Gene detail

Detailed information of ctg64-5.10-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg64-5.10-1	CHARGED MULTIVESICULAR BODY PROTEIN	chr10	18354528	18369643	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg64-5.10-1

CTAACTGCTGGAAACTACAGAGACGAAGAAAGAGGAAATTAAACGGAACAGAGAATGCGCATGTCTGTCAAATACGGAAGTTTTTAGATCTCTGTTTTTATGTTGAAATTTTAATGTCATGTGAAAATTGTAACATTTAGATTATAAAATAACCAAAATGGGACTTTTCGGTAAAGGTCAAGAAAAGTCGCCAAAAGACATGGTTACAGAGTGGACTCATGGTATTAGAAAAGAAGGTTACAAACTTGACAGACAGATTAAATCAATACAGAGAGAGCAAGAAAAATCGAAACGGATGTTGAAAGATTCTGCAAAGAAAGGTGAAAGGGAATCATGTGTCATATTAGCCAAGGAAATTGTGAAGTCAAATAAGGTTGTCAACAAACTTTATGTATCCAAAGCTCAGCTCAGTTCAATACAGATGCAGATGAAAAACCAGCTAGCCACACTAAGGATGGCAGGATCACTGGAAAAGAGTGCGGATGTCATGAAGAGCATGCAGCAGCTGGTCAAGGTACCCGAATTGCAGGCCACCATGAGAGAAATGCAGAAAGAAATGATGAGGGCTGGAATCATCGAGGAGATGCTTGATGATACAATGGAGTCTGTGATGGATGATGCTGAACTGGACGACGAGGCTGAGGAGGAGGTTGAAAAAATGCTCTTTGATCTTACCGCAGGTGCACTTGGCAATGCCCCTGCTGCTGTGAAGGATTCTCTCCCAACTGGTGAACTAGAGGGAGCCACTGCATCCACATCTGCACCTGCAGAAGAATCTGATGAAGAGATGGAGTCCATGAAAGCCAGATTAGAATCTCTCAGAAGCTAGTGAAACCAGATATTTCCCAAAATAAACTTTTGAGCTACTTACTGTATAATGTCACTGAGAGGCATTTGGGATTATTTTGTGAGAGAATTGTTGAGAGTATTTCATAATGTCTCTGTCTTTAATTTCAAACAGTTCTCTTGTAATTTTATCAGATCATGTTCATACTCTGAAAGCAAAGTAGACTGAAAACAAGGAATTACTGTAAGTTTGAATGACCAAATATGGTTACATAGTGATAGACCATATCTAAAATATTTTAATCATTTAGAAATTAAGGGTCAGAAGTAAGTTACTTAATTGTAATTTTTTTAAAAATTATTCTGATACATGATATGTCATTTATTATCAATACTGAATGCCAATTATTGGTCTCTTAAGTACTTAAAATTATGCCAACCACTAAGTTACTGTCAGTTATCGGTGAAGAGACAGAATCTGGTGTATTCTCATCTTTATAGACTTTGGCACTAATTATTCCTAAAGTTGCCTGAAAAAAGGGAATTGGGCGGTTTTTTGAAAGTGGGTGTATGAATATTTCCCGTCTTCATTTTGAACCTTCATTGTGAAATAATTGTCCATACATAAAACATCCTTATGTGTTTGATAAATGCACATATCACCAAGTTTTTCGGCTCATAATACCTACAACTAAAGCAATTGCATTTCTGAAGCAGCAGGTTGTTAAGATGGCAATAGCAGGGTTCAGATTTAACCACAGCACCGACAGAAAGAGCCATAGTTTTCCTCCTTACTTGTCACTGTGTCCCGGAAAATCTGAAGTGGTCAATGGCAAGAAAAATCCTGGGGTGTCCTAATTGATTTGCCACCATGTACTTTCCATAGGGTGATGTCATTTTTGTCTGAGAAAACTTCATAGAATGTAACCTGCTTTTGTGCTCCTCTTTTTAAAGGAAAATTTTGCCTTAATGCCCCTCCAATTTGCCTTGATGCCCTAATTTGTGTTATTAAACCAAAGGCAACACATGTCGTGCCCCACCCCAACCCCACCCCCACTTTTTATTTTTATTTGATTCCTGTACTGGGATACAGTAATATCTGTTGTATCTTTTTATAAAGATGTCTCATTATATTTCAGTTATGTCCATATACAGGGCTTGAAATAGGAAGTAAAATATGGCCTGCTGGGGTTTTTTTTGAAATAGCATGTCAAAGAAATATTTCCTGCTAAGAAAAAATTATAGCCTGCTGGAAATAAGATAGCATGGGGTGAAGGGAGCGTTTGGAATAGTGAGAAATTTTAGGACTGCTGAGATGTGCTTTAGACCATTATGGAATTAACATATAAAATAATCACGAGCTAAGTAGCAGATAAGATAATCATTAAAAATTACCTGCAATTGTTTTGTGGTTTTAGCAGGTGAATTTTTACTTCACCTGCTAGACCTGAAAAAAAAATGCATTGCTTTTCAATTTTCGAGCCCTGATCTGTCATTCTTATTACTGTTTCAGTCAAAAGTTAGATTTCTGAAGATGACTTCACAAAACATGTATTCAGTGTAGTTTATGTCATTCGGTATGAACTGTAAATATGTATAACTTAAATATTTATCATTGTGTACTTTTTCATTGTACATATAAAAATCCATTTAAATGTATTTTTTCCTTGTACTTGTAAAGCATGTTATGAATTATTCGAAGGAACAGACAGAATTATAATTTTATGAAACTATCTGTATGGAACTACTTTTTATTTATCATCTTGAAGTAGTTGAAAGCAAATTGGTATGAACTATGACAGACAGAATGATTTGGGGGGGTGGGGGTAGGGAGAACCATACTGCTGTTCACTTATAGTTTACAGAGCTGTGTTAGGATCTCAACATAGCCTTTTCTGTAGAAATAACCAGAGCCGGTTTAAGGATCCGCGGGGCCTGTAGTACAAATAGCAGTGGGAACTCCTTCCCAGAATATATATTTTGCAACCCCCTTGGGGAGAGGGGGAAAAATAAATCTACACGTCACCGCAGGGCCCATAGCACATGCTACATGTGCTACTAGGATAAACCAGTACTGGAAATAACCTACAATACAGGCATGTATGAAGAAAACTTGATGTTCAAAAAAAAAATACTGGTCATGACTGTTGACTACATAAAATATTGTGGTGAAGTGTAAAGTTGTTTATTTTGTTTTATCCTGCAACCACGTTTTTTTATTGGTCAATTCATGCTGACTGATTGAAGCAAAATCATAAACGTATACTAGCAGATTATAACTTATACGGTCGTGCATGTGACGTGACATGCATAGATACATTACAAAATTGCTCATTTGACTTTTAGGTCATGGTACAATGTAGCTGAAATAATATAATTTAATAATAGCTTTACCACTTATTTTTATGGACTGCAAGATAAAAATAACTAATTAATAACGTAGGATATCGACTTTATTCTGTTCTGATCGAATGGTAAATTTCACATTCTTACCTTTACAGGTCATTAACTAGTTATTCTCTATATCTGTATTGTTGTGGTTTTTGTATGTTTACTCTGAGATCACTGTGGGAGGTGTTCACTACAGGCCTCTGGAAATGTGGGAATTATCCTTTTGCCTGTCACTAACAAGTGTTAGTTTTGTGTAACTAATTTTTAGTGCACCTCATGAAAATGAGGATATGAAGAGTTCATATCCAAAATACTATATATATATTAGCGTATATCATGTTTTGGAGGAACTTTGTTATGGACATACTGTTCTAATTGAATTTGTTGATAGTGTATATAAATATAAGTATATACATGCAATTTTTTTAATGAATTAAAAAAAATATTCATCTTATTTTTTAACTCCAGTATTGTAGAAGATGTGCTATAACAAACTAATGGTACATTGTCAATGTCCTTTTTGACACCATGATAAAAAAATAAAGTTGCTGTTGGCATCATGGTTTTATAATACTGGTTTCCCTCTACGTATTATTATTATTTATTACGATGAAATCCAATTTGGTTTAACAGCAGTATTTTTTCATAGGGAAAAAATATATATATAATTAATATTTGTCGATTAATCTACAAAATATTTTTAAATACTGGCATGGAACCGATTACTAATGGCACTGTTCACATGGTTTGACATGGTTATCATTTACAGAGTTTATTAGCATTGTATTTATTATTAATTATTGACTATTAATTAGCAGGGTTAAAAATAGCAGTCGCCCCCGTGGTGACCTTTATTGGCATGGGGCGACTAAGAATTTTACAAAGATAGTCCATTGGGCGACCATCGATTTTAGAATCTGGCAAGTATGGTGCCAATTAATAAAGAAATGCACTAAAACTGAATCAAATGTGACAAAATACACCGCATTTTTGCTGGCGTGAATTACATATGGCAGCAGAAGACATAGTACATGAAACATGAAATAAGAACAGATCAGATCTAAAGACTTACATGATGACATAACCGTCCAAAGATTACTGTAATAAACAATACGTTCGCTTTTATGCTTTGTAATATGATAAAAAAATATATATATATTGGTAAAATGTTTTTGATTTTTTTTATTGATTTTTTTGTTTCAGTTGTGATTTTATTTGTAGCCTACTACTGTAGAATTTACAATATCCAAATTAAATGCACACGTGTGTGTGCACCAACACAGACACACACCTTTTGGGGGAAAAAGTTCAGTGTAATTTAAAAAGAAAATTCTTACAAATTACCATCAAACTGCATAGGTTAAATCTTCTTTTCTGATACCTGTTAAGGCAATTTTAAGGCTAGGTAATCTGAAGGACAAAAAACATTTTGCACAATGCAGAGCCGAATGGGCATTTGGCAAAATAGTGGATGATTCCATGAATTTTATCCCTCTTGCATCGCTACAAAGTTTATTCCACCCCCTTGTATCACCATGTAGAGGATTGCCACTTTTACTTAAGCTGCATACCGTTCTAGCATTTTATCTTCACCCCTGTATTAAAAATGAGACTGAATCTGTATACAGTATAATGGTAAAACGTTTTATTTATACTGGATTTTTTTTTTTTTAATATGTTATTTAAGTTGGTATGGGTTTAAAACCTAATAACATGCTTTTATATGAATTTTAACTTTATTCATTTATTTATTATCAGTTTCCTTTTGACACAGACTGTATACGGTGAGCACATGGTTATTAATTAACAAAGAAAATTCTAAT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Transcript

ctg64-5.10-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03357	Snf7	Snf7	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR005024	Family	Snf7 family	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10476	CHARGED MULTIVESICULAR BODY PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000815	Cellular Component	ESCRT III complex	Interproscan
GO:0005771	Cellular Component	multivesicular body	Interproscan
GO:0007034	Biological Process	vacuolar transport	Interproscan
GO:0015031	Biological Process	protein transport	Interproscan
GO:0032509	Biological Process	endosome transport via multivesicular body sorting pathway	Interproscan
GO:0045324	Biological Process	late endosome to vacuole transport	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg64-5.10-1 global RNA-seq network