD.

• E1
  • ThiF
• E2
  • UBC
  • UEV
• DUB
  • UCH
  • USP
  • OTU
  • Josephin
  • JAMM
  • ULP
  • MINDY
• E3
  • E3 activity
    • HECT
    • DCUN1
    • N-domain
    • UBR-box
    • RBR
    • RING
      • RING
      • U-box
      • PHD
  • E3 adaptor
  • Cullin RING
    • Cullin
    • F-box
    • SKP1
    • BTB
    • CDC20
    • DDB1
    • DWD
    • SOCS
• UBD
  • Alpha-Helix
    • CUE
    • GAT
    • MIU
    • UBA
    • UBAN
    • UBM
    • UIM
    • VHS
  • UBC-like
    • UBC
    • UEV
  • ZnF
    • NZF
    • UBZ
    • ZnF_A20
    • ZnF_UBP
  • PH
    • GLUE
  • Other
    • SH3
    • Beta-prp
    • CARD
    • Jab_MPN
    • PFU
• ULD
  • UBL
    • ATG8
    • NEDD8
    • SUMO
  • UFD/UBQ
    • UBQ_Other
    • UBQ_PIM
  • UFD
    • DWNN
    • PB1
    • RAWUL
    • UBX