Gene detail

Detailed information of ctg126-4.8-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg126-4.8-1	ANCIENT UBIQUITOUS PROTEIN	chr10	61618274	61641611	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg126-4.8-1

CAGGCATTCAGATTTCACGGTAATGTGGCGGTAAAATCACGGAATTGAAATTTTATTTCCCATGATTATTATATTGAATGTAACTATTCAACAAAAGTAATATAAACAGTTTCCGATGAGTTCCCATGATCACAAGACACGGAACCGAAACAGTGTTTTCCATGAAGTTTGAAATCCTATGACCTGTTTCTGTCCAGTATAATTTATATCTCATCTTCTAAACTCCTCTTTATCATATTACACTTGTTGCACAATAATCAAATTGTGTATAATTGTATTTTACCAAACACATGAAACATCCTCTATTTGTTCTTTATATCTGTTACAGCATAGTGCTGCGGGTGATGTTGGGCGTGACAGGACTAATACTTACTACTGATGGAGATGAGAATTACGATGCCCATGCTAGGATTCTGGTCTCAAACCACACATTGTTTCTAGACCACATTATTACAGACATTCTCATTCCACATTTCATGCCAATTAGTAGACCTGTTACACCATTCTTCGAATGGTTGCTGAGTTTAAAAATGCTGCCAAGAGAGAAGAGCAAGGAAGAAATAAAAACTCTTGTTAAATCATTTTGTGATGAATCTACATTTCCACTGCTGTTTTATCCAGAGCAGGCAACAACAAATGGAAAAGTGGGACTTCTAAAATTCAATGTTCTACCTTTTGATATAGGTCACTTAATTCAGCCTGTTGGTATTACAGTGAGCCGACCCACCGTTTTTAACATAAATATTACTGTTATTCAGAGCTCTTGGATGTGTGACCTACTATGGTGCCTTTTTGCCCCTTACACAGTTTACACATTAAGATTTTTGCCAGTAACGGAAAAGAAAGAAAATGAATCTACGGTTGAGTTTTCTGAGAGAGTCCGGTTCAATCTGTCGAAATCGCTGAATCTGAAACTGACGGACTTCACCCGGTCTGACAAAACGGATTACCTCAAGAGAAAGCAACTCTTACCACCTAGTCAAAATGCACAATCGGCAGAGAAGAAAGCTGATAAAAAGCCACAGTCTGAAGTGAGGGTTGAGGAACAGCCGATGGATCCGAATTTACAGAGGATGATCGAGCAAGTCCAAGCAGTTCTTCCTCATGTTCCAGCAGCAGCAATAAAGAAGGATATTGAAGTCACTTGTGATGTTGATGTTACAATTACAAACATCCTTGAGGGTCGGGTGCCCTTTGCCGAAGAAAAAAAATCAAGTCCAAACATTGGTGATGGACATCACATAGCTAACGATATAAGCCAAGTGACATTCAAGGCTGAGAGTTTTTCAAAAAATGTAAAAGAAAGACATTTGTCACTCGAGGAAAGGAAAGCATTAATGTTAGAATCAGCAAGACTTAAATACAAGCAAAAGCACAACCTGTTGTAGGGATATTTGATTGTTTTGATGTGTGAAACGCTGTGCTTGTGAAGAAACTTATTGAGTAGCAACTCAACCAAGTATCACCTACACAGATAACTCCAACATCACTAATTATTTGAGCAAACATACTTTAGTCAAAGCACATATGACATGCGTGACGAGGTTCCAGTGAAGTTTTTGTATTGGAGCTAGCAGAGATGAACTTCATACCTGTGCATAACAGAACACTTGGGGCCGAATTTACAACACAGGCTGTTTATGTCTTACGAATGTGTAACCACGTACATTTACAATGCTTAAACACCTGCATTTAAGAAAAACAAGCTGCATAAATCCGGCCCTTAAATTGTCACAGGACTCCTCACTTGCACATGAATAATGTCAATGGTCAATGGCATGTTTTTTTATATTTAGTCGATGTTCAGATTTTATGTTAGTTGTCTGTTTCACAGAAACTATGTACTAGATGAATTGGATATGTATCAAAATAAAGGTTCAATGTGATAAATAAAAATGTGACTTTCATGTTATTAGAAATTTGGTTTTAAGTATTTTTAGTAATATGAAAATTAAATATTATACTACTGTATTATATTCCACACAGTAACAATTTCACATCCAATAGTCTATGATTAATGAATCAATGTGCTTTTGTGGTGTCGTGACACAAAACACTTAAAAAAAACCCAACTAAATTTAAGGATTTAAACCAACTTTATAAATATGTGTGTCCCTCATCCCTTGTAACATGAACTGTTCATTCAATTAATATTAGTTTATCTGATACTGAAGTTACCAACCAATAAAGGTTTTACTTGTGGTTTTTCAGAAGTGATATTTCATCTTGATTCATTTTTCTGCTAAAAGCGAGGTGCAAGTAGCACAACACTGGATTATTTAGTTAACAATTAATGCGCAGGCCTAAGAATTTCACACTTTATGGAAAACTCTTTTGGTTCCATACACATGACCAATGAAACATATTGGAAACTGGTTTTTAGTAACAATGGCAACAGTTTCCAATCCTGTAAATCACGTAAAGAATTTAACATTTTATGAAAAACACTTTCGGGTTCTATACATATTGAAAACTTTTTTTTAATAACCATGGCAACAGTTTCCAATGATGTAAATTGTATAAAGCATTTCAAATTTGATGGAAAACACTTTCAGTTCTCTGCCCTTTGATCACTGGAACATATTGGTTTTTTGTAACCATAGTAATGGTGGATGATGATAGTGATGATAGTCTTTTGGTTTCCATGATTTTTTCCCCAAACTACCGAGATGCTACTGAAACCGATTGTTTCCATGAAATCTGGAGACCTGTTATGGTGGTTCTTCCAGTGATCAGAGTCATTCTTAGTGGACTGTCCATCTGATGCTGGGTTTTAGGTTTATGTCTCTTCAGGATTTCTGTGAAGTTGTAAGATGGTCTGGTATTTTCATCATGCTGTAAACAATTTCCTCAGAACTTGCTCTTTCTGAAGACTTCCTTGTGCTGGGTATTTCTGGTGCACTTGTCCTGTACTCTATTAACGTGTCCACATCCTATTTAAGGTTCAGACACATCCATCTCAAACTCAGTCTCTGGTATAGCCAGTGGCTCTGGTGAACTAGTATATATGTATGTGCATGCATGCTTCGATGTGTGTGTCACTGCGCATGTGTGTGTGTGTGACACTGTGTGTGTGCTAGCTAGCTATTATAGCTCAACTTTTAAACTAATTTCTTCATGTACGTGTTTTTACATATATTAATGCTGTATTTGTAAAATGCATTCCTTTGCTAAAGAAAGAATTGGCAAGACAACAAATACATGTTTGTACATTTTAAAATAGATTAACAAGTAATAAAAGTAGCATTTTGACAGTGTAACACAGTACTGCTGAAACTGGTTTTTAATCCACCTCACTTTAATCGGGTTGTCAAGCTTATATAATCACCTTAGGAACAGTTGGCAGAATTCAAACTGACAACCTATGTGTGGTCAAAGTTTTTTTTTATCTATCTATTTATCTTTAATTGCCTGATGGTTATATAGTTTTGATGAAATTTGATCCGTATATTCCTTGAACTTTACTGAATGGCCATTATTTTCTGTGATTGCTGAATACATTTTTATCTTCCCACAAAATCAGATGAATAGATTTTAGTAATGAGCACATGTTCCAAAATACAATACTACAGTTAACTACATCAGGGTCAGACTTTATTTTACAGGTCTTAATTATTATGGTAGCCCCACACTCCCACGGCTAGTTGGACTAGCAAATAACTATTATTGCCATGTCCCATGGCTAGTGAAAACAAAACAAGAGTCAAACGTTGCATTTAAAGTCTTATTTTGTAAATATGAATATCCTGAACCCATCCCAACCCCCAATGTTAAGTGTTTTTAATCTCTATCTCCCTCTTTAGGTGACATATCTGATTATTAAGTAGGGCTAGTTAATATTTAATCGTGGCTAGTAAATTTTAAAAATCACTGATCCCATGGCTAGTGGATTTAAACAACCTAGAAGCCCTGTTTTATGAATGTATCTTTCAGGAAAACCCCCCGTTTATTAGGCAATAAATCTATCGGAGAAAAAACTACGTGGGTTTTTATGTTCATGTTTATGATGTATTACTGCTGCTGTACTTAGTTACTGTAAAAAGCAGCAGTGTTAAACAGTTTCAACAAATTTCTTTCTTGAACATCCAGTTTTTCTTTGTCCCCATTTCTTAATGACATACTTTTACAGTTTCCCCTCGATTCATTTGAAAGACTTAATATCTAATTAAACGGGATCTGCTCTAGTTTATTTTGATGACTTTAGAGCAGTACCTATTTAAAATGGGCTACTATGGTTTCTTACTTCAGCAATACACACAATAAAGATCATATTCTTACGTTCTTTTGTTATTTATTTATTGTCTTTGTGACTGGACAATCACTGGATAATCATGATAATAGGCCTATGTAATACAATCCAATGGATTAATAGCATATAACCTAATGATAATGGGTTAAATATGATCAAATAATACACTGGCATGTAATAAATAAAGATTTTTATTTACAAGTAACAAAATTAAATACATGTAGTAAAAAAAACAACCTTCCTTAGTATTGTCTTAGTATACCACTCAACTTATGCCTGGGATATTTGGAAAAACATGTCAAGTAAAACAAATGCATTTATTGTGTTCCATGGATGACATACCTAATTGTAGTCGTGCATTACTGTGGGTATGTATGGGACATCCAAACTGCATGGATTCATTGTTTGGTATATCTCTAGCAAAAGTTGAGTAGTATATTTTAACACAAAGAAAGAATGAAGGCTTGTTTCAGACAGTTGTATGATCTCTTAGGTGGTGTTTTCCCAGTCTCCAACAGCCACTCGTAACCGATAATTTTCATATCAAATGTTTTTATTCAGGAACTGACATTCCTTTTTCATTTATCAGCATTTGTAACAAGATTTAAAGCCTTATTCTCCTGACTGGTCATCACTTGAGGAGAACATGCAAACTGCATTGATAAACCACTAGATCCAATGAAATTAACCTTTTCATCTCTCTGCAGGAATGATGTCGTTTGCTGAGCCTTCTCGTGATGTCAAACTAATAGTGGGGTGCAGGAAGCAGTCATGTCCACAACACAATTAAATTGAGGGCATTCAGTGTCATGTCCACAATATAATTAAATTGAGGGCATTCAGTGTGGCATCATGCTATAAAAGGCTTAAGCAGCCAGATTAAAATCAGGTCATACTGCTTGAATTTTCTGTCGGCAGATCTGATATAACTAACATTTCATTTCAACTTATTTTCGTGCTTATATCCAATTAAGTTTCAAGCATGCTATACTGGGCACACACCTCAGCTATCTGGGATGTCTTGTCCAGGACAGTGGGTTAGTGATTAGTGAGAGAGAAGAGGGTGTCTTGGCCTTACACCTACCCATTGAGCTCTTATGAACTCGCTCTGGGGTTGGAGCCGGTGCAGAGCTGCAAACCCTGTACCTACCGGCCTGTAGTCCAATGGCTTAACCACTGTGCCAATGACGCCGGTTGATATAACAGGAATAATTCCATGTGCATACCCTTTCATTTAACTCAACAAAACAGAATTAGAGGCCTAATTCACTAAACTCTTGCAACTTTGCGATCTTATAGGCATAATTGGCTTGTTGGCCAATCCTAATCCGCTGTATTTGATTGCTGAATAAATATTGTTTAAACCAACTTTGTGATGTTGCGGTACAATGCAAAAAGACGTGCAAAGACAATGCAATTTTGCTTAAGACAGCTTTGTGATATTGCGGTAC

Transcript

ctg126-4.8-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02845	CUE	CUE domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003892	Domain	Ubiquitin system component CUE	Interproscan
IPR048056	Domain	AUP1, CUE domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR15486	ANCIENT UBIQUITOUS PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0030176	Cellular Component	obsolete integral component of endoplasmic reticulum membrane	Interproscan
GO:0030433	Biological Process	obsolete ubiquitin-dependent ERAD pathway	Interproscan
GO:0036503	Biological Process	ERAD pathway	Interproscan
GO:0043130	Molecular Function	ubiquitin binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg126-4.8-1 global RNA-seq network