Gene detail

Detailed information of ctg671-4.10-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg671-4.10-1	GC-RICH SEQUENCE DNA-BINDING FACTOR	chr4	41762626	41791013	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg671-4.10-1

TGGCAGTTCTACCGGCTATTACGCTGTTTCGTCAAGTAGCGACCTTTTACTGACGTATTGCAAATGGCGACAATGTTTAAGAAGCCCAAACGCAACTTTCGTCGAAAACTTGTGTCTGAAAGTGATTCAGACCAAGAGAATGATAGCAAGAAAGACACAAAAGCTGAAGAAAGAAATGAGGAGCCAATGGAAATTTCTGGCACTAAAGACAATGATAAAAAAGTTAAAAAGAAAAAATCTGAAAAGGATGCGGCAGCAAAAATAGCTCTGAGTTTTGATCATGATGAAGGTGATGATACAGAAATATTTCAAGTTAAAAAATCAAATCATAGCAGACGAGTTGCCAAACAGCTGAAAAAGGAAACACTGAAGGAGAAACAGGGTGACAAACCAGCTAGTCCAAAGCTTAAAACTGACCTGAATAACGAAACTAGTCATGATTTGGCAGAGGAGCAGCTAAAGGTATATTTGCATGCTTTATTCTATCTGGGTGGAGAAATACCTGATGCAAGAACCATCCATATGATACGCAAACAGCGGCAGTACAAACGAGAACAAGGTGATGAAATCATTCCCTTGGAAGAGCCAGTCGACAAAAGCAAGACAGCCCGACTTGTCAGGGATGATGAGCATGATCGGAGTGATGATGAAGATGAAGAGAGAATAGATTTCACTATCAACCTAGCAGCTAAAGAAAGACAGAAGATGAGAGATGATTTCCTTGCAGCTGAACATGGAAGTGATAATGAAGTCAGTGATGAAGATCAGAAAGAGTGGGAAGCGGAGCTCATCAGAAAAGCTGTCACAGCCGTTGTACCCCTGCCAGAGACGGCCAGTGTTATGGACACTTTCACCAACAGCTATAGTAACCACAGCTCTATATTCGAGAGTGTGCCACCGTCCACAACACCAGCCAAGATGACTACTTTCCAAGCATTTAAACCGATGGCCAAAATGACCGACCCGTCACAAATTACGATGGAATCTGTCACAAAACGACTGAAGGACAGGTTGGAATCGATGGACGAGGTTTATCGTGGACATAAAATGGAGTATGACAAACTGACCACTAACCTTGCGGACACTGCGGAAAGCATTGATGAGTGTGATGGGAAATCGGCCAGCTTGGAAGAACGATACCGGTTCTTCCAAGAAATGAGGGGGTATGTGAGAGACTTGGTTGAATGTCTAAATGAGAAGGTTCCAATTATCAACGATCTTGAGCTTCGTCTGTTCAACCTGATGAAAACAAGGGCAGATAAGCTACTGCAGCGTCGACAACAAGACGTTCGAGACCAGTGCCAGGACTACATGACAAGCAAGACTGTTAAAGTTGTGATGGGGACCAAGGAAGAGCATGCCAAACAGCGAAGAGTTGCGGAAAGAGAAGCTAGAAGGTCTCGAAGGCGTCGACAAAGAGAATCGAAGGATATCCGAGGCCACCATGACGGTTTATCATCAGATGATGAAGAGAATCAGTCGGATGTTTCTAAGTTCACATTAGAGAAAGATAACATTATGCAAGTTGCTGGTCAACTGTTTAATGATGTAGTGGATGACTTCAGTGAACTGGAATGTGTGCGTAGAGAGTTTGAAAAATGGAAATTCACTTACCGAGATACGTACCAGGAAGCATACATAGGTCTCTGCCTGCCTAAACTGATGAATCCATTTATACGACTACAACTGCTCAGATGGAAGCCTCTTGAGGAAAATTGTATCGATTTTGAAGAGGCCAAATGGTACAACTGTCTGGTGTTTCTGGGATCCACTGATGACGAAGCCATTTCCCTGGATGATGATGACATCAAAATATTGCCTGCCGTTGTTGATAAAATACTTATTCCCAAGCTCACAACTATGGTTGAATCTGTCTGGGATCCACTGTCGACAACACAAACATCTCGACTAGTAAATCTTGTCCAGAAGCTTATCAAAGATTATCCCACAGTTCGCGGAGATTCCAAAAACACACAGGCTTTGTTGAAGGCTGCAGTGACAAGGATGAGAAAAACATTAGATGATGATGTGTTTATGCCAATGTATCCTAAACCGGTACTTGAAAATCGAATGTCTGGACCAGCAGTGTTTTTCCACAGACAATCTTGGACCTGCATTAAGCTGCTTGGTAATTTCTTGTCGTGGCATGGAATAGTGTCAACGAGTGTGCTGCAGAATCTGGCGCTGGACGGGCTGCTCAACCGATACATTATTTTCAGTCTGCACAACTCCTTCATTAACAAAGAAGCTCTGAGCAAGTGCCAGACTATCGTATCCACATTTCCGAGGGAGTGGTTTACCACCGGTATGGAAAACACAGACAAGACGATTCCACAGCTAGAGAACTTATGTCGATACCTCAAGGCTTATGCCGAATCACTGCATAAGAGTACCATGCTAGCAAAAGACTCGGAGAGACTGGAAGCAAGGGAACACATAAAGCAAATCAGTAAACTGCTTGTGAATATTCATGCCTTGGACCATGCACTGTTGATGTCCAACCAATACAGCTTCAAGCTTTCTTAGCCCAGTTTAGTAGTTGACAGTCTATATACTGAACAGTGAGTAATATCGTCCAGTGATCTGCCCGGATCCATGTACTGTAGTGCAATTTGACTTGATGTCATGTATGCAGATTACAGGACGAGTCACGAAATTGAAGTAATCAAAGGTACACATCAAAAGACTTGGCAAAAATTGTTTTCATGTTGAACAGTATATCAAGGATTGTGTGTTTGATTAAGTATTGTACGAGAAATGTCAACATATTTTGATTTCATTTTGTGCTCTTTTGATAAAAGAGAGCCGAGTCATTGACAGACATGATGCATAAAAGTGAGATTGGCTGAATATTTGGACATAATAATAATATATTGTTCCAGGGTATTACAAGATGTGTTCAGGACTGTTCCACAATTAACCACACGAGGGAGTGTAGGAGGCAGTTATTTGGTGTATGCACCACTCACAAAATTTAATTTCTTTTCCACATCACCTGTCCTCTAGCTAGTGCATATTCCCGTATGAGTAGTGAAGGAAGCCACGTGACCAGAAGAAGAGGGAGCATACAGTAGAAGAATTTTAGGACATCCCATTTGCTGTTTGAATGTTCGGACCAGACTATTACTCATATGGGAATATGCAATAGTTTGAAGACAGGTGATGTATCTATAAAAGAGAAAACACCTCATGTTTTCTCCATTTTATTGAAGCCATGTATGTATATTGTAGCAGACCTACCAGGCATCAAATAAGAATTACTGCCATTTCTCCCGTCCAGAACCCCCCCCCCCCCTCTGAGTTATCACTTCTGGAATAGTCCTCAACATTGTGTTGTGTCAACATGGTGATCGACTCATCAGGTTGTTTGGAGTCCATATCACTGTTGATAAATGTCATACGAGGTGAAGATAAAGCAATTGATCATTCCACTTTTGTTATCACATAACAAAACAAATCCATTTGCACATTCACGAAAATCAGATGTTCTGAATCAGTTATCATTAATAAGTATCAGTAAGACAATTTTGATTTTTCTTCAATGAAGAGGTCATTTCCAAAATGCTATATAATATCCATTTTCAGCATTTTAAGAGAGAAACTTGGTTTCGCTGGAACATGACTTGGTGTATATCACACAATGCAGAGTTTTACTATTTTATTCAGTGGGCATAGATTGCATTTTGATGAAAACTTCATTATCATATTGTTAAGTTGTTCTAACATTAGTATACCTTCACTACCAACTCCAAAATGTGAAAATTGGCATATATATATTTTTATTGTTTTTTTGAAAATGAACTCCTTAAATGTTTCCAACCATATCACTGTACATTAATGATAACCACAGTATTTTATTATATATACTAAAACGCAAAAGAAACGCAGGTTCTCATTAAATTGGATATAAAATATTAAAAAAACAAAACGAAATGAAGATTTCAACATTTATTTTGGAGCTACACCAATTCGGCACACATTGGTGTTGGAAATGTTTGATTGAATTCCTTTTTGGCTATTGTTTCATGTCATAAAGTAGGGTGGGGGTCCATGTTAAAAATGTGAAAGAGACGACCTGTAGCATTGTCAAAGTCAGTATCGCGTGTGACCACCCTGGGCATTCAAACAGGCAGTGCAACGTCTCCTCATTGAGTTGACAAGCCGTTGAAAGAATGCCTGAGGGAGTGAGTTCCATTCATGGACCAATGCTGCCTCCAGCGCCTGCATATTCTGAGGTTGTCCGCGAGCCTGAAGGCGACATCCGATTTCATCCCAGACGTGTTCGATAGGCGCCATGTCCGGTGATAAGGCTGGCCACGGCAACGTTGGGATGTTGTGCTGAGCCAGCAACGCCTGTGTTGCCCTGGCAGTGTGCGGCCTGGCATTGTCTTGCTGCAGCAAGCGCACACGTGGGTGAGCGGCAAAGAAGGGAACGACGTGATTGTTGATGACGTCATTTTGGTACACGGCGGCATTAACGCGTTGTCTGAACACATGAAGTTGTGTTCTGTGGTTGAATGAGAACCCACCCCACACCATCACACTACCCCCGCCCCATCGGTCGGCCTGCAGAACGCAGCAGTCGGAGTAACGTTCATGTCGACGTCGCCATACTCGGATTCGGCCATCAGCGTTGGAAAGATTGTAACGGCTCTCATCAGTAAACAGAACTTGTTGCCACTGGCCACATCGCCATCTTTGATGTTGTTGCGCCCACTGTTGACGTTGTTGGCGGTGCCGAGGGGTCAATATTGGTCCCACATAAGGACGGCGGTTACGGAGTCCTGCTGCCCTCAGACGGCGTCGGAGGGTATCGGCGGACACTGGACCACGTGGACCACGCACCTGGTGAGCGGTGTTAGCTGCTGGCAGCATCCGATTCCTAAGGTGGGTCACCCGGATGTACCGGTCTAGGGCTGCGGTTGTCACCCTCGGGCGGGCGGTGCGTGGTCGATCGTTCACAGATCCAGTGATTTGGTGACATTGAGAAAGGCGTCCGA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Transcript

ctg671-4.10-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
Transcription Factors Family	GCFC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07842	GCFC	GC-rich sequence DNA-binding factor-like protein	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR012890	Family	Intron Large complex component GCFC2-like	Interproscan
IPR022783	Domain	GCF, C-terminal	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12214	GC-RICH SEQUENCE DNA-BINDING FACTOR	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000398	Biological Process	mRNA splicing, via spliceosome	Interproscan
GO:0003677	Molecular Function	DNA binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg671-4.10-1 global RNA-seq network