Gene detail

Detailed information of ctg1106-1.10-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1106-1.10-1	UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE--PEPTIDE N-ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE 110 KDA SUBUNIT	chr6	43927904	43952535	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1106-1.10-1

ATGTTCATATATGAATCGGTCTTGCTGAACTTGCTCATAGAGAGTACCAAGCTGGTGACTATGAACGAGCAGAGCAGCATTGTATGCAGTTGTGGCGCCAGGAACAAGATAACACTGGTGTACTTCTCCTACTCAGCAGTATACACTTTCAATGTAGACGTCTTGAGAGGCATGTCTGCATATTTCAGTCAACTGGCAATCAAACAAAACCCAGTACTTGCAGAGGCGTATTCCAATCTAGGGAATGTTTTCAAAGAAAGGGGACAGCTTCAAGATGCATTAGAAAACTACAGACATGCTGTTCGATTGAAACCAGACTTCATTGATGGCTACATTAACCTAGCAGCAGCACTGGTAGCCGCTGGTGATATGGAACAGGCTGTACAGGCATATGTCACAGCATTGCAGTACAACCCTGACCTATACTGTGTCAGAAGTGATCTTGGCAATCTGTTGAAAGCACTGGGACGGTTGGATGAGGCTAAGGTATGTTAGGGATGTAAATTGCATGGACCTTGTTGCATAATATCTTCAAGAAACCGTTTAAAAAAGAAAGAAAATATTACACTTCTAAAAAACTTTGTAATTCTCAGATTATATATATACTCATACCGTGATATTTCCTGACCAAAGCATTTCCAGTTGTCCTAATTAATTGTTGTGCGATTATTCACAGGATCAGAAAATCAGTCTTTATGTGGAATGACCGAACACAGATGTATGACAAATGCTTCAACAAGTGTTTTTTGTTTGGATCAGATTTAAGTAAACAAAAATGCTGGTTTATTGTTCTACCTGTACCTTGTGACAGGCAGAACATGTTCTAAGCAGTTTAAATTTAATATTTTGACCAAGGTGTGTTTTTTGCTACACTTAATAATTCGAAAATATACTGGTTGTTTTAAAAAGATGAGAAACCTTTCTATCGTCTTGTGGCATATCAAAAACATTAATAGATGCATAAAAAGAAGCATAGTCCATGTCTTGTGGAAAAATTAAAAAGTATCTTTTAGATCTTTTTCTTCAGTATTACAGCTAGTAGATTTTTCATGTGAAAGTTAAAAGCACACTTTGCTCTGTTGACAAACACTTGTTAGTGCATTAGTAAAAAGTATTGGATCTGTCATAATTCATATTTATCCTGATTTGATGCAAAGGGATAAAATTGTTTTATTTTGGTTTGATGTTTGTCAAGCCATGTTAGCTTTAACTGCAACTTCTGCTTCTACTATTTGTAAGCTATTAAAGTCGAGTATACATTACGTGGCTGTAATATAATTTAAATTTTACAGAAATGCAATATGTATGATAAAAAATACTATTGGGCACAGTATTTGTGGATTATTGTTCCATTTTGAAAATTCAGTGAAGGAACACATGCCTCTAAATAGGTCTTGTGAAGAAACATAAAGTTTGTGTGTTAACAAAAATAATGTAATAGGTTTTTATTTCCTTATCTACATATAGCTGCTAGATAATGCTAAGTGTGGGATTTACTATGCAACTAAATGTACAATATATGTTAGTAACTGAACTACATGCATTTTGTGTTGAGCAATAAATCCGAATTGATCATTTGTCATTCTTCACATCAGTATTCTAGTTCTGGATGGGCAAGACAAAGGATGTTAATTTTTTAAAACTGACACATGCCTGTACCCACATGTTGTAGTAATAGATAGTGATGTTCCATGTCATCTAGTTCATGGAGCATTCAGAGTTTTACTGTTTGCTCAAAGGAAACTAGAACAATACAGAGTTACTTACCTTCCAATTTCTTGGTCCTTGGTGCACCAATGAATAAAATAGTTGTATAATTACAGTTTATATTTACACTTCATTCAGTGTTTGACAGCACACAAATATTTTTAGTTCTTTTATGCATGCTGTTTAATTAGTATAATTTCTGAGGAAATGAAACAGAAAATTACAATTTAATTTTTTTTTTTTTTAACAGATTTTGGAAAACATCTTATATCTACACCATTTACAGATTTGTGTATAAGATATATTTAATAAATATTAAATGATCATTAATCAGGTGGTGTAACCTGAGGGATGAACATTAGATTCCTCTACCAATATAATTATAGTGTGTGTCTGTTGGGCATTTTTCAGGTTTTATTATGAAGTACAACTAAAATTAAGTTTTGTTACACACTACGAATGTTGCTTAAGTAGTTATACCGTCAATGTCTAGTTTTGTCGTTAAAACAGACTGATTTTCTACTTTGTTTACTTATTGAATTTGGTGACTGGGCCAATACAGCAAATTAATAGGTTGAATATTGTTTCTTTTTGAGATCTTCATTATTAGCAGAGATCACAAAAGGAAATGCTTCCATTTCTATGCATTTGGTTCTTTTGAAATATGTTCATCACATACAGTGTAAACAAAATTTACCATTTACCTCCCCCACAAATAATGAAATGAAAATGTTAAATAATTTGCTGCATTGTTGCTTACATGTTGTAATAGTTGTCTTTTTCTAGTAATTTACCATGATCTTGCAGATCTGAAGATGCTTTACCTGCATTTAGAAGATAGCATTCTGTGTGGCTGTTTTATATGAGGCAAATTATTGAAATTTAAATATTTTCTCATTACTTCACTTACTTCATGTATATGTGCCCGATTATTGTCAAAAAAAAGGGACAGGCTGGATGAAACAGGTTTCACATACAGCTACCTTCTATCTGCTTCAAAACTTTGTTCCTGGTAATGTTTTGGTCAGAAGAATGTTTTAGCTTTCTTTATTCACTTTGTATTCCATGTCGTGTCATAGTCGGTTTAATTCCATCATTTTTATTCAAAGTCTTTCATTATCTAATTATTTCAGTAATCTTTAATGTTATTATAAAGAATGTGTAGTTCACAGATGTGTTGCATTTTTTCACATGATACTAATTGGATTTTTTCTTTATAATTTCAACACTAGCCTTCTAGGTTGTGAGTGCTACTTGTTTATCTGAGTTATTGTTGGTCATACCACCGGAGCTGTATGCAGTCCTTGAACCAAGCTGGTATGGGTACTAGTATTTTTGCCAATTACATGGCAAATGTCGTATGTATACTGTGTTAAGAATGGGGACAGTAATTGTTGAAAACAACTTTCAAACAATCCATTAAAATTACTGTCTGAAAATAATAAGTTTCCTAATTCAAATAACATTTGGCTTCAGTAATGACAAGATTTTGATAAAAGAAATTAAACAAACTTAATACTTGGAAGGATATTCCTTCAGAAATTCACAAAAATTAATTGGCGCAGCGGTCGCTTAAGGCTTACTGCGGAGACACGCGCTTTGTGTCGCTGCGGTCGCGCGACCATCCACTTCTCAACAATCCAGCAAAAATAGTTTAACCTTCCATTTCTCTTTTTAGATTTCTGGTACAGTTTCGAAGTTTGTGCTTTTTTAGCAGTATACCGTTTTGAAGTTTGCGTTTTGTAGAAGTTTGCTTACCACATGCATGCTTTTGAATTACTGTTCATGGAATGTTGAGAGCTGGGTAAGTTGAGGGAGTTGAGAAAGAGCATGGCACATTTTGATGCAGTGCAGGATGTGACATTTTTACTTAATTCACTTGGTACCATAATGTCTATACAGCTTCATTCTTGTTGTTACTGTTTTCTTTTTGTTTCAAAAAGTTCAGTATTTTTAGTTAATCCTGCACACCAGCTCTCTCTTGAGCCCCTTTACATATCGGCGCTGGCGGTCGCCCATGCTATGCAGACAAGCAAAACTGCGCGTGCCTATTTAATTTTGACATGTTTTAATCTGTTATATTTTCTTTTTGTTCCCCCCACCCCTCCCCCATCCTTTCTTTTTTTGGCCCTGAATAGGCATGTTACTTGAAAGCAATAGAAACGTGCCCAAACTTTGCTGTAGCATGGAGCAATCTAGGATGTGTGTTCAATGCACAAGGAGAGATTTGGTTGGCAATTCATCATTTTGAAAAGGCTGTTGCTTTGGATCCAAATTTCTTGGATGCTTATATTAACCTTGGAAATGTTTTGAAAGAAGCTCGGATTTTTGACAGGGCAGTGGCTGCGTATTTACGAGCCCTCAATCTAAGTCCTAACCATGCAGTTGTTCATGGCAATCTTGCGTGTGTGTATTATGAACAAGGATTAATAGATTTAGCTGTTGACACTTACAAGCGAGCCATTGAACTTCAACCAAATTTTCCAGATGCTTACTGCAATTTAGCCAATGCACTTAAGGAAAAAGGACAGGTGGAGGAAGCTGAAGAGTGTTACAACACCGCCCTCCATCTTTGTCCCACCCACGCAGACTCTCTGAACAACTTGGCCAACATCAAAAGGGAGCAGGGAAACACTGAAGAAGCAGTGAAATTATACTTGAAGGCTTTGGAGGTGTATCCCGAGTTTGCTGTTGCACATTCCAACCTTGCCAGTGTTCTGCAACAACAAGGAAAGCTGCATGAAGCATTAATGCATTACAAAGAAGCAATAAGAATCTCGCCCACATTTGCCGATGCATACTCCAACATGGGCAATACACTGAAGGAAATGCAGGACATACAGGGAGCATTGCAATGTTACACACGAGCCATACAGATCAATCCAGCTTTTGCTGATGCCCACAGCAACTTGGCTTCAATACATAAAGACTCGGGCAATATTCCTGAGGCAATAGCTTCTTACAGAACAGCTCTTAAACTGAAACCAGACTTTCCAGATGCATATTGTAATCTTGCACATTGTTTGCAGATTGTTTGTGACTGGACTGACTACAACAACCGCATGAAGCGTCTTGTGCAGATTGTTCAGGAACAGCTGGAAAAGAACCGTCTTCCTTCAGTCCATCCACACCACAGTATGCTTTATCCATTGTCTCACTCGATGCGAAAAGCCATTGCCGCCCGTCATGCCAGTCTTTGTCTGGAAAAAATAAATGTGCTGCACAAACCACTCTATGACCACCCCAAGTCGATAACTTCCAGTGATGGTAGACTTCGTATTGGCTATGTCAGT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TCTTACTATTGTTATTTTTTCTTCATCCTGTCCGGTGTTTTATGAA

Transcript

ctg1106-1.10-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07721	TPR_4	Tetratricopeptide repeat	Repeat	Interproscan
PF13414	TPR_11	TPR repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011717	Repeat	Tetratricopeptide TPR-4	Interproscan
IPR011990	Homologous_superfamily	Tetratricopeptide-like helical domain superfamily	Interproscan
IPR019734	Repeat	Tetratricopeptide repeat	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR44366	UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE--PEPTIDE N-ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE 110 KDA SUBUNIT	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0006493	Biological Process	protein O-linked glycosylation	Interproscan
GO:0042802	Molecular Function	identical protein binding	Interproscan
GO:0097363	Molecular Function	protein O-acetylglucosaminyltransferase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1106-1.10-1 global RNA-seq network