Gene detail

Detailed information of ctg176-2.7-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg176-2.7-1	S-ADENOSYLMETHIONINE SYNTHETASE	chr8	40854489	40877500	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg176-2.7-1

ATGCACCATCCCACAGACAGGACAGCACAGACTACAACTGCCTTTGATACAGTGTTCGAAATAAGCACTTATAAAATCTGCGACCAGGTGAGCGATGCTATCTTAGACGCACATCTAAAGCAGGACCCCAATGCCAAGGTAGCGTGCGAAACGGTCGCCAAGACGGGCATGATTCTTGTGGCTGGTGAAATCAGCTCCACTGCTCACGTGGACTATCAAAAAGTGATCAGAGACACTATTCGACAAATCGGTTATGACGATTCGTCCAAGGGATTTGACTACAAGACTTGCAATGTTCTCATCGCACTTGAGGAGCAGAGCATTGATATTGCAGCTGGTGTACATGTTGACAGAAATGAGGAAGATATTGGTGCGGGAGACCAGGGTGATGCTGGTTTGACTGGAAGAAAGATCATTGTTGACACATATGGTGGATGGGGTGCACATGGGGGTGGGGCTTTTTCTGGCAAGGACTTCTCTAAAGTGGACAGATCTGCAGCCTACGCTGCTCGCTGGGTGGCGAAGTCTTTGGTGAAAGCCAATCTCTGCAAACGAGTTCTTGTTCAGGTGTCTTATGCTATTGGAATTGCTGAGCCTCTGTCCATCACTGTATTCAGTTACGGAACATCATCAAAGTCTGAAAAAGAACTACTACAAATTGTTAAAAACAATTTTGATCTTAGACCAGGAAAGATAGTAAATGAACTGGCCTTGAGAAAACCAATCTACCAGAAAACCGCTTGCTATGGACATTTCGGACGACCAGAATTCTCCTGGGAGGTCCCCAAGAAGTTAAATTATTAATGTATAAGCTCATGTTAAATATGGGACATGAATTTTTAATATTGACAATGAATTTTTACTTTTTTTTTTTTATTCCTATTTTATGATTGTGTTTTGAAGAAAACTATGTGGCAGAGTATTATGGATTTTCGGGATTTTTTCTCGGTAGGCCACAGTAATTGGAAGGATACCCCGACGCTGATGTTGACTCTTACACCAATTGAAGCATCTTAATGGGGTCTGTAGTCCTGTCACCTTGTTTCCAGGGCAACAACAGTCTCGGTTTCCGCCTTCCAGTTATTGCAAATGTGCAGTTTCCTTAACTTTTTATATGCACAGTAATTCCCTGTGCACATTTGTCTTGTGTTTATGAAAATTTAAAGGAAAAGAGCACTCTTTATAAACACTCGGGCCTTCATCCATATTGCTCTGTAACATCATATTTGCATATCTATAATATATGTTATGATCTTACCTATGTATTACATGTTGTTCAAATGATACTTCAATAGAAAAATTGCATAAGAAATGTTTTAAATTTACTTGGTGCTGAAACTTTAAGTTGGGGTTCCCACAGATATGGGATAGAGCAATTTAATTGTTTTAAAATCCAACATTTCATTTCCATGCAGGGCTTGAATTTAAGAGCGGCATGTGGCAAATTGCAGAAGTGACCTAGTCATATGCCCCATTGGCCTGAAAATTAATTTTGGCTTCTGCCAAACTGGCTATGCCTTATTTTGCCTATTGCTTAAACGCGACTCCTGGATGCTGTTGTATTTTGAAAACATGAAACCATTTACACTAGTTTATTTTGGAATAAAATAAATTAACATTCTTCTGTATTAGGTCCCTTGCTCCTTTCTATTGCTACTGATCAACTTATTGACCAAATCAGAAACCTTGCACAGTATTGTTGCCAGAAAACAGTGATGTGAAGGTTTCTTTATTAGGGACTGCTGGCTGAATTGTTTTGATTGAGGCAATTGGAACACTTTGATTAGTAGTACCCAAAGATTAATTTGGAATTGCTCATAACTTCCAAGTCTGATCATAGGCAGTGACATTCAAAATGCTATAGACGAGAATTCTTTCTTTTGTTTACTGTGAAATTGTCAAAATAGTTGTTACAAATGTATTACTAGTTCATCAATATAAAACACAATCAAATAACAATTGAACTTTGTAATACACAAAAGCATTTCCCCGATTCTGCAGTTGGTTTAGTTTTTTTATTCTATCAGTAGCCGAATGAGGGAATTCTTACATTCTTATGCCTGCTTTCAATTAGCACTATTCTTTACGTAAAAATATGTATTTCCATATCGTCGTTTTTGCAAGCTGATTGCTATACACTTACTTTCAGTTTGTTTCATTTGATTTATCATCATTTAAGAATGCTTATATCTGGTACTTTCACGATCATTGATGATCATTTACCCAGAATGTTCTTCATATGGTGGTTAAAATTTTAGTTCTGAACTGTATTACACCATTATAAAGAAGTGAACTTCCTCCACAGATTTTATGTCTTAATATTTTGTAAATTTCACAGTTCTCAACTCAATATTGTTGTGCATGTTTCTGTACTTTATTACATTCAACTAAGCTGCTAGTGAACAAATCGGACGTGAAGCGATAAAACTGAGCTTGAGAAAATTGTCTATCGATTGACTTTTTTTTCACATGCATTAACATATTTACAGAATAGTACTGTGTATATGCACTACATCAATAAACTTGCATGCAGTAGCACAATGTCTGCATGTTTAAATAAAAAATAGCATTTACCGATTCAACATGAAACTGTTTTTAATTTCATTTTGTTTAACAGTTAATCTATTTACTAAGTAGTGCAGAAATGAGGAGTGATAAAAATTGGATTTCGAGGTTGTATAAAATGATTTATGACACTAGTAGTTGCAGATTGGAATTATATTTATGTAATTCCAATATTGTTTTTAAAATTATTGGATAACTTTTAATCACTTTTTGTTGAATTGCTCAAAACTGCAAAGCTGAATGGTTGTATGACCGCTGTATTGTGATCTCATTTGCATTTAATTTGATGATTTGTAGTATTGATGAGAAATTCTAATGGAACACTGGCCTCAACATTGTTTGTTTTAAGGCATATTGTCACATTCCTTCCATGCAAAAACATGTGTAGCACAAGATTTGATTGGCAGTTTATATCTAATGATATAGAACATGTTTAATCATTCAGACCTGAAGACTTACTTTTTAAATACAATTATTTGGTGCTTTAAATTACAGCAGTATAAATGACTCATAAACTGCCCCAATTCCTGTAATGTAAAACAGCGCTCTTAGTGGCCAGTGCACTGGTAAAGAATGTTGTACTTTAATAAAGTAAACCAAAATTTACCTCAAAACAAATTGCCTATTCTAACTTTAGATATTTGTGGTGTCCAATCTGTGGGAGCCCTATAAATGATCACTTGCCTTGTAACATAATAAAATTGATTTCCACTGGGCAGAAATGCTGAGACTATGATAATCGGATAATGTTGTTAATTTCAGAAGTGGATGTGATGTCAAATATTCTGTATATATGAATAACACATCTGAAATGGCAACTTGTATTTTAAAGTTTTTTATAGTGGTCGTATGGGTTTTGTCAAGAATTTGCAATATTATGTTGCATTTAGCAACATCAGGTACATTATCAAATCGAGGGATCATGTAATAAAATGTTTTGAAAATTTGATTGTGTTTGATTAGTTGAAACTAGTTTTAAAACTGAAAATTGAGATTTGGCTAACCTTGCCAAACGTTAGTACAAATTTAGTGACGTTTTTTGTGTCAACTGCTGTTGACAAAAGTAACAACTCTTGTATTTCAAGGATATTCCAGATCCAAAGATTAACAGATCATCATAGTGTACCCTGACCCAATCACTGGCCTGCTTTTACAGTAATTGTATATTTAATATCGGCAACACGTTTTTCAATAATTCCAGTTTGCGTTAATGTAAAATGATATGAAAAAGTTTTATAAATACATTTATTTTAAAACGGCAAATTTTTATTTGCTATTTAATGCATTTGTGCCGTTGTATTACTGACAAATGTTTTTACAAATTATAAATGTAAAACGTTTTAGTTAATTCCAAAACCTTTTTTTTTTTCTTCTCTTTATTGAACAAAAAAAAAACATTAAAAGTTTAGCAGCTACCTTTCCACATCCAAAGATTGCATGGACAAACTGAATGACCTGACATTCATTTCAACTTATTTTTGTGCTTATATCGAATTAAGTTCAAGCACACACCTCGGCCATCTAGGCTGTTTGTCCAGGACCGTAGGTTCGTGAGAAAGGTGTGGTCCTAGCCCATGAAGTGGCGACAGCAGGCTGTCTCTATCTGTGTGGTCTTTAAATAGAATGTGTTGAGTGCATCGTTAAATAAAATATTTACTTCCTTCCAATAGCCGATGATTAATTAATCAGTGCTCTAGTGGTGTCATTAAACAAAACGAAGAATTTGATCCCAGCACGTAAATTTAACGCACCTAATTTGGGTCATTTTGTCTATTCGGGAGTGTATCGCGCAATTGAGCATTTGATATATTGATCATCGGCTATTGGACGTCAAACATTTAGTAATTGACATATAGTCTTAGAGAGGAGACCCGCGGCATTTTTCCATTAGCAAAGGATCGTTTATATGCAGTTACCCACAGACTGCAAAATACGGCCTTTAACCAGTTGTGCACTAGTTGGAATATATGAGAGAGAGAAAAAAGAAAAAAAATTCGCTGAATGGATAGGCTACATCGAGATTGTTCGATCCTGTCCTGCAGTGCCAGCACTCTACCAACTGAGCTAAATCAGTTACAGAATGTGTGTGGCTATTTGGTTTAACGTGAAGCGGACGTTTGCAACAAAAAGGCCTTACAATTAAGTTTGAAAGTTATAAGGAATCGCGACTGGCAACTTTCAGAAAATTCGGTGTGCTAGATGTATCGTGAACAGTACATATTTTAGTGTTCTAGTGAATATATTTGAAAATATTTCAAGCAGGAATACCCCTGCAGCACTATCTGCAAGAGGGGGTACAAACCTCGCACACAATCCGCCGCCCCAATGTCAAATGCCTTCCGACGCCCCTTTAAGTCGTGGATGCATTTTAAACACTATTTATTATTAATGTCTTGAGGAATGTTGGACTTTGTTGTTCCAGCAGGTTTCAGCTC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Transcript

ctg176-2.7-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00438	S-AdoMet_synt_N	S-adenosylmethionine synthetase, N-terminal domain	Domain	Interproscan
PF02773	S-AdoMet_synt_C	S-adenosylmethionine synthetase, C-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002133	Family	S-adenosylmethionine synthetase	Interproscan
IPR022628	Domain	S-adenosylmethionine synthetase, N-terminal	Interproscan
IPR022630	Domain	S-adenosylmethionine synthetase, C-terminal	Interproscan
IPR022631	Conserved_site	S-adenosylmethionine synthetase, conserved site	Interproscan
IPR022636	Homologous_superfamily	S-adenosylmethionine synthetase superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11964	S-ADENOSYLMETHIONINE SYNTHETASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004478	Molecular Function	methionine adenosyltransferase activity	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0006556	Biological Process	S-adenosylmethionine biosynthetic process	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg176-2.7-1 global RNA-seq network