Gene detail

Detailed information of ctg1540-0.9-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1540-0.9-1	PROTEIN ARGININE N-METHYLTRANSFERASE	chr6	10459075	10489834	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1540-0.9-1

AAAAACTGGTATCTTGCTTTTGTTAGTATCTTGAAATAAAGCAATGAAGCGGATAGTTGTGGGGGATTTAGTCAATAAATTTCACAAATGGCGGGGTTAACAACTTTGTCCACATTGAACAAGGAAGAACGATCCAATGCTTTGGTGCAAGAGTCTTTAAAATGTGCTTCTAATTGTTTAAAACTAAAAAATTATGGCCGTGCTTATGCACATTTTCTGCTAGTTTTACAACTGAGACCAGACTTAAAGAAAACGCCTTTAAAAGAAGATTTTATTTTATCTTTAAAAGAATGGACGGAACACTTGGAGAGGCTAGGAAGACTAGAAGATTTATTTAAATGTTATGACCAGACATGTGAAATATTTCCAGAATGTGATGTTGCAATGAACAACATTGGTGCACAGTTATTTAGACTTGGGTACATCGATGAGGCTGCAGTGTTTGTGAGAAAAGCTCTGAAACTCTCTCCATCATATCTTGCTGCGAAGGAAAACTTGGAGAATATATGTTGTCACCTGGTGGAGCGATGGCATTTCCGTATGCTGAACGACATGACCCGTAACAGAGCTTTCCGAGATGCCATCGACATGGCTGTGGCACGAGGTTATCTGCATGTCCTTGACATTGGTGCGGGCACTGGTCTCTTGAGTCTGTTTGCAACTGAAGCAGGAGCATCGTCAGTGTTTGCCTGTGAACAGAGTAAAACCATGTTCACAGTGGCTCAGGAAGTGTTGGAGTCAAACAGTGCCATGTTTCGGGTGTGTCTCCTGCCCAAGATGTCCACAGACTTGGTCATTCCTCAAGACATCCCAACACGGGTTACTCTTGTCACAACAGAAACGTTTGATGCTGGACTATTTGGTGAACACATCGTTTCGACTTTACATCACGCCTGGCGTAATCTCTTAACAACAGAAACAGATGCTGGGTTTGAAGGGAAGGTCATTCCTCGAGGTGCCACTGTGTATCTGTGTCCGATCGAATGTGAAACAGTTCGAAAACAAAACAGATTGTTGTATCCAGTACTGATGAACCTCGATCTGACCGGTATCACAGTCGTGTGTCGGACGTCCGTTGACCACAAGGAACCGTACACAACTGAAGATCTGTCGGCTGTCAGAAGTGGATACCGGCAGCTCCATGAACCGAAGCCAGTTCTTGAGGTCAACTTTGATGATCCACTTGAAATTGAAAAGCTGCATTCTGGGCTGAAGTTGAACTTGGAGCTTGAAATTGCTAACAATGGTGAACTTGATGCTATTGCCATGTGGTTCGACCTTCACCTTGATGATAGTATTACCATAACAACAGCACCTGATGCAGTGAACTGTTGGGAACAAGCCATTTTCCCAGTGCAGCCAATTAATTTTACTTCTAAATCTTCCTCAGAGTGTCTTGGTGATGAGAGAGAAAATCTTGCGGTGAAAGGTGGAGACTCCCTGAATGTAGACTTGTTACTGGTAGATGACTGCCTTACGGTGGTGTGTTCCAACATCAAACGCAAGAACAGAGGTCACAGGTCAGGGGGTCGAGAGACGACAGGGGAAGTAACCTCACAAGTTGAACCACAAGGAGATGTGGAATTTGAAACAGAAACGTTTTACAGTGCAAACGAAGTTAGTATGTCACAGGCTCATGAGAGGACAGATATTTTACATTCATCTCTTGAGACTGGAAGAGTTTCAGAGATTCAAACAGAATCAGCTAAAATGAAGGTTTTGCATGAAGTTCAAACATTACAAAGTCTAAAGTTGACTGAGGTAGAGAATTTGCATGCTATGGAAAGAGAATCAAACTTTGAAGAAAACACTGCTGCCTGTGTTTTCAACCAGTCCCGCAAATTGACCAACATGGAACATGTTCATACACTAAGTTCCTCTGACATCGCTCGTCTTAATGATATGACATTCCACAAAGCTTTCCACGAAGGACTAGAAAAACACCTTCTCCGATGCCAGAACACTCGGGTGACCATGCTGGACTTGTGTTCGGGGTTATCTCCCTTAGGCTTGCAGGCAAGTCTCCTGGGTTATTCCGACATTACAGTGGTGACAGGCAATGACAACATTAAAGATCTTCTTGTGGACATCGCAGAAGTGAATTCTGTGTCTAGAAGCCGGCTGAACTTCACTACAAGCCAGGGAGTGATGGAGTCAGACACAGAGTTCGACGTTATTGTCTGTGACCTGGTGGAGCCATCAGGTGTCCTCCGACAACAGGTCCTCGAGGATCTGGCCTTGTTACGGCTAACATCTCTGTCTCCGAATGGGATCATTTTCCCACACAAGCTGACGGCGGTTGGGATCTGTATTGAATCGGAACAGCTACTGAAGACGAGTCGAGTAACAAACAAAGCTACACTTGGCTTCAACATCGCGGAGTTCATGAAAGAATTTCAGGCCAGTACTCATTTGGACATAGACCTGCACACCTTGCAGTACACCAAGCTTTCGGAGCCGTTCGAGCTGTTTCAGCTAGAGCTAAACGAGACTTCCAGTGACATGGAACTCCCAGCATTCCTTCAGCAGGAAAAGGAAGTGGTCATTGAATTTATCGACTCGGGTCAGTTTGACGCCGTTGTTTACTGGTTCGAGATGCAGGTTTTCGATGAGATCAAACTGCTGACTGTCAATCCTTGCCTCCATTGGAAACAGGCTGCAAAAATGCTCAGTGAAAGTGAAAATGTCGAGGCAGGTCAGAGCGTGACACTAAACGTTGTGCTCAAGAACAGTTACATTGATATAAAGTGTGTGACCAACATTGAATAAAGGATCATGTGTTATAAAGTTTATCCTAGTCTTTTGTTTAGTTTATGCCATGGTCTGTGTGTTTAAAACTTTAAAGTCTATAGATTCAAATCTTTAATAACGTCACATGCATATAATGTGTAGGTGTTGCTATGACATTAAAGTAACAAGACTATAAAAAGTAACGACACCACAGGAGCACATTGATTTATTCATTATCAGCTATTGAATGTCAAACATTGGGTAATTCTGACCGTCCTAGAGATTGAAACCCACCACTTTTTTTCCATTAGTCGTATAGGATTTTTTTATATGCGCCATCCCATAGATAGAATAGCACATACCATGGCATTTGATATACCAGTCGTGGTGCACTGGTTGGAAAATGGCCCAGACCGACTGCACATCAAGTGAGTGCTTTAACACTGGGCTACCTCCCTCTACTATTAAAGTCGGAGTCTTAGTACAAAAGATTTTTAAATTCTGTTTTAACGCAAAATAACTTTTCTTTAATTGGCCAACCAGAAGATATTTTATTTTTATGTCACAAACACCTATCATGGCCTTTGATGTATTATTACCCATATGGCTAAAACTATCTTGGTATATAGACTGCTACGTCTCACTAGAACGCCAAGTGGGACGTAACACTTTGACGTCATCGATTGGCACACTACAACCTTAAAAGCAGGTCAACCAAACGAAATGAGTGATATAAATGAAGCTTGTGACAACTGAAAATTATTTCACTCTGGACTAAATGGAAGCTCATTTAATATCCTATAATTACCTACATGGTACCATTTTGAATATGGAAAAACGAAGTTCTGTTAAATCAAGGGAGATCAGTCCTTTTGAATAGATCGTCAGACAAGTCAAGTTGAGAACAGGGACTTAATATCTTAATAGTTACTGATTCTGTATTCAGAATAGACGTGCATCAAGTTAAGATTTGTAATTTGAATAAATAACGCAGGAATCCATTTTCAAGACTGACAATTGTTTGGTAACATGACAGAGAATTACAGGGTGGCTTTGGTTACACATGCAGAGTACAGACAATTGAGTATTTTACTTAGAATCTGCCCACAATGTTTTTGTCTATCATTCAAGACTGCCTCTGATCGGATATTAACATGTTTATATTATTTTTGTTAGTTAATGTTCTTTTTATACTGGTAGTACTGATCTTGACATGGAAAAATCAAGTCTTTTCATTTGTACAATGTTTCTGGGGGTTTTACAGATTGTCCCAAATGTTCCATATTCTCCATACAAACTTATGATTTTGAATGATAGTTAGCATACATTGTGAAATGACACACTCAACACATTTCATTTACGGTTATATGGCGTCGGAACATTGTGAATGGGGGGCTGCCATTTGAAACCATTGTGCTAATCTCAGTATCCAATTACAAATATAATTTCTAGAAATTGGATTTTTGGGGGAAACCCACTTTGATCTTTGCAAATCTTGACAGTAAATAAGGGATCATTTACTTGGTGTATACATGTACATGTATGTTTGAAAGGATGGTCGGTGTAATCAACAAAGTGGATAGGGTGGGAGACATTTTATAAAATACAACATAATATTGAGTGAAACAGCAGACACTAAGGTAATACTAGAGCCTTTCAGAATGCAAATTACTGTCACAGCAAAATGTGAAATTGGCAAGAGAGTGGATTGCTGGATTTACAGTTAACTGACTTGCCGTATAGTACTTCATTACCAACTGCTGTGCACAAATGGAATACTGGCATGTGATATGTGCATAGTTATTTAATAAATACGGAATTTGTATTGCAAAGCCGCACATTCAAGACCTGGCAGTGAAAACACATAGGGGATGTGTGTGCCACCCACCCCCCACCCCCCACCCACCCAATAGCCAGAGTTATACCCAGTCCTCTTTTAAAACTGACAGAAAAGCAGATTTAACACTGTCCAAAATACAATCCTCTAAACAACTAAGTAACTCAAGATATTTTGACTAATGCTTCCAGTTAAAAATTACTTCTAATTCAATGTGCATCTGTATGTAGCTCTGTATGGAGCAGCCACTATTAGAATAAAAAATGTATGAAATATAACAAATTTAATACACCATAATCGGAAAAAATAATACATGCAACAAAATTTTAAATGGACTCCAGGGTTTGCTGTCATTGTACAATGTTTCCAACTAATAAAGCCTGTTAAACAAATAAATTTACATAATAATTTATATAATAATTACATTCTTATT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Transcript

ctg1540-0.9-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF06325	PrmA	Ribosomal protein L11 methyltransferase (PrmA)	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011990	Homologous_superfamily	Tetratricopeptide-like helical domain superfamily	Interproscan
IPR019734	Repeat	Tetratricopeptide repeat	Interproscan
IPR025799	Family	Protein arginine N-methyltransferase	Interproscan
IPR029063	Homologous_superfamily	S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11006	PROTEIN ARGININE N-METHYLTRANSFERASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0016274	Molecular Function	protein-arginine N-methyltransferase activity	Interproscan
GO:0018216	Biological Process	peptidyl-arginine methylation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1540-0.9-1 global RNA-seq network