Gene detail

Detailed information of ctg1665-0.15-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1665-0.15-1	OS02G0168900 PROTEIN	chr4	86783842	86791057	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1665-0.15-1

ACACCGTTTGTGAGTTTTTTGCGGGAATGTGTGTATTTTGTAAATAAAAATCCTGCATCATAATGACCACTTCAATTGATACAAACTCGCAGACGATTTCAGACGTAAAACACTGCCATCTTTTACCATGTGAAATACAGTACAGTGGAGATGCAAATGTTGCCAGTTATTTCCAGTCATCAATTAGAAGTGACGAGAATAAGGGAATTATTCTGAAGGAAAACCACCGCCAGGTGACTGAAGATGATGACCGTCACTTGATTGCGACTCACAAGTTTGAGAAGTTCACGTACTGGAATCTGGACAAAGTGCCCAGTGCAGATGATAGATTAGTAAAAGCACTACACTGGATTAATATTGCTAAAGTGCTTCATCGTCCTGTTGATGAAGAAAGCAGTCAGAAAAGTGTAACTGGAAAATAATGTCTGATCAGAGTGTAAATTTCATGAGACAACACTTCTGCCTATGGAGTATTGGGGAATAAACCCCTCATGGCTGGCTTAAGTTTGATGAATAACAATTAAATGGGCAAGATCTACAAACATAAACATGTTTTTTTAAGAAGTCTGTGGAATATTAGGGAATAAACCCCTTTGAACTGTTGCCTGGCTTAAGCTTGATGAATTAAAAGGGCAATATCTACAAACATAAATATGATTTTTTAAGAAGTGAATAATGTTCATATTATATGTTGATATTTCTCTTCAGACTAAATGGGGAACGCACCATTTTATGTCTTGTAAGGAATATAAATGTTTTTTTGTTTCATGTGGAGAATAATTTTGTACTTCAAATAAATATTTCTGCATCTTGGATTATATCCTATTCATATTTGTTTTCTTAGCTAGTTGTATATCACAAGAAACAAGAGAATAGGTAATGCATCAGTTGAAATCTTGTAAGGAATGTGCCGTTTTGTTTCATGTGGAGAATAAATTTGTACTTCAAATATTTCTGCACCTTGGATTACATCGTATTCATATCCATTTTCTTAGCTAGTTGTATATCACAAGAAACAAGAGAATAGGTAATGCATCAGTTTATTAGCATGTTACATTATGCTTTAATGAAATGCAGCACATGGCTCAATTATTTTAAAACAATAGGAATTGTATGTAAAACGGACAAGAAAAATTGCTTGACGTTATTAGTTATTACTAGCAAATAAGATGCTGTTTATTAGTACGTTTTAAATAAGTTAATGAGATTTAAAACATTTTTCAATTCTTTGTAGCAAAATTAATAATTCTACAATGCCATTTGATAAATTAAATGAAACAGTTATACAATGGTCTCTGTCAAAGGTTAATACAGTTGAAACCTGTCTAAACCGGACACTGAAGAAACCGGAATCCTGTCGAAACATTTTGTAGTCCCAAATTGTTTTAATTCTGAAATGCAACCCTCTAAACACAGGATCCTGTCTAAATCAGATAAATATTACGTCTCGGTTTAGACCGGTTTCACCGTGTTAAAAAAACAAAGCTAACATTTGTTTCTCTGTTGCCAAAAGGATCTTTTAAAAATTAGATTGTAGCTTGATCCTGTTTAGACCGGTTTCACTGTATTGCCAAAACAAAGGTAACATTTTGGTTGCTCTGTTGCCAAAATTATCTAATAACTTGTCTATATACAGTACGGGTGAAACAACTCAACAAATAAAAGTGTCGTTTGTAACTGATTAATCAATGTGATGCTGTAAAAGCAAGTGTTCAACTGCATTGTTGAGTGGTACTCTGTATTATTGCAATCATTCACAGCAACAATTTATATTTTTATTATGCTTTTACAGAACAAAAAAATTTGTATAATCTACTAAACACGTGGGAAATTAGAAGTTTAAAGAGCACTCCTTAAAATAATGTGATAAGATGGAGAGAACTGAAATGCATGTATTTACATGTCCAGGCCCTAATCTAGAATTAAATTGTAATACATATATTTCAATATGAAATACTACTACTAATAAAATTATTTAATATTTTCATTGAAGACATAGTGTTAAGTAATTGATAATTAATGTGTCATTATGTTAAAACAAAAGTAATATTATTTTCTTACATTACTGAAATGAATCTGGCCGAGAACCAAAAGACTGGTCAAATGCAAAAAACATGACGAGCATTAATGTAGAATTGTGGCAAGTAAAAGAAAGGACTGATAATGTGTCAAGAAAGCTATGAAACTAAACAAGATGGCGTCTTTATATCTGTTGTGTGATTTTGTTTTAAAATCCGATTACAGCAACTTCAACTTCTCGATTATGTTAATAACACAATGACTTTAGCAACCTTTTGGTATAAAAAAAAATTTGACAGGTTAGATTAGGGCTCAGTGTTAAATTAATATAAAAGTGGAAATTTAACAAAAACAAACTTAAAAAACAGAAAGATTACTTACATTTGCCAATAATTTGGCACAACACTAAAAAATACATCATTGTATACTGATACCATAAAGTTTTACACTGGATGGATGGAAAACAATTACCAATAAAATTAAGATGACTGATCCAAAAATAGTGTTTGACTAAAAGAATTAAAGGCACTTTGACACAAAAATGGAAAAGAAGAAAAAAAGCAAAACAAAAAACATGAATGGGCATTCAATAATTGCTTTTATACATGTTGAAAGTTCTGTTTTAAGAGTAACTTGATTCAAATGAGGTCCACGGACCTAAATGGTCATCTGAATAAATTGCTGACCCCCCACATACCAGACTTGTAGAGTGTGTGACAGCTATTTACAGAGTAAATGTATCTATAATTGGTAATTTGCTTCCCCTCGAGTCGAGGAAGCTTGTTGTGAAGAAATTAGTCTTAGTAAACTTCACCCATCTCCAGGCACAAACCAACATTAATGAAATTTACAACTTTGATAAACTATTTACCAGTAATGATTTCTTACATATATGAATACTATTTAGTTATACCATTTTTGCAATTAGAATTTTAAACACTTACTTAGGCTCAGGTAAACTTCACCCACCCCAAGGCACAACCAACATTAAATTTACAACTTTGATAAACCATCTACCGGTAATGTTTTGACATAAGAATACTATTCATTTTTACCATTTTTGCAAGTAGAGATTTTTTAAACACTTACTCTGGTGACCTGAAAGATATTTACATCTTGCCATAATAGAGTAGTGACTAGCTAGTCAATGTAGCTTATCCACTCAAATGACAATATGGGTAGTGGAGTACAACACAATACATCACACTCAGCATGGGACGTTTATTGTCAGAACTAACACATGATGCCCAACCTTACTGAAACTATTTCAAAATTATTTTCTCAACCATTTATAACAAAGGATGAACAAAAAATGGCTCCATTACAACCCAGGAACATGCTAAACACAAGTGTTGGGTTTCATACGACGTTGGCAATTGCTGCTATCAACCATTAACTCAACAACGATGAGCCTGCTATATGACGTTAATGCACTACTTCTTGTTACTCGTAAACAAATACATTCTACTTCCAACTGCTTAGCATGTGTTCATTAAACGGTGTTGACTGTATCACAGAAAAACATTCAAACACTGCAAATGACAAAGAAGTAACATTTTGTTTTTAAAAAACCAAACAAATTCTTCTTTTTCAGACAGACAACTATTATTTGTGTATTGTAGTGAGATTATGCTTTTCACACCCACATCAGGAAAATGCTTTGAACATGTGCAGAATGTGGCCTGAAAAACCTATCAATATAAAACATGCGGCTCCATGTTGTTCCTGCACACTCAGTTCATTTGTAGGTCTGCCCATGCATATGTTAGTTTTAACCCAGGTACAAAACATATCACAGATCACTTTGGAAGCTTTCACAAACGTCAAGTCTGCTGTTGCATAGACATTTCCATGGCTATCTTCAACATGTCCTCTTCACTTAATTCTGTAAAATACAAATTTTCATCAAAGTATTTAAAAATTAAAATGTAGAAGAAAAATTAATAATGCAATGTATACATTTAAAGGGGCATTCCTGAGTTTTCTGCAATTTTTAAGATGTTATTTACTAACAGACTTTTTAACGATTATAATTACATATCAAATATATTTTTCTGCATAAAATATTAGTGGCTGTATATT

Transcript

ctg1665-0.15-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF08615	RNase_H2_suC	Ribonuclease H2 non-catalytic subunit (Ylr154p-like)	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR013924	Family	Ribonuclease H2, subunit C	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR47204	OS02G0168900 PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0006401	Biological Process	RNA catabolic process	Interproscan
GO:0032299	Cellular Component	ribonuclease H2 complex	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1665-0.15-1 global RNA-seq network