Gene detail

Detailed information of ctg396-3.5-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg396-3.5-1	UNCHARACTERIZED	chr6	63588905	63602540	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg396-3.5-1

CAGTGACGTTTGCAATGTTTTGACACGTACAAAACAATGTTCTTGAAAATAATCTGCGGATAAATTGTGATGTGATTAAAAATGCAGTGCGTACAATGTGTACAAGTATGCTATCATCAGGGTTTAAAATAACAGACTAACGTCACTACGTGTCTTTTCACTGAAATTCTGTTGTTCAGATTGTCGCCGTAAAATATTAAAATGTAAACAAACAAAATGGCAGCTGGTCGATTGAATACCCAGGATAAGAAAGACCTGGAGAAATTCACAAAATTCTTCATTTTTAAAAGTCTTCAAATTATTGTACAGTCCAGATTAGGGGAGAAAATAAAGACAAAGTCGAAACCATTTTCATCTGGAGCTGATTGGTTCAATTTGGCCATACGGGATATACCTGAAGTGCACGCTGAAGCCAAGAAAGTGTTATCCGGGCAGCAGCATGTGCTCAGTCAAAACGTTTGTGTGGAGATTTCTCTGCAGACATCCGAGGGAGACACCATGATGCTGGAGACCTGGTACATCAGTCTCAACCAGGATCAGACTGACCCCAACGTCCGCGTGTCATTTGCCGTGTACAATCGAATGGGCGTCGCCCTCAAGTCCCTGTTCAGTGTGTCACGTGTACCTCCGGCATACAGACTGGCAAGGCAACAAGGTTTGAACGGCGGTGACTATGTCATATGCTACAGAATCTACTTGGGTGATCCACAGTTCTTTCAGCTTGGTGATGGTTACCAGATTACGAAAATTGGAGCTATTCCGACGCCCACTGGTACAATAGTGCTCAATTTAGCATACAGAACAAAACTGTTGATATCTTCAAACAAATCTAGCAAGGATGTTATGTTTAATGTTAAAGATGATCACTTCAAGAGAGATGTTAGTCCGAAACGGCCAACCACCCCTAAACCTTGCATCCAAGGCTTTAGAAGGAACAGTTCAACAGATGAGTTTGGTGTGACTGGCTATGATAGGCAGGACCTGTGTTCCACTACATTCTCAACGAGTCCATCAGAAGGCATTCTCTTTGAAAACAGCAATCTTCCCTCTGCTCAACCCATGGTTATCAGTGGAAAATCCGCTGAAAATACAGATGACCGAAAAGGTCAAAGTAACCCTGAAAGAGGGGGACATTTTGGAAACCTTCAGAGAGTCGGAGCATTTGCCAGTCACAAGAGCATTAAAGATCTGAAGACTGACATTGAGGATGTGCCATTCATCAGTCTTCTCAACAACAGAGTGTCGAGTGTTCCAGAGTGTGCCACAAGCTCCAATGTGTCCGTCACACCCACGGGCAGTACCGGGAACATGCAGACCTCCAACTCGGCAGGCAGTGATACAAACAAGAGTAACTGCAGTGAGACAGCTCTCGATGATTTTGTTATGGTCGAGCTGAAAACTCCATTTGCTGGAGTGGATGCAAACACCGACCTGGGCCAATTTTACCGGGACTGTCAAGGAGCTCCACAACTCAGTATGTGTGAAGACGAACCGGAATTCAATGAGGCTCTGGAGGAGGTGACCTCACAGTTGGCAAAGTTTGAATCGAACATGAAAGATTTTGATGATTTTGTGCTTTCTTTACGTGACACTGACTCCAGTGACTAAATATTTATTTCACATTAAAAGAGTTTCTTGACCAAAGGTTAAACATTTTGATTTTGTTAATCAAAAAGCAGAATTATATGTAGTTTCTAAAAATGGCATTGATTGCTCAGTGTTGTGTGGGCCCTGTGTTTATTCAGCTAAACAGTCTTGATAAAGTGTTATGATGAATAGCAGGTACAGGTAGTTCATGTGTGGACCTTTGCTTGTTATGGTTTTAAAGTCTATATACAAGGCTTTCAATTTTAATAAAATTTTGCCCGTACAAGTAACTTGTAGTTAAAAGTGTGGATTTTAATGTTTTATAAGCACAGGACCGGATGTATAATTTTCTGCAATTGTATGCATCACATACAAAAGGCTTGATATACATGTACATTCATTATTTTTTTCTCAAGGAAGTGGAATATGAGATGAATGTTAACTGAAAGGTGTGATAGAGGCAAATTAAGAAAAGGTTGCATGGAATTTGTGTTTTTCCATTTATTCTTAAAACTGTTGAAAAGTCATCTAATGGTTGTTGTTTTTTTGTACCAAGGTCCCATTTTGATTCAGTTATCACTACAAAGTCTTGAGTTCTCATTTACTATGTACAGATTTATCGTCCTCAACATGTTGTAAGTTTACTAAAGCTGAATTCGATAACAGATTGGTGCAGATATCTTGAACCTGATATGGTGTGTGCTTTTTTATTGTTTTGTGCAGTGTTTGTTGTCCTTAGCCTGTGAATATTACTTATTCAAATAAACATGCTGATTCTTCTTTTCTTTTTTAATAGAAAGGGGAGAAATAACATTGAAAATAGCACATTCCTGTGTACACAATATTTTAAAATTGATGATTAGTGATTTTGTTGCAATGTACTTACATTTCAACACTAACAAGTATTATTTTAATAAGTCGGCTTGTGATATTTATACATGTACATCATTGTCGAGTGAAAACCGAGAATTGCTAGTATATATTATAATTTTTATTTCATTATTGGGGTTTGGTGAGGGCTGAAAGGGGCATTCCTAGTTCATAAACCCCGATACAGCCCATACATGTACATTGTATTTCCCATTTCCACGAATGTAAACATAATGTTAAAAGCCTACATTACAAAAATACCCATTTGTTTTACTGCTTGATTAATCCCAGAACTAATAACTGACAATAATAAAAATACCCAAAACAAAATTAAAACTAAATAATAAAACCATATATTACAAAAAACAACTCAATAACCCAAGAAAGGATCCTAAATATTTTGTTACTGAAGCACTTGATAACATTTTCCTCAAAGTAATGTTCTTTTAGTGTTCATGCAAAATGTCAATTCCAGTGAAATCATATTTTTTAAATGTATGTCATGTATAAGTATATTATATATCCGAGCAATATATGGAATTACATGTACATGTACATGTATGCATCACAGTATACACATGTAGTTGCTTCATTCAACTCCCCCATGTACAGAAATATAGCAGCTGTTGTGATTAATGTAAGGAATCTCCAACTATATCAGTCCTACAATTATGTTTTAAATAAGAGTATAGTGATAGAAAGTTATAAGGGATCACAGAAAGACGAAAGCAGAGAATGACTGCAACCAATAATCTCATCCATGGTGCCAGGACGTTAACCACATTATTCACACTTGGTACCACATTTTGTATTATATACAGACATTACTATGCTACATGTAGTAGTGACTGAAATTTGGTATACAATACCTTGTGTTCCCTTATTTGATTCAGGATAAGTCTGCATGTACAAAATAACAGAGTTTATTCATTGCAAGCTTCACATGTTTAACCACAACTTCCACGATTGACCAAAATAGCATGATCCTCATGTACACATGAATAAGTTAGCTGTTATTGTTAAGTTCAGTGTATATCTGTTATTTATTTAATGAATGGTAACAATGCATGCTAGTATTTGCACTACCATTACAGATATTTTGTCCTACAAAAGTTTAAGTAAACAATATTTTGTTATATCTCATCTTTATTTACGGTTTAATAATGTTTATACAAAATGTACACTTCAGTTTGGAATGATGTGAAAAATGGATCCATCTTTAATGGATAAATTTCATTGATACTTAATAAGTCCTAAACTGATGATCAGTAACAAATACCTTTACCTTCCGATTCCGATAATTTGTTTTACAGCTTAAATTGAGATAATTACTGTTGCTTGGTTTGCAACAATATTTTTGTGACGAAACAGACATTCTTAGAGAGTAAATATTGTTGCAATGAGAGGACTTTTGTTTGTATGCACTTGGATAAAAAAGTTGGTAGCATAGATATTTGTGTTACATGGGATTGTAATTTGTTTTGGTTTGTGACATCATGCATTGTGGTAAATTCCATTCATTGTTGTGATTTGTGTATACGAGTAGTATGTACTCTGAATATAGAATCATGTTGTTCAATAAGCTATTTTGTGCTAGTTATCCAGTCATGAACACATGAAAAGACTTGTGATATACACATACAAATTGCTGAATAAAAATTAAATAATTTCATTCTTTGTGTTAAAAGATTTTTTTTTTTTAGGTTTTTACATTTACATGTTATGACATTCATCAGCAGAATTTTCCTAATGCCCATTTATCCAGTGTCTTCCTCAATTTCATTGTCTCATGAGTTTTGATTTGATTGTTCTTGAAACATGATGCAATGATCCTCTGGGTAACTCTCTACAAACTAATAGAGATAAATTATAAAATTGTGAAAGTCTATCTTCTAAGAGTTTTGATCGAATAATTCTGAAACTTGGTGCTGTGATTTGCTGGGGCAGTCTCCATAAACCAATACTGAGAGATTTTGGAAGGTTCACATTTTAAATTTAAAAAATTTAAATAGAAATTTAAGATTGAAAATTTGAAGGACCACCTTCTAGACTGGGTAGTTATTGAACAGCATGACATCATCCTTTCAGTTCTCTTTGCATTGCACTACAAGATCGCAGTTGCTATAGTATAACGAATTAGTGTATAGACATTCAGATAACTCTGATCATTCCAAATGATAGAAATCAGTTGAGTTCCATTACACTAGTCAAAATATGTGGTATCCAAACTTCTTTTTTCAAATCTCATACATTTTTAATGAGATAATTTTTAATCTCGACACATAGGTATTCTAAGATAGTCTTTACAAAATTAATGTGGACAGGATGTACCTCTGTGGTTAAGCGGTTGCTTGATGCATGGTCGGTTTGGGATTGATCCTTCTTTGTGGGACCATTGGGTTATTTCTTTTCCAGCCAGTGAACCACGATGGGGTCCACTGATGGGGATCGATCCTAGATAGATGGCACATCAAACAAGTGTTTTACCACTGGTCTACGTCCCGCCACCCACATTTATCATGCAGTTAAGTATGTCAGAATAA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Transcript

ctg396-3.5-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF10033	ATG13	Autophagy-related protein 13	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR018731	Domain	Autophagy-related protein 13, N-terminal	Interproscan
IPR036570	Homologous_superfamily	HORMA domain superfamily	Interproscan
IPR040182	Family	Autophagy-related protein 13	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13430	UNCHARACTERIZED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000045	Biological Process	autophagosome assembly	Interproscan
GO:0000407	Cellular Component	phagophore assembly site	Interproscan
GO:0000423	Biological Process	mitophagy	Interproscan
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0006914	Biological Process	autophagy	Interproscan
GO:0034497	Biological Process	protein localization to phagophore assembly site	Interproscan
GO:0034727	Biological Process	piecemeal microautophagy of the nucleus	Interproscan
GO:1990316	Cellular Component	Atg1/ULK1 kinase complex	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg396-3.5-1 global RNA-seq network