Gene detail

Detailed information of ctg1439-0.0-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1439-0.0-1	IRON-SULFUR CLUSTER ASSEMBLY ENZYME NIFU HOMOLOG	chr4	46822295	46837105	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1439-0.0-1

CTAATCATGAATAAAAACATGCTAAACGTTTTGGGTTAAGTATATTTCGACCCGGTTTATTCTGTTGCGTGCGTTCCCTATACTAGCCCTAAGTTCAGCCGGCAAAGGTTGCGTTAACGTTTGTGATTGGTTTCCGACGTGGCCATTTGATTTAACGGGAACGAACGCAGTCCAGTTTTACCAACATTCCATTTCGGTTAACTTCGGTGTTTAACAAGGCCGATCAAAACAAAACAAAATGGCGTTTCAAAGGACTGTGTGTGGTGTTGGTAAAAATTTGCGACCTATTTTATTGTCAGCAAATCACTCTCCCGTTGCATCATATCATAAAAATGTGATTGATCATTATGAGAATCCAAGGAATGTTGGATCCCTTGATAAGAGTGACAAGAATGTTGGAACTGGACTTGTTGGGGCGCCAGCCTGTGGGGACGTAATGAAGCTTCAGATTAAAGTTGATGACGATGGTAAAATTGTTGAAGCCAAGTTCAAAACATTTGGGTGTGGCTCAGCTATTGCCTCAAGTTCTCTTGCTACTGAATGGGTGAAAGGAAAGTCGATGGAGGAAGCTATTAAAATCAAGAACACGGACATTGCAAAGGAACTCTCACTTCCACCGGTTAAACTTCACTGCTCCATGCTTGCGGAAGATGCTATCAAGGCTGCTCTTAATGACTATAAACTGAAGAACAACATTGGTGATCCACCACAAGGAGAGAAAGTGGCAGGGAGAAACTGACAGACTCTTCCTTGGGATTGTACGTGTTGAATTGAGTTTTTGTCAGTGTTAACGTATAATGGTGGTTTGTAGCTGACAGCTAGAACAAATGCTCTCCACGTCTTTTGTCCAAATTGTTAAATTGATTTGATGTTTGTTGTTTTGAGAATGAAGAGTTTAGTGTTAATTTTGTATTTAAAAAAATTGTGTTGGCATAGGTTGGAATTTTGTGTGTTGTTTAAGTGTGACAAAAATAAGCCAAGCGAATCATCATCATTTTTAATGTACTTTTCCAAATAAATGCAGATGTGGACTTTTGTTCCTGAGCAACTTTAACAAGAACATTTGGTTGAATTTAATTAAAAAGAATTGTGTGTTTAACCAATACGTCGTATGTGTATATATTAATTATGATAATAATACTCTAGAACATAATTTTTATGTTAAGAACTTAACTGGAGATTTACTTTGAATAGGCAGTATTCATTAACCTGTGAAATATAATATGATGTTAAATCTGTAATAATGTTTTGGTATATATCAGTTTTAATTTTATAATTATCTATGACATTGGGTTTTCGACTGTACAACTTCAGATGCATTTGTAGGGGGAGGGTTTTGGCATAAACCTATTTGGGTCCGAAATCATCTCATATGGGACATGTGGAAAAATTAATCTTAAAAAGTTACATTTGTATTTACAAGAATAGAATAATGATTACATATGTTTAGAATACCCCTCTCCCCTTCCCCATCTATTCAATAATATTTATTTTAGTTTAAAAAAAGTTAACATGGAATTCACTAGGAAACGATAGTGACTGCATTTATGAACCTATAGTGCAATTTCCATACCAATAACGGGACAATATTTCAAAATGTTAGGTAACTGGAAGTCAGTTCACGTGAGTTTTACTTGGGTAACTGATTGTTCGGTTACGTGAATATAGTTCTCGTAACCGATGAGTTAGGCCTACCTAATCCTAAAACACTTGAACTATGGTTCTGTGCTACATTGGTAGTTCAAATGTATAACATAAACTTATTTTTACTTTCATTACTGATATATGGTACTTTTAATTTTAGAATGTAATTGTGCACCATATAACTGATTGGCAGTTCTTATGATTTTAAAGTTGCGTAACAGACACGCGAACAGAACAGTGGTTCTCGTGAAATATTTTGCCCTGCAATAATGTTCTGGTTCATGTACATACATCATGTTTTTTTAAAATCTGTTTCTTCCAGGCCATTCTTAAAAGAAATAGTTTATTGTAACTTGACATAGTATTGTAGCAATGGCTACAAAGAGACTGGCAACTTCAAACTATCAACATCCCTGGCCATAACTGAGGGTGTTCATTATCTTTAAAAGTAAAAGGCTCTTTGGCATAATTAGGCAGCTATATCTACTGTGTAGAGACTATATATTAATTTACTTGTAAGCATAAAAACTAGATGCTGGTGGTGGCAGCAGCAGAAACCACTGAAAATCATAGCCTTACACTCACTAATGAACACTAATAATAATAAAAGTTGTGAAACTACAATTAACTTTTGTTTTACAACTGTCAAACAGTGAGAGCCTCTTTTAAACTAGTAGCCAGGGCTAAATAAGCTTGGAGACGTCTGAGCATATGGCCCAGTTCCCTGTATTAACACTGGAAGCCATTTTTCCCTGCTTTGATTTGTTTTGTGGGTTTTTTAAAGTAAAAAAAAAAAAAAATTACAACTGAAAAAACAATAGAACTTTTTTTAATGAACAGGACATACAATTGTTTTTAAAGATTCGCCCCATCTTTATAAAAAGGGTATTTACAACTGCTAACTCATAAATGTTATAATATCCATTTGTTTTTTTGTGTAGGTTTTGTGGTGTTAGAATTTAATAACCAGTAGTAGTAGTCATTGTGTTTAGATAATGCTGTTGATTTTGTTGAATATATATTAATGTTGGTGGCATAGTGAGTTCACCATTGATTTCACTTGCATGTGAAACTATCAACCACTTTACATATCGGACCAAAATGTTTTTTTACAGAGCTCATATAATCGGGGGACATTCGCCTGATTGGATTCTTCCCCATCTCAGTCAGTTCCCCACAAACTGGTATATAAGGCCCATGGTATGTACTGTCCTGTCTTTTTGAGGAAAAGTAATTACTTGGGCAGTTTCCTCTGAAGACTGTGTCAGAATGAACAAAAATTGACACCTCAAAAGCTAATGATTGATTAATCAGTGTGCTCTAATAATGTTGTTAAACTTTTAAGTTTAATCAGGAATTAGGCTGTAGCTCAGTGGCAGTGCTCTCTGTAATCCTATGTGGACCTATAGGGATTTCCCTTCCAAACTGGTATCCTACAACTCGTACATTAAAGGCTTCGGCATGTGCTGTGATATTGGAAAATGCATATAAAAGATATCGAGCTGCTATTCAGTAGTGGAGGAGCTGGCGAAAGTTGACACCTGCATCTATGACGGCTTGTTCTGAATGTGCACATTAAAACCTATGACCTGACCGGACCTATTCGGTAGGAGTGGCAGAAGTGGGTTTTGTTTCTCTTTAAACCACATGTTTAAATAATGTGTGAAGTTGGCACTGGATTGGGGGAGGCTGCCTAGTTACCATTTGCCCTTTGGCACCAAACACTCACTATGCCACTGTTTACTGTATGTTATTATTATGTTGTTTTAAAATGTGAAGCGCACAAAAAGAGTGTATTTATACACACAATGTTACGTGTAAATATAGTACAATACTTAAAATGCAATTTATTACCAAAGACTGCCTTGTACAACACATGTATACCATTAATGATTTATAATTAAAAGTAGTATAGTTTTCCAGTTACAGTTAAGGATTCTCTCAAAACTGAATGATACTTTTAAAAAAATGCATTTAATTGGGTGTGAAGATGTTATATCATGTTTGGTTTTTTTTAATTATATTTTGGCGTCCAAATATTGATGCCATTTATTAATCTAATATTAAAGATGCAATTTTGTCTGTTTTGGCATCATTCAGTTTTTGGGATAATCTCTTATAAATCAAATTTGTTTGGGTCATTTGTTAAAATAAAATCATTTAAGTTAATGATCAGTATAAGGGTACATTGTAGATTACACTTTTTACCCCAATGCATGCTCCTACTCTCAGAATTCATAAAAATCTGTTGCATAATGGATCTGCAACAGGATTTTATCATTATCAGGTAGAGCTGGGCAGTATTGAAATTTTAGGTTCTGTATCAAGTATTTTTGGGGTGATTTACCTCAGTATTGATATGATATTCGGTATTGACACAATACCAATACCAATATCGAGCAGTATTTTAGGTATACTCTGCTTTAAATGCATGCCTGAGTTGAGGCTTACCCGCTAATTTCATCTAAATAAAACTAAATTCCATACACAAGGCTCTTGTCTGATTTATACACAATTCATTTTGCATTCGTTAGATATATTGTTAGTGCTTTGCTAAATCATGGCGGGAAGTATTTCTCAATAACAAAACTTCAGTATTTTTAAATTTGCTCGGTACAGAAAATCAATATTGACATGATACCTATACCGAACAGTATATATGGTATACTGTCCAGCTCTATTATCCGGTATTTACTTTATTATTATTTGTTTAAAATGGCTGTCGTAAGATTACCTGAATTTCGAGGGATGCACTCATAATTGGGGAAATAGAAATAATAATAATTTCTGATAAATTATTATTGGATGATTTGGCATTTACAAATAAATGATCTTGTTGGTACAATGTACTAAATATCACATCATCACAATTTGGCAAAAACTAAAAATGATGTTATATACTTTAAAGAGTTCGCATTTATGCCTCTCTGTTTTTATTATTAAATTTTGTAATAAAACGGGTTTTTTAAATACAGTTCATTACATTTCAGTTCATTTTTTTTTATCAGAGTAAATAGAACATGTTTTTGAAGATTGTTTGTGAACAGGAATACAATACAAAGTTATAACAATACTCGGAGCAGTGTATAAAGTGGTTTACATTGTTTCTATATATACACGTGCATGTATGGATATTGAAAATAAAAGGCTTTTTAAAAAAAAAAATAGCTATGTTTACAAAAACCAAACTAATTCCAATGAAGACATTCTCCCTCCAAACTGTTCAGTTGTGTTAATAGGCAAGATAGATATTTGGAAATGTTTTGTTATTAGAAATCTGTGAAAATAGGTCAGTAAATTATGAGTAATCGAGTTCCAGGGCTTTACCTAGCAATACCAATAAGAAAAGGTGTTCT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Transcript

ctg1439-0.0-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01592	NifU_N	NifU-like N terminal domain	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002871	Domain	NIF system FeS cluster assembly, NifU, N-terminal	Interproscan
IPR011339	Family	Iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10093	IRON-SULFUR CLUSTER ASSEMBLY ENZYME NIFU HOMOLOG	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005506	Molecular Function	iron ion binding	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0005759	Cellular Component	mitochondrial matrix	Interproscan
GO:0006879	Biological Process	intracellular iron ion homeostasis	Interproscan
GO:0008198	Molecular Function	ferrous iron binding	Interproscan
GO:0016226	Biological Process	iron-sulfur cluster assembly	Interproscan
GO:0051536	Molecular Function	iron-sulfur cluster binding	Interproscan
GO:0051537	Molecular Function	2 iron, 2 sulfur cluster binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1439-0.0-1 global RNA-seq network