Gene detail

Detailed information of ctg7-9.2-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg7-9.2-1	ADAMTS A DISINTEGRIN AND METALLOPROTEASE WITH THROMBOSPONDIN MOTIFS PROTEASE	chr2	7925305	7949047	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg7-9.2-1

AACCGACTGAGCTTTAATCCCGCCCCCTATTATTTTATATTTCAGCTCTAATTGTATTTTCATTCTAAAAGAGTATTATGTAAAAGTGTGATTGAGTAAATACGAAACGAAAATTCATTTTAAATTCACTACACTATTTATTTTTTCAGATTCTGCTGACTGTTCGGGCAGACGAGAGAAATGACCGCTACCAGTGGGAGGTCACGTGGGAACCCTGCTCTGTCACGTGCAGTGATACCAGAAGACTTCCGCTTCCTGCAAAGACGTAACTTCCGGTCTGTACGTTGATGAACATCACTGTGCCAAACACAGCCGACCTGATGACGTCACTCTACAATGTACACTTCCAGATTGCACTACGAAACAGCATTACCCCAACTGGTACATTGGATCGTGGTCACCGTGTTCGACAACTTGTGGGTATGGCTACCAGCAAAGGGAGGTAATCTGCACCAGTCTGTTTGATCCAGACTGCTCGGTAGATAACAAACCGCCGGTGAAAAAAGCATGCAGCACGGGTGTCTCGTGCGGTGGTACAAACAGAAGACAAGATTTTACCCCGGATTACGTGGAGCCGTATTCGGTGAACCCCAGGAAGAGCAGTCTGACACTCGACGGGACACCAGTCGAACCAAGGTATCCATTTCAAAACATCTGACGTACGTGGCCGGTGATTGGAGCTTGTGTAGTATCACGTGCGGACTTGGTGTTCGCACGCGACGGGTGCTGTGTAAGGTATTTTTCACCCCCAGGCGTCTGCAGTGGACGGTGCCAGACAGAGAGTGTTACGGTTTGAAACCCGCCGAGAAGGAAGACTGCGTGGTAGAGGAGTGCGATGACCCCCTGGACATGAGTTTGAACGAAATTTACGGGACGGGGGAAAACTTCAAGTGGATCTTGGGAAACTTCTCACAGTGTTCTCGAACCTGTCTTGGAGGCCAGCAAAGAACGCGACTGGAGTGTGTGCGTGAAGTGGATGGCACGATCGTTAGTCCGACCTACTGCAGCAACTCACTAAAACCCGTCACCAAGACTCGAGTGTGCAACGATATTCCATGTTTACCAAGATGGAGAGTGGAAAACTATGGACCCTGCACATCAGAGTGTGGCGGAGGGATACAGAGGAGGAGGGTGGAGTGTGTCCGCGAAGTCCGGTCTGGAACGACAGAGATCCTGGACGACTACAGATGCCCAGACCCGATCCCAATCTCTGAGCGAAGCTGCAACACCCAGTTCTGCCCTGCCAAGTGGATGACTCGGAGCTGGTCTGAGTGTTCTGGAACGTGTGGACCAGGGGTACAGACCAGGCGGGCGTACTGTGTCAAATCTCCGGTCAGAGGTCACCAGGTCACCGTGTCCGACACCGAATGTCTCGGTCCGAAACCTATGACGTCACGCCGGTGTCACCACCTCAACGACTGCTTTGCAACACCGCAAGCGGCCCCGTTCATCAAGGCCGAGAACTACACGTTCATCCAGTTGAAAAGGTCGAAGAAAGTCAAACTTAATGTAGGGGGACGATTAGTTTTACTTCCAGGACAGTCCTTGACCATAAGGTGCCTGGTTAAGAACTTCCACAGGAAGCTAATATTCTGGAGTAAAGGCTACAAACTGATTCCAATGGCTGGGAGGGTCAGAACAACATTCAGTGGCAACCTGAAAATCCGGAAGGCAAATCCAAGCACGGACGCCGGGACCTACACGTGCATGGCAGGTTCCGAGAGCGTTGACGTCACAATAAACTTTCACACAAAACTCGAAGCTAGGAGAAAAGCGAAAGAGATGAAAAACTATATTATCAATAAAAATAATATATTCATTGGAGTTCCCCCGCAAGACTCCAATGGTAGCTTGTTAACTGAAAGGGGTGTCGTGAGCGATCCACAGTATAACATATCAAAGAAATATATTTTCACAACCGGCGCTTGGTCGCCATGTTCAGTCACGTGTGGTTCCGGAAACAGGAGGCGTAATGTGACATGCGCAAAAGTGACGGAAAAATACGTCAAGATTCTAGGAGACAGAGAATGTATAAAGATGGGTCTTGCAAAACCTCAGTTCATTGAAAAATGTTCTATAAGTTTTGATTGTCCCATCTGGAAAATTGGAGAATGGAATAAGTGTTCCAGGACCCACTGTGTTCGTGATGGGTTGGGTCAACAGAAGCGCCCTCTAGACTGTGTCTACACGAACGGCTCGATCGCCAGGCTGGAGGTGTGTAATCAGGCAGAGCGACCGCCTCACAAACAGGAGTGTGACAACCACGACTGCATGTCGATGTGGAGGACCACCAAGTGGACGAAAGTATCTGTTGTGTTTTATGTTGCAGTGCCGACCACTGTGCGCCAAAACGGGTTTCAAGACAAGGATTTTAACCTGTATCTGGAAGAAGACCAGACTGCCCGCCTGGTCAACGTGCAAGACGAAAGCTCGTCCTTCCCTCAAGAAGGCTTGTCAACCGCATTATTGTGGAGATCATTGTGTGGACCAATCACGTTACTGCAGCATTGTGGGGATGTTAAAGATGTGTCGTCTGCGCGAGTTCAGGAGGCGCTGCTGCTCCACGTGCAAAAGACTAGCTTCACTGAGATCTTGATTCTCTTCTATTCTCTTCTCTTCTTCTCTTCTCTCCGCTCCTCTGGGGAATTCATGTTACAATTCTAAAGGCGCCGTCATACGATATGAGTCTCTCGTACGAGGATTGCTGATTATAACAAGACAACGTTACGATTTTATTGATTGTTATTCAATCGATCGGCTATTCTCGTACTAGGCACTCGTATCGTGTGGCGTCGCCTTAATCTAAGGCGTGTTCAAGAGGCCGAGCACTGTTTGTTGCACCTAATGTTATATTTAGTGTCATAGGATGTGGCGTGTTTAGTCTCCGTGCTTAAAAAGGCTCATACAGACTGGATGCGGCGCGTGCGTGCGGCCCGATTGAAAGAAAGAAAGAAATGTTTTATTTAACGACGCACTCAACACATTTTATTTACGGTTATATGGCGTCAGACATATGGTTAAGGACCACACAAAGTTTGAGAGGAAACCCGCTGTCGCCACTACATGGGCTACTCTTTCCGATTAGCAGCAAGGGATCTCTTATTTGCACTTCCCACAGGCAGGATAGCACAAACCATGGCCTTTGTTGAACCAATTATGGATCACTGGTCTGTGCAAGTGGTTTACACCTACCCATTGAGCCTTGCGGAGCACTCACTCAGGGTTTGGAGTCGGTATCTGGATTAAAAATCCCATGCCTCGACTGGGATCCGAACCCAGTACCTTCCAGCCTGTAGACCGATGGCCTAACCACGACGCCACCGAGGCCGGTCCGGTTCGATTGATGCGTAGAACTGATGCATCTGTGGCTTGAGTTTTGGGCATATACACCATATACAATTATTTTCTTTTGGTCGGCCGCATTCGTTCTGCAGACGCACACGTCGCACGCATCCAGTCTAAACGTTCTCATTGAAACTAATGTATTTCGATGTATTTACTTTTTACGGTGCATCCAGTCTATAGGAGCCTTTATAAAAAGTTTAGAGTCAAGACTCTAACAATCTTTAACGTCATGGTAACGCCATTCAGATTGTAGGATATGTGTGTGACGTCACTAGAGATTTGAGTATTGACGTTTATAACCTTTTATGAGCACGAGGCTGTACGTTTGCGGACTATTTGACTGGTACCATCGTCTTCTAGCACATCACATGCATCAACTGTTCGGTGCAAAAACCAGTCTAGCAGCGAGAGTAAAAGCGATCGCTCGCCGTCCTGGACACTCCTCAGGATGGAAACCAGTCAAGTTGTTCGCTGACGCACTCGATCTCAAACACGCCAATAGTCATGATGCACTACACTGCGTTTACACAACTTTTAGTTCTATCACGGCATTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATATATATATACCACACACACACACATACAGACACATACACATACAAACAATACACACACACACACACACACACACAATACACATATACGCACAGACACACAAATTTACGCACATCCAAATCCACACACAAACAGAAACACAAAAAGAAAAACTCGCACAAAAAAACCCCACAGACATACATACACACATACAAACATAACCACACAAACACTTTGAATAAATCTGTCTTACTGTTACGTCGGCAATAATGGCTGATAACGTTTCTTGCTCTAGTCCATTTGTCAACAATGTGTGACAATTCGAGTGAAAATATTATTCACTGGAAATTTAAAATTGCTGATGTATATTTTATTTAAATTTGTATTTTATTATTGTCTGCTCATAAACTATAATGCAATTGTATGAGAGTGTATAATTTTGTACTTGTCCAAGGTCAAACTATGTTCGCTAGGTAAGTAACAAATAGAGTATTAAACAGTTTGAAATACGGGTCATACATGTATACTATACATATTTAATGGTGACAAGGAGATCATTATTTCTGTTTCCTTTTACCATGTCAATTTATAAAGCCAGACCCGTAGGAACGGAAGGGTGGTGCAAAGTGTTTACGTCTCACCCCCCATTCGTTGACCACAAAATGTACTCTTTTCTTTCTTTCTTTTTGTCCAGATATATACATGTATATAAAAACTAAAATTACGTTTTAAACAGTTGAAAATTGTTATCCAGAATATCGCAATTTATCCAAAATATATTTGTTCTTCGGATGCTAGGAAATTGCTTTTGAAGTAGTCTAAAGATAAAACAGTTTGCTTGTGCCCCCTCTCCCCAACACTGCAGATACCGTTCCTACGGGTCTGATAAAAGAGTTTTTAATTAGTAAATATCGTTTGGCATAGGAAAGCAAATATGTATGTTTGTGTTCATAGCGTTCATTAGTATATATATATATATATATATATATACAGTGAAACTTGTGTTAATTAGCAATGATCAAAAGAAGCACATGTATACTGAACAAAAAAAGAAACGCAAATAT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Transcript

ctg7-9.2-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF19030	TSP1_ADAMTS	Thrombospondin type 1 domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000884	Repeat	Thrombospondin type-1 (TSP1) repeat	Interproscan
IPR003598	Domain	Immunoglobulin subtype 2	Interproscan
IPR003599	Domain	Immunoglobulin subtype	Interproscan
IPR007110	Domain	Immunoglobulin-like domain	Interproscan
IPR013783	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like fold	Interproscan
IPR036179	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like domain superfamily	Interproscan
IPR036383	Homologous_superfamily	Thrombospondin type-1 (TSP1) repeat superfamily	Interproscan
IPR050439	Family	ADAMTS and ADAMTS-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13723	ADAMTS A DISINTEGRIN AND METALLOPROTEASE WITH THROMBOSPONDIN MOTIFS PROTEASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004222	Molecular Function	metalloendopeptidase activity	Interproscan
GO:0006508	Biological Process	proteolysis	Interproscan
GO:0030198	Biological Process	extracellular matrix organization	Interproscan
GO:0031012	Cellular Component	extracellular matrix	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg7-9.2-1 global RNA-seq network