Gene detail

Detailed information of ctg850-1.10-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg850-1.10-1	E3 UFM1-PROTEIN LIGASE 1	chr4	73168013	73204176	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg850-1.10-1

ATGCGTGCCAAAGCAACATCAAAAGATACCATCAACAAATACTTTGATAGCCTGGAAAAGATTTTAGACAAGTATGATTTACGAAACAGTCAAGAGTCCATCTACAACATTGATGAAAAAGGCATTGTAGAAAATCACAAATCCCCATCTATTGCATCATGTTCCAATGTCCCAGTTGCTGTAACAACGAGCAGGTCCAACACTACTATGGTTATTGGGTGTGGAAATGCCCTTGGTGTTGCGATACCACCATATTTTGTTTTCAAGGGAAAGTGCATGCGGGAGGAATTGTTAGCAGGTTGTACGGCAGGCACTGCAGGAACCGTTAGTAAAACGGGTTGGTCGAATTCTGATATTTTTCTAAAGTATCTTAAAGAAATTTTTTCAAAGTATTTTCCAGCAGCATCTTCTGACAAGCCTGTCTTAATTCTTTATGATGGTCACATGTCACACATAAATGTTTCCCTGATCCAGTGGGCACGAGAGAGGCACATAATATTATTTGTATTACCTGCTCACACATCGCATGTTCTTCAACCAATGGATGTGGGATGTTTCGGCCCGTTCGAACGCATTTACAATGGCATGAGACATACCTACATACGCGACCATGCAACATCGGGTATTGACAGACATTCCCTTTGTGAGACTGTCTGCAAAGCTTACTGTGCAGCACTCACACCCGCCAACCTGCAGTCATCGTTCAGAAAGACCGGGATTTATCCATTTGATAGAGACCTCATACAGCCTTCAACATTCCTGCCTTCAGCTCTTTTAAGCAACAACATGGAGTCAGAAAATGAATCAGAAACCAGGGCAACTGTCAACTGTGAAGACAATTCAACAAAATGCAAGACGTTTTTCACAACTGCAGAAGAAGTGATCACAAGAAAACCAAAACCTACTAAGAAGAGGAAAGTACTCAGTGCTGTGGTCAGTGGTAAAGCCATCACGGAAGATTTGGTTTTGGAAGATATCAGGGAACATCAAAAGAACAAACAAAACAAGGAAGGATTGCAGAAAAGAAAATGTACAAAATCAAAGAAAACTGAAGATTCACCAAAACCAAGTACGTCAGGAATTTTTCTCCCACCCAGTGCTAACACAAAACAGCAGCTTGAAGACGAAGATGATTCATCGGAGGAATCTGACGACCCTAGCGATCTTTGCTGCAAGTGCAAGAAGAGCCAACCAGATGAATACAAACACTGTGTTTCACTTTGCTTCGTTTCATTATCTGAAAGGAACATTATTGAGTTGGTGACCAAACTTGTTGAACTGCGACTGATCAATGTGATTTATACCACTGATGGAAAGGAATATCTTACTCATCAAGAACTTGCAAAGGAAATCAAAGATGAACTTGTTGCTCATGGAGGGCGCATCAATCTTGTTGACTTGCAACCAATTATCAATGTTGATTTCACCCATATCCAGAACAAGGTTGGCGAAATTGTTGGTCAGGACTCAGATTTGTGTCTAGTACTAGGCCAGCTCATTAACAGGTCCTATCAAGACTGTCTTGCGGAAGAGATAAATGACAGACTACAAGAAAAAGGTCATGTCACCATTGCAGAACTCACAAAACTGCATGACTTACCAGCAGATTTCCTTTCAGAGGTAATTAATAACCGACTTGGAACAGTCATCAAGGGTCAGATCGACAGTTTTGACAGGGATGTGGTATTCACAGAAGCTTTTGTAGCTCGAATGAGAGCTGTCATACGAGGATCATTTAGTGCCGTTACAAGGCCAACACCAGTTCAAGGTATAATGCATCAACATGGATGTCAGGAGAGGCTATTTTTTTCTATTTTGGAGGAACTTATTCAGAGTGGAAGACTTGCAGGCAGCATTTCTGGTGGTCGTCAAGAAAAAGCAGCATACTTGCCTGAAATTTACACAAAATCCCAGAATGAATGGGTGGATGCATTCTACAAACAAAATGGCTATTTAGAATATGATTCATTGTCTCGTCTTGGAATTCCTGACTGTAAGAACTATATCAAGAAGCGTTTCAAAGATGAACAGCTGGTTTATCTCAGCACCTGCTGTTGTGGCAAGGCAATACAGGATCAGATTGAATCCAGTGTCGATGAGGCTTTATCCTCTGGGACATGGGTCGACATTATGAGCGTTTTGCCATCAATATTTAGTCTCAAGGATGCTAACCAGCTTTTGACAACATATTTAAAAACTCGCCAAGGAGCACTTCTTTGCTGTGATTCCATTGTAGCGAGTGAGTCATTAATTCAAGATTGCAGTAAACCATTTGTTCCTCTTATGACATCAAGAGCTGAAAAAGATGTCAAGTCTAACCCAGTGTTCATAGACTCTGGAAAGAAAGGCTCTGGTGCCAAGGTAGCTGGTCTCGATGATGGTAGTTCAGCACGAGAAGACAAGAAAGATCAACGCAGAAAGAAGGCTGCAACTAGCACCAAAAGTGGTGGTGGAACACAGGGCAGAGAAATCAAAACAAAATCAACAAAGAAGAAAGGCCGCAATAAAGACGTGGATGATGACTCGGATGATGAGCATACATCAGTCTCACAGAGTAAACAGCATGATGTGTCCTTCATGAATATTAATGAGATCGAGGATGTTCTGAGACACCAGGACCAGCTTGCAGAATGTCCTGAGGAACTGGTTAATGAGATAGCAACACGGTTGTGTAGACCACTTTCAAAGCAATACCAGGAAATTGCTAAGTCCATTTTTCTCCAGTCTGCTGGAGCTGCTTCTGGCTCAGACCGAAAGAAAACTCATGGAGATCTTCAAGAAAAACTAAATGGACTCTGGTCAAATGTTAAACTCTTTGAAAAGGGGTTAAAATTATTTCCAGAAGATGCTCATTCTCAGTTTGTTCGACACATACTGAAAACATTGTGCACAGATATTTCAAACATGGTTGTCAATTTCATTGCTACAGATAACATGCTGTCTGTATCAGATGAATTACAAATTACACCAGAGGCCAGATTGAAAATTATAAGTAAACTCCCCACCGAGATTCAAGGTCCTTTGACAAAGCTACATTCATCTCTGAATAGCAAGACCTTGGAAGAGTTCTTTTCTAGTCTGGAATATCTTTGTGGCCCTGAGAATCTTGGTATTTTGTTCAAGAAGTTGGACAAGAAAAGAGAAAGACAAATTGTATTTGCCCATCGACAAACACTGGCTGAGCAACTGAGACAAGAGACTGACCCAGCAATGACACTTCACTTGGCGTCAGTAATACTCTTCCAGACGTTTACAAATAACATGATTCACGTCCCAGGTCGTCTTGTGCCGCAAGTTATCCAGTTTCTGTCGGAATACTTAGAGAAAGATGTCCATGAAAAGCTTGTCAATTTACAAGAGCTGGTTGTGAAGCATGCAAAACTAGTCAATGATTCCACTGCAGAGAAACCTATGACAGAGGAAATTTCAGATGTCGAGGCACAGATGAAAGAATTACTGCCTGGTGTCAAGGAAATTGCACTGACTGCTAAGAAAAACAATATGGTACAAGAAGAAACAAAGGACGAGGCTTGATATAGATACTACAAATGTGACGATGTCTCAATCAAGTTTGAAATAACAGGAAAACCACACATTGGCATATTCGGAGTACTCTCATAATTATTTTATTAAAGTGTGCCATCGTGCAACTTGTAGTAATACTTTTATAAAATAACCTTATGTTTGACATCCAATAGCAGATGATTAATAAATCAATGTGCTCTAGTGGTGTCGTTAAACAAATCAAACTATTTATAATACTTTTATATCATATCATCGAATTAGAAATTGCTAAAATATATCTGGTTCCCTTTGGCTGTTCATAGGAAATTTATGGAATACATTATTACTGAAAGTTGTACTGTTACTACTAAGTGGCAGCATCAGCCATTCAGTATATAAATGGGGAAGAAAAAGTGTTTCAGTTGAGGCAGTTGTACTTCATACACAGTATACATTGCCATATGTATAAGCAGAAAGGGACCCGATAAAACATTAATTTAGTATTAACATAACACTGTTTAACAAGACATGCTGAAATGAGGATAGGTTTGCTTTGAAAAAATAAATCCGATTTATTTTAACAGCAGAACAAATGTCAATGACTCTGAAGGAAAACTTTAATAAACAGGTTGAGGTGTTTTTTTCTTGTGATATATGAAATGTGAGCTTTCTGTAAGAATAAAGGTTTTTGGTAACACGATTAGTCGGCTGAACGATAAATATTAATTTAAAAGTGATGTTGTGCTCATTATATATGTAAATATTGTACCATAATAAAAGTTTGATCGACACAGGTATAACTGAGGATTTAATTCAGATGAGATTTAAAAAAAAAATGAAATGTGTGACGGTCACGTCTTTACATCTGAAAATTGTCATTAACGTGTCTGAGCACATTGGGCATTGCATGTTGACTGGTACAACATTAGCTCATGCTTCTCATGAGACAGTGGATCTCTGGAATAGTGAATAGTGATCGAGATCCATTCACGAGTTAAAGCACGTTTAAGGTTGTGGACGTTCCCTTGCACCCTACAACCAAACAAATCCCATACCTGCACAATAGGGAACAAGTGAGGCAATCTTGCAAGCCAGTTTAGTGCCTCAATATTGTTCCTCTGAAGAAGTCCAGTCGTTAGTCTGGCTGAATACAGGCGTGCATTGTCCTGTTGAAACAAAATGCATGGATGCTGATTTCATCACTAATGCTGAGCATTCAGATTCCCATGAGGTTGTTTGTCCGATGTCATGAATTCCTGCCAACACCATGATGTTACCACCACCACATCGGTCATGTTAGTGCACGAAGCGACGTTGTACCACAGTCAGTGCACAATGTGCTCAGACAATTTAAAATATTTTTTAGCATGCACTCCCAAACACCATTTAACGAAGTGACCGTCACACATTTCATTTTGTATTGAAAATCTGTTACTTATACTGACAAATGATGCCTTAATTAAATCCAGTGTCCGATTTTATTTTGAAAGTCGTGA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Transcript

ctg850-1.10-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03184	DDE_1	DDE superfamily endonuclease	Family	Interproscan
PF09743	E3_UFM1_ligase	E3 UFM1-protein ligase 1	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR004875	Domain	DDE superfamily endonuclease domain	Interproscan
IPR018611	Family	E3 UFM1-protein ligase 1	Interproscan
IPR036397	Homologous_superfamily	Ribonuclease H superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR31057	E3 UFM1-PROTEIN LIGASE 1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0005789	Cellular Component	endoplasmic reticulum membrane	Interproscan
GO:0032434	Biological Process	regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process	Interproscan
GO:0034976	Biological Process	response to endoplasmic reticulum stress	Interproscan
GO:0061666	Molecular Function	UFM1 ligase activity	Interproscan
GO:0071568	Molecular Function	UFM1 transferase activity	Interproscan
GO:0071569	Biological Process	protein ufmylation	Interproscan
GO:1990592	Biological Process	protein K69-linked ufmylation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg850-1.10-1 global RNA-seq network