Gene detail

Detailed information of ctg704-6.13-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg704-6.13-1	RAS, DI-RAS, AND RHEB FAMILY MEMBERS OF SMALL GTPASE SUPERFAMILY	chr9	82071404	82087271	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg704-6.13-1

ATGTATCAAGACATTTTATGTTACAGAGGACTCATACAGGAAACAGAGGACTCGTACAGAAAGCAGGTGGTCATAGACGGAGAAACATGTCTGCTTGATATTCTAGACACGGCAGGTCAAGAGGAATACAGTGCAATGAGGGACCAATACATGAGAACTGGCGAGGGTTTTCTGTGTGTATTTGCTGTGAACAACATGAAATCTTTTGAAGATATTAGCCAATACAGGGAACAGATCAAAAGAGTAAAAGACGCTGATGAAGTCCCTATGGTTTTGGTGGGCAACAAGGTGGACCTGCCATCTCGCTCTGTGAACTCGAAACAAGCGAAGCAGATCGGCGACAGCTACAGCATTCCCTACGTTGAGACATCGGCCAAGACGAGGCAGGGAGTCGATGATGCTTTCTACACGCTGGTACGAGAAATAAGGAAATATAAAGACAAGAAAGGCAAAGACAAGAAGAAAAAACCTAGAAAGAATAGTAAATGCATTCTATTTTAATTTATAGATATTGATAAATATTTTTACAATATTCTGACTTTCAACAACAGCGGAGCTACATGGATTTTGTATATGTGTTACTATGGCAACTCTGTTAATGTTCTGGAAACCGAATGACTGATCTCAGTTGGTTTTAGTTCCAGATTAATTTCCAGATGTAATTATTGAACCTCTCTTGAACTTGTCGTTACCTACCTGTTGGTATAATACACTTAAATGTTTAATATACCTGTGATACGGTGGAGTTCCACTCTTGATACCCATATTTGAGGGAGTTAAGATATCGGAACTAATAACAGGGCAGCAGTGCTTGCTGAAAGGAGATTGGGCTTATATTAGCGTGTACAGGGGTGTGGATCTTCCCCTTTTTTTGATAGACTGTATATATAGTTTAATTCGATGTTTTTAGTCTAGATGCAGGGTCATCATAAATCTAGAGCTTAGTGGACTGAACATTTTGCACCCCCCTTTTTAAATTTTTTTTATCTGTCCCTGCAATTTTTTTTCTTCTTTAAAATGTGTTTCTGAGATTCTCCAAGATTGCGTTTAGCTTTAGCAAAAAAAAAACTAAACCCAAAAAACAAAACAGACAAAGAAAAATATGATTAAAATATTTATTTATTTAAAAAGACCAATTTTTAAAATAAGTAACTAAATTTGAGGCCTTCTTTGATAGTGAGATTAAAGCCACATGACTGTCTTGTCTCTTATTGGTCCTTTCCTTATCACACTAAGCAAAATCGGTTTTGTCTCAATATAGGTGTTTCATTTTCTTTGGTATGAATCATGGTATGAAACAGTACATTGTAGTAGTGTTGGTAAAGTGCTCCTACTGGCATTAGCTTGTGGGAATTTCACTATCAGCTCAGTTGGTAGAGTACTGTACTCTCAAACTGAGGGTCTGTGGTTCGAATCCCATACGTGGAGGTTGCTTTTTCTGTTAGTCATAGTCTCAATCTGACTGACAAGGCCTAGGAAAATGGGTATAGGGTGGGGGGAGGTTGATGACTTGTTACATCAAGTAAACTTCTGACTACATATGAGTCATAATGAATTTTCTATCTTTGTCCATATTTTTACTATTTGTCATACATTTTTTTTAATGTAACAATTACTTTTTTCTCTCATTTGTTTTCTCAAAAAGTTTGAAAAAGAAAATAGAAGAATTCCATTGATTGCTTAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAATTAAATTCGTCTGATGGTTTCAGAGCACTAGCTTGTATATAGATCTATGTGGTGCACTGCTTCCATGGATGATGTAAAACATGTTTGTTGGAGTTACTGTTCTTACTAGAGACATTATAAAGTCGTATACACTGGAACTGTTATTATCTTGAATCAGATCTCTTATACTGTCTTGTTTGTATTTTATCGACTTTATAAACTTAATTATTTTACAAATTTAACTTGAAAAGAAATACTGGAATCGAATAACTATTGTTTGCAGTTTTATTAAACATAATTACTTTGTATTGAAGACTAATTTTTGTCAGCTTTTCTTGAAATGAGAAACTTGAACAAGTAAATAATATACTAGAATGCTTTAAAGGGACAGACACTAGTTTCAACCCGTGAAAATTAACACTAAGTTTAGTTAATCTACAAACCTGTAACACATTTGGATAAAGTTACAATAGAGTGAAACATGAGTCTGTGACTTTGAAATGGTGAAATACCCTCTGAAATAGACTAAAACTCAACTCCCATAACTGTTACTTCTCAGACGCACGTGCGTTTTTAAAAATATGAGAAATGCATTTTGTGATATTAAAAACATCAGGATGACCAATAACACTTCGAATGTACGGAATTGATCATCTAAACAATAAAATCAAAGTAAAGTATGATTTAAGTTACCAAAAACGGATATAATAGTCAAAAATATGCGTTAGTGTTTAAAAACTAGGGTATGTCCCTTTAAAACCAAATTTCCGAATATTAATGGCTATGGATGGACTTCATAGAGTGAAAACAGGAAGCCAGGTTATAATATTTCAATATGAAGCTTTTCATGATGGGTTGTATTATTAAATTATTATTTTTAGTGTGTGATATTTATTGGAAACAGTTTGAAAATGTTTAATTTTATACTCCTATGAATTTGCCACTTTTTTAAACTAAAAAACATTATTGTAGACCCCTTTTATGATTTTTGTCATGTACTGGAACTATATTCAGTTTGTTATTCTAGATTAATAAACTGAAGGTCATATAATGGTTGTGTAAGCATTTAAGGTAATTAATCATGTTTTCTTGTTGGTTCTCTGAATATGGGTGGAAATGTATACAGAAGATAATTACATGTGTATGCATATAAAACATGTTAATAACTAATCGTATAGGATACAGCACATTCACTTTGTGGTTTTGGGGTCAAGACTCCTTATTTAGTGGGCAATCTGATTTTGGCCAATAATTAATCTTATTTGTAATGCATTTCATTCAACTGGTCGAATATAATGGTTGTATAACTGAGTGTTAAGCCCTGTCATATCCTGTCCTGGACGGAGGAGCTGGCATGGTCCAACACCTGCACCCATGACAGGCGTGCATTACAACAGCTTGCTCTGAATGTGCACGTTAAGCCCTATGACCTGACCTTTCATATGATGCAATCCAAACTTGAATCATTTACACAATATTGCAAAAGTTGTATGTTTATTTAAAAGGATAATATATCTGTTATTGATGTTTAATATGACAATGTTGACTCATTATAAGGATTAGACCTACATAATAAATTGTTAAGTTTATTTACATTTATTTACATTTATTATGTAACACTGTTAATAACAAGTAAATTAAAATTAATTCCCAATCCACCATTTCTGTTTGTTGCAGGATAATAATAATTGGATAATGATCAGGATAGATTTATCCTTCACAATATGAACCTCATATCCTACATCATTCAACAAGATATTTACATTCTTCAGTATGAGTTTTCATACATATGTTATTATTCAGTAACCATCTCCCATAGAACACAATTAAATCATTTAGATTGATTTGCATTAATACAAATTAGAGTAGACCAGTTACATAAAATAAAATTTTGGATCTCCAATGTATGTGATAACAGGGTTGTACCTGACCCAAAATAACCAGGGAGTAATTCTAAAAAATGATTAGGGCACAATAATATAGGGTCTCCTTCAGTTAGGCAGAAAGACACTTGTAAGGTGAACATTACACATTTTCTTATTTATCTTGGACCCTCTTCCCCACCTCCATACCTCTGTTAGGTACAACCTTTGAATAAGGTCAGCAACAGTGTTTGTCCATTAAATAAGGAAGTTGGATGTGACATACGGTTTTTATTACATGTTCATCACAATATGCAGATGTCCTCTACTTGCTCATTGTCAGTTTTTCAAGGGAGATAACTCTTCTTGTTTGCTAAATGTCTGTGAACTGATTTGACTACTGTGTATGTGCTCTCTGTCTATATATGCGTGTACATAAAAACACCTTATTAAATACCTGCCTTTGTGTCAGTTACCTGAGAAATGGGTTGGCTTGTGATGTGTTTTTCAATTCTTTTTGTTTTCATTCTGCAAGGTGGGGGATAACAATACACAGTACTCATCGTCTTGTCGTATCTCAGCTTGAATGTTCATCATAGCTTTGTTACTCCTAAGTGTTGTCTGTGTTGGAGGACACTTTATACGCAATGGATGTTATTGGTTGGATTTTTTAGTGCACTATATTCAAATTTCTACGTTGAGGTGTGTGTGTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATGCACCAGCCTACATGCATAGGTTTGTTGCATGCATGTTTATCTTTGTATGCTTACATTATAGAAATTCAAGTTCTTGTATACTACAATGTCAAATAACCTGGTTACATATTTTTCAAAAATTATGTTATCACTATGATGTCCTATAACCATCATAGGCTGTATCATCACTTCAACACATGCCATAGTGATGTCATAGCCTACAATGGTTTTATGATATCATAGTGCTAAGATATCTTTGAAAATATGGTCCAAGGCTAGTTTTTCCTTTTTCCACATGAACGTTTTGAAATTGTTCACGCCACCTGTCTTAGCTGCATTTGTATGTTATATACCGATAGAAGGATAAACCATTTTATTGTCCATGTGGATCTTTCTAAGTACAGTGCTTTCACCAGAACGATAAGCCATCATGGCCTGTGCTACCTTACAATACAGCACAAACTACATCTTTAATATAACAGTCACAGGACAAGGGTTGGAATGGAAAATTAATAATTGTGTTCACTGATGATCATATCATATGACCATTTCGTGTCAGGTGTGCTAAACTGGAATTTACCTTCCAGTAATTTTAAAAGTACCAAAAACGTATATTAGGACTTGAATGCAACTGTTCTAGACAAATGGATAAATTAAAAAAAAGTATGTATTGCTGAGCGAGAATTGATTGAATAAAACGGGGTGGGGGTGTGTGTTGGTGTTGGTGGTGGTGCATTAATTTTCAACCAGCGAGAAGAATAATTATAACACTTTTTTTCTTTAAAATTTAAGCAAAATTTAATGTGCTGGATGTGTCATTAAACATTCATTGATTCATTGATGCCAAATAAAAGGTACAAACAGAGCAAACCTAGCCTGAAATAAGTGGGGAGGCAGTACAGCAAGAATCTGGAAACGGTAATGGAGGATCTACTAATAAAAAGGTTATTTTTAACGAAAAGGGCACGCACCTTTTCTAGGGATGCATCTGCCCCTTGTGCCGCCCCATTGACTAAATACCACCCTGGCATAGGGTCAGTTACTTTAAAATCACAGTTATATAGCTTAGCCGTATTGGAGTTTCCCCATTTAGCTTGAGATGCACCAAATGATGGTACTGGTACTGATATGTACAATTGACATCCAATAGCTGATGATTAATTAATCAATGTGCTCTAGTGGTGTCGTTAAACAAAACATTTCTAATATGTACAAAGCCAAAGTTTCTAAAATAATGTTCTTTTGTTCAGATATCGTTCTTATAAGCCATTTATGGTTCTTATTTGCTGAAAGTAAGAAATACTTAATTATTTATAAGTTATTTTTCATGGATCGACTTATAAACTGGTCAATAAAAACATTAGGTTTTCACGGCTTGAAATTAGGGACTCGACTTATAGGCGAGATCGACTTACAGGCGAAGATATACAGTACTGATATGCTACTAAGGTATTTCATAGCAAAGAAGCAGGTCTGTGATTTCAACAGTCTAGTTCGAGGAATATACCTGTAGATCTAGTATATAATATAGTTATTTCAGTATATTATACATACATATTGCAGCTTTTATACGGTAGTAGCTTATCCTAATGAGTTGTAAAACATTGAATTAACAGGCTTCATACTGTGTTAATGTCTTAATGATTTTTTTTTTTGTTGTTGAAAATAACTTGATGATATAAGTATTGTGAATTGATGTATGAACCAACATTTCTTTTTATAACTATATGTTTTGAAAATATTTCATTTCTTATAAATTATCTTCCTTAAAATTGTTCTTATGTTTGGTAATGTAGTATTTAATATTTATGAGACAATTTACAACCCAAATTTTTTGAGTATGTAAAGTTTTAATTGGTCATATTTTTAAAATGCCAAAACAGTCTGAAATTGTGCATGCTGTCAAGTCCAGAATGTTTGTGACTGTTGTTTTGAAGTACTTGTAGATGCTGAAACAGTCTGAAATTGTGCATTCTGTCAAGTCCAAAATGTTTGTGACTGTTGTTTTGAAGTACTTGTAGATGCTGAAACAGTAGACTGCTTGCTAGTGTGCAGCCGGGGCTGATTATGTTAAGTGAGTAGCATTTTCAGCAAATGATTTTCATGTGCACCTCCTTTACAGCTTATTATGAAAGCTAATTATGGTTTATTATTTAAACCACTTGAAAATCTTTTGACAGTTTGTTTTTTCATGTATTTGTATTTGCATTGTAATGTACCTGTCGGTACGCATTTTTTTTTTTTTTATTAATAACAAAATTCACATATAAAGA

Transcript

ctg704-6.13-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00071	Ras	Ras family	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001806	Family	Small GTPase	Interproscan
IPR005225	Domain	Small GTP-binding protein domain	Interproscan
IPR020849	Family	Small GTPase, Ras-type	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24070	RAS, DI-RAS, AND RHEB FAMILY MEMBERS OF SMALL GTPASE SUPERFAMILY	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003924	Molecular Function	GTPase activity	Interproscan
GO:0005525	Molecular Function	GTP binding	Interproscan
GO:0005886	Cellular Component	plasma membrane	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan
GO:0007173	Biological Process	epidermal growth factor receptor signaling pathway	Interproscan
GO:0007265	Biological Process	Ras protein signal transduction	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0019003	Molecular Function	GDP binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg704-6.13-1 global RNA-seq network