Gene detail

Detailed information of ctg722-5.7-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg722-5.7-1	PHAGE_INTEGRASE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	chr10	4515676	4526540	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg722-5.7-1

ATGATCAAAGGGTTTCGCCTTGAAGATCAAGTACACTGGTTTCGGCCACCAAGATGGGACCTGAATCTGGTGTTACGAGCGTTATCGACTGCACCTTATAAGCCGATCGAATCCTCTTCCCTGCAAGACTTGACGCTTAAGACGGTGTTTTTACTCGGTTTCGCCACGGCTGCCCATGTCTCAGAACTCCATGCTCTTGATGTAGACTTGGTACGTTTTCACCGAGATCGGCGTGCAGTCAACTTGGGGTTACTCATGAACTTTGTTGCAAAGAATCAGTTACCAGACCAAGCGCCTCGTTCGTATGCTGTGCAGGCCCTCTCCTCTATCGTTGGTCCAGCGGACGTTGAGGACTTGGCGTTGTGCCCTGTTAGAGCCCTGCACCAGTACATCGAGAGGACCAGATCTTTTCGACAACATCGCAAAAGACTTTTCCTCTCCTGTAACCAGAGTCGGTTGAGGGATCTTACCAAGAACACGGTGGCCACCTGGATCCGGTCTTCTATCCTGACCGCCTATCAGAAGGAGGGTTTACCTGCTCCGTCTGCTTCTAATCCGCATGAACTCCGTGCCTTGGCTGCCACGATGTCCCTGCACTGCAACACACCCATTCAGCACATTATCACTGGTTGGTTCTGGGCTACGGACTCCATCTTCACCAACTATTATCTGAGGGATGTCTCCACAGAAGACGAAAACACTCTGGATGCGTCAGTTGTGAAGATATTGCAGGCTGCCGGTGCCAAGGACTACATTCCTTTGGTTGCTCGAAACCGGATCACGGAGGAAATATTGTTACAGCTCAGTGACGACGACCTCAGACAGATGGGTGTACACGAGCTTGGCATTAGAAAAGCCATTCTTAAACAGATAGCTGAATTCCTGGCCAACAGTAAGGTGAAGAACTTTGATACTGATCAGTTTGAGACGTCTTCAAAAGAAGTTCACCCTGAGCCGTCTGCTCCGCCAGAACCAACAGCCTCCTCCGACGCCAAACATCCCTCCAGACAGCTCTCCATTGTCGCCAGGGGCATTAACTCTGAGTGTGTCGTCTGCATGGAGCATGAAGTGCGTAGCAAACTACATCACAAATTATATTCCTCAATTGTGGCCATGTTTGTTGCTGTCCGAAGTGTTCACAGTCAGTTGACCTCTGCCCCATGTGCCGTTCAGAAATCAAACAGAAAATAAAGTTGACAATTCCATCTGTCAGTGTGTCCACGTGACGCATCTTGGTCTGTACCAGGCAGACGTTGCAGATTTTCATATGTAAACGTTGCTGTGTTTACTCATTTCTAGTTAATACTATACATTTAACATCTTCCTAATTATTAGAAGTAGAAATCCAAGGTGAGCTGTTTGTCATTCTGCTCAAAGTGATTTGGGGGAAGTAAGGTGTGACCACTTCTTTGAAGTGTAAACTGATAACCTCTGCTGTGGCTGTGATGGAGATAATAAAATGAAACGGTTGTGTCACTGGTGTACTCTCCACAATAGACTAGCCATTTCAGCATTGTTATGAATAACATAGTACACTTAATTGCTCATTTTGTATGGCCTTCATTCTTTTGAATCCAGTATAATGAGAATGTATATTATCTTTGCAAGTGCTGTATTATAAGCTTTGGTTATATGTATTTTACAGCAACCATAATATTTTATTGTGTTATTTGTATGCATACGTATTACCTCTCGGACACGTGTGCAATCAAAAAAATTCTTTATGGAGTAATTAGTCATTCAATAGTATAGGTGGTCTTTTTCTCCATTTATAGTTTTCTTCAGGATTAATATAAACAAAATGTTTACGAAGGGGTTGACGGTGATCAAGTTGCTACTTGTTATCTTCAGATACAGAATATATTAATTGTTATAGTTGCAGCCCAATGGATATCTCTGTAGCACTTTATTACATTCTTGTTGTCAACTCTAAAGCTTACTGTTATAAATTATTTTTAATCTATATATAATTATATATATTTGTACAAATGTAAATTGCTTTACTCTGAGCCTTATTTTAATGTAATTGTTAAAATAGGATATTGTATTGTTTTTCTACTGTTTATGATTGCTGTGATTTCTTTTCTATGAATTAAAGTATTCCATTCATGTTATACTTTCCTAGCATGTTTTACCTAAGTAATTTGTATGTCAGTAGATAGAAAGGCAGTATATTATAATTGATATTAATACCAGTTCTTAATCAGTTTACATATTTTATTGCAATCCTCATGAATTTGATAAAGTCATTTGAACATGCTTGCATTTAATTTAGCATTTCTACAGCTCATACTTGTATATTACAAAATACACTTTGCTCATGTAGTTATATATTAAAAAATCAAAACTTCAAAAGCTTAACTGAAAGGGAAATATATTATAAAATACACTTTGCTCATGTAGTTATATATTGCAAAATCAGAACTTCAAAAGATTAACTGAAAGGGAAATATATTACAAAATACACTTTGCTCATGTAGTTATATATTGCAAAATCAGAACTTCAAAAGATTAACTGAAAGGGAAATATATTTTTATGATGATTTACAATGATTTATAATGACAGTGGACCACCTGTCATTCCTCTATGTTTGTTATTTAAAATAAGTCATGATAGCCGTTGATGCATGGTATTGTGGTCCATTACATCTGTTCCATCCTGGACCAACTCACTGGCCATGCCAGAGGTAGGGGCCAGGGGGAAATACCCAAACTTTGCAAGGATGTGGGCATGTCAAAACTGTTTCGAGTTTGTGTTCCAATACTATGACTTTAGACTTGAATTATCTGTTCAGGTCACATCACCCTCGGTCCATGCACATCAGTTAATTCAGCAATTTAGCTGAAACTCCTGGCATAGGTCATGGTTTGGGCTATTGAGACATTCAAGGTAACTCACCACATCAACAAATGGACAATGTTAAATTATTATTATTATTTTGTTCGAAGAATAGTGTGGAAATGAGATTATTGTTGGCGATTTTGGGGGGTGTTTTTTTTTGCAACATGTACACATATGTGATGAAATCAAAATAACTATAAGAAACATAATGTTATAATAAATTAAATATAAACACAAACCTTGTGTATTTTGAATCAGTAAAATCTGTGAATTACAAGAAAGACAGAATCTTTAAGAATAATTTTCAAACTAATTCTGTTAAATTAATCTTTTTATTTGTGTAATTTTATTAAAACATTTTACTTCTTTAGTCCAGTGATATATTCAGGATAAGTTTTGTGAACAACTTAAAAACATTTATAGCAAAAACGATAAAAAATATTTTTTTAAATCAAAGTAAAATGACAGGTTATTCTGATCTGATGATAATGTAGTATTCAGCAAAGCCTGACATTACACTCCTAGTGACACAGGCTGTGATTTTTGTCAAGTTATCTCTATTAGAATGGTTGCTTTACAGGGTTCATGAATCCATTCTATCCAGTGGGTTGATTTGATTTTGTCTTCTAGATGTCTTGCCCTCCAAGGCTGACGAATGACATCTGTCCGGGTTTTATTTTATTCCATCTCTTAGACAGATTGTCTTTCATGACTAACGTACTCTGTACGTCCGTGCTATTTGTCCATGGCAGGAGCTGGATTAATGAGTGTCAGAGCATGTCCATACGTCGATGGGTCGTGCACACTGCACCTCTGGGGCTCCAGCTGCTCCGAGATCCCCCTCATTCTAGCCCGAGTCTGTAAGGGCCCAGTTACCGTGTTGTGCCAAGCTATGTTAGCAGGGGGCAATGAGAGAGTCTTGCCTGCAGAGAGGTTATGTACCGGAAGAGTAGGACTTCCATGCCTCTGCCTACCTTTTTGTCGTTAGACTATCCGGTGGCTGCAGCTGAAAGCGAGAAGGTCAAGCCAACTACAGCACTAGACACCTCACACAGGCCTGTGGTTATCATACCACCACACCACAGTTTGATTTGATTCAAACCTGAACAACAACAAAAAGTAATTAATATTGGTGTTGTCTTGTAGATCTTGCCATGAAAAACAAAATTGAGGGGAGAGATTAATTGTTCCCGTAACGTAGATTATGGGGAGCCATTGAAGATATTAGATTATGGGGAGCCATGGAAGATATTGGATTATGGGGAGCCGTTGAAGATATTGGATTATGGGGAGCCGTTGAAGATATTAGATTATGGGGAGCTATTGAAGATATTAGATTATGGAGAGCCATGGAAGATATTAGATTATGGGGAGCCATTGAAGATATTGGATTATGGGGAGCTATTGAAGATATTAGATTATGGAGAGCCATGGAAGATATTAGATTATGGGGAGCTATTGAAGATATTAGATTATGGAGAGCCATGGAAGATATTAGATTATGGGGAGCCATTGAAGATATTGGATTATGGGGAGCCATTGTAGATATTACAATATTAAGCATTGATATTTAATCCTTTTCTTGGTTTGGGGGTCATTTTTGGAGGGTTTTTTTTTTTTAAATAATTCAAAAGCTAAGGAGCTAAAATGTGTCTTCTAGAACTAGTATCAGGGGAGTGATAGAGAGCCTGAGTGATAGCTCCCCTTAAATGGTGAGGTCTGTAGAAGTAGGAAGGCATTTTTTTTTTCAACTTCACTTGTCCTCAAACAAAATGCATATTCCCCTAAGGATAGTGGTTTGGTTTGAACATCCCAAGTTTATGGGGAGAATACGAATGCATCTTTGGAGTATAAAACCCACCACCTTTTGTTGAATGCTGTATTTTATGTGAGGACAGGTGAAGTTTAAAAGAAAATGTGAAGTGTTTTCACTTTTTATGAATACTTCAACTGTCTTCAAGGGGTTATACCCTCTCAGGCCTTCCCGTTTCCAATTTTCCGTGTGATTTGCTCAGGGAAAAGAAGTTACAGTCACATGACCAGAACAGGAAGGAGGACTCGGTAGAAGAGAATTTTAGGCCATCCCATTGTCTGTTGGGATGTTCGAACCAGACTACTATCCTTAGGGGAATATGCATTTTGTTTGAGGACAGGTGAA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Transcript

ctg722-5.7-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07647	SAM_2	SAM domain (Sterile alpha motif)	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001660	Domain	Sterile alpha motif domain	Interproscan
IPR011010	Homologous_superfamily	DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core	Interproscan
IPR013761	Homologous_superfamily	Sterile alpha motif/pointed domain superfamily	Interproscan
IPR013762	Homologous_superfamily	Integrase-like, catalytic domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR35617	PHAGE_INTEGRASE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003677	Molecular Function	DNA binding	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0006310	Biological Process	DNA recombination	Interproscan
GO:0015074	Biological Process	DNA integration	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg722-5.7-1 global RNA-seq network