Gene detail

Detailed information of ctg173-20.3-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg173-20.3-1	MITOCHONDRIAL IMPORT INNER MEMBRANE TRANSLOCASE SUBUNIT TIM9B	chr6	85967859	85974275	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg173-20.3-1

GTATTGATGACTGACCAGTCTATTACTTAACACATGTAGAAGTCTGATTAAAGTTTTATTTATAATATAAATGTGGTCTAACAAAGTATGGTCTAATGCATTTTGTTACATTTAAAAAGTAATAATAATAATTTTCATTAGAAATGAATTTGGCTGATGAAACACATCAAAGAAATTTGAAAGACTTTTTGTTGCTGTATAACAAACTGACTGAGCAATGTTTCAATCACTGTGTTGGAAATTTTAACAACAAGAAGATATCTGGAAAAGAGTATGAGTGTATTGATGTCTGCACAGACCGATACGTGGGCTTCAACCAAAGAATCATGCACAACTTTGTAGAATACCAAGGTCTCCGCCAGGAAGCTGCTGTGAAGGAGGCGGAGAGAAAAGCAGCAGAGGCAGCAAACAGCCAATGAGCTGTCTAGTAGTGGTGTGTTAGGACATGAAAGAAGTGATTTTGATTGGAGAGAAAAACAGAAGAGGCAGTAAACAGCCAATGGCTGTCTAGTACTGTTAAATCATGAAACAAGTGATTGTGCTTGTACAGTTTGAATGTAAAACAAGTACATGTCTATGGCTGTCTGTATTTGGAAGATACCTGCTGTCATGATGAAAATGGTGTTTGTGGTTTAAATATATACCTACAGTATAATTAAAATGGTACACCAGCTTAATTAACACCTTGTAGCCTATCATCTGTGTGTCGCTCAAGCCAGTGCACCACTACTGGTATATCAAAGGCCGTGGTATGTGTTATCCTGTCTGTGGGATGGTGCATATAAAAGATCCCTTGCTGCTAATCGAAAAGAGTAGCACATGAAGTGGCGACAGCGGGTTTCCTCTCAATATCTGTGTGGTCCTTAACCACATGTCATATAACCGTAAATGAAATGTGTTGAGTGCGTTGTTAAATAAAAACATTTCCTTTTTTCCTATCATCTGTAGTAAAGATGCCAATACGTGTATCTTTACAGGGCTAGCTCTGGGTCAGCAGAAAAGTTTGCCAAAGTATCTACTAAACTTCAAAAGTTGCACAAACCAAGATATATTGATTATTTCATAAAATTATGTACCAAATCAAAATAAAATTTGCCAATTGTTTTTGAAATTCGCATTTGGCGAGTGCCAGAGTTAGCCCTGCTTTGGAGAGTGGGGCAGGTCAGACCCTTTTGTACATCTGTGTTCCAGCCATTGCTCCATAACTGTATATTAAAGGTCGTTGTATGTTCTTTCTGTAGCAGAATGTACAGTGAAACCCCTCTAGCCAATGGGACCAAGTAAAAGTATAGTTTTAAGAGGTGTCTGGTTTTGAGAGGTTATATTCTGTATTAATATTTAAAAAGGGACAATGAAAAGCGTTTGGTTTTGAGAGGGTTCACTGTATATAATGAATCTCGTGCTGCTATTTGGTTCATGCTGATTATATGGCAGTAACCGGTTTCGTCTCTTACTATATATTCAAGTGATATAGTAATAAATAGCTATGGTTTATGTGTTGAGGTGTCATTCAACAGGCATTCCTTCATCAACTAAGGGAAGATAATTCTACAAGTGAAGAGAAGCTTGCTACTATGCAACAACCAGCCTCGGTGGTGCAGTGGTTAAGCCATTGGATAACAGGCTGGTAGGTACAGGACTTGCAGCCCAGTACCGGCTCCAACCCAGAGCGAGTTTTTAAGGGCTCAGTGGCTGGGTGTAAGGCCACTACACCCGCTTCTTTCTCACTAACCACTAAACAACTAACCTACTGTTCTGGACAGACAGCCCAGATAGCTGAGGTGTGTGCCCAGGACAGCGTGCTTGAACCTTAATTGGATATAAGGACAAAAATAAGTTGAAATGAAATGAATACTATGCAACGTTTCAACTTGATCTGTATTTAATGCTTATAATTAGACCAAAACAGTTGAACATCTATTGAAAACCGTGAGATAATTAATCTTTGTGGTAATTTTATTTTGTTGAGTAAGGAGAAGAATGGAGGAAATCATTGTACTAAGGGGAGATAATTTCTTAAATATAAAAAAAAATAAAAAAATGAGAACGTGATTTAGCAGTGCTCAGGGTCGTTTCTTGTATAACAAATCTTGGACTAATAGTCACACTAAGATAACTTCATAAAAAAATTCAATTGTGACAACGTTTTTACAGTGTAATATGTTTTTAACCAGAATGTGAAATGTATGCAATATATACCATTTTTGAAATGCTATGCGTTTTGTAGAGAATATTTTTTTCAACATTTTTTGTTTTAAAGGTGTACACTGATATTAACACACACAGTTTGTACACCAGTGAAAATATTGATAATTATCAGCAGCTCATAATGAGTATGTAGGGGTGGGATATAGCTCAGTGATAAAATGCATGCTTGATGCATAGTCAGACTAGGATCGATCCCTATCGGTGGGCCCATTGAGCTATGTTCTATCCTGTCTTGTGGGATGCTGCATATAAAACATCTCTTGCTACTAGTGTAGTCGTTAAGCAAAATAAACTTAACTTTAATAAACTTAACGTTTTACAAAGGAAAGAAGTGTACAAGAAGTTTTAGAACTTCCAGATTGGCCAGTACGATATGGGTGATTTGACTGTCGTGAAATCTGTGGCCTGTGGAAAAGTGAAAAGCTGCAGTGTACAAATTTAAACAGTTTATTAAATAAATGTATTAGAAATTGGAAATTTGTGTGATTTATACGCAGTAAACTTTATACACATACAGTGCTTGTGTGTTA

Transcript

ctg173-20.3-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02953	zf-Tim10_DDP	Tim10/DDP family zinc finger	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR004217	Domain	Tim10-like	Interproscan
IPR035427	Homologous_superfamily	Tim10-like domain superfamily	Interproscan
IPR050673	Family	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13172	MITOCHONDRIAL IMPORT INNER MEMBRANE TRANSLOCASE SUBUNIT TIM9B	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
-	-	-	-

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg173-20.3-1 global RNA-seq network