Gene detail

Detailed information of ctg9-8.16-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg9-8.16-1	MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE	chr6	76990646	77017862	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg9-8.16-1

ATGCCGCCGTTACCGTCCGCGGATCGGCGCGTTTTAGTGGAGAGTATGATTGCCGAGTTTCTCGACAAAGGGGCCATCCAGAGAGTCAGTCTGGACACTCCGGGATTTTATTCTCATCTTTTCTTCGCCCGGAAGAAAAATGGGGAATGGAGACCAATCCTAAATTTGAAGCCACTGAACGTCTACGTCGATGTTCCTTCCATGAAAATGGAAACGGTTCATTCGGTCCGGAACCTGCTTCAAATTGGGGAGTGGGCTGTGTCGATCGATCTGAAAGACGCATACCTCCATGTCCCGGTGCACAAGGCGTTTTGGAAGTTTCTGCGCTTCCTGTTCGACGGGAAAGCGTACGAGTTTCGTGTGCTCCCGTTCGGTTTGGCGACGAGTCCCCATGCTTTTACACGTGTGGTAAAAGCGGTGGTAGGTCATGTTCATTTGTTAGGGGTTCGAATGCATACCTATCTGGACGATTGGTTGATCCCAGCTTCGTCGCAACAGGAGTGTCAGACCAATGTCGGGTTGGTTTTGGACACGATCCTCCAATTGGGTTTTATTCCCAATTGGGTGAAATCGGAGTTAACGCCGGCTCAGATTTTCACATATCTCGGAGTGGTCTTCGATCTTGTGGTAGCGTCGGTTCGTCCCACCGATGCGCGTATCCACAATTTCCAAACGTCGGCGCGACGTTTGATGGGGGAGCAAAGTACTACGGTACGATCTCTCCACGTGGTGTTGGGCCACCTCGAATCTCTGGCCTCATTGATCGTGCGGTTCAGACGATTCAAACGACCACTCCAGTGGCATTTGTCCCCACGGTGGGACGGTCACAATTGGGACACGATAGTGCCTCTGGGCCCATGGTTCACTCATCCGATACAGGAGTGCCTGTCGGACAAGTGCATGTCCCTATCGGTTCCGTTGCACCCCCCTGCTCCGGATCTGATCCTGTTCACGGATGCGTCGCTGCACGGGTACGGGGCGCATCTGTTGGATCAACACATTTCAGGGGTATGGAATCTCTCCGAGAGGAAGCTTCATATCAACTGTTTGGAGATGGAGGCAGTGCATCGTGCCTGTCTTCATTTCCGGTGTGTTCTTCGACACCGTCGAATTCTGTTGAGATGCGACAATACGTCGGTAGTGGCATATCTCAATCGTTGGGGTGGAACCAAATCGGAGACTTTGGGTCGCAAAGCTCTTGCGATTTTGGAATTCTGCGACCAACTAGGGACCACTCTGTGGGCGAAACACATTCCTTCATCGGTGAATGTGTTAGCAGATGCCCTCAGTCGACATACCCCTGTTCAGACGGAGTGGATGTTGAACAAAGGGGTGGTCGCAGCGGTTCTTCGGGTGTGGGGCAGTCCACAGGTGGACATGTTTGCCACACGGTTGAACAACCAATTGCCGGTGTTCGTGTCCCCGGTACCGGACACATTGGCGTTGGAGTACGACGCGTTAAGTATGGATTGGACGGGACTGGATTTTTATGCCTTCCCTCCTCCTGTCTTACTCGGCAAGGTGTTGACCAAAGTGGTCCAGGAACCTTGTCACGTGACGTTGATAGCTCCTCTGTGGGTGGCGCAGCCCTGGTTTCCACAGCTCCTGTCACTGTTAGTGGCAGTCCCGTTCCGATTACCAGTGTTGTCCGATCTACTCAGCCAGCGACTGAGTCAGACGGTGTGGCATCCGAAGCCGGAGGTCTTCCGGTTTCACGCGTGGAGGTTATCAGGGCTTCCTTGCGACGCAGAGGTTTTTCGACAAGAATTGCGCATCTCGTCTCTTCAGCAAAGCGCAAATCTACCGAGTCGGTTTATCAGTGTCACTGGCAATGTTTGGAAGATAAATCGTCTGAATGGATGTTTGTTGTTAACAATGATGTTATATTTTTCAGAAACTGACCTGCATAATGTAATCAAGCGAGGGAACATTCTGAAGGATGTACACAAGAGATACATAATGTACCAACTGTTTAAAGCGACAAAATACCTTCATTCTGGGAATGTCATTCACAGAGATCAAAAGCCCTCTAACATCCTGTTGGACAGTGAATGCGTGGTGAAGCTGTGTGATTTCGGCCTCGCTCGATCCCTCACACAAATTGGCATGGACGAGACGGGTGACCCGAATCTGACAGAATATGTTGCTACCCGGTGGTACAGAGCCCCAGAGATTCTCCTGGCTTCACACAAGTACACTAAGGGTGTGGACATGTGGAGTTTAGGCTGTATTCTGGGTGAGATGTTGCTAGGGAAGCCAGTGTTTCCCGGCACGTCGACACTGAATCAGATCGAGAGAATCATGTCCTCTATAGCTACACCATCACGAGCAGACATTGATAGTATAGGTTCAGCGTATGGAACTTCTGTTTTAGAGAAAGCTTGCATGAAAGGCAGGAAAAAGTTTGAAGACCTCATTCCTGATGCACCAGCCGATGGTCTCGACTTGATGAAACGATTACTTCACTTCAACCCGGATAAACGTGTTACTGCTGAAGAAGCTCTCAAACACCCCTACGTCGAGAGATTTCATAACCCATCAGAAGAGCACACACTGGACTACGACGTCGTTCCTCCCATCAGTGACGAGACACAGCTCACGGTAGATGAATACAGGAGCAAGCTATATGAGATGATAATGCAGAAGAAAGCCGAGCGGCGGCGGAGACGAAGGGAAGAGGCTCAGAAGGCTCAGAAAGCTGTCCAGCTAGCTCAGATAGCTCAGCGGACCCAGGATGAAATACCACCGGCAGAACCGGAGGTGGGCATGGAGGAGAACTCACCCAAGGGAGTGTCACCCAAGTCCATGGCGAAACACGTATCTGCCGAGAACTACAGACACCAGTCCTCATTCACAGGTGTAGCATTTGGTAGAACGACACACGATGGTCATCACAAGGGCTCCAAGACCGTATTAACACGGCAGAGAAGTTACGAACATTTACAAGGTCCTTCCAACAATATGGGGCATGAGCCATACCCACCCATCGGTATGAGTCAGAAAAACCGCCAAACGTCGGCACCTCCCGCTGCAGGCTTGAGAGGCCGACCCATTTCAGGAACGTACGCTCGGCAGGGAAACCCAATGATAACGCGAGATGACAGATCAGGTCTGACAGTGACCAGCTCAAGAATGGTACCCGGTCAAAGGCCAACATCTGCGAACGTCCCTCGACCGAAACCATTGTACGGCAGGAAACAGTTCAGCAACGCTGTAAACCACCCGTCGGTGGGTGCCCACAAGGCGACATTTGGCAGCTACACGCAGTCGTACGGAACAATCTCATCAAGCGGGCTCGCTGCTCTTCAGACGAAGAAGACATGAATCACACCCTGAGAGAAAGAGACAGAGTTGACTGGTGTCAGGCTGCTGGTGTAATATCAACACAACTTGTTTATAGTCATCACACACTCACACACAAACTGGCTGCTCCATCTTGTCAATCCGTCCGTCCATTCGTTCATCCATTCATCCATCCATCCGTTCATCCATCGTTGTTGATCTGACTTGAGCAGGCGTCTAGATGGATGGCTGATCGTATTGTGTGATGTCAGAAGTGTTGACCCATATGTTGATATGGTTGTTTGCTGGCAAACAATATTCTAGGCACAGTTAAAGGACGGGAGTGTTTTAGCGTCAGTGTTATGTGGGTGCCTCCCCCCCCCCACACTGTAATGCTACATCGTTTGTCTACTGAAAGTAGATTTAATAATGTTTTAATACTGTAGGTACTTTTCAAAAGTACAAGTGAATTGTTATTAGTTTATTGCCAAAATAAGTCATTACTGATACACGTATATGCAAACAGGATGAAGAAAACTGCACCAGAGTAATTTTATGAAGACTTTCTTAATATGAATAATATTGTTGACTTACATAAGGTTTGTGAATGCATTTCCTTAAATATTTCTTACACTGCCTTTGACATTGCAAATATATATAAATCCAATATCCACAATGAATTTGGAAAGCGAATGTGAACACATTTTATTACAGTTTCTTTAATATTTCAGTAAGGGCTGTTCTAAAAATAATCACATTTGAATAGTTGGGAGGCAGTATATTCACCCAAGCAAATTATTTACAATCATTTGAATTTATAAAAAAAATAAAAATTCCAGAACTTCCAACACAATAATATTAGTACATACTGTGGCCCTGTGTACCAATGTCCTAATCAGAATTGTATTGCTTATTAGTCCCCTATCGGTCCAACTGGAGGGGACTATAGGTTTCATCGCCGTCCTTATGTCTGTCCATCCGTCTCTCCCACATATAGTTTTTCGGATGGTTTTTTCATAATGCTTCGAGATATTGAGCTGGAATTTTGTGTATAGCTTTATCATATACTATAATTACAGATCAAGTTGACTTTCATGACGATTTACCCATTTTGACAGAGTTATGGCCCATGAACTTAGGAGATATGAAAATTGTTTTCCTGACTTTTTTTCCCCAAATGCCTCAAGATACTAAGCTGAAATTGTGTGTATAGCTTTATCATGTACTATTACAGATCAAGTTTCAATTTCATGATGATTTACCCATTGTGGACAGTTATGGCCCGTGAATTAGGGAAATATGAAAATATGTTTTCCTAAGTATTATTTTTACAATGCCTCCACAAATTGAGATGAAATTTTTTTTTTATAGCTTTATCATATTCTGTTACAGAAGTTTAACTATCATGTCGAATTACCCATTTTTCACCGAGTTATGGCCCTTGAACATAGGAAATACAAAAATATGTTGGGCCCAATAGGGGACATGTATTGCTTTAACAATACTCTCAGAATGCTTGTTATGTACAATACATGAACATTTCTGGAATGAAAATCTGAACAATATACCATTCTGATGGTATATTACTAAATGTACGCAACAGACATAATAAATTACCACTTATTATATCTGTTGTTTAATCGTACTAATAGGTCATCATAATGAAGTTCAGTGTTCAGGCATTTGGAATTAGATGGGCATGATTTGATTAGGACTTC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Transcript

ctg9-8.16-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00069	Pkinase	Protein kinase domain	Domain	Interproscan
PF00078	RVT_1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000477	Domain	Reverse transcriptase domain	Interproscan
IPR000719	Domain	Protein kinase domain	Interproscan
IPR011009	Homologous_superfamily	Protein kinase-like domain superfamily	Interproscan
IPR036397	Homologous_superfamily	Ribonuclease H superfamily	Interproscan
IPR043128	Homologous_superfamily	Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain	Interproscan
IPR043502	Homologous_superfamily	DNA/RNA polymerase superfamily	Interproscan
IPR050117	Family	Mitogen-activated protein kinase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24055	MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0004672	Molecular Function	protein kinase activity	Interproscan
GO:0004674	Molecular Function	protein serine/threonine kinase activity	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0006468	Biological Process	protein phosphorylation	Interproscan
GO:0035556	Biological Process	intracellular signal transduction	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg9-8.16-1 global RNA-seq network