Gene detail

Detailed information of ctg493-3.10-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg493-3.10-1	ACYL-COA-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 6	chr10	73523875	73546128	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg493-3.10-1

AGCAGCAAAAACCCAGAATGGCAGATGACGTTGATGCAAATAAATTAGAAAGTTTATTTAAATCGGCTTCAGGCTATGTCAGACTGATTGCTGCAAAATTAGAATCAGATAAACTGTTATATCTTTATGCCCGATTTAAGCAGGTTTCAGTTAATTTATTTTTCAACCATACTTGGGAGGCGTGGAAAAAGTTGGGTAGCATGACTAAGTCTCAGGCCATGATGGAGTATGTGACCCTTGTAAATAACATTGCACCGGAATGGAATGAAAAGGCAAAGAATGTTACAGAAGAAAAGAAACCTGGAGGTTTGGGTGTTGCTGTCAGCACAATGTATAACCCTGATGATGACATATCCGATGATCAAAAAAACGTCTTTGATTGGTGTAAAGAAGGCAACGTTGAGCAGGTGAAAAGATACCTGATAAAGAAGACAAACAGTGTGGACTCGCTCGATGATATGGGTCTTGCTCTGATGCATTGGGCCAGTGACCGTGGTTACATGTTGATGGTGGAATTGTTGTTATCCCTGCAAGCTGCAGTAGACATCAAGGATGTGGATGGACAAACACCTTTACATTATGCTGTATCCTGTGAACACACTGATGTGGTGGAGGTTTTGCTTGGTCATCGAGCCGATGTAACAGTTAAAGACAATGAAGGGTTATCCCCCCTGGACTGTGCTTCAGAAACCTTGATACCCATCTTGCAAGCCACGGTTAAAGCTAGTTCTTGATAGAAACCGTTACCATAGCAAATGCAGATCTGGTTATCTGTTGCAGTTTGTACTAAACCATCACACGGTCGTTTGAGCACTTGATATTTCTGTGTACATATTTAATACCATTTGTTTTAAAATGATAGATATTTTGTCATATGTTAAATAATATTTCACAGCAGTTGTAATTTTGTGTCATGAATGTATCTGTATTCTTTTCAGTAGCAGCACAATCAAAGTTAAATTTGTTTGCATGCTTCAGTTACATATTGAAAAAAAACAAAACAAAAAAAACTGAAGTTTGTGTCAAACTGGGAAGCTGTGTTATTATTCAATTTGTAGACTGTATAAAATGTTCACAACTGAACTTTATATTATATATTATATTACTGGTACTATACAAAATTTAAATAAAGGAACAGGTTTCATAAAACACACAGTTATAATTGAATTCCAATTTTTTCATTTCCAATAATTTGGTACATGTTCATCTTCAACAATTCATGATTTATGGTTGAATTTCGACTATGTAGCATGGTCAAATTTAAATGTATTTACATACTTTAGTATTTAAAAAGAAAGAAAAAGAAAGAACTACAGGTTTTGCCTCCGTCTGTCTGATTATTCATCCTTCTGTCTGTTCATCTCTTGCATATATAGTTTTCCAGGTTTTTGTTTGAGCTGAATTTCTTTTCTGTTTTTCCCTTTTTGTATTTAAAAAAAATAATTAGATCTCAGTATGTTGAGGCATTACCCCAAAAAGTCCTCTAGCTTTATCGTATAAAGTTACACATCAAGTTTGACTCTCATGAGGATTGGCCCATTTTCACAGAGGTATGATACATATATAACTTGGGAGATATTGAAAATGTTTGTTGGGGACGGTAGACGATATGTATTGTATTGCGTCAGCAGTACTGTCACAATGCTTGTCCTGCAAAGGAATATTGATGTAATGATCCCTCAGCACAAGGTCTTGAGCTGCAGTCTCGGTAATATTTTTATTATTGAACATAGAATAAGCACGTTTAGAATAGACCATCACATGCCATTTGTTGATAACATTTAACCATACTGACTACATGTTTCTACATCACACAAACAATGTATTATTTTCAGTTTTAAAAGTTAAAAGCTGGCTCCTATTTCCCTGGTTTGTCTTATAACAAATTTGGCAACAGACTTATATGTTGTATAAAGGCCGCTGACAATAGCTTGATTAGAATTTCTATTATGGAAAATTGAAAAATGTGTTCTTATTGTTGAATTTAATTTTTGAAACGGAGATCCTCACATTGGGCATGTCTACCCACTACCCAGCATTTTTAACCAATTTAGTCTTTTTGCCTAGCAATAATGTTTAGTCAGTGTGCCACTAATTTTTCCAAAAATACAAAAGTCACCTGAAATAATGGGAAAACTGAATAAAAATAACCCAGGATGCATTTTTAAAAAAATATACATTGGGGGAGCATGGCCTTAGACTCCCACTCCTAAAATTATCACTGGATTTGCCAGCTCACTTGTGTCCAGCATTCAAGATTGTCTAGGCACAATCCAATGGCGTTTTCAGGAGGGCCAGCACTTGTCATTGCTCACTAAACTGGTGTTTACATCCAACATTAAATTAATGTGATTTGATAGAGCACTACGGTACCAGTCAAATTGTTTGCCAGCACTCGCCCTCTTGTACCCACCTTTAGTGTCATTTTATGCAAACCTTGACATTATCTTGTGTACTTAAATGTACATTGAATATAAATTTGTGTTTTTGGGCTAAACATTAATTTGTTCATTTTTACTGAAACAGAAATCGTTTTTATTTAATAATTCAAGAAACAAAAATATTTAAAAGACAAGCACTTCTTCTGACAGAAGTTGTTTAACAATTTGTTTACATTTTATTTTAACTACAGTGCTGTTTATAATATGGAATTGATTTGTCCAGCATGGTTTTGGGGTTTTGTAACCTAAACACATACTGTAAATTCTGTGTTGTGACAAGAATTGTGAAATAATCTATAAAATAAATATTTAATAGCAAGCAAAAAGATATAACAATTAGATAATGATAATTTGTTTTGCTACTTTTGAATGTTTTCCATAATAATAATTACTTATTATCCAAGTTGTTAATTTTTCACTTGTTAATATACATTTATATCCACAGTAAATACTTTTCAAGTTAGAATTTGTTTGAATTTTTATGTGTGTAAAGGCATACTACATGTATACATTATGAACAATTTGTTTGGATTTACACATGTACATGTATTTGTCTGGTATATTTAAGTAAAGAGATGATGTTTTAATTTTAACAGAAAGTTGTTGGGGTTGTCTTTGTCATTATCCAGGGACGGGACGAAACCTAGTGGTAAAGCCTTGCCTGATCGATCCCCGTCAGTAGGACCATCAGGCTATTTCTTGTTCAAGCCAGTGCATGACTGGTATATCAAAGAATGTGGTATCTGCTATCCTGTCTTTGGGATGGTGCATATAAATGATCCCTTGCTACTAATTGAAAAATGTAGCGGGTTTCCTCTCTAAAAATAAGTCAGAATTACCAAGTGTTTGTCATTCAATAGCCAGTGAGGGACGCGATGTAGCCCAGTGGTAAAATGTTCTCTTGACGCACGGTCGGTTTAGGATCAATCCCCGTCGGTGGACCCACTGGGCTATTTCTCGCTCCAGCTAGTGCACCACGACTGGTTTATCAAAGGCTGTGGGATGGTGCATATAAAAGATCCCTTGCTGCTAATCGAAAAAAGTAGCTCATAAAGTGGCGACAGCGGGTTTCCTACCTCAATATCGATATAGTCCTTAACCATATGTCTGATGCCATATAACCGTCAATAAAATGTGTTGAGTTCATTGTTAAATAAAACATTTCCTTGCCTTTCAATAGCCGATGATTAAGAAATCAATGTGATCTAGTGGTGTCATTAATATAAAAAAACACCTTTAACGTTTTGTCATCATTCAAGTGTTAGACTACCATTTTCCCAACTGTGTATTATAATTTATATATATATATATATATCTGGTACTGTATAAATCTCTACAAGGATTCATAAAACACACAGTTATAATTGAATTACAGATTTTTCATTTCCAACGATTTGGTACATGGACACCTTTAGAAATTAATGATTTATTGTTCAATGTTGACTCTCTTCTCTTCTGTTTTTTTCTTGTTTGCTAAGAGGTTTTCTAATCTAGTTTGATTTTAAATTATGTTTGTGCTTATATATTTAAATAAGGTTCATGCACACGGTTCAACAAATAACATACAGATGAGGAAAATAAAGGACCATGTGTTATTTTAGACCACATTTAATTTACTGCTAGAGTAGATATGTCTGTATAAACTACAGAAATGTAAGAGCTGTTGGATTGCCTGCTAGTTAAACAGTTAAATTACTGATTCCCTTGATAAAGGTTTTGTTTGCAGTCAACAGTTGCTGTTGCTGTTTTTGTGTTCCATTATTTCGTTCCATAGCCTAGGCCTGAAGGTTTCCAGTACATGGAGATTTCTAGTGCATGGTGAGATACCGTCTTGGCAATGTCAGAAAGCACATTTTATTGAGTTCTTCTAAGGTCGTCATTGTGGCAAATGCAACCTTGCACCTTCTTATCAGTGCTTTATACTTGTAACCTTTATTGTGTTATAGGTTTTACAAAATAGCTCAACAAAATATGCCGCCTTACTGTCATCTGCAAGATCGTTTTGGTAATAATGTTTCGGATGACCTCAATTAAAATTTGACAAGTCTTATCATGTCGAAGATTAATTGGTACCTGCTGCATGTGTGCATCTTGCAAATTGTGTTTACAGCATTGCTCCATGACGGATCTTAATTCTAAAATCACAAAAGTTTAAACAAGGTTCAAAATTCAGACATTATGTTAAGTTTGGGGGGAGGGGGGGGTCTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTGTGGGGTTGGGTTTTTTATTTTGGTGGATTGACTGGTCATGGGGATGATTTTTTTTGTTGCTGTTGATTTTTTAGGATAGGTGTGTCATTGCAACTAGTGCTCCACGACTGGTGTAGCAAGTGCCAAGTATGTGTCGTCCTCTAAATGCGTGGTGCCTTATCTCTTCCTGCTGTCGGGGCGGGACGTAACCCAGTGGTAAAGTACTAGCCTGGTGCATGGTCGGTCTAGGATCGATTCCCGTCGGTGGGCCCATTGGGCTATTTCTCATTCTAGCCAGTGCACCACGACTGGTATATCAAAGGCCATGGTATGTGCTATCCTGTTTGGGATG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Transcript

ctg493-3.10-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00887	ACBP	Acyl CoA binding protein	Domain	Interproscan
PF12796	Ank_2	Ankyrin repeats (3 copies)	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000582	Domain	Acyl-CoA-binding protein, ACBP	Interproscan
IPR002110	Repeat	Ankyrin repeat	Interproscan
IPR014352	Homologous_superfamily	FERM/acyl-CoA-binding protein superfamily	Interproscan
IPR035984	Homologous_superfamily	Acyl-CoA binding protein superfamily	Interproscan
IPR036770	Homologous_superfamily	Ankyrin repeat-containing domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24119	ACYL-COA-BINDING DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 6	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000062	Molecular Function	fatty-acyl-CoA binding	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg493-3.10-1 global RNA-seq network