Gene detail

Detailed information of ctg235-5.23-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg235-5.23-1	PROTOHEME IX FARNESYLTRANSFERASE, MITOCHONDRIAL	chr8	56586362	56603681	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg235-5.23-1

ACCATTACTTCCGGTGTAATTATTCTCACATTGGTTGAGCACGTTCGACGTTTTTGTTTATAAATGTAACTATCACTTGGTTCGTTGTTGCTGCTATTGAGTAATGTACATTTGATTTAGACCCCGTACACGTCGTCGTCGTCATAAGAAGATCCTACGTAATGCAGCGATGCCGCGGTGTTTACATCAGTTTATGTCGACGATCAGCTGACCTCCAAAAACATGGCTTCTTCAGATGGGCCAGTGTGAAATCCACTTCTCTTGTCGTTGTCTCAACCAACAAACATCATTATTATTGTTGTGCTGCGTCATCAAAATGCCAGTACATATTAAGGCACAGTTATACTACAAGACCAGCTGTGGTAGACGCACATATTACAAAATGTGTTCAAGGTACTGAAAGCTTTGGACCAGAAGAAAGTTCACAACAAATTACGTTGGACCCTAGCGACAAACCTTCTGACGTGAATTCAAATGCTGTTGCCCTGACACAAACTGTAATTGAAGACCAGCTCAAGAAGGATCATGCAATATCCCTTCACTTCAGAAAGTCAGATTTGATTTTAAATGTTGAAAACAAGAAATTGTCAAACTTTAGCCTCTTCCTCCCAAGTGAGAAAGAGGTCTACCACATCGCAAATGATGATGATGCAAAGTCTCGGTTGTCAGAACCGTATCCCACAACCGTGGAGGACATTCCCAAATCTCGACAAATGGAAGGCGAGGAACCTGCACCATCCAGCAACATTGAATCAATAGAAGAACATTTGTGGAGAGAATGTCGTCTAGATTTGCGCAAACTGCCACAGTTATATCTTCAACTTTCCAAGATCAGATTAACAGGTCTGGTGGTTTTGACCGCAATGGCTGGATATGCCATTGCACCTGGTGCTTTTGAGCCAACAACATTCCTGTTTTGTACCCTTGGAACTGGACTCACATCATGTGCGGCAAATTCTATCAATCAGTTTTTGGAGGTGCCCTTTGATGCTCAAATGAACAGAACAAAGAACAGAGTATTGGTTCGGAAGTATATGAGTGAGCTGCATGCTGTTTCATTTGCTACTGCCTGTGGAGTCACGGGACTGACCATGTTGACTCTGGGGGTAAACAGTATGACAGCTGCTCTGGGTGCCTTCAATCTGGTGTTATACACAATGGCTTACACCCCTATGAAGAGAATGACCTCTGCAAATACCTGGCTGGGTTCCATCGTAGGAGCAATACCACCCATGATGGGTTGGGCAGCAAGCACAGGTGGTTTGGAATCAGGAGCATGGCTGTTAGCTGCTGTCATGTATGCGTGGCAGTTCCCACATTTCTGTGCCTTGAGCTGGAACCTTCGCCCCGATTACTCCCGAGCTGGATTCCAGATGCTGTCGGTGGTGAACCCGGCGATGTGTAAACGGGTGGCGCTCCGTTACTGCCTGGTCACAACCGGCGTCTGTCTCCTCTTCCCGGTCTTTGATGTCACCACGTGGGCTTTCGCAGCCGATTCTCTCCCCTTGAATATGTACCTGACCTACCTAGGCTGGAGGTTCTATCAAGATGGCGACAGTAATTCTTCACGGAAGTTGTTTCGATTTACGCTGCTGCATATTCCAGTTCTGTTGATTCTGATGCTCCTCAGCAAGAAATCTTATGGAAAAAGAACTAATGACTTGAAACCTTCAACAGATCAGCTAGTGGTTCAAAATGTATAGTGTATTAAAAATTAAAAATTGTGTGTGTGCCTGTTATTTTAGTGCGAGTGATGGATCAACGGTGACATTTTACTGTGGTTTTAAAACAATAAAATTTGACTGAGACACAGGGCAAGCTTTGGGTCAGAAATTTTCGCCAAATTATCTATTAAAATCCAATAATTGCAAAAGCCCTGTAATATTGTAACAAAATATCAAATATTCCATAAAATTATTTTGCCAAATTAAAATAAAATTTTCTAATTGTTTTTGAAATTCGCAGTTGCCGAATTTGGCTAGTGTCAGAGCTAGCCCTGGAGACACCTAGTGGTAAATTTATATTGAACTTCAAAAACATGTTGTGGGTTCACTTCCCCTATTCCTAGCTGTTGTAAAAAAAACAAAAAAAGAGGATAAAATGTTATACGTTCATATTGTTAATGTTTACTTTTGGGATGGGTGAGGACGGATATAAAGTTAAATTTTGAATTGTGTGGAATGGTGTCCGTATCGAAGTCTAGAAAGATGAGTTGTAAAACATTGTCTCCACAGGAAGTGTGTGCAGTTTGAGTTTTAGTAACACACTGTAGGAAAGAGACTACATGTACTTGTATTGCTTAATTGAATAATTCTCAGTCTGGTTTGCATTCTGGCAAAAAATATCAGGTTCCTAATTGTGATATGTGTGTGAATTTTAATGAGCTTGACAACCATATTCTGTATATACGATATTTATGTATTTTATAACCAGCTGCATTGTAAGTGTTTTTATTAAGTTTTTGTTCCAAGTAAAATACTGTGTTTACCATGAGTTTTAACATATCTTACTCTAGACGAGTTTAACTGATGCAATATTATTTTCTATATATATGTGGATAGCAGTTTGTTGTGAAATACCAGAGCTCACCCTGCCCATTGCCAAATTAGCCAGCTGCTAATTTTTATAAAAAGTGGCTACAGTGTTTAGCAGTTGGCTAATTTTTGTGTAAATTAACTCTTCTTTTTATAATCATGTTCACGGAATTACTGCACATAATAAAAATTTGTTTAAAACTAAATTCTTTTTTGTGTGAGCCCTGAAATACCTTACAGGGCCGTAGCTAGAGGGGAGCCCAAAAAAAAAAATCAGAAAAAATTATAGAAACAGAGAAAATTCTCCTCTTAATGGTTGAAGGAGTTTTAGACTATTAACTAGTCAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAACAAAAAATCCTAGCTACGGCCCTGCCCTAGGAACTAACAACCATTCACAAAAAACACTGCATTGCATTAACGTAATGTTATTTATAGAGATCATGGAAACTGGAAAATCTTAAAATGCACAGCTTCTACAGTGGATGACCCGATGGGTTTCTTCCTGTCAGCAGTATCACGCAGTGTATGTAAGGGCTAGGATTGAGCTCCTTTCGTGGACTATTTTAGCCATTTTGTGTTTCAGTACTATGCTGTCGGTGGGGTGGTGCATAAATAAGATCCCTAGCTGCTAATTGAAAGGAGTAGTCCATGGAGTGGTGAAAGCAGGTCTCTTCTCATCTGTATGATCTATGACCATATGTCAAATGCCATATAACCATAAATACAAATGTGTTGAGTACATCATTTAATAATACATTTCTTTATTTTCTTTCAATTAATAAATATTACTTATTACTGAAAATCAAAGTGGGGTTCATGTTTTATACTACTACTACTACTACTAGGTCTTACTTATCTCAATATACCTACAAACTTTCCACTGTTCTATGATTTACTCTTCTCATTCGTTGATGTCATTAAAAAAAACCTTGAATGTTTATCTTTCGATAAACTTTAGAAAATTATGCCGTATCATCAAACGGGACATCAGTGGGTATGTAAAACAGGTCATGGAAAGGAGGATAAAAGCTGATTTATGTGTATTTTTAACTAAAGTTGTTTGTGGTGATAATATAAGAATTGTTTTGTGGTGGGGTTTTTGCAAAATTATTTAGCTATAACATTCACAAATTTAGTTTAAAATCACTTGGCTACGCAACACAATTTTATTCAGTTTTGTGACTGTTAATGTATACATTGATAAATTCACACAAACATGACACACAATTATTATATGTAAAGCTGCATTCTCATTCCACTTGTCACAAAATCATTTCTAAAGTACAAACACAAACCTTCCATGTTAATTAACTGTTGTGTTTTCAGTATGAAGATGTACGGCCCTCTTGATTCTTTTGTCATATTTTGTAATACTTTTTGACATTGTTACTGAGATCAGCAGAGTTAAAATCTGTGCAGTACTCGGTGGCATACCTAGGGTATGGCAGGTATGGCACATGCCTTAGACACCACTTGAAAGGGCAGTTTCTATTAAAGTCGGATGTTATCTAAAAGATGGGTGTCAGTTGTTTGGACAAGAGGAGCAATTTCAGTGCTTGCCATAGGTGCTATTTTCTGTAGATACGCCATTGGCAG

Transcript

ctg235-5.23-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01040	UbiA	UbiA prenyltransferase family	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000537	Family	UbiA prenyltransferase family	Interproscan
IPR006369	Family	Protohaem IX farnesyltransferase	Interproscan
IPR030470	Conserved_site	UbiA prenyltransferase conserved site	Interproscan
IPR044878	Homologous_superfamily	UbiA prenyltransferase superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR43448	PROTOHEME IX FARNESYLTRANSFERASE, MITOCHONDRIAL	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0006783	Biological Process	heme biosynthetic process	Interproscan
GO:0006784	Biological Process	heme A biosynthetic process	Interproscan
GO:0008495	Molecular Function	protoheme IX farnesyltransferase activity	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0016765	Molecular Function	transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg235-5.23-1 global RNA-seq network