Gene detail

Detailed information of ctg146-8.10-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg146-8.10-1	RECEPTOR-TYPE TYROSINE-PROTEIN PHOSPHATASE	chr6	29621462	29652873	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg146-8.10-1

AAATAATGTTGTTTGTTTATTGCAGCATGTCCACTGAACAAGTATGGGTGGCGATGTCGATTTAAGTGTCGATGTCGGAATGGTACGTGTGATCCACAGACGGGGAGCTGCAAGTCCGGGTGCCGGTCACCTCGATACGGTACATCGTGTCAACTCAAAAACCAATGTTTATACGATTTACATGGTGTCAACTACACTGGCACCTGGAATAAAGCAAAGGGAAACAAAGTATGCATCCCATGGTCTGATGAATTTGTTCAGAAGAAAGGTTACACACCAGATATGTTTCCAGATAAGAAATTTCCAGAAAACTACTGTCGTAATCCCCGTGAGAAAAACGGGAAGTACAGCAATATGCCATGGTGTTACATAGCACGAGGTGGAGATAAACCGTTTGCTTCCTGCACTGCTCTCAAAGCAGCTACCAAAAGTGTTTGCCAGTGCCCTGATTATATGTTTGGTGTGAACTGTGCGCAGCAGTGTCACTGTAGAAATGAGTCTGAGGTGTGTGACAAGCGTTATGGTAACTGTGGCAGTGGCTGTGCCCCGGGATGGTCAGACTTCAGCTGTCAGACAGCTTGTCCTGTGGGAAAGTATGGACTTGGATGCTCTAAGACGTGTGAATTCTGCCTTGATGACAGATGTGATCCGGAGACTGGACATTGTGTGCAAGGCTGTCAGGCTGGTCACCGTGGAGATTTCTGTGATACACCTTGTGCTCTTGGAACGTTCGGACCTAACTGCCAGGAAGAGTGTGGCAACTGTCGTGATGGAGAACCGTGTCGACCCACACTCGGAGACTGTTTCCGTGGTTGTGCCCCGGGATACACAAACACACACTGTAAAGAAAAATGTCCACCCGGGCGGTATGGCTTGAACTGTGACAATCTGTGTGGACAGTGTCACCCAGGAACAGACTGCAGTCACATCACTGGGTTTTGCACCTCCGGCTGTGACCAAGGCTACAAGGGAGATAAATGTGACACAGAGTGTCAAGAAGGGACGTATGGAGAGAACTGCACGGCAGTGTGCGGACACTGTAAAGGGGGAACTCCGTGTCTCACCACCAACGGCCAGTGTCTGAAGGAGTGTGATGAGGGTTACTTCGGATACAGATGTGTTGAAAAGATTGAAATGAGTACAATGGCGTCGGAAACTGGCGGGATCATCGGGGGAGTCCTCGCCTTCATCCTCGTCTTTCTCATCATCTTCCTGCTCGTTATTTTCATAAGACGCCGTCGACACAAAAACACGATGAGTATGACCCGTCATTATGTGACAGAGGAGCCAGTGGGACATCCCACAGAACACAATGAAAGTATTCAGCTGCTTGGAGACTCCAGAATCGAAAATTCGACAGTGTTGACATCTGAGACTGAAGATAACACTATAAATGAGGAGGTGAATGAGCCCATCTACGTAAACATCAACAGCAAGAAACAAACCAACCCCATCCCACTGTCCGACCTGTATGATGTCATTCTCAAATACAGAGAGAACAGCATGGCTGGGTTCAAGACTGAATTTGATGAACTGCCAATGGGTTTATTGGCTCTTTGTGAAGTTGCTAGGAGACCAGATAATAAAGCTAAAAACCGATATGGAAACATTGTTGCTTATGATCATTCTCGAGTTACACTGGAGCCAATATCTAATGAACCATTTTCCGACTATGTCAACGCAAATTTCATGGATGGATACAGTAAGAAAAAGTCTTACATAGCTTCTCAAGGTCCAAATAAAGCAATGATCCGTGACTTTTGGCGGATGGTCTGGCAACAAAGAGTTTCCAAAATTGTAATGCTTACCAATTTGGTGGAAGCTTGTAAGTACTGGCCGAGTGAGGGATCGATCAAGTACGGCGAGGTCACAGTACGAAATGTGAATGAAGCCAAGTACACGGATTACATCATACGAACCTTTGAAATATCTAAGGATTCAGTGAGCCGGATTGTTAAACAGTTTCACTTTACCACGTGGTCGGACCATGGCGCTCCGACGTTCCCAACCACCCTGCTGGCCTTCCGCCGTAAGATACACACCTACAGCCCAGACAGCACTGCTCCGGTCTTGTCTCACTGCAGTGCTGGTATTGGTCGGACAGGAACATTCATAGCTCTGGACTATCTTCTGGAGCAGGCTGCTAATGAAAACCAGATAGATGTGCTGGGCATTGCTCAGCTCATGAGAACTAACAGAGTGAACATGATTCAGACCTGGGAGCAGTATGCCTTTGTGTATGAGGCTGTTCTTGAATCCATCAAGTCGGGTGAAACGACCATACCGAAATCTGCTTTTAGAAACGTTTACCAGAACATGTCACAGACAAACAAAGAAGGAGAAACGACTCCATTAGAAAAACAGTACGAGGTTCTACAACTCCTGTCTCCAAACATTGATCGGGATGAATGTACTGCTGCATGTGCACCTGAGAACAATGGCAAAAACAGATTCCAGAACATCCTGCCAGCTAACCGCTGTCGGCCTTTCCTGTACACACCTGTACAGGGTTGTACAGACTACATAAATGCTGTGTTTTTACCTGGCTACACACAAAAGGACCGTTTCATTGTAACGCAGATGCCACTGCCCGGCACAGTGGCTGACTTCTGGCGCATGTTGTACGACTATACATCGGACACTGTGGTTATGCTCAACGAATTTGATCGCAATGATAAGTCGTGTGCCTTGTACTGGCCTGAAGAATATGGGTACACTGAAGAGTACGGTCCACTCAGTGTGGAGTTGCTGTCCTCGTCAGAGGCCGATGTCGACGTCACGATCCGCGTCTTCAAACTGAGCCACACAATCAAGGGTGAAGAGCGAGCAGTCAAACAGTTTCAGTTCAAGTCGTGGCCAGACTACCAGACAATCCCCAACTCTGTGACTGCTCTCTTGAGGCTGCAGAAACTTGTCTCCGATTGGCTCAAACAGAATGGAAAGGGACCAATCTCCATTCACTGCATGAATGGTGCCAGTAAGAGTGGTTTGTTTGCGGCGATCAGTCTGGTGCTGGAGCGTCTCACTATGGACCAGGAGGTGGACATCTACCAGACCATCAAACAGATCAGGATGAACCGGCCACAGTTCATAGAAAACTTTGAGCAGTATCAGTTCTGCTACCAGCTGATCTTGGAGTACCTTGACAGTCAAGATCACAGCTGAAACGGTGCTGTACGCTAGCTGTGTTTTTCAATTTAGTATGCATTTCACCTGGATAGTGTTGTATTATGTTATTGAAACTGAAGCAAGTGGATTTCTAAACATTGTTGTTACGGAACAACAGAGAAGAAACATTCCACTGTTTGTGTCATTTTAATCAGCATTCCAGATTACTTGTTACATGCGAGCTTGTTTGTAGTGTGCAAAGCATTATTAAATGTTGAATGTATTATGGTCTTCTTTTGGTTGAAAGTTTGGTTCGCTGCATTTTTGCTGAATGCTTCAAGAATTGGGAATATGTTTTAGTTATATATAAAATTTATAATTAAAAAAAAATATTCTTTAAAATATTTAGTTTTTTAAAAGTAAAATGAGTGGATATTTACATTAGGTATGTGCCTGAATCTTGATTGGATATAGATACGTAAAAAGAGTAAGCAAGCATTAGGTATTTGTGTTTTAAATATGTACATTGTACATTCAGCATTTATTTTGTTTTTAAATTGAGTGAAAGGAATGCTCTTGGTATTTAAAAATAAGAATGTGTGAAATACTCTCACTGATAATATTTTATGTTTTAAAACTGAGTTAAAGGTATGCATTTGATGTTTGTTATGTTTTAAAGTTAAATATATGCATTGGGTACTTTTTGTTTACCTTGAGTTATGCACTGTATATTTTGCTAAAGAGTCTGGCTCAGGTGGTTTTTAAATTCAGCTAATTGTATGAAGGGTCCAATGTATTGCATTAATTTACATATTTTATGTGATACGTTTTTCTGATTCTCATATTGCAATATTTGTAATTATGTTCCACAGCATTGTTTAGAAAGTATTTTAAATTTTAAACTGTGAGCTCTGTGTCCATGATTATTTGCCCATTTGTTTTCAATTATGGCAAGTTATATAACTGGCTATAAAGCTTAACACTGTCAGTAGTCATATTGGCCAGCCTTGTCCAATATATCCCCTGTTGTGTCCTTGTTTAACATACATGAAGGTCTTGTTTCTGTGAAATTAATAAAACTGAATTTACATTGATTAATTAGGTTGACAAAAATCATGTTCATAACTTTTATTAATTGTTTTAAAATAAAAATCTTAATTAAAATCAGAGTTTGCACATTAGTAAATTGCAATAATAAAAGATGTTTACCCCCCCCCCCCCCATTTTTTTTTAACTTTTCATGTTTTGAACTTCTAAGCTCTTACATAATTGTACTTTCAGCTTAAAATAGTATTACAGTTTTATCAAAATGTTAGATAAAACTGAACAAATATAAAATAATATTACTGTTTATGAAGATTGCTTTCTTACTTCAATTAAACATCTGTTAAAGCATAGGTTTTTAAAACAGCCATTTTATAATAATATATTTTAATGTTTGCATGTTTTTAGTTCTTCTGTTGCTGAAACCTGAAAGTATTACATTTGTTTGCAAATATTTAGAAATAAATAATCAAACATTCACAATCATTAGCTTTTTTAGTTATTTTAATATTAATGTTTTCATTTTATAATTACCAGCAATTGCTTAGATAAAAATGATTTAGATTTTTTAAATTTTATTAATATAATTCTATAGATAATGCCTGTGCTTCCAGTTTTAATGGCAGAGTTTTAAAATGAACCATGTTTTATAACATTTAGTAAGAATGACGTTTTGCTATGTGTACATGTATACTACCAATTTTAGTTTAATATATCATGTTACATAATATACAGAATTTAATGGAAAAAAGAAAAACTAAACAGAATAATTTATGTTGCAATTTACTGTTACAATCTCAGTTATCGTTCATAGATTTGATAATAAATATACAAATATATTTGCTTTT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Transcript

ctg146-8.10-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00102	Y_phosphatase	Protein-tyrosine phosphatase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000001	Domain	Kringle	Interproscan
IPR000242	Domain	Tyrosine-specific protein phosphatase, PTPase domain	Interproscan
IPR000387	Domain	Tyrosine-specific protein phosphatases domain	Interproscan
IPR003595	Domain	Protein-tyrosine phosphatase, catalytic	Interproscan
IPR009030	Homologous_superfamily	Growth factor receptor cysteine-rich domain superfamily	Interproscan
IPR013806	Homologous_superfamily	Kringle-like fold	Interproscan
IPR029021	Homologous_superfamily	Protein-tyrosine phosphatase-like	Interproscan
IPR050348	Family	Protein-Tyrosine Phosphatase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR19134	RECEPTOR-TYPE TYROSINE-PROTEIN PHOSPHATASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004725	Molecular Function	protein tyrosine phosphatase activity	Interproscan
GO:0006470	Biological Process	protein dephosphorylation	Interproscan
GO:0016311	Biological Process	dephosphorylation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg146-8.10-1 global RNA-seq network