Gene detail

Detailed information of ctg75-9.15-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg75-9.15-1	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 4E RELATED	chr3	74230268	74253268	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg75-9.15-1

GATGCAGTCAGGTGGTTAAAAAATGGCTGCCTTCAATGTTGACACTGAGAGTGAGGCGGCAGAAAGTGGTAATTTATCCAGTCCCGAACTGGTACGGCGCGCGATCAGTGAAATAGACACATCAGAAGACACCGGTGTGCCTTTACAGACGCCATGGACATTCTGGCTTGACAAGACATCCCGAGGAACCTCCGCCGCACAGTACGAGGCAACGCTGAGGAAGTTGTACACAGTAAACACAGTTCAGAGTTTTTGGAGTGTTTACAACAACATCCCTGACCCGAGCAGAATGTGCACTCGATACAGTTACCACTTGATGAGACACGAACACAGACCTGTCTGGGAAGATGAATCCAACTGTCGTGGCGGATACTGGAGATTCAAAGTTCATAAACAGGATACGCCCACTGTTTGGAAAGAGCTGCTCCTCGCTGCTATAGGAGAACAGATGTCGGACTGCATGGCAGATGGAGATGAGGTTGGTGGAATCAGCGTCAGTATCAGAGACCGTGACGACATTGTTCAGATATGGAACATTGCGTCAGACTTATCAGAACAATCTACCATTATTTCCAAGGTCAAAGAGCTACTACCCAATGTAACCTTTCCAGCATTATTTTATAAAGCATTTCAAACACACGAAGCCTTTGAAGCGGACAAAGTACCCTTCACGAGGAGGTGACATTAGGCAACAGTCGTTAGGAACCTCTTCAAGAAACAGTTGCTTGGAATACAGTATTTATTTGACCAACTAGTTACACTACTGCCAGATATCTTTGTATGATTTGTATGTTTGAAATTTTATAACTTGTAAAGCTTTTAAGTTGAAAGGGATATGGAAATAAGAAGAAATATGTTGAATAATGAGACAGGGAAAAATGGCTAAAACTCTTGGAAGTCTTCATGTGAATTATTGAAATTGAATTAATAAGACGACAATGTATATAGCTGGTCAAACTAGCATATGTGATGGAGATGGGGGTGGGGAGGGTACTGACACTCCTAAATGAAGCTGAGGTGGGCTGATTATATGTTGCCCCCTGTCTTAGTTTAAAGGTAAATCTAACTGTCTCATCCTCAGTTGCTGGCAGCTTCCAATGTCTATGACTTGCTCTAAAGGGGAACCAGTGTTATACTGTCTTAACCCTTCTCAGTGTTTCTGCAAGAAAGAATATTTTGGGTATGGCACTATGAAATTGAATATTTACAATGTGTGTTGAATGTGTTAGGGGGCCTCACCAAGAAAAAAAATGGGTTAGGTTTGGGGTTAGGGTTAAGAAAATCATCCAGTAATGATAAGAGTCCTTCATTTTGTCAAAAGGTCAACTTAAAAAAATAAAATCTGCAAAAACATTTGGGTATGGTGCCGTACCCATTTTACCCTCTGACCGAAAGCCTGCAGTTCTCCATTTGCCTTCCTCAGCCATGAATAAACAGGTTAACCTAGACCAAATTGTCTGTTCTCGATGAATGTGCTTTAAGAGTGATAAAAGCACATTAAAATCACTTTCTGACCCTGATTCTAATCCAACCGCCATAAACGACATTATGTGTCTTTGTTTCCTATGCCAAAAACATTTATGCATTGTTGTGCATGTGTCAAGTTCATCTCATGAATGCAATATTTTGGGTGGTCTCGAAGGATTGGGCATGTGTTTTATAAAACTTTTAGAATCTAGACTGAAATCTTTAACCCACATGCAATTTGTCTGGGTTGCCATGACGTTAAAGTCTCAGGACATTATTAGAGATGTGAGTCTAGACTTTAAAAGTTTTGTTAAGTATGGGGACGACTATATTTACGTCTAATATTTCAGGTTTGTTCATTTGGCAGTTTTGTTCTTTTAGTATCAGGGCTAGCTCTGCATCAACAGAAAATATTCACCAAATTATCTATTGAACTTAAAAACCTGCAGAATCCCAGTTATTTTGTACAGAATATCAATTAATACTTATAGGATATTAAACGAACTTCCATTTCGTATCATGTTTTTGTCCCGAGTGAAATAATTTTCAGTTGTCACAAGCTTTAGCAAGTGACAATGAACATTATTCCACGAGGGACATAAACATGATACAAAATGGTAACGAGTTTAATATCTTATTTATTACCCATATCTTAATTTATATCACTCAACTCTTTTGGTTGGCATTCCTGTAAGGTTGTAGTGCGCCAATTGATGACGCCATCACTTAGCGTCGAAGTGTTACGTCCCACTTGGTGTTCTAGTGGGACATATCACTTTGATATGCACCCAGATATTTTTAACTATATGAAAATTATTTTGCCAAATGAAAATGAAATTCGCCAATTGGCAAATTTGGCGAGTGTTAGAGCTAGTCCTGCAGTATACTGGTATATATAAGGCACAGTATTTTGTGCAAACCGCCATTCTCTTTGCATGTCAGTTACACAGCTTATATTTACACTGCCAATCGGTTAACTGCAAGTTTGAGGTAACTGATTAGGCAGTTCATTGTTTACACAAATATAATTCATGTTACTCAACAATCGCTTACCTAGGGGAAAGTCATGTGAATCAATTTTTGCTTACACGATATAGTCAAACTTTGATAACTCCACCTTCGATCTCTCGAAAATTTTGATCTCTCGACCTGAAGTGATGGCCCTGGCCGAATTGCTATACAAAGTAGTAATAACGGCCTTCGAAAACTCAAACTTAGAATACTCGATAAACTTGATCTCTCGACCTAATTTTTTGGTCCCGTCATAAAGATTTAATAGTTTGTTCACCTCTAAAACTCGACGTGTGTAGATTGATCAAACTGTCATTGCCGATAGTATGTTAAAGAAAAATGAACTGTTATTCTGGTCAATCAGACGAAGTGCGCCCGTCTCAGGTGGTCTTGGCTGTTGAGGATTACAGTGATAATTATAGAATAGATGGCCTAGCGGAATGAACTGATCCTGTGTGTGGTTGACCGGCCTCGGTGGCGCAGTTGTTAAGCCATCAGTCTACAGGTTAGTAGGTACAGGGTTCGCAGCCCGGTACCGGCTCCAACCCAGAGCGAGTTCTTAAGGGCTCAATGTAAGGCCACTACACCCTCTTCTCTCACACTAACCACTAACGAACTAACAACTAACCCACTGTCCTGGACAGACAGCCCAGATAGCTGAGGTGTGTGCCCAGGACAGTATGCTTGAACCTTAATTGGATATCAGGACGAAAAATAAGTTGAAAATAAAATGTGTATGGTTGTCGGTGGTCGTCCATGGTGGAAAGCCTCGCTACATAATACATAATTACAGATAACTTCAAAGAGCACTTGTAATAATTGTTAGCGCTGTTTCATTATTATAAATGTTAGTTCCTGATTTGCATTAATGCTTTTTAATGTTCTTCTTATTTAAAATAATTAAAATAATTAAAAAGAATTTGTAAAAAACAAATGTACTAAGTGTTATTCAACATTCAGTGTTTTATTTGTAGCTACGTTCCGCCATATTTTGACATCTGCAAAATACATCAACTTTCATTATGTCATTTATTTCCTGTTTCAAATTTGAACTCTTATATATTAATTTCAAAAACTCAAACTCCCTGAAACTCAAACTATTCCCTCATCCCCTTCAAGATCGAGTTATCGAAGTTTGACTGTATTTTGAAAAATAATATTGTCCTCTGTACATGTATATGTACAATTAAGGATCTCTTTTTTTTTTTATCAAATTAAGTTTCTTTCTGTTAATTGTTATACATATATCATAAAGATGAAATAAATTGTTTAAAAAACAAAATAATTGTGCTTAAAATTAATTAATTTTTTCTGACTTTTTAAAAAAAAAAAAATGTAAAAATGCCATTTTTGAGATCCTCAAAATTTATACCTCATTTAACGGTATAGTGTTTTACTGATAGACAGTATTACGTCTACCAAACACTCTTGGATTTGTTGTGAACAATGTTGTAGTTAGTAATGTTGAAGGTAGTTTTGTCATTTGCGGGTCAAAAGAATATTCCTACAGGTTATAATAAAGTATATATATAGGCCTGGAAACCTATAGGTTTCGACGCATTTATCTAATTTATTATTCCCATTATCATTCCTTTCATAAAGTCGCTGATATTTTGTTATTCATTGATATCATTGTTCTCACTGTAACTAGGTGGGGGCATTTTTGTTCAAACCAATTGTAGGAAGTGGGAAGTACTGTTCTCTTTTTCTTTTATTTTTTGAACATGTGGTAACCTGGGGTAACCTGGGGTAAGTTCAGTCAACCGCTTTTCGCTAACGTCCACTAGAATTGTTTATGTGCTTCACGTTAAACCAAATGGCCACTTCGGGAACCAATCAAATAGTTCACAAACCTTTGCGAAATGTTCACTGGCTGGACTTAGGCTTGGTAACCCGAACGACCATTTTTGTAATTTGTTTTAATGCCTTCTATTTTGTAATATATTTGTTTAGTGAGAGATGAGCATGGTGCAGCTCAAAAATGCAAGTATTCAGGCTTTAAGCTGTTGTTCAGCAAAATAAATAAATATGTATTTTAGAAGTATTATAAGATAAATAGAATTCACTAGTCATGGGTTTTTTTTTAATATGTAAAATATCAACCACGTCTTGCTAATTGATATTTGTCTCGGCAGAGTCACAACAAACACCAATTAACAGACTCTGTTGATATTTTCCATGTTTAAAAGGACCACTTGAGAGGAAGCCTCTATATACAGTTGAATCACATTGGCTCGAACCCCGTTGGTGCTCGAGAAAGTGTTCGACCCATCAGGTAGTTTGACCTAACCATTGTGTAAGTGTGACTCGGGACTTCATTTTTGGTTCGAGCATTGCAGTGTATTCAACCCTTCCGCGTTCAACCCAATGAGATTCTACTGTATATTACAAAAAAAATTAAAAATACATAAAGGGTGTGGAGACAGGCATAGCATACCACCACCACTATTACTGTGGGCCTCTGTATTTATTTATTTTTAATTGCTTTCAGATTACAGTACAAAGAATGTTTATCTGTTTAT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Transcript

ctg75-9.15-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01652	IF4E	Eukaryotic initiation factor 4E	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001040	Family	Translation Initiation factor eIF- 4e	Interproscan
IPR023398	Homologous_superfamily	Translation Initiation factor eIF- 4e-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11960	EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 4E RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000340	Molecular Function	RNA 7-methylguanosine cap binding	Interproscan
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0003743	Molecular Function	translation initiation factor activity	Interproscan
GO:0006413	Biological Process	translational initiation	Interproscan
GO:0016281	Cellular Component	eukaryotic translation initiation factor 4F complex	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg75-9.15-1 global RNA-seq network