Gene detail

Detailed information of ctg57-5.5-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg57-5.5-1	CONNECTIVE TISSUE GROWTH FACTOR-RELATED	chr4	89118046	89143180	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg57-5.5-1

ATGTTAGTGATGACCTTGGTGTCCAAGATCTTGGGTGTGCAGTCATTCGATATATCCGGAGATTCGGGAAGCTACAACCTGAACGCGACGAATGTCACTCAGACGTCGGTGTACCTCACGTGGATGGACTTCAAGCCAGCGAACTACGAACACGAGTACAGTCTAATGAAAACCGAACACCAGTACAAGGAGAACCTGTCTGATTGGCTAACGATCCAGTGTGACACGGATCCACAGTTTGAGTATGTTAATCTGGAACCCGATACTTGGTATTTCTTTAAAGTTGGAGTGTGGCTCGACCCTTTCAACCACATATACGCAAACATTTCCGAGGCACTCATGGTTAAAACCAAAGCTGTTGAGTACTGCACTCATAACGGGGTAAAGTATGAGGTCGGTCACACGTTTGACAACAACTGTGAACAGCGATGCACGTGCCGAGAGAACGGTCAGTTCAACTGTACAGACCTGTGTGAGGAGCAGGTGTTCCCCGACCCACAAGACAGAGTCGGCTGTGAGATCGTCAGGGGAGAAGGCGAGAATTGCTGCCAGCTCAAACTCGTGTGTGAACACGAGCCATGTAACGTGAGTGGGACGATATACCGTCATGGTATGGAGTTTCAGATTGGCTGTAAGACGTGCCAGTGTAATGACGGCAGGGAGAGCTGTGCTTACCCAGAAAACTGCTCCAGACCGGAAACCGGAAGCCAGTGTCCCCACCCTCAAGAAATACCGGTCGCCGGGCAGTGCTGTCCACAGTGGAGCTGTGGTAACCGCACGTGTCGCTACCACGGCGTCGTGCACGCGTACGGCGACGAGTGGATGGACGAGGAGAAGTGTCAGCTGTGTAGCTGCGGGGAGGAGGTCGTCTGTGAAGACGTCTGTGTCGAGCCCGTCGTGCCCGACAACTGCACGTCGCCCGTCACCAAACGAGCTCCTACCGGCTGCTGTAACGTCGTCGAGTGTCTGCCGCCTGACTTAAAAAGTATCATACGAGATCTGTTTGGAACTTCGTACAGCCCTCATTCTGTTACACTGAGTTTCAACGTCGTTACGAAACAACGCACCCCTCCTGCCCACAGTTTTGAGATTCTGTATGTGAGCAGCGAGAATATCACCACCAACCTAACACACGGCTGGCACAAAACGACCTTCACCCCTGAGTACGTGCACAGCGAGGACGAGCCGCTGATGTCGCCGACGGAACTCCTGCAAACGACAGGCGCGATCCGGGCAGAGCGGCGCATCTACGTGACCATTTCCGGTATGAAGGCGGACACGACCTACTTTTTCAAGATCCGGTCAGTCAGCTCGGAGGAACACGATGATGAAACAGTAGGAGTGGAGTCTGGCTTTGCTGGGGCTATAGCTGTGAAGACACTCGCAACAGACGAGCCGTTGACGTGTACAGACCGGTGTCCAAGTGCCGAGGTGATCATGGTGCCGTCTGCTTCCTGTCCAAGGCCCGTCCTCGTGCAGGCCAACCACACGTGCTGTCCAGAGTGGAAGTGTTTCCCTAAAGACTCCGGCTGCCGTTATAAGAACCTGGTTCTCCAGCATGGCGAGCAGATACGTGAAGGCTGTGACAAGCGCTGTCGCTGTGACAGTGGGAAGATGATCTGTTCTAGCATCTGTCCAGAGATGGACCATACTCCACGACCCGGATGTCAGCTGAAGATGTTAGCGGATCACTGTTGTCCTCTCTGGATGTGTACACCATTTGAGGCTGAAATTGCACAGACACAAAACACAATTCGTTTGAACGTATCTTTGTCAACCGTCGAGGTCTCTACAGATTCTGCCATTTTGAAATGGGATCCATTGGATATTAACGTCATTAATTACGTCACCGGTCTGCAAATCGAGTACAAGGAAAAACACTACAGCAATTGGAACCAGTCTAGTCAGATGGACCCCCACGTGACCAGACACACACTGACGCGTCTACAGGCTGCCAGAACTTACAAAGCTAGACTAGTTCTCCTGATGGACATGGAGAAGAATAATCGGGTATCGGTGTCCATGTTGGAATTTATGACGAAGTCATACGGGCGTGAGTATACCAACGATTATGTAGTATCTCCCTTGGGAATAAACATCAACCTACAGGAGATATCAGTGAGCGACACGTCAGTATCTATTACGTGGTCGCCGCTGTCGCCGTGGATCCAGAAGCTGATATCGGCCATGCAGGTGACCTACAGCGACAGCAACGACACGGACGAGAAGAGCAAGCAGCTGAAGGTGGTCAGTTCCACGTGCGTCCTAGATGGGCTGGCCCCAGGGACGAACTACGCTGCGCGGGTGGAGGTCTTGTTTAGGAACGGCTCTGTGGCCAGATCCAGCACGATCCATTTTGTTACTGGTACAGCAACTGCAAACACGCCCCAGAGTGTCCTGATACCATTGGTCGTGTCCGCTGTGGTTGTCGTCTGCGCCATCGCAATTGTGTTGGTCACGTGCTGTCTGTGGAGACGGGCAAAGCTCGCGCAGTCTCGTGACACGTCGTTTGAAAACAAGACATTTGGGGTTGATTCACATGGAAAACGATGGAAAGATACTTTCGGCAAAGCCATGATGATGACGTCACGTAGAGTAGAATACATCTCAGACAGAGACGACGGATGTTTCGAGACGAAGCTAGCAATTACGTTTCTAATCCTTGGCACACAATTACCAATTAATTTTGACTCGTCATTTGCGTCGGCGTTCATCGGCAGGTGCGTTCAAGGCAAAGACGCGACAGTCGCGTTTAATCGCTAATTTGTGCCCGATTAAACTGTTGGTTGGTGAGTGCAGCTGCACATTTTCAGACTAGTGCTGACGCGACAGTCAAATCGGCGTTAATCGGTAGGTGTACGCCAAACATTAGGCAAAAAAACCCCAACGAAGCTGGATCTGGGTCTTGCGAGTCTGGCAAAGATAAAATGTCTGGTGTGTTTTGACGTCTGGGTCGACAACTGTAAAATTCTATCAGTATATAATAACTATCAGTATATAATAACAGTGTTCATATCTTTAAGTATATTTTTTTACAGAAACACCAACAGTAATTATGAGAATTCCATATTGATTAATATATTAAGAACAATAAAAAAAGAGTAATTATAGCGCATGTTCTATGTCGTCTGTCGCCAGATGTGCAGATCTCAATCGATACAGTGCGTTCCCTTTTCGACTTGTATCATACTCGCCAGACCAAGACCCATATATGAATACATGGGTTATGATTCGTTAACAGTCTCCCGAAATGTCCGTATCGTAGTAATTTTTACCTTATTGAAATGAAAACGCATGCGTGAGCAGCAGTGTTAGGTACGAGTAGTATTTGGTTGTCAATAATGCATATAGTGAGTACCAGAATTATGCGAGTCCTAACATGTATAGCTCATGTCAGTTATGAACGTCAGTCAAATAATGACATTATTTAAATAAGAGGTGGAAACGAAACCGAGAATATAAATACTAATTAGTTAATGTGTTATCGAATACCAGCTAGGTAATATCAGTCTTCGTTTCGTTGGAGATCGTTCACGGTCGACATGAAAGGACTGTTCTGAGTGTGCATTCATTGTAATAAAAATGTCGACAAACAGAACCCTTTTTTGGTGACTAAATGTTAGTGTCTGTATTTAAAAACAAGGTGTTTGTTGTCGTCCTAATGTTTGTAGTAGCACAAACCAGAAGTTACTTCCTAACAATTTTGTATGTACGAAAAAATATTTATTACGACGTAAAATAAAAACTGATTTCTGCAAACATTAACACACGACCACAATCACATTGGATATACTCACCCTGGTATTCTAAACACGAACATACATGTAACATCTAATTTTATCTTTACAAATACTCTGTTAGTCGGAAACATCTTATAATTACTTCAAACTCAGGACAGTCCCGTTAATATTCGAACATTCAGTCTCTGTGTATAATTCAACTAGGATTAAAACTACTCTCGTATAAAGATCCTATTTACATCCGTGGATTGGTGAACGTTTTAAGAGAATTGAACTATACTGAGTTTGTAGCCATTAAAATAGTGCATTGTTTTACTAATATGTAATATATCTGAGCAATAAAACTTATAAAAAAAATTGAAATGCCGATTTTTCAAGCATTACAATGATAAAAACAAAAATACAAGGGTCAAAATGCACCAAAAAACGACCAATGGGACTGTCTTTACTGGTCATAACCCGCAAAGGCGGGGTGGTCTTAATACCGGGGTAGTTTTACCTATTAAAATAAGGAAATATTCCAGTCTTTTAAAAAAGTGGTTTTAATAGCGGAGTGGTCTTAATTACGGGATGGTCGTTAGGCGGGGTTTCATTGTATATTATATTTAAAACTTAAAACAGTATGTATTGACCGAAAACGTGTTATAGTGGCTACAAACTCAAGAGTCGTATTTTTATTGTAATGATGTCATTTGATGACAAAGTGATCACTGCCCGTTCAAATTTGTGGATGTCGTCTTGGTAACCATCAAAGATTATAAAGATTCTTCAGTGTGTAATTCCATCTACTGTAGACATTGAGATTTATCATATTTCACATCATTTAAATATTTTTATAACAGTAAATAATGAATGCTGTGTGATTGTGAAGTGCCGCCTATTGGTCACGCCAGGCTGTTTATATTTAGAAATGAGTGCCTGTTAACAGGTGTATAAAGGTATGCAGTTTGATTATATTTGTTAGTATGAACATTTAATATGAACTGTATTTTTGGATAGTTAATGTTTTAATTTAAACAATTTAAAGAACAAAGTAAAACTTTGGTTGAAAAACTAAAAACGAAAGCATTTTTAATCGCATGCATTGGTTTATTTATTTCTGTATATTTTTTATTTATTCTCTTACAAATATATTCGTTCTGTGTTTCTTGCATAAATGTTTATGTTCTTTTATTATACGATGATGGAATGTTATTACTTTGATGAAAGGCTTTATTACTTAAAGATATCAGTATTGTTATGTGTGGTATTTGTTCACAA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Transcript

ctg57-5.5-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00041	fn3	Fibronectin type III domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001007	Domain	VWFC domain	Interproscan
IPR003961	Domain	Fibronectin type III	Interproscan
IPR013783	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like fold	Interproscan
IPR036116	Homologous_superfamily	Fibronectin type III superfamily	Interproscan
IPR050941	Family	Cellular Communication Network Factor	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11348	CONNECTIVE TISSUE GROWTH FACTOR-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005178	Molecular Function	integrin binding	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0007155	Biological Process	cell adhesion	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan
GO:0008201	Molecular Function	heparin binding	Interproscan
GO:0031012	Cellular Component	extracellular matrix	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg57-5.5-1 global RNA-seq network