Gene detail

Detailed information of ctg1307-1.10-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1307-1.10-1	UNCHARACTERIZED	chr9	43660170	43676023	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1307-1.10-1

ATGGACGACAATGTGTTTACAGACGCCGCAATGAATATTTTGCCAGCAACTGCGTCGCCCAAGTTGACAGATATGATGTGGGGAGCCATCTCATACACCGGCAGAAATGAACTTGTGTTCGTACAAGGCAACCTGACAGCTGTACGCTACCGGGATGAAATTCTTCGCCGTCACATGCTTCCCATTTTGGATCGACAGAGAAAACTCTTTCAGCAGGACAATGCTAGGCCGCATACGGCACGTGTAACAATGGATTTCCTACAGAATGAGAACATTAATGTGCTGCCATGGCCATCAAGATCGCCAGATCTCAACCCCATTGAACATCTATGGGACGAACTGGACAGATGTGTACGCCAGCGTGACCAGGAGCCTCAGATGCTTCCGCAATTGTCACATGCACTGCAGGAAGAATGGACTAGGATTCCACGTGCCCGGATTCAGAGACTCATTCAGTCTGTGCCAAGGAGATGTCGCGCAGTGATTGCTGCTGCTGGTGGCCACACAAGCCAGTGCCCCACGACTGGTATATTAAAGGCTGTGTCTGTTGAAGGACGCCAGATAGAAGAAGTTGTTCAGAGTATATTCCACACACTTTTGATGCACAGAACTCTTGGAAAGTTTCACTACAAGCAAGAACATAGCTATTCTATTGGAACAGTTGGAGTGGTTGATGTGGATTGTGATTTCATTGACTTCACTTATGTACGCGTGGCATCTGAGTATCTTGAGAGCTGTATCCGGCGAGATGTCAGTATGTTCCGCGATGCTCTCAGAAGTACGGAGGAACCACAGTCTGGCCAGATAGCTCTGGAGTTTTTCCAGAAGAAGAGAGCAAGATGGCCGTTCCAGGCTGAATGTATCCCTTGGGAGGTGTGGACGGTCAAGCTGGACGTTCTCACACTGGCCAATGAACATGAGCGACAAGTGTGTCGAGAAAAGGTTGGAGAAATGCTGGGAGATAAAATCATGTACATTGCCGAGATGATGAATCGACACGAATATGTGCCAAAAATGCCTGATCAGTCCGATTTGGAGTTAATCTTTGATACTGTCCAATCAGATGTACAACCATACCTGTATAGAATTTCACATCAGTCAACGGGACCGTCTTCTGCTTCAGTTGGAACAACGATGCGAAAGTTCCTCAAGGATACTCTGGCTTTGTGATACACGGACTTGTCAGATAGATTGATGATGCCCCTAGAGACAGACAGATGTGGAAACCATTGGTGGATACCTCTTTTATATCATTGGAATGGCTGTTGCCGGTGGATGCCCACTTTGGTTGATGGATTGGGTTTTCCAAAGTGTTCAAAGATTGTGATAAATGAATTTTAAACAATTGATCATGATCATGGAAAGTGTTCTGAAAGACATTGGGTTGTTTCTTTTCTATGTGATGCAATTTTCTGCAAGATGTGTTATTTGTAACCATGCAATAGATATGTGCAAAAATGTGTGTTAGATTGTCAAACAGGATAGACTGCAGTGTTCGACCGACCAATGTTTGAGAACATCACTAGCCTTCACAGCAACTTTGGCTGGTGCCTTACGTATCATAGTAAAACAGTTGATAATTTTCTCTAGCCCAAACCATAAATTCACAGCCTGGACATAGAATTCAAATTGGACTTCAGTAAGTGATTGTAGCGTCATCCGGGGACTGACAGTCTACCCTGCATCATGTAATACTCTAATCAGAAGGATTTTCATTTGATCAGACTAAAAGCAAACCTTTAATAAACCACTCACCTCTAGTTAAATACATTAAGTGGTCTCTTAAAGCAGTTGGTTGTTGAATACAGGCCTAGTTGTGGTGTGTTGGATGATTTGTCAAAACTACAAGGCATCCTGTCTTTATCAAACCATTTATTTGCTTAATACATACAGTTTGTACTATATTGAGAGATATGTGAGGCAGGTAGGGTTAATCATTATAATAAATTTCTGCTTTATAGAGTGCTTGTTTTAACATGTTTGCTTAAACATCTAAAAACATACTAGCTGCAAAATGTGTTAGAATATGAAGTAATAATGTGTTTAGGCTACTGAAGTTCATTTTGGGATACCAAATTCCCATGGTCTACTAGATTTTCACATCTGCAAACTAATACACTACGAGAGACTAGATTTACCAGTGTCTAAAATTCACATTTCCTGTTTAAATTATATTCTCGAAAAATACTTACATGTGTAAAATACTACCTTTCCTATAATGCTTGCCTTTGATCCATTAATTGTAAAGTTGTATAACATCTTAAAAAGAAAAGTGAAGGCCATTCAACATTTATGTAAAACAAAAATCTGGCCATTTTGGTACCTCCATCCTCCATATATAATCATTCGTATTCACCAAGCACTTTTCTTCCTCCTCATTGTGACGTAACTGATCAATTTTGGGTTCAATATTTGTATTTTTAATTTGTTTCTTTGATACAAGCAATGATAAATATTTAATACTTATTATCATTATGAAAAAAGCAGCATTTATCTTAAAACAATTAAGGGCTACCCCCCAAAAAAGATGGCTACCACTGACAAATGTTAAGGTCAAGGCGTATATTAACCTGTTAGTTAAAAGATTGTTTAGTTAATTAAATGAATGCCAAAGTAACCAATAACTGAGCTTTGTACTTTCGTATTGTGTTCATGGAATGTGCTCTGGTGTTGAAGATCATATTATGTTTAATTTGTTACTAGAGATTGGCATTATTTTAAGTCTTCCTTTTGATCAGAAAGTGAGAACCATGCAGTGTGTCTAACTTGTGTCATGATGGTAATGTTAGTGAAAGATGCAGTAACTTTGTCCCGTAGTGATTCATATGGTAGTTCACTGGTATTAGGATTATAATGGTTTTGTTGGTTTCTAGTTTAGACTGTTGTAGGTTTGTGGAGATCTCATTCTGACTCTCCTGATATGATTTAAGCAGATTAATGTTTAGCTTCCCTCAGCATGTTAATAAACAAAATGGTACTACAATATGATTAACTGTCAATGCTCAGTATGATAATGTCTTTAATGGCTGCCCATAATCTAAGTTAGGGGAGCAGGTAATCACTGTAATCACAGGGTTTGTTCACAGTGAGGTCTGTACTATGGGATGAAGCTAAGCTAGCTATAAACACGGTGTTGGGAGACAAATATTATGTGATATTTTATACTAAAGGTTGAATTACATGTATTTCCAGTTTACAATCATAACATTTAGAATCCTAATTTGAAAATGTGACTAGAATTAATGATCAATTGCATTCATTGGATGATATCTTGTGCTGGATCAAATTAACATCTAAATGATGCATCACATTTAATCATTCATATCAGTCATCCACTGATACTCCTTATTCAGGATCCTGAGGTACTTGTAACTTGATCTAAATGGAAATTCTTATGAGTGTATATCTATAAAAATACGATTCTGCGTGCTATGATCATTTTGACTTTTAGAAATTAAAAGAAATGATAGTTACAAGAAGTTCAGACTTGTGATTATGTACCTCATTCGGTTGCCATGATTTAGCTACCAAGTAAGCGGTCAGTGGGGAAAGTGCTGAATTATGCTTCAACTTAGTAAGTGCTAGTTATTAACAAGAGATTCAGACTTTGTGGCTAAATAACTTACTGTTTAACAAAAACTATGAGGAGACAGCTTCCAAAAAATACTAGTTGGAAGTGGATTTATGATATATAAAAAACAGCATGTTTCAGGACAAAGAGTGAATTGTTTTATGACCAATGTTGTTTCTCGGAGTGTTTTTTTTTTTTAAATTAGTTGATTGGAGTATTTGCATGCTTTGATGAGTATGGCAAAGAGTGAGGTAGGATAACAGGTTGTGGCTTGTTTTTATAATTTGTGTGTTATTTTATGCTACATATAGTGCTTAGGTGGAAACTTGGATACCCTACAAATCGGATTCATTCCACTTCCCAAGTAAAGTGCCATACCATTTGACTGTCAGAAGTTGCTCATGTGTGATCTGGGCTTTTGTAGTCAATCTGAATGAGATATATCTCTTAGACTCTTAACAAGCTTGATGCACGACTAGCAGTCGGTAAGATTTTCTTTGTGACACCCTGGCTTAGGGACCACTAACTATATCTACTGATAATATCTTTGATGTTTGGAGGATAATTTCCAAAGGAAATTAGTATAGTATTTTACCCAGGATACATTGCCAGCTCTGTCTACAGGAAGGTTTGGTTGTAGTTACTTTCAGTAAGCAGCAACACTTACTATAAAACATAATAAAGATTTGTGGAGGGTTTTTCTAATCTTTGAGTTGTTTTATTTCCAGTTTTGCCACACTGTTTCTTGCCATCCAAGTCCACATCCCTAGTCCTTGTTTATTGTGTTTCACCATCACCAGCTTGTTGCTAATGTTTTGTTTTACGTTCTTTTTGTTGTTTGCCTCTGACAATGATTGTGACTGTTTGTTAAATGATTGTCAAAATCTGTACTTTATTATAGGTAGATTGTAGTTGTCTTTATTACTGACAGTATTTTTGTTGGTATTTATGTACTGTACTTTAAATTATTTACTAAGAAAGGCAACGTGTGCATAATGTAAATATTTCATATGGGGTTTTTTGTGTGTTTTTAATGTGATTTTTTTACTCCAATCATGTTGTATGAATTATGGCAGTTATTTTATTGACATAACCTTCATTTAAAATGTGTGTTTGTTGTTCAGGTAACTGTAAGTTAATGTTAGAATAACAAATAAGTGGACATTGTTACATTACTATTGATGCTTATGTGTTCAGGTATTTTGATATTTAAGTAACTTTCAAATATGAATGTTGTATATAGAGGATCATTTAGTATGTTTGTTTTATGATATTGTGGTGGAAGCAGCAGATTGGTACCCTGTAATCAAAGTGGAATTATTGATTTGAAACCATGTTGAAACTCAAAAAAATTAATTATATTTAATTTGTATTAGGTTTGTTACAGACATATATAGTATGTGTACAATGTGCCTGACCCAGTCCGTTT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Transcript

ctg1307-1.10-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07855	ATG101	Autophagy-related protein 101	Family	Interproscan
PF13358	DDE_3	DDE superfamily endonuclease	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR012445	Family	Autophagy-related protein 101	Interproscan
IPR036397	Homologous_superfamily	Ribonuclease H superfamily	Interproscan
IPR038717	Domain	Tc1-like transposase, DDE domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13292	UNCHARACTERIZED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000045	Biological Process	autophagosome assembly	Interproscan
GO:0000407	Cellular Component	phagophore assembly site	Interproscan
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0006914	Biological Process	autophagy	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1307-1.10-1 global RNA-seq network