Gene detail

Detailed information of ctg958-1.2-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg958-1.2-1	EF-HAND CALCIUM-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 10	chr3	3943418	3954058	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg958-1.2-1

GTAAAGATGGCGACCGAGAGTAAGGAACTGGGACCGCGAGAAACTGAAGCTCACGAATATATGGAAAAACATCGAATATTAGAACTTTTCAATAATCTGACTACACAACTTATATATAACCGACCAGATGATCCAAAGAAGTTTACGATTGAGGTCTTGGAGAGACTGATGAATGCCCGAACTGCTCACCGCGAATATCCATGTGTTTTTGACGACTCCAATATCACCTCTCTGTTTGGTATGCTTGACCCTACGCAAACGGGCTATGTGTCCTACCAACAATATGCAGAAGCTATGACCACACTGGGTGTTAAAAACTATGATGAGGAGCCCGATGGCAAAGACATTGACAGGATTCAGTATGATGTATTTATGGCAGAGGCAAGGAAAGGACTTATCCAGGCCTCAGCAACATTTGCGGTACCGAGCCAGTAACAAGTGTTTTTGTGCCACTGACACATCACCCATTGTACATAATTGTATATTGTATTAAAAATTTGGTAGTCCTATTTATTCTGTTATTAAAAAGACTGGAGATAGAATACTCTTTTCATTGGTGTTTTTCACTTTATGACACTGCAATAGAAGTAAATTGGACACAATAACAAAATGTTGCACTGGACACCAGGCCCAAGTTGGGGGATTCGACTAGGAGTTTGTGAAACCCCTGAGATTTGTATGGGGATCCAGGAGCATGCCCCCACCCCCGTAACATTTGAAATCTCTAAGCCTAAAGTGCGTTTTCCTGACATCTGGAACCTAAAAATTGATATCTTAAAACAATGATTTTCAACTATTTTGTAAATTGTATTTTTGTTATTAGTTATTTATTTTTGTTTGTGTTTAAGATAATTGAAATTTTAGCACACAACAGGAGTTAAGGGTATTGACCCGAGGTATATGTTCGGCAATTTATTTTTATAGGCTAAGTAACAGGAAAGGTACGTGTACCTCAGAACTATGATCAGTTCCCTATAATAATGAACATATATATTTATGAAAAACAAAGCATATTACATTCTTACAAAATATATCGTCACGAATCATTGCCAACGCATGCAGCCTCTGTTAAAGGGACATTCCTGAGTTTGCTGCAGTTTTAAGATGTTATTGACTAACAGAGACTTGGTATGTATTTATTTATGTATCATACTAAAATGTTTGATACTTTAATATTAAACTATTAATACTAACTTACGTAGGTATAGACATACATGCATACACCATACGTACATAAATAGTTTCAGGCCCGTACGCAGGATTTTTAATGGGTGGGTGCGAATTGCTCGTGATGGGACCAATCAACATAAAAATAACACCTCAAAACAACGATTACGTAACGTTATTTAAATTTAATAAAGAAAAGTGGACCTTTAGTAATTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGCGTACACACCCGTCGCGGTTCTAATGTAATGTGTAGCCAGCATCAAGAAGCTGAAACCAACAACATTTAACAAGAAGCTGAAATTAACAAGAGCGATCACATGGCTGATGAAAATTAAATGAATGAATGAATGTTTAACGACACCCCAGCACGAAAAATACATCGGCTATTGGGTGTCAAACTATGGTAATGCAAACAAATCAAGATTTAAACAAAAACACAGTGTAAAGAACTGCAAAAATACAAATATCACAGATGGATACTGACTTTTACTCAAAACTTCAATTTTGTGCTGTATGGGCCATTCTCAAAGAGAATGTTATACCCCTGCACCACGGTGAGGTTACAGCACGCGCAGGGGATGAAAATTAATAAAAAAAATTAATGAAAATCACAAAATTGGTGGGTGTGTGGAATTGAGGGGTTAGTTTCGAAAAACAAAAACCACACAAGGAAAAAAAGTACTAGCAGTCAAATTCTTATTTGGAGAAAAAAAGGAAATAAAAGAAAAATTACCCCGTCAAAAACATTAATGTATCTCTATATTTCTATATTTTTAAAATAATTTTTTAAAGATTTTAATGATAGTGAAATGTTCCAAAAATCATTTTATTTCTGTTTTGGAGAGGTTTAGGGTTAGCAGGAGATGTAGTCACTGCCTAAAGAGACACCTTTGTCACTAGACGAGGTTTACATGTTTGTTTTGAATTTGCGTCTTGTTAATTTTGTTTTAATAACTGACATTTAATAATTTAATTTCCTACATCTCTCATTTCATAGTTTAATGTTAAACACATCCTACTATTTAAATGCTATACTTGATTTTTGCTCACTGGTGGCATGCTTCATTCAACAAGTCGGTAGTACAGTATTGGTAGATTCACTGTAATTATTGGTATTCGTGAATATTTATTCGTATTCGAGATCCTATATTCGTGATACATATCGTATTCGACACTTGGTGTATTCGTTGCAGCTCTAATACATACATGTATACACACAGAGTCGTTTTTAGATGAACGTCTTTGAATTTGTCCCGTTTTAAGTTTTGGCACAGAGCCTACCAGCCTGTAGAGCGATGGCCTACCACGACGCCACCGAGGCCGGTCACCAACGGATATGTAAGAATATTCGAGAAACTACTGTTCTTTGCACTGATCGCATATATTTGTTTTAATTCTTGTTTATAGTATTTGAAATCGACATACTGATTAGTGTAGATGAACCCCATTCCCGTGTTATTGAAAATACGTGTTATGAATTTTTGGCCACCCGCTTGACGTCACTACTAAAACTTGTGAAACTCGAGACATGCTTTATATTTCCGACTGAATGCACGAGGCAAGCTCCATGCAGGACCAAACTTATGATTCAACGAAACCGTATTATTCATCTCATTTAGAGTGATTTTCCCCATCCGACCTAAAAACTCCAGATAATCAATACTTAAAAATAATAATCGAATATTTCGAATACCAAATTAGCGAGCAAATATTCGAATATTGGAACCGAACACTACCCAAAATGTTACCAATTTTGATATTGACCCACATACAGACAAAGACACATGCACACACAAATTCGTACATACATACATGTATACATACATACATAGTTGTTTTTACATGAACGTCTTTGAATTGGTCCCGATCTAAGGTGTTGGCACAGAGCCAAACCTTTGAAATTGACATGCGACGTAATTCGGGATCTTAGCAACGAAATGTGAGAAACTAAGCACGATTCTTAAGAGTTATGTATCATACTAAAACGTTTGATACTTGAGTAATTCTATTAATACTAACTTACGTATGGTGACTACATTCGTATGTTACTTTGGGATTCAGTATACTTCAGTTAGTAAGATTTATGTATGAAGCCTGTTTGTGTTAAATTCCAAATTGTGGGTCATTTACTAAGTACTACAGTGAACTTTAAGATGCAAGTGATATAATCCGCAATTCTCATGAAACTGGTGCTATTTACTGGTTTACAGTCACATTGTTCTCTCAAGTGTCTTTGGTATATTTAGAATAACTTCTACCTTCTTACGTATCTTCATATCAAGCGCGAATACATACACAATATATTTTGTATAATTGATTCAGTGATTGTGTAATTTAAATATCAAAGTCCTTCTACATATAAAAATGACAATAAACCACACGTCGCCAACACGATCACAAAACTTCAATCATTTATTTAGTACAAAAAAATCCATTTGAAAAAACAATCACGATAGTTAGGTAAATCATGGCAAGTTTTCTTATTGTACCTGTCACGGTACATGCTCTTAATTTGTTTCGCCTGTGGCGATTTTAATTGTGTTAGGGTGCCGTGTGCAGTTTATTGCCCGTAGCCCAGGTGGACAACTTGTTACGTAATACCTTGAGCGATCTGGCTTTCCAATATGCACTTAGCCCCGCTGTGGAGGCCATGTGGCGAGTAGTTACGTAATACCCCTGCGAGTGCGGTTTCGACGACCGTGATTTTGGCGACGATGGCGTCAGTAGTCTGACGATCAGAGAGAAATAATATCTACGCTAGGAGAGATGAAATATGAGATGATACGTGAGGTGCCGCCTTGTTCCCCCAGGCCAATTCTGATTTTGGAATAAATAGCTAGGATTTAGAGATATCGAGAAGAACGAATTTAGGACGGCTCCTGGGAACGTTAGTCCGTTTGGACTTTGGTAAATATCATTTCTGCTCTGTGTATAACCTTGATGTGATTGATGTGACTTTAAATATTTTAATACTGTATTATACCGATATTCTTTAGACAGTGTCTTCGGTCATCTGACGAAGTAAATCGTAGACTTATTGTTCTAACATTATATGAGTATTTGGTAATATAAAGCTTAGCCAGTCATCCCAGCCGACCTGGGTAAACTGTAGGTTATTGTCTTTATTGTGATAAGTATTAATTCTGTGTTACAAGATTACTGAAAGAGTAGTTAGGGTTAATTAAAAATTAACCCGTTAGGAATAGAGCTGTAATTCCTTTATTAATTAAGTTCCCCAAGAAGCGTTCTAAATTATCACACGTTACTGAACGAGTAGTAAGGGTTAATTATAAATTAACCAGTTAGGAATGGTGTTGTAATTCCTTTATTAATTAACTTCTCCTGTAAGCGTTTCTCAATTATCACACGTGTGGGTGTGGTGTACGGTGAAGTGATTCGCATATTGTGTAACTAGACACCTAGAGATTAACTAATTAAGTGATCAGTTCTGGGTTGTTATTATTGCTGTTATTAATTTACTACTACGGCTGTACATTTGTCAGCGTAGATTAATACAGATTCCAA

Transcript

ctg958-1.2-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF17819	Tex55	Testis-specific expressed protein 55	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002048	Domain	EF-hand domain	Interproscan
IPR039879	Family	EF-hand calcium-binding domain-containing protein 10	Interproscan
IPR040760	Family	Testis-specific expressed protein 55	Interproscan
IPR049760	Domain	EF-hand calcium-binding domain-containing protein 10, dimerization/docking domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR21847	EF-HAND CALCIUM-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 10	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005509	Molecular Function	calcium ion binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg958-1.2-1 global RNA-seq network