Gene detail

Detailed information of ctg75-13.12-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg75-13.12-1	PHOSPHOSERINE PHOSPHATASE	chr3	73783291	73799134	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg75-13.12-1

CAGGCAGCTACGTTGTTTGCGTATGGACTGCATGCTGTAACTTTGGCAGGACTAAAGTATAAACAAAATTTAATATTGCCATCTTTACGCTATGTTGGGACAGTGAAGTGGCAAGCGGAAGGAGTAAAGTACGCTATAAATCAAGAAGAAGAAATACTTCCTGTTACACGATTGACAGAACCGAAGCATCGGCCCGGGACGTTGTTGATGACAAAATCTTTATTGACCGGTTTCCTGCTGTAATTTATGTATCGAACTGGTAACAGGTGTTTAGAATTCCGCTTAGTACTGGAGGTGTTGTTGCATCTGTGTAAGGACATTTGTCAATATAAATGTCCCTCCCCAACTTTTCCTTTTTTTATTTCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATGTCGACGTGGTGGGAATAATTGATGCAGGCAGGATAAAATGATGTAATCAAGAGTTCCACGCGTAGGCCTACTGGTTAACATCATATTCTCGGAACCGAACATACAGATTAATAAGACTGCTGTACGATATGTCACAGAAAGACGTCAGAGCAGTGTGGCGGAGAGCGGATGCTGTCTGTTTTGATGTCGACTCGACAGTGTGCAAGGATGAAGGCATTGATGAGCTGGCCAAGTTCTGCAATGTCGGTCTTGAGGTGTCAGAACTAACAAAGAAGGCAATGGGTGGCAACATGTCTTTCAGGGAAGCACTTTCGCAGAGATTGGATATCATTAAACCATCTCGGCAACAAATGGTTGACTTTATTGGTCACAGAAAGCCACGGCTTAGTGATGGAATAGTAGAGTTGGTGTCACTATTGAAGGAGCGAGGCTGTGCAGTTTATCTCGTGTCTGGAGGGTTTATTTCAGTTATTACTGAAGCAGCCAAATTGCTGTCCATACCACCAGGAAACATATTTTGCAATAGACTGAAGTTTTATTACTCAGGGGAATATGCTGGCTTTGATGTTGACCAACCGACCTCTGATTCCGGAGGGAAGACTAAAGTGGTGAAGATGATCAAGGAGAAGTTTGGTCACAAGCAGCTGGTCATGGTGGGAGACGGTGCCACAGATATGGAAACCTGTCCGCCGGCGGATGCATTTATTGGATATGGTGGAAATGTGGTCAGGGAAAGTGTGAAAGAAAAGGCATCTTGGTTCATCACAGACTTCCAAGAACTTATTGGTGAATTAAAAAGTGCAACAAATGTCAATACGGACAATTTGTTAAACGGAGTACATTAATGATGTGGCATTTAGGATTTAAAAAAAAATTAAGCGGCTTTATTTCTTACAGAATTTAATATATGTGATATTGCTTTTAACTGGAAACTATGCAAATTACTTGTTTCATTGTTAATAACTGATAAATTATTTTTTATTCCAGATTTAATATTTTTACTGTGTAAAAAAATAATAATTTAAATAGTGAAATATTTTTTAAATACAAAAAACAATCATATTTTAGCCTAATTGGACAGTTAATAACTGAAGATGTTATGTAAATAATTGATGATATTTAAATATATTTAATCATGTTTTTACATAATTATGAATATTTTACATGGAACAGTGTTTGTTAAATTTGTTTAGTAGGTAAATAATTTGTGATATGAACACAATTGTCCAACATTTACATTTTAATACTTGTGACTTAACAAAAGCCAGGATTCGCAGCCCCGTTCCGGCTAAAGTCCAGAGCGAGTTCTTAAGGGCTCAATGGGTAGGTGTATGGCCACTACACCCTCTTCTTTCTCACTAACAACTAATCCACTGTTCTGGACAGACAGCCCAGATAGCTGAGATGTGTGCCCAGGACAGCGTGCTTTAACCGTAATTGGTTATAAGCACAAAAATAAGTTGAAATGAAATGAATGTCATTGGATTTTGAATACATATTTGTATTCAGTTTTGTACCCGACAAGCTTAACGCTCAACAGATGATTTATTTTTAAGTTTGAAACTTGAATTTTACAAGTATGCACTTTACTTACTGGAGTCCAGTTCCATTCAATTTGATGTCAACTGTGTTACATGCATTTTTGTATCCTATCAGTTGACCAATCGAATTATTTCAGAGTATTTTCCAAGTCTGACTTGTCAATTGATAACACGACTATAGTCTCTTTGTGTGGAAAGGGAACCGATGAATTGGCATATACCGATAACTCTATAATAAATCATGTTAAATCTTATATTATAACATATTACTGAGTTTTAAACCCATACCAACTCAATTTTTTTTTTTACTAAAACATTCTGTATAAATATAACATTTCTTTACAAATTATATAGATTAATCTCATTTTTAATACAGGGGTGAAGACAAAATGCTAGAATAGCTATCAAAGTAATCGATAATGCAGGATGCTGAGACTAAAGGTACAACGGTATGTTGGTTGTTCCATCAATTGTATTCCTACCCGACTTGTAAAATAAGATTTAACCTATGCAATTTGATAATAATGTGTAAAGAAACTTTTTTATTTAAAGCTGCAGTCCCTGGAGTTTTTTTTCAAAAGATGTTATTTGAGTTGCTATGGCTTTAAAACTTAATATATTTTTATATGAATTTTAACTTTATTCATTAGAGTTATATGCCAATTCATCAGTTCCTTTTTTACACAAACGGAATATAGATTAGTCAGTGGCTATTGAATGTCGAACATATGATAAATTTCCCACAAAAAGGACATGTTAATGATAACTTGTTTTGATATTATCATCAGTGTCACTTGATCTTTTTACAGGCTCGTATGCAGAAATTTATATGGGTGTGTGTGTAATCGACGGCCCAAAGGGCCGGAGTTGCTAGGGGGTCCGGGGGCATGCCCCCTCCCCCCCCCGAACTTTTTTTATAATCTAGAATGCATGAGATGCATTTTCCTGCATTCTGGGAAGTAAATTTGTCACATCATCAGACTATTTTTATACATGGGACCAAGTTTGTTAGCAACTCAACTTGTGTTAACTGATGTACATTAAAATTTATAGAAACAATGAA

Transcript

ctg75-13.12-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00702	Hydrolase	haloacid dehalogenase-like hydrolase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR004469	Family	Phosphoserine phosphatase	Interproscan
IPR023214	Homologous_superfamily	HAD superfamily	Interproscan
IPR036412	Homologous_superfamily	HAD-like superfamily	Interproscan
IPR050582	Family	HAD-like hydrolase superfamily, SerB	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR43344	PHOSPHOSERINE PHOSPHATASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000287	Molecular Function	magnesium ion binding	Interproscan
GO:0004647	Molecular Function	L-phosphoserine phosphatase activity	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0006564	Biological Process	L-serine biosynthetic process	Interproscan
GO:0016311	Biological Process	dephosphorylation	Interproscan
GO:0036424	Molecular Function	L-phosphoserine phosphatase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg75-13.12-1 global RNA-seq network