Gene detail

Detailed information of ctg1498-0.2-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1498-0.2-1	CYTOKINE RECEPTOR	chr12	11048003	11099407	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1498-0.2-1

ATGTCAACACCACAACAGGTAGGTTACAGCAGGACCTATGTCAACACCACAACAGTTTCTCCTCCCATCTCCGACTGCCGTAACGAAGCGCACAGTTTCCGGTGCTCAAACTACGAACAGTGTGTGCCCTGGCTGTTTGTGTGTGACAGTCACAGTGACTGTGACGATGATAGTGACGAGATGCTATACGAATGTTCTAAAAAAGTGGATCTCAGTGTGACAGTGCCGAGTGTAACAGACAGAACAATTTCTTTAAGTTGGGATAAATATTCCGGAATCAACGTCAAATACATGGTGTCGTATATGTTGATGACTTTAGTGCCGTCTGTTCCACGCATTTTCCATGCACAAATGATTACCGTTCCAGAACTGAAAATAGCTCTTGAGTGGGAACGACCTGAGCAAACCTATGGCAAAATTACTGCCTATCTGATTCACTTGAAGGACACACAGTCGAATGCTGAAAATGAGATAACGTGCGACAGTAGCCATTGCCATGGGAGTACCATTCACTTTGATCTGACAGAGGAATATCTCAGTTATAACAAGACATACACAATATGGGTATCGGCTGTGAATGATGCGGGGGAGGGGGACAGAACAGCTCATAAAACTGTGACCTTCTCGGACAACACATCTCAGGAAATGTACCCAAACTTTGTCCTGGAAATTATTATAATTTCCGAGTTGTTCCCGTCTTTAAAACTGGACTGGGAAATCCATCGAAGGTTCTCCATACTCGTACAAAAGGACAAGTGCTTTTGTATTTACAACTTGTCCAGTGTGAAAGTTGGCCCTGTGACTGGTGTGACTGCCACCGAAACGGACAACACAGAGGTTATGGTGACCTTCAACAGCACTGGTACAAAACCATCTGAATACATTGTGTATTACCATGAGCATTCTGAGCTCCCCGGGGAGCAGGTGATAACCGCGGCGAAGAAGGTGAAGACCAACTCAACGTTTGTCACAATCCGCGGACTGCTGTCGTGTGAGAGATACTTCTTCCGGGTGGCCGCGTATTCCCCGTACTGCCCACTGTCCTATCCCGTTACCCTAGAAACAAGTGAAGATCCTAAAGCAGCACCGAAACACATCAAGTTCCATCTGCTGGACGACCTAACCTCCGGGACTCTCTCCTGGGACCCTCCTTGCGACCACGAGGCACTGCATGTGGACTACGTGATTAAGACGTTGGAGGTGGGATCACAGAAAGGGCCGTACATGCAGCGAGTTCCGAAAACCAGCGACAAAGGGCGTCAGAGTTACAAACTCACCCATCTGACCCGTGGAGCTTCGTACAGCGTGGCCATCAGAACGTGGATCAAGTTTTCCAGATATTCCTCAAACCTGACCATACCGATACCCCCTTACCCCGAGCCACTGAACCTCGATATGTTCCCATATAATGACAAGATGCTGCTGCAGTGGGAACCAAACCCGAAGGACCAGCCGCCTAAAAACTTATTCCACGACCAAACTCGACCTGGACCCGAGTACCCGACACTTACACTAGATGATAATGAGACCAAACTCGACCTGGACCCCGAGTACCCGACACTTACACTAGATGATAATGAGACCAAACTCGACCTGGACCCGAGGTTACATGGTGGTTACATGGTGTACGTGTCCGGAAGTAAGAAATTGTCCAACGGCAACGACTCATTCACAAAGCAGACGAACAACACGAAGATTCTTCTTGATATTCCATTCGGATACGACTATACGGTCGCCGTATGCTACAACGCGATCAACGGATACTACGGAAAGAACGCAACGGAAGAGTTTCCATATGATGAAGACACTCCCATGATCCAAGGTTTCTCGGATGATGAACCTTTAATAACAGCCTAACATTTGACAAACGCTCCAACAGAGCTGTTCATGTACTGGGTCAACACTAGAGAGCAGCTTATTGGGTATTCGAATCGGGACTCCATTAATGTTTTATGGACATCAGAAAACTCCTGAAAGCATCATGATGGACATCGTAAGTCCTGAATATGGGACTTATGAATAATAATGTTATTGAGGACAGTTAAAAAAAACAAAAAAATCAGCTTTGTTGATACCACAGACCCCTAAATAATAGCTTAATGAGTATCTGGAACCCCTAAAAGCAGCTTAATCTTTATGAATATTACAAACGTCTAAAAACAGTTTTATGATCACCATAAGCCCTTTAACAATAGCTTAATGGATATGTGAAACATCTTAAAAACAACATAAGCCCCTAAAAGTATAATGAATATCAGAACCCATAAAAACATCTTTGTAGACACCATAAGCCCCTAAATATATAATGAACATCAAAAACCCCATGGTGAGAGTTTAGTGATAATCAGAAACACTAAATAACAGCTTCTTGTGCATGAGAAGACATCTCTGACTGCGTCCTAGCAGATGAAATCTCATTTTATTATGACATTGTTTTTTATTATTATTTGTGTTTTGTATATATAGCAATATACTAAATTGTGATACGTGTTGTAGAGAATAATATCAAGAGCCATTAATTTGTTATGCGAGCTACTCTGTCAAAAGATTACGGTCAGATTGTTAATGTGGCATATACCGTACGTGTAATGTTGTACTCGATTGACGAAATCATTCCATCTGTAGGTTAATCTGATTGGCCAGTCATTTGGCCGGGGTTTTTTTTTTTCTTTTGTTTGACACTTATGAATGATGAAATATCCAATTAGCCAGACATTTTGCTTTTTTTTGTGTGTTAATGATAAATGATTTATTGTTATCCATTTAATCATTTATTTGGCTTTTTCTTGTGTAACTCATGAATAATGATTTATCCATTTAGCTAGTTATTTGACTTTCTTGTGTAACTCATGTACAATGAATTATCCATATAACCAGTTATTTGGCTTTTTGTGTACCGTATTTTCCCATGTATTATGCGCACCAATGTATAATGCGCACCCCCCACTTTGAACATTTATTCCAAGAAAAAACCCATGAACCACAATATAATGCGCACCGTTTTTTTTTAATCCACAAAATCAACCGCGAATGTAAGATGTACCATTTTCCACCTGTCACCAAAATTAACTAAAAGCGAAATTAGCAGTATATTAAAGAAACAAAACTTAAGTTAGGTACTTGCGTACACAGACCTACATATCACACAAAATGTAAGATGTACCATTTTCCACCTGTCACCAAAATTAACTAAAAGCGAAAGCAGCAGTATATTCAAGAAACAAAACTTAAGTTAGGTACTTGCGTACATAGACCTACATGTCATATTAAACATAGGCTAGTACTTGCGTACTTACATGTCACACATGCATAAATCAAGACAAAAGTATATACCCATACACTCTAAATGACTAATAAATAAATGAAAACAAAAAAAAAAGCGATTTTTAAGGGTGTTTTGGCGTTTCATTGTAATGAACACTGTCAATAACCTGTAAACTGATTGCTGGACATTTTAAAAAGATTTAGTTTTTTCTGTTGTTATGTATAATGCGCACCCCCATTTTTAACCTGTATTTTTGGTGAAAAAAGTGTGCATTATACATGGGGAAAATACGGTAACTCATGTATAATGAATTATGCAATTAATCAGAAATTTAGCTTCTTTTTGTCTCACTTACAAATAATGATTTATTTGATTAACCAGTTAATTGTTTTACGGTTATCAGAATTTTTTATTTTCTCGTTAGAACCAGAATGAATTAATTTGAAACCCAGAATATGTAAAGCATGGATTTTTTTGGTGGGTGTTAAGAAAATATTGTTCATTAGACACCTAATGTAAATTTTGGTGGGTGTAAAGAATATATTGTTCATTAGACGTCTAATGTAAATGTTGATGGGTGTAAAGAAAATATTGTTCACTAGAAGTTTAATGTAAATGTTCAATCTTTCTGTGACTGGAAAGTATGTCTTTAAAGCAGCTAAAACAAATCCATCCATTTTGGTATTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGATTGTAATGTCCGACTTTCTTTGACATTCATTGTTTTATTTGTAGTTAGCAGTCTCAAATTTACATGCAGCATTTTTTAGCTTATTTATATTACACAGATTTTGAATATTGTTTTAGTTATCAAATACATACATGTATGTGTATGTGTGTGTGTACATGTTGTATATATCACAGATGTCAACCTTTACTGATCAACACCTGCAAGACTGGACAAAAATCCATAAGAAATCCATAAGCAAGGTGCAAAAGGACGGGGAACTGATTATTTTAAATTCAAGACAACATGAAAATGAAAATCGAGACTATTAACAAGTACAATTTTGATTAGTGCACATATATCCGCTAGGTGGCACCTCTCGTCCAAAATAAATACGACAAAATGGCCGTTTCCCGATTCACGAAAGGACAACGAAAATCACGAAGGATGGCTTACTTAGATGATAACGAGTCATGTAAAAATAATAATGAAACAAAATAAAACCTGAAAATGCGTGTTACCCATAAGGAATTTGTCCTACGCCCGTAACACTGTCAAATGCTAAAAAATCTGTAAGTCTTACGGGTGATCCGTAAGAGTTGACATGTATGGCATATATTTGTATGTATGTATGTGTGTGTGTGTATATATATATAGAGAGAGAGACACACACACACACAGATACATCAGGGCCATAGCTAGGATTTTTTGTTTGGGGCGGGGCAAGTGAGTAGTTAATAGTCTATAACTCCTTAAACAGTTAAGAAGAGAATTTTCTTTAAGTTTCTATAATGCTTGCCCCCCTGCTAGCTACGGCCCTGTACATGTACATGTAGGCGATATGCCAAAATTCTTTTTAAATGGCCAGCTAATTATATGTAACAATAATAGCTTATTAGAACAGTTGGCTGTTTACTAAGAGGTACATATAGTGGCTGGTTTTATACAAAGCAGTTAGTCAAGGGGCAGATTACTATGGAAGGAACGAAGAAAGTGCAGTTTGAAGCTAAAAGTTAAAAAAATATGGCACACTGGGGGTTTTTTCTGAGT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Transcript

ctg1498-0.2-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00041	fn3	Fibronectin type III domain	Domain	Interproscan
PF00057	Ldl_recept_a	Low-density lipoprotein receptor domain class A	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002172	Repeat	Low-density lipoprotein (LDL) receptor class A repeat	Interproscan
IPR003961	Domain	Fibronectin type III	Interproscan
IPR013783	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like fold	Interproscan
IPR023415	Conserved_site	Low-density lipoprotein (LDL) receptor class A, conserved site	Interproscan
IPR036055	Homologous_superfamily	LDL receptor-like superfamily	Interproscan
IPR036116	Homologous_superfamily	Fibronectin type III superfamily	Interproscan
IPR050379	Family	Type I Cytokine Receptor	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23036	CYTOKINE RECEPTOR	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004896	Molecular Function	cytokine receptor activity	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0009897	Cellular Component	external side of plasma membrane	Interproscan
GO:0019221	Biological Process	cytokine-mediated signaling pathway	Interproscan
GO:0019955	Molecular Function	cytokine binding	Interproscan
GO:0043235	Cellular Component	receptor complex	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1498-0.2-1 global RNA-seq network