Gene detail

Detailed information of ctg253-2.19-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg253-2.19-1	8-OXOGUANINE DNA GLYCOSYLASE	chr10	50026632	50040246	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg253-2.19-1

ATGGCCACGCCCCTGTGGAAATGTATTTTATGCCCGGAAAATGAGCTTATACTCAAAAGAACGCTTGCTTGTGGACAATCGTTTAGATGGAGAGAAACTGACAGTGATGTTTGGACTGGTGTCATTGGCAACAGAGTGTGGAAACTGAGGCAGTCACAGACACACCTGTACTATCAAGTGTTTCCAGAATACAGTGAAACTCTGGAACAGGCAGACATATCTAATGTTAAAATTGAAAAAGATGAAGATGGCTTTCCTTCTATTAAATTGCAAAATACAATGCAAGAAACGTCCATGACCTTGACGGAGTGTAAACAAGCAGATCGTAAATTTAAAATAAAAGTAGAGATACCAGATCACAAATATGAGATAGATGACAAGAAAGTAATTAACAAAAATAAATTTCGGAAATCACAACACACAGACACTGCTGGTGATATTAGTGATGGTACAGAGAAGGTGGATGAGGAACAGTCTATTCTTCGAGACTATTTTCAGCTTAATATCTGTCTGACTAAACTTTATGACCACTGGTCTGATGTCGACCCACATTTCAAAGAGGTGTCCTCTAAATATTCTGGGATCCGGATGATTCGCCAAGATCCTGTGGAAACCTTATTCTCTTTTATCTGTTCATCTAACAACTCTATCCCTCGTATCATTCAGCTGGTTGATAAACTGTGTAGTCACTATGGAGAGAAAATAGCTACTGTGGATGGTGAAGACTATTATTCATTCCCTAAAATATCAGCTTTTGTTGGAGATAATGTTGAGAGCAATTTACGAATGCTTAGTTTTGGGTACAGAGCCAAGTATATTCACAAATCTGCAAAATTTATCTTGGAGAATCATGGCAAAGATTGGGTCAATTCTCTGCGAAAACACTTCCGTGACCTGTGGGGAGAATATGCTGGCTGGGCTCATTCTGTGTTATTCGCAGCTGACCTGAAGACCATTACGGTTCCCAAAGATACCAGTGGTAGTAGTGCAAAGGCAACCAAGAGGGAATGGCCTGACGAGCTAAGCAAGTCAAAGAAGTTCAAACAAGTGTGATATTCAACAGACTGGCCTCCCAGCACCCTTACTGATGAAATTATTAGAGGACAGTATCCTAGATTTAGAGGACATTTTATATTGGAAGGAAGGAAATGTTTTATTTAATGACGCACTCAACACATTTTATGTACAGTTATATGGCCTAGGACATATGATTAAGGACCAGCTATTGGGAGAGGAAACCTGCTGTCGCATCTTCATGGGCTATTCTTTTCAATTAGCAGCAAAGGACCTTTTATATGTACCATCCCACAGACAGGATAGCACATACTACAGACTTTGATATTCCATCTTGGTGCACTGGATGGAACAAGAAATAGCCCAATGGGCCCACCGACGTGGATCAATCCTGGACATCAAATGAGCGCTTTACCACTAGGCTACATCTCGCCCAGACACCAATATTGGAAGATGTTACAGTTTCTTGTTGCCTATATGTGGGTGGGTGTACCTCCCCTTACTTTTCACTCAGGAAGAACTGTTAAAACATTTCATTACAAATTTAACAATTAACACAGAGGTTTAAATGCAAAATAATTACATGACCTCATTTTGTCAATCTAATTAAAATTAGCTCCACTATTACATGTGGATCTAAAGACAGCCAGTTGGAGCTCATGTCCACCAATCAAAACCTTACTTGCAGAATCCTGCCAGTGATTTAAAAATAATTTGAAAACATTCCGAATTATCCTGAGGGTATACGACATGTTTCGTGTGAATTACGAATGCCTTAAAATATGTTTTATTTTATAAAATAAATAATTTGTAATGTAAAACTGAAGACTGATTTAGTTTTTTAAATTTTATAAATAAATAAATAATTTTTGATGTAAAATTGAAGACTGATAACCCACCCCGTACGTATTGGTATGGTTCGCTGTACTGCAGCCACTAAAATAGACTCGCCCGATATTTTTAGAATTTGTATGCTCCCAAATAACGTTATAAAAGGCGAAGTGTGATTGGTCAATATTTAAATTATTATTTACAGACAAAATGTTACCTGGACATTGGGGACTACGCAGTGTTGTTAGTTTTAAATCACTGGCAGGATTCTGCAAGTAAGGTTTTGATTGGTGGACATGAGCTCCAACTGGCTGTCTTTAGATCCACATGTAATAGTGGAGCTAATTTTAATTAGATTGTCATTTTGTATGTTTGTAAGTGCAAAATTGTCCAATATTATTATGTACATAGCTATGAAATATATCTACAGAAACCATTCAGTGAAAGTCATATTTTTACTGTATTTTAGTTACAGTAAAAATATAGAAATTATATTTATATTTTTGTGAACAAATTCATGATTCAATTATCTCCCTTGTAAATTATTACTTTTTAATTACTGAGGTCAGTGTTGCTTCATCGTGTTTTAGTTTGATGATTACCAATACATCTGATCATATTTAAATAAAAAAAAGTAGTTTAAACAATTGTACCTATAAAAAATGAATATGAATGCAATTATGATAAAATAACTAAAACTGATTGAATACGAAGCTAATTATTATGACACAATGTCCTGTCATTGAGTGAAGTTAAAGATTAACTTCGAGTTTGATTCATGTTTTGTTTTTGTGATTTTTTTTAGAAGGATCGCTTTGTTAGGTATGTTTGCACCAGAGGTGGGGGAAAGCTTTTTTCTCCTGTTCTGGGACAGATTCCGAGATCAAAAGTAATTTTGGAAAATGCATTTTTGTAATTGCATAAAGGTTTGTAGAAAATAATCTGTATTACCGGTAAAAGTGTTATCAATTATACTCCAAGCCACGTGAGTATAAAGCAAATGTAAATGTGACAGTTATTTTTCATGGAATAAAGACAAAACACATTCTGGAAAAGTTCCAACAGAACAAATATATTGTCATGGCTGTCCCAACAATTTTCTTAACTGTGTGCTGTGACATGGACTTTTCTCAAGTAATTTTAATATTGGACAAAACAGAATATTTATTTTTACATTTAATAGTAATTATTTGCACATTTACTTGTATTGTGTAATGTCTGGAACTATGCCATGTATTATAGTTATTGTTTAATGAAATTCTTAGTAGTGCCGTTTGTTGTGTCGCACACCATAGAAAAAAACTAAATTGCGTAACCATTGTTATTAGTGATCGTTTGGATGCACAATGCGAGCTACATTTAGTTGTATTTCAAAATAATATGTTTATAGTGTGTGAAACTATGTTTGTAAATAGTTGCCGTAATTTATTTATGTGATATTAGTATAATATTATTACGATCCCTAACTCATAAATGTGTTAATTTAATGCTTGACGTCCGTGTTTTGGTTTTGCGGTCTTCGACTTTATTTAATTCCCAAATTCCTGTGCATATGAAAGCTATGACACAACTTTGACATTAATATTATTGATGTAAATATTTCCATAATTGCAAAGTGTGTGCACTTACACACTGAAAACGTCGCATGGGCTCATAAATAAACCTGGGATAAATTTCCGTTTGATCGACAGTTTTGACATGGCTGCCGAGAGCGACCTTGCCTTTCAGTAAAGTTTATTTTCCTCCAAAACTTGTATGATCGACGTATCCTAATATTGTTTGTACATTATGACAAATCATATTAATTGAGATAATAACTGTAAAACTGATTACTGTAATATTAGTGCTTTCAGGAACTATATCCTTGTACGCTGAGAACCTGTTTAGGCATAGGGCTTACATGTTGCTACGGTCTGATATATCGGCACATAATGTTTGTAAACAACAGTATAAAAAGGCTTTTTCATTAAAACTATTTTATATTGAAATTAGACCAAAAAAGCGATTGTGTAGTGATAGGTTCGTGTTTATGCACATTAGAATTTGTTTGTATTATTAGCTTGAATTCCTAATGTATTTGCAATGCACAATAGCAGTATTTCTGTGCCTGGTCAGTAATGTTGTTTTTATAAATATTCTAAAGTCTTTTTCTGTGAAATTGTTTTAGACTAAAAAAGCAATTAAGAAATGTTAGTTTTATGTTTATGCACTTTAGAAATTTCCAGTATTAATTATTTCAAGTTTGTAATGCTTTTGCTATGGGCTAAACCGACGTATTTATAAAAGTTGAAGTTTTTCAGGATCTAGAGTGTGCATTTACAAACTGCAAATGGAAGCTGGACCAAAAAGCAATTACTTTACTTATTGAGAAATTGTGTGCATAACGTAATTATTAAATGAAATTATATTTATTTTGTAAAGGTAGATCTCTTCCTAGCGTGACATAATTTCTGATTGGCTGTTATGACGTCACGTGGTACTTAAGAAAAAGTATAAAAGGCTGACGTCAATGGACGAGCTACTCTCGACTCACTATCCTCCCACCATGGAATTGTAGGCTGGCGAAGTCAGAACCCGAGTCCATGGCGGGCATGCCTGAACCGAAAGGATGTGGGCACGTTAATATAGTTCCCTTCCCTTCGACTCACTAAAATCAAAACCTATATTAGCTCTTGATCTTTCTTTTTTGACCGACCGCTCAAAATTGCACCATATTTCCTTAATTAAAATTGCGCACCTTTTCTCTTTGGCATTTTTTGCTCCTTAAAAATTCCATAGCACCACTACCCACCCACCTGCCTGTTACCAACCACGGTCGGGCTGCTGGTGCTCCCTTGCACCTGTCCAACTTTTCAATTTTATTACATCACATACATTTAAATTGACACTGGAATAACTTTAACTTAAAAGTTTTAAAGAAATTTTTATTAACTTACCATCTCTATTTAATTAATTTGTTTTATGGAAGTAATATTGGTATTTATAAGCAACTGCAAGCTGTTTACATTTATTGGATAGTCCTCACTGGTTTAATATAACTAGAGCTCAAAGGAAGAGATCTATCTGTTGGAAACTTAACTGTGAACATCAACTTTATTTTCATTTACTCATAACTTTTAAATAAATGTATAATTCTGGAAACTGGAACTTTTTGTTTTTGTCATCTGTGGATGTTATTTATATTCTTTGGACATTGTTGATATCCTTGGGACGTAGCCACAGTATCATGGCATTAGTGTTTTT

Transcript

ctg253-2.19-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00730	HhH-GPD	HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein	Domain	Interproscan
PF07934	OGG_N	8-oxoguanine DNA glycosylase, N-terminal domain	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003265	Domain	HhH-GPD domain	Interproscan
IPR011257	Homologous_superfamily	DNA glycosylase	Interproscan
IPR012904	Domain	8-oxoguanine DNA glycosylase, N-terminal	Interproscan
IPR052054	Family	Oxidative DNA damage repair enzyme	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10242	8-OXOGUANINE DNA GLYCOSYLASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003684	Molecular Function	damaged DNA binding	Interproscan
GO:0003824	Molecular Function	catalytic activity	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0006281	Biological Process	DNA repair	Interproscan
GO:0006284	Biological Process	base-excision repair	Interproscan
GO:0006285	Biological Process	base-excision repair, AP site formation	Interproscan
GO:0006289	Biological Process	nucleotide-excision repair	Interproscan
GO:0008534	Molecular Function	oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity	Interproscan
GO:0034039	Molecular Function	8-oxo-7,8-dihydroguanine DNA N-glycosylase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg253-2.19-1 global RNA-seq network