Gene detail

Detailed information of ctg429-3.4-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg429-3.4-1	RYBP AND YAF2-RELATED	chr3	34285943	34296063	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg429-3.4-1

ATGTATTTCATTTTCAGAAAACCTCGAATAAACCCCCAGCTTGTTGCCCAACAAGTAGCCCAGCAGTTTGCTCCCCCAGCGCCACCCAAGAGAGAAAAGATAGGAAACCCAGCTAAAAAAGGCAAACTTGATCCCAGCTCAGGCAGGAAAAGTAATCGGCCTCCCCGTTTAAAGAACATTGATCGCAGTAGTGCACGCCACATGTCGGTGACAGTCGGCAGTGTGACGGTCATTATTACGGACTACCAACAAAAGAAAAAAGACACCCGCTCTTCAGAAACTCATATCAGCTCAGATAACAGTGACACTAACTCCTCCAGTGCTGGAATTGATCCCATTGATCATGAGGAGGTCGATGATGAGGAGGAAAACCATGCAGATAACAGATAGACACTCGCTGATTGGCTGATAGTTACAAAAATGTTTTATTATCTTCATAGTCATTGGTCAGTGGTGGACAAGCAAGCCATCATCATAACAGAGAAGATTGCCGATTGGCTGATGTTGTTAAAATGTTATATTATCTTCATACTCAGTGGTCAGTAGTGGAAAAGCAAGCTGACGTCAGCAGAGAAGATGGCCAATTGGCTGATATTATCAAAATGTTTATGAATATTATCTTCATAGTCATTGGTCAGTAATGTACAAGCTGACGTAACAGAGAAGACGACGGATTGTCTGATAATTGTTACAATGTTTTATCTTCATAGTCATTGGTCAGTAGTGTACAAGCAATCTGATGTTTCAACAAAGAAGACTACTGATTGGCTGATGTTGTTAAATTTTTTATTATATTCATAGTCATTGGTCACTAGTGGACAAGCAAGCTGACATCCCAACAAAGGACATGGAATGCACTATAACAAATTCATTTTAAAACAGTGCAAATAAATCACTTTTATCAGACGCTTTTATAACACACATTAAGAAATGCTTCCAAAAATAATAGCTTGACATAATTTAGCCCACGCTGCATTACAAGGGTAAAAGGCAAATAAAACAGAAAAGGATGCATGTTATGGGTTAGTCATACAGGTACTAAGATCATAAAAAAAGAAAGAAAAAAGATCATACAACTCAGAACAATTTAAACTAGTTCAGGTGAAAATGTCTGCAGTCTAGACCTCTTCATGGCAATCAAAACTATTTTGATCTAGATTCATTAAATAAACACTTAGTGTTTGTACCTATATGATTTAGACCAAATGAAAAAAATTTGATGGTTAAGATGAATTTTAAAAGTGGTTTATCAGCCAAGATGACAGCTCATTAATATCAAAAGGTTAAAAAGAACAAGTCTCATGCTTACCATAAGAAACATGTTAAAAAGAATAAGTATTGTGCTTACAATAAGAATAGAGAGTTGGGTTTGTGTAAATTGTTGTGCAGTATTGTTTTTGGAATGTGATGTTTGCAGGACTCCATATGGAAAGTATTATTGTGCTTTGGTGTGTAAAGAAACTGTAACATGATTTGGTCCCATGCTTGTGAAGCTTTTAGGGTCTTAACTCTTACTCAGTCTTAAAAACTGTAAATGTTTGTTCTGAGATGGGACACAAAGGGTCTGTTCTCATTTGCAGTTCAGAGGTAAAAGTTTGATAGAGAGGAAATTGACTTTTGGGGGTGGGAGATGGGGGGGATCTTTTAAAAAAACATTACAATGTCAAAAAGTAGGGGTTCAGTGAGAGAGGTTTTTTTTTAGAGAATAAGGACAACAAAAAAAAAGGTTTGGGTGGCACTAAAATCCAAGGTTTGTTTTTTCATTCCTGCTTTCAAATCTTGATCCATAATAATTTAAAGGCTCCACTATAGAAATACCAGGACTTATCCTAAAGACATGCATTGAACCGTCGGTGGAATCGGAGTATAAGTGTATATTTTTCATTTCGAGTCTGGACAAACTGATAGTTGAACAGTTGGCTAGAACTCTGTTTTTAGATTCTAGATGTTTGCAGATCTCAGTCATAAGTTCCCAGACTAAAACTAGACCCTGAAAGTTTTATAAGTACAAGCCTTGGTTTGTGGATCAGCATCATGCATAGTGTTAGAGTACAGATTTCTAGTCTAGTTTTTAAAACGAGCGTGGTGAAAAAAACAAGACTTACATTGAGCAATGTGTACTACTAGGTGTACATGCATGTTTGGACACTTAAAAAAAATGGTGACTGATTTAAAAAACCTGAGCCATTGTGCCCATTACTGCGTGCTACGTACTAACTGCTTGGATTCTGTGATGTTCTTGGCTTGGAAAGTGTTTGGCCAATTCTTTATTTAAATGTGTTGTTTTCTACTGGAGAGAGATGTATGTGCTAACATGTATAATGTGCGTGTGGAGTGGATAAACTGTGTACAGAATTAAGACATTATTCACCAGTATATTGACGGTGTGACGACATATTGTTATTTCTATTCATATTTACCAAAGCATTTCCGTACCGATGTACATACCGGAAACAGATCTAGAACACAAAGTTGATCTTGTCTTCACATTTTCATATAGGCACCATGTTACAAACAAATATATATGTTTTTCATTTGTTATACTTTTTTTTCCAGTACTGGTTTGGAAAGTAGTACAATGTACCATAAGTTTACATGTACATGTAGTTTTGAATTTACTGCCAAATATATTTTTTATCAAAACCATTATCATTATTCGTAAACTAGATGGACACACTTGTAATATGCAAGATGTACCTGCAAATAGGGAAAGTACAAGGACAGGTAGTCTTTGTTATTCAGGTAATCGAGCCCTGAAATAAAAAAAAATGTCTGGCAAAAAAAACATTGGGGGTTGGGAACCAAATAGAAATGTAGTCCACAGGAAAAAAAAATGCTACGGAGAATTTAAAATTGCATGGCAATCTCCAATCCGATTGCTGTGTGTATCTGCAGATATTCAGTAACCAAATTGAGGATAAAAAATATGTCTTATTGTCTATATATTTCTACTCTATTTACTGATTCTTTGTTATTTGACTGATACATACTATAAATATCTTAACTAGGGCAGTTTTGGTGCCTTAATACATATTTTTATGTATATCAGTGAAAACCAGAGGAAATGTTATTCCAAAGTATTTTGTCATACATAACTAGGTGTAGGAAAGCTCAACAACAACAAAAAAGTAATTAAAGAAATAAAATGCATTGCACAAAGTGCCTAAATAACCATTTTGCTTGTAATATCCTTAAATTGGTCATCTCTAGCAGACTATATTTATTAAACATGTCTGTTAATAGAATGTTGTCAGTTGCGTTTGAATTTAGTTTTACGCAATTTAATACTTAACCATCTTACAAATACATGTACCTGTACCTCTTAATAATTAATAATTAAAATCATAAATGCAAATTGGTATCAAACTATATGCATACACACCTTTGTCATATTTCAGATCTTCATCTAACTGCAATATCATTGTGGAAAAAAAACATTTATCTTTTCACTTTTTAAAGTTGACACATGTTACTGTTACTCTGATACTTTACTGAGAAGAGGGAGAGGTTTTATTGTTCATACACTTATTACTCTTGATCATCTGAATATTGCAATTTTATTGCAAAAAAATTCATACATTATTAACTGCATGTTATTCTTTTTATTTTTCTCTTCTTTTAAAAATTAAAAAAAAAAATTATTTGAAATATTCACTCACTATAAAATTAAGGTAGTTAAGTTTGTACTTTTAAAATCTATGAAATTAACCATAGCATAGTTATTTGAAGGCAAGTATGGATTTTTTTTTTTTTATCTTTACAGATTAATTAATAGTAATACATGATTGTACAGGCAGAGTTTCTTATTTGTGGTGATTTTTTTTGATAGGTCGTAGAGAAACATTACAGTTGTTCATGAAAATTGTTTTAATTGTCTGCAGCTTGCTACTTTTGAATTCCAGCCTTGTGGACGAGTTAGCAGCAGTGTTGTGTAACATGTGAACCTCACTATGCTCGCCTTATTGATCGAGAGCAATGACATGTACACGTACACTAAAGGTTTTATGTCACAAAAACCGTTGAGGTCAGCAATATTTCATATTATAGTCAATAAACTGTTTATTAGACACTTTCACTTTCAAGGCAAATGTCGATTTTTGTGACATTCAACACCTTTTTGGGTTTTTAAACTTCAAAAAGGAATTAAGGCAGCATTTTCGAGGCATTGGTGCTTGCACCACAAAGAATTGTGGGTTTGGATCAGTGTTAAAACATGCATGATGAGCAAGACGTTGAATTGTATGATTTACATGTAGCTGGTAGAGTTGGATTTTGTATGATACAATAAAATTACATGTACAGTAAATATAGATTATTGCATGAGAGTCGGTGTTAAGGAATGAAGGGAATGTAACATTTCCAAAACTACATGTAGTTCCATACTTGGTGTATGGCACCTGTGTAGCTGTAATACATGTACACTAACAAACAACATATAGTTTAGTTGTCATTGACCATGTTTAACAATGTCCATTACCATTGAAGAGTAGCATTTTTACACATTAATATTTACCAAAGTGTGTAAGGAGTTTGGTAAATATTTGATTTTGGTACAGTATCTGGCTAGGGTTTATCTGCCATGAATGATTTATAAATATGGCCTTATTAAGTATAAATATCCTCCTTCCATGAAGAACAGGACTGAATACAATGGTATGGTATAATATAGGGATTAACATGCACATTCAGAGCAAGCTGTTTAGCACATGCCTGTCATGGGCACAGGTGCCTGCCTCGGCTGGCTCCTCTGTCCAGGACAGGAAAGGTTGGGGTGGGTGGGAGAAGGGACTGCCTGCACTGGCAGGTGCAAGAGAGCACCAGCAGCCCGACCAGGGTCGGTAGCAGGTGGAGGACTGAATACAAACCGGTCAAAGCATTATGTAGTCCACATTGAGAGGATGTAGATTTTCAACTGATGGGTTTATACCATGGTCAGTTCTTATCGAGAACAATTTTAAATGGTTTTGATTATTAAACAAGCAATTCTATTTCTTGTAAGG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Transcript

ctg429-3.4-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF17219	YAF2_RYBP	Yaf2/RYBP C-terminal binding motif	Motif	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR033774	Conserved_site	Yaf2/RYBP C-terminal binding motif	Interproscan
IPR039958	Family	RING1 and YY1-binding protein/YY1-associated factor 2	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12920	RYBP AND YAF2-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003677	Molecular Function	DNA binding	Interproscan
GO:0003712	Molecular Function	transcription coregulator activity	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0006355	Biological Process	regulation of DNA-templated transcription	Interproscan
GO:0045893	Biological Process	positive regulation of DNA-templated transcription	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg429-3.4-1 global RNA-seq network