Gene detail

Detailed information of ctg104-11.1-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg104-11.1-1	GLUTAMATE DEHYDROGENASE	chr8	37113885	37148543	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg104-11.1-1

ATGGCCTTGAACTTCAAAGGACTTTTGGGTCTTGGAGAGGTCAGAGTCTTCCACTGCATTGACTGTCGCTTGGTTTCCGGGTCATATGTAAATATCCAAGTTTCATCGCAGACCTCATATAGTACATGTGCAGCTTTGGTGCAATCTAAAGCCCTGACATTAGATATGTTTCGCCGGATCTCCAGTGGGGTTTGCCAGACTTTACATAACCAAAGTCTTCTACCAGTATCAGCATGCGGTGTAAGAAGCTTCCTGTCAAGTGCACGACCTTTCAGTTCACACACACCCGACGAAGAGCCCGATAAATCGGAAAAAAGAGAAGAGCATGACTTCTGTGCAATGGTTGAAAAGTTCTTCGACAAAGCTGCTGGTTATCTTGAAGATCGACTGGTAGAAGAAGTCAAAGGGAAGAACCTAACCATTGAAGACAAGCGTAAACGGGTTCAGGGCATCCTCAGGATCATTAAACCATGCAACCATGTATTGGCACTTTCCTTCCCGATAAAGAGAGATAATGGGGAATTTGAAGTTATCGAAGCATGGAGAGCACAACACAGTCAGCACAGAACACCGTGTAAAGGAGGAATCCGCTACAGTCCACTGGTAAACGTAGATGAGGTCAAGGCTCTGGCCGCTCTCATGACGTACAAATGTGCTGTCGTTGATGTTCCATTCGGTGGGGCCAAGGCTGGAGTGAAGATAGATCCAACAAAATATTCTGAAAGCGAACTTGAGAAAATAACCAGGCGTTTTGCTGTTGAATTAGCCAAAAAGGGCTTTATAGGCGCAGGTATCGACGTCCCGGCGCCTGATATGGGCACGGGTGAGCGCGTGATGAGTTGGATCAGTGATACGTATTCAAATACCCTTGGTCATTTCGATATTAATGCACGAGCTTGTGTCACTGGAAAGCCAATTCCACAAGGTGGAATTCATGGGCGTATCTCGGCTACAGGCAGAGGAGTTTTTCATGGTGTGCAGAACTTCACAAATGAAGCCAGTTACATGAGCATGATTGGACTAACTCCGGGTCTTGGTGACAAAACATTCATTGTTCAGGGTTTTGGTAATGTTGGACTGCATAGCATGCGATACTTACACCGAGCTGGTGCCAAGTGTGTGGGCGTTATGGAATTTGATGGCAGCATATACAATCCAACTGATGGAATCCATCCCAAGGAACTTGAGGACTACAAAATACAAAATGAGACGATAGTGGGATTTCCTGGTGCACAGCCCTACACGGATAACTTGCTATATGAGAAATGTGATATCCTTGTTCCCGCTGCCAGCGAGAAACAGCTCACCAAAGATAATGCCCATTTGGTGCAGGCTAAGATCATCGCCGAAGGTGCCAATGGTCCTACAACAATAGAGGCAGATGAAATTTTCATCAAGAACAATGTCCTCGTGATACCTGACTTGTACTTGAATGCTGGTGGTGTCACAGTTTCATACTTTGAGTGGCTGAAAAATCTCAACCATGTTAGCTATGGCAGACTGACGTTTAAATATGAGAGAGACTCAAATTACTATCTTCTTGAGAGTGTCCAGCGCTCTTTAGAAAGAAAGTTTGGTAGACAAGGAGGTTCCATTCCAATTTTGCCAAGTGAGGAATTTGAGCAGCGAATTGCTGGTGCATCGGAGAAAGATATATGCCACTCTGGTTTAGAGTACACCATGGAACGATCTGCTAGGAATATTATGCGCACAGCAATGAAATACAACTTGGGTCTTGACTTGAGGACGGCTGCTTTTATTCATGCAATTGAGAAAATCTTTGGTGTTTATCAAGAGGCTGGCCTCACCTTCTCTTAGTGCTGGAAGACTTGAATAAACGATGTTATACCAAAAACATGAGCAGCTTCTGAATGAACTTTTAGATTTTCAGTATATGTACCGTATTTACTAGTGTTACATTTCTTTTTAATGATTACCAGATTTTGTTATGTGTGAAATGGTTTGGTTGTTTAGGGTTTGATAACGTCTACATATTTGTTTGCACACATGCTATGTGATGGTAATTTTAAGTCTAGTGCCTGATTAAGCAAGACATCCTTGTCACTGGACTCATCCTAGTGTAACCAGATGATACTCTCAACGCACAAAGTACCGTTTTAGTTTGTTGCAGGAAGAATGGATTTAAGTAACTTTTAGTTAGTCTGGTCAACACAGATTTTAGCCATTATTTTACATAATATACTGAGGGCAAGAAATAAGGGAACACCAAATTAAATGTTTTACTAGCATAGTAATGTTCATGTAAATTAGAAAGATTTTGAATGTTAGTAATGTGGATTGAGTGTAATTTAGTTAACTTTGTTATATTATGGTTTTGGTTGTAGTCACTCTTGGCTGTTATTAGTCCCCCTACCGATCCAACCAGAGTGGACTATAAGTTTCATCTCCGTCATTCTGTCCGGCTGTCTCGCATATAGTTTTCCGGACCTTTTTTTGTTGTTGAAATTTCTCAAAATAAGAACTGAAATTTTGTATATAGTTTTATCATGTACTGTTGCAGATCAAGTTTGACTTTCATGACATTTTACCTATTTTTCACAGAGTTATGGTCATTGTACTTAGGAATTACAAAAATTAGTTTTCAAGATTTTTTTTTTTTCATAATGCCTCTAGATACTGAGCTGAAATTTTGTGTATAGCTTTTTCAGGTACGGTTACAAATCAAGTTTGACTTTCATAATAATTTACTTCTTGGCCTTTGAATTTAGGAGATAAGAAAGTTTGTTGGGCCTGGTAGGGGACATATATCTATTGTTCCCCTTATTTCTTTCCATCAGTATCTATTTTATTATTTTAGTAATGTTTTAAAACATCCCAAAATGTAGTTTGGTTTGGCTAGCCTTCTTGAGGTTATCACTAGTAAATTTGTCAAGTGACTTTAGCATTGTGTAGCTATGCTCATAAATTGTCTCACCAGAATTTGAAATGATTAAATGTTAATGTTTTGTTTTTGCAATGTATTGCTTTGGTGTGGGGAAATTGCATTTTTATCATGACAATCATAATTGAAAGTTTTGATCTGGAATATTTTTTTAATGGAACAAACCATTCCCTGTGAAACCCCTGCCACCTCCCCCAAGATGAATATAAAAAATACCATTTTCCATGTTACAAACAATCATGATCTATATAATTAATGCAGTGTGTCTGAATGAATGTCATTCATTTGTTCTGCAATTTTCTTTTCAATGGAAGAATGTAATCTGATTTTTTTTTTAAATGTATGCAGAATAGAGTTGTAATAAAAATGTAAATAAAAACAAACCGGGAGAATATTGATTTTTTTTTCACTTGTTTTCAAAGATGAATGTTAACATTCTCAGATGCAGTTTTAACTATTCAGTCATTTGAATGGCATACTATAGAAACGATTTAAATCTTAAAAGCAAAGATTGGTTACTAGTTGCATACGTTTTGTTAGGTGTGAAGATCATCTGTTGCTGGGGCCACATGAAGTGAGTAGTTACTTGTTTTTTTGTTTTTATTGACACCCTTGAAAAAATTACTTGTTAATTCTCGGAACAAAGTAACAGTGCTAATACGGTCTTAATATAAATATAGAAAATTGGAATATGGATTCGTCTGGCAAATAGTGCTCTCTGAATGATGTACGGTTCAATTACTTCCAAGGTCTGTACTTACAAAACTTTTAATTTTAAGAGTCCAGACTGTATCTCAAATGATGTCGCACGCATTGCAATGTGTATGGTGTTGCCATGACGTTAAAGTCTCGGACTATTAGAGTCTTGAGTCCGAGACTCTAAAACGTTTATAAGCACCAGGCCAGTTGTAATCCTATTTAACACCTGCTCAATGTATTGACACGATTTGGGACTAATATTCTCTGAAGTCATTTAAATTCTGTGGATTTGTACATGACGCTGCCTATGATTTTTGTTTCTTACCCTCCATATTAGTGTTTTAACATAAAACCTGGCCAGATATATTTTCCATAATATACATGTATCTTTTTATTTATGCAGTTTAGTTAGCTTCATTTACTTCAGGTTTGTTCTGCTACTTCCTGTTTAAAATTTGATTGTCACAACATACTGTTATTTTATACATGACATCCAGACTAATCTAATTTAAGGTCATTTATATAATTTTTTTATAATTTCCAATTTTACTGTGACAAAATTTCTTGTATTTTTGTTTGACTAGAAAAACCTGAAACTTACAGAATTTTTTTTTACAAGCAGTTCTGATGCCAAATGATGTTGGCCATCAAACTATTAAACAGGAAGGAGAAATTATATAATAATCAAGTTTTTAAAATTTCCTCTCTTTTGTATAAACATGGTGGCTAAACTACATCACAATGTTTCACTGAAAACGGGTAACAAGTGGATTAATGTCTTGGAGACACGGACAGTCATAAAGTGTCAAAGCCATAAATCCATAATACAATCAACAGGCGTTATACAGTTAATGCATACCTGTTTAATGTGTTAAAACAAATATTAACAGACTAAAGGTTTTCTTAAGCAGTAAAAATGTTGGTTCAAGTATTTACAGCAACAGCATTTGAAAGTGTACCTTCGTGTTAGTATTGCTTGTCCGGAACGGTTTCCACTTTAAAGATGGTCACAGTGACGTAGTTTGGTCACCATGATAAAATGAAACTTGCTTGTGTTATGTCGGATGGTGGACCCTGAAGACAAGGTTTCGTATGGCTACCTGCTGATATGTTGAACTTAATAACATACTAGTATTTGTAATGGACATGAGGAATGGTACATCTGAATATTAATGTAATCAAGTGTGGAAATTATTTATACATTGTTGTTCCTATGGTAACAAAAATGACTACTATTAAGCAAATTCATGTTTTTTTCTGAAAATATGATTGTTCAAAATAATTTACTACATCTATTGCTAGACATATACAGTGACCTAGCGACATAGACTGTTGTGTTGGCATTATTGCAGACTCCTCACTGATCATTTGGTAGGTGTGCTGGGCAAAGATGCTGCTT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Transcript

ctg104-11.1-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00208	ELFV_dehydrog	Glutamate/Leucine/Phenylalanine/Valine dehydrogenase	Domain	Interproscan
PF02812	ELFV_dehydrog_N	Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006095	Family	Glutamate/phenylalanine/leucine/valine/L-tryptophan dehydrogenase	Interproscan
IPR006096	Domain	Glutamate/phenylalanine/leucine/valine/L-tryptophan dehydrogenase, C-terminal	Interproscan
IPR006097	Domain	Glutamate/phenylalanine/leucine/valine/L-tryptophan dehydrogenase, dimerisation domain	Interproscan
IPR033524	Active_site	Leu/Phe/Val dehydrogenases active site	Interproscan
IPR033922	Domain	NAD(P) binding domain of glutamate dehydrogenase	Interproscan
IPR036291	Homologous_superfamily	NAD(P)-binding domain superfamily	Interproscan
IPR046346	Homologous_superfamily	Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11606	GLUTAMATE DEHYDROGENASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004352	Molecular Function	glutamate dehydrogenase (NAD+) activity	Interproscan
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0006520	Biological Process	amino acid metabolic process	Interproscan
GO:0006538	Biological Process	glutamate catabolic process	Interproscan
GO:0016491	Molecular Function	oxidoreductase activity	Interproscan
GO:0016639	Molecular Function	oxidoreductase activity, acting on the CH-NH2 group of donors, NAD or NADP as acceptor	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg104-11.1-1 global RNA-seq network