Gene detail

Detailed information of ctg695-1.5-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg695-1.5-1	VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN	chr9	27536361	27554576	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg695-1.5-1

ATGTCGAGGGATTCCACCATCTGGGTCCTGTGGTTGCAGCTCAATCTCTGGTCAATACTGGTCGTCCACGTCGCCGCTGATGTCTGTCGGATTCTGGACTGCACCCCAAAATGTCCTATGAATCGACAGGATGCGATTATCACATCTCTGCAAGAATACAACCAGCACATAGACTCTCTCAAAGAGGAGATGGAGGAGGCCACACAGAGCGCTGAGGAAATCAGAAAAGAAATCCAGAGCTTTAGAACCAAGTATGCCTTTGTGAAAGGTGAAGATCGATGTTCTTCATGTAACTATCCTCTCATGGTCCGAACATTCTATCTGTTTCCATGCCAACACAAGTTCCACATGGACTGCCTAATATCTGAGGTGTTGCCTAGCCTGTCTGGCTCTAAGAAAGCTAAAGTGGACAGTCTACAGAGGAAGCTGGCTGAGAGAGCCGAGAGTCTGCCGTACAGAAAGTCGACGTCCATACCTGCCGGTGTCAACAAGGACATTGAAGTGAAGGCTGAACTTGATGATTTGGTTGCATCTGAGTGTATATACTGTGGAGATTTCATGATCAGGTGTATTGACAGTCCTTTTATTGAAGATGATGAATGGAACTCGGCACAACAGGAATGGGAATAACGATTACGTTACCCAGTTTGATCAAGTGGAACAATTTATTTACACTAATACACTTTATGGAATATCAGCTATTTATTAACCTTCTGACTACTGGATTAATTTTCAACAAAAACCATGTTGAGTGGGTAGAAATGTATAACTCTTACTCACATATTTTTACTTAAATTTTTTATAAATACATCAAATAATGTTCATATGTGAAAAGTTAAGTACTATTTTCGTGGGTTTTTCTAATTTATGATATTTTAGATCAGTTAATTTGGTTTAAAAATATGCAAATTTGTTTATAAAGTTGAACTTATTTACACGCAATTGGGATTAGCTTCCCGTTATTAACAGACATTATTCTCAATCACTGTTTTCTTGACCACTTTGTTTTTGTTGAAACTAACTACGATTCATATCCCAATATTTTGTGAATTTCATTGTTTATAAAACGATCAAATTTGTTATCAAATTACTTGTTACAATTAGCTATCAAGTTTTCAAAATGACCAAGATGTTCCGCCATTGTTGTCTCGCAAAAATACTTGCCAAAAAAAAAAAAATGAAAACCTAAAAATTCCCATATTTCCTGTGTTCTATTATTATTTCTGGTGAGTGCTGGGTGCAAAACGGCAGGAAATATTAATTGGGGAATAGTATGTCTGCTTGCTTAATGTCCCTGCAATATCCAGAAGGTTAAAATACAGTGTGAACATTGGATAATTGTGACAGAAAAATCACATTAAAAAAGATAACTTTATTATCATTCCACTGTTAATCATTATGTGCAATAAACATGTTTGTTTTTATACATTGTATATTAATTCATTTTAACTTATTTTTGTGCTTTTATCTAGTTACAGTTCAAGCACACTGTCATGAGAATGCATATCAGCTATCTAGGACGATGGGTTATAATACTTGTTAGTGCGAGAGAAGTTGAGAAAACTTTAGAAAAAAATTAGTTGGGGGTCAAATGTTTTGGGAACAGCTGCTAGGAAAGGGGAGTCCAAAATGGTTGCGGTCTACTTCATTAATAGAAAGACCTGCAATAAACTGAGTTTTAATGGTTTGATGAGAGGCACAAGGACACTTCACTATCATTAACCACTAACCTACTGTTCTCAACTGACAGCTCAGATAGATGAGGTGTGTTCCCAGGACAGTATTAACTGGTTTATTCTTGTTTGGGCCACAAAACATACTTATTGTCAAAGTAGACAAATTGTGATTATCCATCAGATAACAGTTTTGTGGTTGATTTTCTTCGATTACACAATGTGACAACTTCTAGATCAATGAAACGTGAATCAAAGTTGCAGCTCAGAATTTTTATTAGTCCCCTACCGGTCCAACCTGAAGGGGCTATAGGTTTTATCTGTCCGTTTGCTGTCCCACATATAGTTTTCCAGATGTTTTTTGTGTGGCGATTTACCCAATTGTGATGGAGTTATTGCCCTTGAACTTAGCAGATGTGAAAATTTGTCTTCTGGACATTGTTTTTAGAAGGCCTTTTGATATTAAACTGAAGTTTTTTGTATACCTATATCATGTACAGTTACAAGTTCGACTTTCATGGCAATTTACCCATTTTTGACAGTTATTGCCCGTGAACTTTTATGAACATTTGTAATCAGACCTGTCAACCCGCCTGGATTCGGCAGGAGTCTCCTGGTATTTGATCAAATCTCCTGACAACCTGTGCAGGAGAAAATTTCTCCTGTTAAATGACATTTTTGTAGGCATAAAAAAAAAATTCAATCCCCTTTTGCCAAAATAACATAAGGGAAGTGCCAGACTCTGGCCCAGAGTTGACCAATACACACAATGTTAAAATCACATGTCACAGCAAGACAAAGAAAAGACCAATTAGCTATATAAACATATTTGTGTCAGTTAATTTTGTATGTTTGTGCAGTAAAATGTTAGTAACAAATGTACACTTCAAAAGATTATTTTTTTTACAATTAATAAATGTTGTGTTTGATATAAAGTTATCCATGGAAATGGGTATAATTCCGGTATATTTCACACAATGTCCGTAATGAGGTTTTACTTGATTAATGGAAATACAATGTTTATTGCATCATTATATTGATTTTAAATAAGTACCACACCACTGTTCCTCATTATAGTAAAAACTGAATATTAATTTATAAGATTTATATAAATTTGTCTTGGGTACTTCAATTTGGGTACACTAGCCACAAATGATGATGTAACGTAACCTATAAGTGTAATGCCATAAATGTACTAATTAATTGTAATCCATACTCCTTTTTTTTTGCAATGCCTGAAAATATTGAGATGAAATTTTGCATATAGCTTTATCATGTACTGTTACTGATCAAGTTTAGCTTTCATGTTGATTTACCCAATTTTCACAGAGGTATGGCCCTTGAATTTAGGAGATATGAATAATTGTTGGGTCTGATAGGGGACATGTATTGCTTTAGCAGTACTCTCAGAATGCTCGTTATATATATCTTTTTTAGTTTTGTTTTTTTAGAAAATTCTAAAAACTAAATCATGAATTTTATATCATGACAAGACCCTGTGGTAAAGTGCTTGCCTGATGTACAGTCGGTCTACGAGTGTTGCAAACAAATGTATCCGAGAAGTTCAGTTCCATTCAATTCTTGTAATTACATTGTTACCCAATTTGCAAAAAACAAATTAAACACAAGAATTCCACGGAATTAATGTCTCACCTACATTAAAAATTTTTAGTACACTGATGAACATCCATTGGTGCAACTATAAACCAAGTTTCATTATGTGCAAAACTGATCTGAACATGAAACTAACAAAACTTCAACACAATAGCAGACAAAACACAATAACAAAAGAAACAGATATATACAGTTTTATTATCAATAAAATAGATCCACATGATTTGTTTTCAAGAACACATGTTTAATATGGACACTTTGCAGAATTTTACAGGTAAAAATATAAATATACATTGGTATGTGGCTCACATTACAAAACCCCTAAAATAGCAACAAATAAATCCAGGAAACATTTATACCTCATACTAGCAAAACTGATTTTTTGTTTGGTTAGTAATTTCAGTTTGGCTTGATGTTAGAACAAAGGACAACTTTTTCAAAAATAATAAAGATGTTCTATTTTTATGTGCAAATTGTAAAAACTTTAGGCAAAATATCAATAAAACAGCAATACTCACCCATACAGATACACTGGCATACCCAATTATACCTGTGACCCCCCCCCCCCCCCCCCAATCACCTTTTATATTTCCTTGTTGCCCATCGACTGCCCCCTCACCCCCCAATACCCGTAGTGAAGAATGTCTTCTTTTCATGGAGTTTGAAACAATTTCTAAATTTTGTTTTATTCTACATACATTCAAAACAGATCCCCATCTAGAAGATAGATTAACAAAATAATAATCAAATAAGTATTCTGTAGGATAAACTAATCAAGGAAATATAATTTCAAACTCCATGAGCAGATGACATTCTTCACTATTATTTAGTATTGCTGTTTGATTTAAATCATGCTTTTACAAAATGCACATAAAAATGAAACATATTTGTTATTTCAATTTTTAATTATTATTTTTTATATGTCAAGCGAAACTGAAATTATTGATTAAAAATCCTTAAAATGTTGGTTACTATGTGATATTATGATTTTGATTTCATTTGACAGATTAAATTTAATCTATTGTGGAAGTATAACTTTGTTGCATGCACACACACACACACACCCGCACACACACCCGCACACACACACACACTCAAAGATACTTAAGTGCACAAATTCAGTGACTTTAAAAACTAAGTTACATATTCCTGGGAAAAAATAAGGCAAATTTTATTTGAAAGCGCAGAGATCCTATCATAGTTTAGTATTCATGGCATCTAGTTTAATGCTGGTAGATTCTGGGTTCTTATCCCAGTCCTGCAACTAATACACAGTATGGGTAGTATAGGCTATTGCTAGTGCTGGACACATTTACTGCTATGGCACACATAACCAGTGCAAACCAATTAGAAAAATACCACTTTGCTACTACCAGTAGTATTAAAAAAGAGATTTAGTATCCATTACAGAGTATTTTATCAACATAATTTTTAAAATTTAAACTACATGTACATGGTAGTAGTACACATACATGTATATTGGGCATGGTAAACAACTTTAAAATAAGACTTTAACAAAGGAGCATTACAAAACTGTTTCAAATCACAAGCTACAAAGAGACACTTTCACATGACAAAAGCATAGATGTTAAAATGTTATAAAGCAACGAATGTTCTTGAAAGTATGTACCATTTTTATTTTACATAAAATCAAACTGGACAACCAGAAAAACAGCTGATTTGTCTAACTAGTCAAACAGCTTTACTGTACAT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Transcript

ctg695-1.5-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
--	--	--	--	--

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
-	-	-	-

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23323	VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005768	Cellular Component	endosome	Interproscan
GO:0006904	Biological Process	vesicle docking involved in exocytosis	Interproscan
GO:0007032	Biological Process	endosome organization	Interproscan
GO:0007033	Biological Process	vacuole organization	Interproscan
GO:0007040	Biological Process	lysosome organization	Interproscan
GO:0008333	Biological Process	endosome to lysosome transport	Interproscan
GO:0030674	Molecular Function	protein-macromolecule adaptor activity	Interproscan
GO:0030897	Cellular Component	HOPS complex	Interproscan
GO:0048284	Biological Process	organelle fusion	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg695-1.5-1 global RNA-seq network