Gene detail

Detailed information of ctg483-11.7-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg483-11.7-1	PHOSPHOLIPASE A-2-ACTIVATING PROTEIN	chr6	58002635	58018289	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg483-11.7-1

ATGCTGGCCTTCTTGACGTCTTCCATCACGTCCATGTCAACCATGATCACACATCATCGGCGACAGGCTTATCTACGAAAATCTTCCCTGGATTCTCAGTGGAAGAAAGAGCTTTTAGCGCAACCTTGGTCGGCGTCCACTTTGTTTGCTGGTAAAACATCTGAGGTGGTTGCAGCAAACGACAAGGATCAGCAGTCCACAGCCACGGTGAAGGCCCTGCAGCTGATGACAACTCAGAGTCCAACAAGAGGAAGAATATGTTTGCGGGGACGAGGTTCAGGAAGTTACAGGCCTCCAGGATCAGTGTCTGCACAAGCCAGCTCTTACTTCCCCGTTTCAACATTTATTACATTCGACAATGCAGACCCTGCTAAAATTGTGGAAAAACTAAAGGAATTCAACAAGCGAATGGACGGTTGTTACAAAGTTGAAGATTCCAGTATCGACAGCTTGTCACTGCTGTTATCAGAAGATTCCACTACACCAGAACAGCTTGGTACTCTCAAAAGGATTCTGTCTTGGCCTCAGGATGTTTTCCCAGCTTTAGACATTTTGAGGATTATCATCAAACAACCTTGCGTCCTTCAATACTTCAACAGCCAATCCGATTTCCTGCCTGAACTTCTGAGATTCACATCTCCAGATGGACCGGTAGCCAATCAAATGCTTTCTCTGAGAGTTTTGGCCAACTTGTTCAGTCAGTCAGAAGGTCTGAACCTAGTCTACAGCAATAGATCAAATGTTCTGAAAGCAATCCTCAACTGCAAGATGTCGTCAAATAACAAGATTCATATTGCCATAGCAACAGTCTTGTTAAATATGGCTATAGCTGTGCGAGCCAAGGATGATCTTGACGGGAAGTCTGAATGTCTGTCAGGTGCACAGACTCTGTTACAAGTCCATCAAGACTCGGAAGCCATCTTCAGGACCCTGGTGTGTGTGGGAACAATAGTGTACAACGATGAAGAATCCATGGCCTTGGCTCTGTCACTCGACATTCCCAATCAAATCGCAAAGTGCAAATCTGTTCCAGAACCCAAGAAATTATCTGAATGTGCAAAGCAGATTTGTGATATATTAAACTGATATGGACGAATCCCAAAACAAGACTCTTAAAATTAGTTTTCTGATATATGTACATGTTAATGAAATTTCATTAAGTTATTTATTAAAATGTTTTTGTGATTAACAATTAATGTGCAACAATCTTTTTTTCTTCTTTTATATTAAAGTGATGTTGCTTTTATCCATGTGAATACACTGAAGCAATTAGAGGTAAAATTTAATCATATACCAAGGTAAATGTGCTTAAAAATAAAATAAAACCTGAAAAATAGAATGTAGTAGTACCAAATTGTTTTGTTGTGGTATATATGTAAATATATTATGTAACTTCTGCTTACCAATGACTTATTTTGTTAAACTTACATTTAAAGGAGTTGTTTTATAATTGCACAATTTACAGACCAAATGTAGGCTGTCATCTGTGGTTATTTGCTGTAGTCCGTGTTCATAGTCTTGGGAGGGGCAGGACAGCCCAGTCGGTGGGCCCATTCGGCTATTTCTCATTCCTGCCAGTGCACCACCACTGGTACATCAACAGCTGTGGTATGTGCTATCCTGTCTATGGGATGGTGCATATAAAATATCCCTTGGTACTAATGGAAAAATTCCTAAATATTTGACATGCAATAGCCGATGATCAATAAATCAATGTGCTCTAGTGGTGTCGTTAAAACAAACGTTTTTATAATCTTGGAAACAAAGATCTGATAATTCAAGAATGTTGGATTTTTTTCACAGTTGAACATGTAAAACACTAAGATAAAACAAATTTATATTAATTTATTTTCTTTGCAGACAATTTCTTTGGACTTTGTGTTAATGGTGATATTGCAGATGTTTGAAAGAATTGTAAATAATGGAAATAAAACAAGAACACAATAAAATGGCCACAGGAATACACTGATATCAGCATTGCAAACATATCTGGAAGATGTTGTGGAGGTTTGCTAAACTTGGCCACAACTGTTAGAACTGCAACTCCCAACATTGATGCTGTGAACTGAAATATAAAACAATGATTTACAATCAGTTGTGTATCTTCCCTGAATCCGTATTTGTATTCAGATCATACCTGTTTATATAAATTTATGAAATCAATTTTACTATAACAAAATTGAAAACACTGATGAATAATATTTCACAATTTTAATTTTGTTTTAATTATTGTAATATTCATACAAAATCATGCAGAAATGAGGTAATACTAGTAGCAAGATGCTAATTATATTCACTGATGTTAATCTAATTTGTGAGGTGACATTTTCAAGGTTATTTACTCACCAGAACAATTGTGATGACTTTTTGGTACTGCTTGCTGCCTGTTTGCTTCATGTAGGCAATGGAGGCAATAAAGAACAGACAGGTCAGACTGACGTACGGACTGAACAAACCATCCTTGATTAATAGTGGTAACATGCTGAAAAATAAATACATAAAACACTGGCATCTTTTGAGTAAAGTTCACTACTAAAGCAGCTTATTTACAATGGCTAAATCAACTTTTTAAAATTTCTGTCAAGATTCGTTTTGATAAACGGAATAGCATTTGCAAATACTTGATGTGTGGTAACTATCATTTTACAGAATAAGAAGAAAGTAGCCAACACATGATTTCTCACTAACAGTAACAACGAGGGGTCTTTTGTGTATTTTCCTGCACAAAACTCGGACGTTGATAAACGAAAAATAAATCACAGACCAGGCATATAAATGACCATGTGAGGAAAACAATTTTCATTCAAATATTTATCCCAGAAGAAAACTAAATATGATTCATTTGCAGTTAAAAAAACCCCTAGCATTCCGAGTGCTGTCAAAGCAATACATGTCCATTACTGGGTCCAGAAAATTTATAAATCGCCATGAAAGTTAAATTTAATCTATAACAGTACATGATAAATCAATACCCAAAATTTCATATCTTCAGGCATTGGAAAAAAAAAAGTCAAGAAATTTCAGCTCAGTATCTTGGGAACTATATGTGGGACAGACAGAAGGATAGTGATAAAACCTGAAGTTGGATTGGTACGAAAATAAGGGAGATAACTCATGTCTTATGCATTTGGCAATTATCACTTGGCAAATAAAGTGACAAAGTTACTTCATGGATGTCTGATACCAATAAGTACATCCAAGATGTTCTGAAAAGTCAGTAACCAATTTATTATTTAACAAATTCACACTTCTTCGCAAAGAAGATTTTAATGATTAAAGGGGGACTTACGATTACCATACGGTTGCTTTGTGGAACGGCTGTGAAGTTTACAGTGCCAGTTGTAAAACTCCCCTAAAGTTGCTACAATTAACCTTGGCTACAATTCTTTTGTGGAACGGGGCCCAGATAGCTTGACATGGTGAAATACAGGAACAACAATCTCGGTCCAATATATAGTCGTAACCTCTTCACGGATGAAATTCTCTCAGCATCCCCTGCCCCCATACTCTGTATTAAGGTTTAATACCATTGTATATGGCGACCCATGATTTGATTTAAAAAACCCTGGTTGTAGTCCTGACAAATGTTGTCAGCACTTAAACGTGACTGTGGTTTATTTTACTTGTCCATATTTGACAAAACTCTTACTTTCTCAAATTTTGAAATAAAGACCAATTACACGAGAACACATTTGAGATGTTAAACATAAATCTTAGCATCATTAAATATTTAAAATAAACATTCTGATGCAATGTATATAATTTTTGTATTTAAATTATTATGTTTCCAGATGGGCAACCATAGGGATTTGAGTTGCCTGTTGTTATTTTCAATCACCAGGGATGATTGTGAGAAAATTTAGTTTGAACATGCGGGCATAACTCAATGTACATGACTCAACAGTGTATGGACACACTAGCACTCTGTAGTCCACCAGCAAACCAGGACAGACTATGCTTGTCCTGATTTAACAATTGATTGATCAACAAGCCGAGTCTGGGTAACATTCAGAACTGAAGGTTAACTATGCTGACTGTATATGGTAAGGGGGTATCCTAAAAACCAAAAACCTACATACACCAGTATGCACTTAACCCAGGTTAGCCATTTAAACATGCCCAACCTGGTCAGATGCAGTGGACTTCAGAAACAGAAGAAGTATTTTCAAATTGGTGTTTATCAAATCCTGAAAAAACACACGACGAGTGTATTGGATAGTTATTCAGAGAACACCAGTTCAATTACTCTTGTACCCAACAACTAAAATCAAATAATGTTTTACCTAAATGTTGAAAGAAGAAGAAACCAGGTACTGCCAAATTGATGAACTGGGAAAATAGCCATAACTGGCCTGAAAATGAACAACAAAATCAGTTACTGCTATGTATTTAGTTAACAGCAGCACATTTAATAAAAAGGTTGTTATTTTTAATATGCATTTGATGCTCAACACTAAAATGAAGGTAGTATTTTATATTTATTTAGTAATATTCACTTTAGCTAACAGTCGAGAAGGTTAGCATACTAATATAAGAGATTCCAATTTCATTAGTAACTAATATTGCATTATGAAGAAACAAATTGCCATTGCCCTACAATTGTAAACCTATATTGCAACCCTAACATGGATACTGAATGCTTGATTGGACAGTCAAAATTCGGTGAGAATTATATACTGAACAAAATAAGAAACTTCCGCTAACTTTGCTTGAACATAAATTGATGAAAACAAACCGGGGGAATAATTGTTATATATGCATTTAAAGAGTGTTCCATGATGCATCGTTTGGTGCAAAAATCATGGCCATAGGTTAACAGAAACTGGAAGAAATTTTGACCAAATGTGGTAGGGGTTAAAAATAAAAACACCCACATAATAACGGGTATGACCACTTCTTGAATTGACCACCGCAGTGCATCGCAGACGCATAGAATTGACTAAAGTGTTGATTTCTGCCTGTGGAATATTGTTCCATTCCTGAATGAGCGCTTGACGAAG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Transcript

ctg483-11.7-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF08324	PUL	PUL domain	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011989	Homologous_superfamily	Armadillo-like helical	Interproscan
IPR013535	Domain	PUL domain	Interproscan
IPR016024	Homologous_superfamily	Armadillo-type fold	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR19849	PHOSPHOLIPASE A-2-ACTIVATING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0010992	Biological Process	ubiquitin recycling	Interproscan
GO:0043130	Molecular Function	ubiquitin binding	Interproscan
GO:0043161	Biological Process	proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg483-11.7-1 global RNA-seq network