Gene detail

Detailed information of ctg113-4.17-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg113-4.17-1	PERIOSTIN-RELATED	chr6	61781300	61822377	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg113-4.17-1

ATGCCTCAAGTATGTATGACCGATGCAAGCTCGACACAAGACAATTTCACTCTTCCTGCTCCACCTGTAGGAGGAAACAAAGAAGAAAGAAAAGGAGGTGAGAAAGAGTTGGTTTGTTCTCGCGAGTATTCTGTTATGGGCGTTTTAGCAGAGCTAAGTCCAAATATATGTGTTGCTCAACAAGTGTTTGGAACCAAAGACAAATATTATTCTGATTGTCTTGGAACGTCGTTCAGACAAATTTGTGAAAAACCAACATTTATAAGCTTTCAGTGCTGTCCTGGTTATAAGAAGGTCCGAGGACAGAGAGGATGTCCAGAAAGTTTACCGGTAGAGAATTTGTACCGCACAGCCCACGGCGTGGGTCTCATTGAATTCAGCAAGTACGTCCGGAAGGCTGGGAAGGCTTTGACACCAAAGGATTTGAATGAGCCGTCAGCACTTTTGTATCATATGATTCCCGGACGTTTTAACATCACCAAAAGTAAGCGTGGGAATTTTGAGAGGACGACTCTTTATAAAGACAAGAAATTAAGGATAAATAAGTATGCCTTCGGGGTAACCACGGTGAACTGTGCCAGGGTGGAGCGCACAGACCAACTTGCTACCAACGGAATCGTTCATGTTATTGACAAAGGGTGGAACTTGGGAAACTGGCGGCGAGTATGGTTCAGCGACGAGTCACGTTGCCTTCTACAGCGACGTGATGGACGACAACGTGTTTACAGACGCCGCAATAAACGTTTTGCCAACAACTGCGTCGCCCAAGTTGACAGAATCGGTGGAGGGAGTGTCATGATGTGGGGAGCCATCTCATACACCGGCAGAAGTGAAATTGTGTTCGCACAAGGCAACCTGACAGCTGTACCCTACCGAGATGAAATTCTTCGCCGTCACATGCTTCCCATTTTGGATCGACAGAGAGAACTCTTTCAGCAGGACAATGCCAGACCGCATACGGCACGTGTAACAATGGATTTCCTACAGAATGAGAACATTAATGTGCTGCCATGGCCATCAAGATCGCTAGATCTCGACCCCAATGAACATCTATGGGACGAACTGGACAGACGTGTCATCCACCCGCTGGATTCACAGGGTTCCCTTGCCGAGAAGATATTCCGTGACATGGAGTTCACCCAGTTCCAGCTGGCGTTGTTCACGTCTGACCTGGCCAACCAGCTGCGCGCCGGTGGGCCCTACACGGTGCTCGCACCTACCAACGAGGCGTTCGCGCGCCTACCCAACGACTTGCTCGACAGGATCCTTACAGACGCCGACACCGCACAAAGCATACAAATGATGGACAGTACTACTGGATTCTTTTCCCTTGATTTTACGGATCCTATTCCAAACAGATTTCACAGAGGTTTGGGAATTCAACTTGAAGACATATTTTCTCCAAGATGTTTTCTTACTTTGTCTGATCTCTCTGCGGGCCTTTGCCTTAGCAATACGATAGGCAAAGAGGTTGTCCCAGAGGTGCTCAAACACCATATCATAAAGGGTGTGTACTGCAACGACGCCGTGGTGATCGCCATGGGGCTGAAGACTCTCGACAATTCTTTCATAATGATGCGATGCAAGCGTGACGGCGTTTACTTCGGAGATTCCAAGGTGGTCGAAGGAGACATCGTTGCAGAAAATGGCGTCATTCACGCCGTGGATAAAGTTATGATTCCAGATTCAGTAAAAACTGTTGACGAGTTTGTGAAAGACCTACACCTCGACACATTTTCGGATTTAATGGTGCAGTCAAACTTTACAAGTTTCTTCAAAGGTTCTAAAAACATCACCCTTTTGGCTCCAACAGACCGTGCCTTTAAGAACTTACACCCTCGATATCTGGCGGCGCTGAGAACACAGCCGCTGGCGACCAAACAATTCATGAACTATCACACGATTCATGGAGAACTGACTTCGGACAAATTTCTCGGAGACACGGATATCACGTCCGATTTAGATGAGGCGAGACTGTCTGCGCAGATCCACGTTAATGTCTACAGAGGTGGACTAGTGGTGAACAATGCCAGGATCACATCCATGGACCATACCTGTGAGAATGGAGTAGTCCATAAAATTGACAAGGTTCTCATGCCTCCTCAAGATTCCATCATGGAAATCATAGCAAAAGATCATGAACTAAGTATACTACACCAAGCCCTGGAAACAACTGGCTTAACTGAGATTTTGAGCAGTCCGGGACAATATACAATGCTGGCACCAACCAATCAAGCATTCCGATACATCAGTAGAAAGCGTCTGGCGAAGCTCATGAAAGATCCTCCCAAATTACGACAAATTCTCGAGCGACACATCATCAACCGAATGGTTGTGGAGTGCTCCGTGGACCCCAAGATAATATACAGCATCGACTCACGGCAAGGCGACCCCGTCGACTTCACTCACAGGACTCACGGATTGACCGTCAACAAGAAGTATCGCTTTAAATCAAAAGAAAAGCTGGCTACAAATGGTGTCCTGTATAAGCTGAGTAGAGTGCTGCCGTGCTCGTGCGAGCCGCAGTTACGTACATGATACATCATCATGGTTGCGAGCCGCAGTGACGTACATGATACATCATCATGGTTGCTGCACCGTATCTGAGTTTGCTTATGTAAATAACATTTTAAGATCAGTTATTCATAGTTCTGCCTGTTCCATTTGATGGAATGATTAATGTTAAATACACTTTGACTTTTAATCGTCAGTTAATAAATTAAACACGTGTTGTATATACGTGTGAATATATAGTTAATGTAATTATGAAGGCTCAGGGTTGTTCGAAACGCAGGATGGATGAACTCGAAAGGGACCAAGACACTGTGCTGATGTGCAATATGTGCTGATACTGGACGTTGTACTTTTGGTGAAAGACTTCATTAAATGAATAAACCAGACCAGTAGGAACCGAGTGGTAGGGTGGGTGCCCCTTCACTACAAAGTCGACTTTACATAAACAAAAATAACCTGAAAAAGAGATGAAAATTGCCATCCAAAATATTTTGTTATCCTGATGTTAGGATGTCGTTTTTGAGGCCATGAAAATATTTATCAATAGATTTTTATACGAGTCCTTTTGTAAATGGTTTTTCTTACTCATCTCAAGAAAATAAATCTTTGAGGCGAGCTTTATATTGGTGATCTCCAAGGACTGATTTTCTTGAGACGAGTCAGAAAAACTACGAAAGGATGAGTGCCAGAAATATTTTCTAGTTCAATCAATCTTATAATTTTACTATAATTATTTAGGGGATAACTATGTTGTATTTGACCATTTTCAGACGTTAATGCTGGTTTTGCAGTCGCAAATTGAGTTTTACCGGCAACGTGGAGCGGAGAGCAGGGCCGTAGCTAGCATGGGGGCATGGACAAAAATTCGGAAAGCATTATAGAAACTTAAAGAAAAGGAGTTTTAGACTATTAACTACTCAGTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCAAAAAAAAATTATTAAAAAAATCCTAGCTACGGCCCAGGAGAGAGCGTTGATAACTGTCTAAAATGTCCGTCTAGCTCTCTTACCGTCAGAGTATTCGGGCCAATTGAACTAGAATAAAAAAGAAATGGTGATAGCAAATGTAGCAGACGGACTAGGTTACTTTAAAATTGTGTGGGGTACCCCCATAAATAGCTTCAAATATTGTTCCTACGGTGGACGGGCCTGTAAATGGCGCAGAGAAAAGATTTTCACCTTGGAATTTTATTGCTTACTTGTTGTGACTTTACAAATAGTCTAGTCTATTTACATGCATATTAGTCCGTCCGCGCCAAAAGGCAACCGATGATCTGACAAGCATCTATACAGGCCCATGTGCTGGAAGTTATGGCGATCAATGTGTTAGGATGTCGAGTCACAGAGTTCGACCCCCGAAACCACACCTGTCCACATGTGCCTGCTATATACTAAATAATGCTAAAACTCATATATTTTAAACCCATACAAATTCTCGTAATAAAAACTTTAAAAAAAACAAAAATGTCAGTTTAAATAAAACGTTTAGCAAATTATCATCAAATTTTATACATTAAATCTTATTTATAATAGAAGGGTGTTTGAAAGTTACACCTGAATTATTGTTAATATTCGATATGCACTAAAACAGAACGGCATGGACACTTGCTTTACTTTGGCTGTTCCAACAAATACATCACCGGCCTCGGTGGCATCGTGGTTAGGCCATCGGTCTGCAGGCTGGTAGGTACTGGGTTCGGATCCCAGTCGAGGCATGGGATGTTTAATCCAGATACCGACTCCAAACCCTGAGTGAGTGCTCCGCAAGGCTCAATGGGTAGGTGTAAACCACTTGCACTGACCAGTGATCCATAACTGGTTCAACAAAGGCCATGGTTTGTGCTATCCTGCCTGTGGGAAATGCAAATAAATGATCCCTTGCTGCTAATCGGAAAGAGTAGCCCATGTAGTGGCAAACAGCGGGTTTCCTCTCAAAATCTGTGTAGTCCTTAACCATATGTGCGACGTCATATAACCCTGTCAAAAAAAGATATTTTACCTAGGCAATTTGATGGTAATTTCTTAATTTACATTAAGAATTTCAGTTTTAAAAAGTTACAAGAGTTAGTATGGGTTTAGCTTAGTTATATGCTAATCCATAGGTTTTCTTTTGACACAAACGTACTATAGAATGGGTAGTTAAGTAGCAGACCCTAGTTTTAGCCCGTGAACATGTTTAATTAATTTACTAACATGTAACACGTCTGTATAAAGCTACAATAACATGAAACAAGAGTTTTTGACATTACAATGGGGAAATACCCTCTCAAAATAAACTAAAGCTAGTTCTGAGGTACGTGCATTTTTAGAATTCTGCAAAAATGCATTTCGCAGTGTTAAACCACCAGGATGACCAGAAACACTCGGATATACGGAAAGTGATAATCTAAACAGTAAAATCTAAGTAATGTCCGATTTCAGTTTTCAAAACCAGATCTACTAGTGAAAAATATGCAGTAGTTTTTTAAAAATTAGGGTCTATCAGTCTTAACACAAGTGAAAATTGTTCATTGTAAATACATTTTTATTAGTCCCCTACGGTCCAACCGGAGGGGATTATTGCTTTTATTTCCATCCTTCTGTCCGTCTGTCCCATATATAGCAGGATGTTTTTTCACAATGTCTTTAGATATTGAGCTTAAATGTTGTGTATAGCTTTATCACATTCTGTTACAAATAAAGTTTGACATTCAAGACAATTTACCCATTTTTTGACAGAGTTATGGCCCTTGAACTTAAGAAATATGAAATATTGTTTTCCGAATTTTGATGTTGTTGCAATACCTCAAGATACTGAACTTGAAATTAAAATGTTGTGTATAACTTTATCATGTACTGTTACAAATCAAGTTTAACTTTCATGGCGATTTATCCATTTTTAGAGTTATGGCCTTTAAATTTAGGCGATGCAAAAATGCGTGGGGCTCAGTAGGGAACATGCATTGCTTTAGCAGTACTATCAGAATGCTCTTTTCAATAATAAAAAAATGTATATATCTAGCTTGGTAGATGCACCATGTTGTATGTAAAAATAATTTGTGTATTAACATTACTGTGTGATAGTTTCGTACATCGGAAATAAATGCTAAAAACAAGTTTTAAGTGTTTTTACGAAAATAGGTTTTCTTTGCTGCAAAATAGATTCAGCATAGTGTTTGAGGCCTTGGAGGCTTACAGGCGTCCTTAGATGTCTATAACCCTGATCAAACAAATTGTCTACCCGGTATGGTGCTTATTAAACATTTAGAGTCTAGACTCTTTAACAGTCTGAAACAGTAACGTCGTGACAACGCCATACAAATTGCATGCGTGTAACGTCATTTAAGATTATTTATAAGCACGGGCCCAGCAGGACTATATGTCGGTCTTTAAAACCAGCATGAATTTTGTAATTATATGCTAATATCCCTGTGGTTTGTTTGTCAAAAAGTGTGGGGCATACGAGTGCTTCCACGTCAGTTTTGCATACATGTAGTTGAGTACACAGATACAACTTTCAATATGTCTTCAGTTCAATGAAAATAAATACATTTTTGAGAAACCCACCCAGAAACCAAACACTAACATGCTGCACTTTCACTTTATATTGGTAATAATTTAACAAACAATAAAGACTACCATATATGCTCATGTTTTATTTCATGTTATGTGTACATGGTCACAAAACAACAAATTATTATACAAGTAATACACTAACCTGAACAATAATAATATAGTAATAAAGTAGTGTATGGAATAAACATGCATAGTCTTACTAGCAATAACAATGATAAAATAGTGCATAGAACCTCAAAATACATACCCCAGTTTGTGTTAATCCAGTATTAGATCTATCCTTCAAAAACAACTCAACAGTTGACATGGGACTTACACAAATTATATTAAAACTAGGTTTCAATCAATGTTCAGTAACTGTTTAACATACAAAGCAGTCTCTGACGGTTTCGAAAATGGATTCAAAGTTTCAGAAGAAGAAAAAACAAACACCTTCATGGAAGGAGTCAGAATGGTTAAATTCACACATTTATTTCTCTATAAGGCTTGGCATTTATAGAAGAGATTTTTGAAAACTGGCTTAGTTTGTTTCCCAATTTTGTTTCTCAATAGGACAAAAAAGCTACCCATCAAATTTAGATGGAAATGGTATAGAAAATCTGAAGAAATTACAGTATAACTTTTAAATGCATTTTTAATAATAAAATGACAGTAAACTATGGGGACCCAGCATTAATTGCATTTACAAATTAGATAAACCATCTGTTGACCTTTACATGTATGAAGACTGTTTATTATAGTAATTCTGGAAGTACAGAATTAAAACACATTTGTTTAATTCTCCCATCTTGGGTCCCGATGTTCAAGTCCTTTGGGCGGAGTCGGTATGACCAAATTCACCAATTTTGTTTTCTACATTCTTAGGGTGCTTGTTTAGCTTTCCTCAAAATTTGGTTGGCATTGGTCAAGTGGTTTTGGAGAAGAAGTCAAAAATATGAAAGTTATGCATGACAGACAAAAAAGTATTAAAAAGGCCACTTGAGCTCTTGGTTCAGAACTAAAAGACAAAACAAAAAAAGAGAGAAGAAAACTGGTGTATCCAGAATAAGTTCTACTTCACTTACTGGCAGACCTCAACTGTATGTAACTAAGTCCTAAGTGTGCTTTTAAATGTACCTACATGTACGAAATAAGGCTTAGTAATAATGTTTAAATGCTGCCCATACAAAAGTACCATCAACGATAAGGAAGGACTTATTTTTTCCTGCATTTTGCTACATTTGTTAGCAAACAGTTCTACAAGGCCGAGGTTTAATGCCATGGTGCAGAAATGATCCTCAAAGATGGTTCGAATCTGTTGTGTATAAAATGCTGGGTGACAAGTTAAGTAATCATCAAAACACCAGGGTGTGGCTAAATGTAAAGTAAAACTGCCTGTAAACATTTAGAATTTTTTTTTTTTTTTTTAAATATTAAGTTTACAAAACACAAATAAAACAAACCATGGAATAGGACCTTAAAAATGGGCTCCAATTTGGCATCAACTCTTGTAAACATACTTGCACATGAATAACATGAAGATATTTCATACAGCACTTACAGTTAAAGGTAACTGGATATAAGAACACAGCTGATCATTCTACCACATAACTTAGAGTAAACACAATAAACAACATTGACTAACCACTTGCCTTTGACTGCTTTATTGTTATAATTTACTGACTATAGTCAAGCCACAGCAACAGGTTATTGTAAAAATTAAACATATATCTGGCCAAACAATATATACATGTACTGGTCTCTGGTCAGTGTGCTCAATGATTTTGCACATCAACATTTTTTTTTTCAAATTTCCCACGATAGCTACAACACAATTTTTACCAGAAATAATTCCATGCTTCTTCAAATAATTATATTGTGATGCACCATGACATTTTGGATCTTTAATTTCTGTCTAAAAATAAGTTCTGTTATTCTGCTTGTTTTTAAAGCTTTTGAGGGCAAAGTAGAAGTCATAACATTTGCTATGGCTGTATGGAAAATGTGAAGGATATACAATGTATACCAAGACAAATGAGGGGGAACTATGATCAATGGGGAGGACCAATGCAGATGAAGAGGACATAAAAAATACAAAATCAAATATGATACTCTTCTTTTCTGGGAAATCCATGCTATTAAAAAAACACAACAAAAAAACAATGCATGGGCACTTCAGTTATGGAACTTTGGTCTGACCAGAGACCGACTACATATTTTTTGGGGGCCCCAAGAAAAAACAAAAAATATTTCGAGTTCTTACTTGCTGCCAGCTATGCAGTACATATCACAATATATGAACATTCTGCATTCTATTCTTTCTGATGCAAATGTTTTCCATTATATACATGCCCTACCCCACCAAAATTAAATAATTAATAATACTATAATAATATATATATATATATATATATATA

Transcript

ctg113-4.17-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02469	Fasciclin	Fasciclin domain	Domain	Interproscan
PF13358	DDE_3	DDE superfamily endonuclease	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000782	Domain	FAS1 domain	Interproscan
IPR011489	Domain	EMI domain	Interproscan
IPR036378	Homologous_superfamily	FAS1 domain superfamily	Interproscan
IPR036397	Homologous_superfamily	Ribonuclease H superfamily	Interproscan
IPR038717	Domain	Tc1-like transposase, DDE domain	Interproscan
IPR050904	Family	Cell adhesion and biosynthesis-related protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10900	PERIOSTIN-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005615	Cellular Component	extracellular space	Interproscan
GO:0007155	Biological Process	cell adhesion	Interproscan
GO:0030198	Biological Process	extracellular matrix organization	Interproscan
GO:0031012	Cellular Component	extracellular matrix	Interproscan
GO:0050839	Molecular Function	cell adhesion molecule binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg113-4.17-1 global RNA-seq network