Gene detail

Detailed information of ctg438-1.3-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg438-1.3-1	CASEIN KINASE-RELATED	chr2	39345899	39372103	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg438-1.3-1

ATGTTTGCAACTCTGGATTAACAAAGTCGGAGAGATGATTTAGAAGCTTTAGGTCACATGTTTATGTATTTTCTTCGTGGAAGTTTGCCGTGGCAGGGCTTGAAAGCAGACACACTGAAAGAAAGATATCAAAAAATAGGAGACACAAAGCGAGCAACGCCTATTGAGGTTCTCTGTGAGAACTTCCCAGATGAGCTAGCAACTTACTTGCGCTATGTGAGAAGGCTAGATTTTTTCGAAACGCCCGACTATGACTACTTGAGGAAACTGTTTACTGATCTCATGGAGAAGATGAGCTATGAGTGTGACTGGCAGTTTGACTGGGTGGGCAGACAAGTGTCGACACCTGTTTCGTTGAGTGCCGCCGACACCGGTCCTTCCCCTCAGAGGGACAACATTCGAGAGAGGCACAACACAACACACTACAACAGACAGAGTACAAATCAAAGGGGGAATGCATGGGGTGAACAACCACGGCACTCCAATAATTTACTTGGTGCCAACCTGGCGGCAGATAAACATGGGGGTTCTGTGCAGGTGGTCAGTTCAACCAATGGTGAGCTTGCGCCGGATGACCCGACTGCTGGACATTCTAACACACCAATCACAGCACAGCAAGAGGTTGAGGTCATCGATGAGACAAAGTGCTGCTTCTTCCGGCGACGCAGAAAAAAGAAGGGCCGCCAGACCTAACCAGGAACTTGAGGAATTTAGCCATCCTATGGTTAACCTTTTTCTTTGTACTAGCTGCCAACCATAGAGATTTTTCTAGCACTAAAACAAGAGCCACCAAAAACTTACCTTTGCACTAGATGTCGCCGTAAAAAGAAACAATTGTAAAATAGTTAATGCCAACCAGACTGTGAACATTAACTCTTGTATTCTTTACACAATGTGTGGTTACATCGGTTTTGTCATTCCCAGCATGCCCTGTGTGTGCTGAAGTGGATACATCCTGTGGTTGTTTAGTTTTTTCTTTGTGTTTTTTTTTTAAAATCTAAATTGCTAGCTTTGTGTACTCTGCGATCTGTACACCACTGTCGCTCTCTTTTGTGAACAATTCTTTTAGTGGCTGTACATTGCCAGTCATGTGTCCTCCTTTGTCTTGGCCTGCAGGTGCTGTGGGTGCTTCTCTCGTGGAAGACGGAAGCGTGGTAAGACGAAACGCCAGAAATGACTCGTTGCCTTTGGACAGACCAGGGACACATTACCACTGCATTGTCAGGAAGACTCTTATGTAGATAGCGAGTCTAAGGACACTAGCAATCTCGACGGTGTGCAGAAGTTAAGCCCAAGACATTTCCCCGTGCTTCACACTGGATACGTCAATCAGACATTTCTGTAGCTGCACCACAAATGCTTAATAATATCTTTATATATATGTGTATGGAGTGGATGTAGTCTTTCTTACTGCAACAAACCTGTTCTCGAACAAGTAACAACTTTTCAGGGTTCAAGGTGGACCCAGAACATTTAAAGAAATTTTGGTGAATATTTAGCAAATTTCTAAGTTTTAGTTGGCGAAACAAACTGTAACAAAATTAACATTGTTTAAAGCACTGTGTTTCATTTTCACAAAACTTTTGGCAATCTAATAACAAAATAAATTTACTAAATCCAACTTCAATTCACACTTAGTCATTCAGCAAAGACAGCAATGTCTATTCAAAAGCTTTATTTAATTACAGTCCTGTTATATACACAACTCTTAAATGGCACATTAAATTTAACACACACAAAAAAAAATAAGAAAAGAAAACAACAAATCTAAAATGTTAAAAACAAAAAAAGGAGACAATGTTTAACTTGAAAATGCAATTGTATGTACAAGAAATGGAAAATAGTATGGGGTTGTTGTTTTTTCTCTCAAAAAATATATACTAATGCTTAAAAAAAGAAGAAAAAACCTTGTTCACAAAAGCTTATTTTTTAATGCTATTATTTTGTTAGTATGTCCCTAGACTTGATGTTTTGCAGTAGCTTAGTTTTCAATGCTATATTGTTTTCAATGTTTGGCTACCTTTAAGACTGGGCAGGCCTGTTCGTTCCAACATTTTTCATGTAAAAAATTGCAATTTGATGGTAACCAAGGTTTGATGTTGAATGTTTTTGCACTTTACATTGCTTGCTTATCTTTTTAATTTAAAAATTATTATTATTATTAATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATGTTTTGTTATTATCAGTACATTTAATTTAACAGTAGTTTTTATTGTGTCAAGACTATTTGCATGCATTTGGTTGAATTAGTTGCAGTAACTGTTTCCTCGGTGAATTCCCAGTTTGCACAGCTCCTGGTTTGATCCAGTAAGTCAGAAGAGAATGTGAATTTGTTCATTTATTAATGTGTATTCCACAACTTAATATATACTCAACAATATTAATTAAAGTAAACCTTTTAATAATACTTTGCTTGGGTGATAATAATGTAGCAAGTTTTTAATCACTGATGACTTGCAGGCATTGCTTCAGTAAAATATTACTTGTGATATACACAGAAATCTTGCATATTGTTGGTTTTTCTTGCAGTTGTGAAGTGTCGAAATGTACAATCTTCTAAGAGTCATTACACATTGGTTTGTAATGATACTTGTCATTTTGGGTTTTTTACTCAAAATTGTTCAAATCATTAAATTTGAGAGCATGTCACAACGTCAACACTTTAAAAAGGAAGAAGCTATGTTTCATTTTTTACTGGCCTTTTAATTAATTTTGTTGAGAATGTATACGTTGTGTATCTTCTACCACTAAGTACATTTATTTAGATTTCTGATGAAAACATTGTTTTACATGTCAGGTACAATGTATCTAGGCTATTCCCACAAATGACCACTTGGGAACATGGAGGTAACATCTTTGTCAGTCTGCTGGATTAAAACGCTTTTGGTTTTTTACATATTCCTTGTTGGATGTGACAAATAAAATAAAAATTGGGGTGAGGGGGAAGAAGGTAAGGATAATATTCTGGTTATAAGGATATTTTTGTGGGATTGAGTGTTGGGGACTAGTGGATGGGTATTCTACAAAATGTTTTTGTGTATTTAAATAATACTGACTAAAAAAAGTTCTTGTGCATACTTTAGAAACGGTTGGTATAAATTTAATGATATTGAATGAAAAATAAATTGTTTTCACAAAATTATTTATTGAACAAGATTATTTTCACAATTATGGCATGTCCACACAAGTCGCACATTTCAACCATTTACAGACTTTACAGTTGGGTTGAGACCATTTTATCTGTTGCACAGGAACCTTTCTGTGAGTATATTTAATGATTAGTGACTGGTTGTAATTAATGGGATTTTATTCTGTGAGGATTTTAATATATTGCCTCCCACATTCCACCCCTCAAGTGTTCATTTCTGGAACAACCCATATCTAATAACCAAAACATTCATTAGATGTATTATTTTCTTTCACTGAACACTGCCCTAATTATTACAATGTAGAAGTAAAATAAAAGGTTGGGGTTTTTTTGGACAAATTACTTGACTTGTCTGACTTAACAGATGTAATGATTTGGTTTACCTAGTTTACAGTAAACACCTCTTGATTACGAAACTGGATCAGAATTGGTAGTTGTATGCAATGCTGTTTAAATGTACTAAGTAAAATCTTCTTGGACTACACAATCATAAATGTTGTTTTCAGTTTGCCGTTGTATGTAGAATGAGAAGCAAATTAGTTTCATGTAATCTGTTACATAAAAATGTGTTGTGATAATTGAATTCAATCTTACAAATGAAAAGATGTTTGTTTCTTTCATCGAAACAGTCAGGAGGACTAAAATTTGGAAGCAATATTCATTTTTGTTTTTAAAATAAAATTGTGTTTGTTGCAGTATCTATAAACCGATAAGGTATGTTAATGTATGTATTATGCATTGTTTGCTATTCAGTACTATTTTAGTCTTTATCAGTTACTTTGCCCCGATTGCAAACATTTTATTATTATTTTCCTCTTTTTTTTTTTCTTTTTTCTCATATAAAATTTAATTTTAGAATGAAGTGTTATGAGTAAATATCTGTTGGGATGAAGTTCCATTGTGCATGATAAAATACTTGAATCATTGAACAGTCAATGGTGAAATGTTACACCTAAAAAATCTTTTTAATATAACGTTCAAAATATTTGTGCCATATATTTTTGTTTAACTTTTACCAAAGATTATTTATATAACTTGACACATCAGTCATTTTATTTGTCCCAAACAATGACTATTAGCATTTTAAATTGGCCAGGACAAATTATTTAAAGTGTACACCTTTAAATTAATTTATTAATTGGGTCAGTTTTGTTATAAATGGATACTGTTTATAAAATCTGTTAGAACATCTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTTTCTTCAAATATTTATATTTTGGTGGTGCCAGTGGGTGTCAACAAAACATCGAATGAAAACAAATGTTTATTGTGCATTTCAGGGAACGCAGATCATTCCAAGTATATGTAATTAAGAGAAAATGCATTGCCAAATGTACATTGATATTCAACATAATTAGGTTATGAATGCAAGCATGATATGTCTTGTTTCAGATCTGTTTCTTCATATTTGAATCTGTTTCAGAAATGCTCAAATAGTTTGGTAACAGTTCCTTTCAAGTGCCCATAAAATAATATCGAAGTCTATCTGCTTTTAAAAATAAATTAGTCATTTCAGAATACTTAACAACAACAAAAAAACAAAAAATTGTTAAAGTAAAAACAATTCCTAAAATATGATAATTAATGAAGCTGCCATGAATTTTTTTGTAGTTTAACAGTTGCTTTTCTCATTTGTCATGAATAAATTGATTCACCAAAGCTAACTAAAAACCAAAGAAGTTGATTTTAGTTTCTTTAGAAAAGCAAACAAGATAGGAAGAAAGATCTAAGTAAATAAATCAACTGACAGTTTCATGTCTTGTGGTAAAGTGGATGCAGCTGGGTTTTGTACAGATTTACAAGAACACATAG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Transcript

ctg438-1.3-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12605	CK1gamma_C	Casein kinase 1 gamma C terminal	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011009	Homologous_superfamily	Protein kinase-like domain superfamily	Interproscan
IPR022247	Domain	Casein kinase 1 gamma C-terminal	Interproscan
IPR050235	Family	Casein Kinase 1 Ser/Thr Protein Kinase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11909	CASEIN KINASE-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004674	Molecular Function	protein serine/threonine kinase activity	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0005886	Cellular Component	plasma membrane	Interproscan
GO:0006897	Biological Process	endocytosis	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan
GO:0018105	Biological Process	peptidyl-serine phosphorylation	Interproscan
GO:0090263	Biological Process	positive regulation of canonical Wnt signaling pathway	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg438-1.3-1 global RNA-seq network