Gene detail

Detailed information of ctg1009-1.3-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1009-1.3-1	NUDIX T16 FAMILY MEMBER	chr3	3245659	3254915	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1009-1.3-1

TGAACTTGTAACACGTCACTGACGTGCACCACGAGTCCACCACTAGTAATACACAGTCACTGGTATTTCCTAGTTGCTGTAGTTGGACGATGAACACACTGCTATAATCAAACTACTTTATTGATCAATATGGCAGATGTAGGCTGGGGATGGTTGGAACAATATGAACAATTTGGTCGTCTTGGTGATCACAAACATGATTTTGAAACCATAACATTTGTGGAAGCAAAGACTAAATATTCATCATTCATGCATGCATCTCATGGTATGATATTTGCCAAAGATGATAGAATATTGTGGAAGCTATATAAAGCAAAAGCTGCAGTTTTGATGCAGCTGCGATTTGACGGAGTGTTTGGTTTTCCTGGGGGCCTCGTTGAGCCAGGGGAGGATCCAGTTGATGGGTTGAACCGAGAAATGGAGGAAGAAATTGGTCTGGATTTGAAAAAACACAGTTTCTTGGACAGTGACCACATCGCTTCGTTTGTTAATTCAGAAAAATCTTTGGTGCTGCATTTCTTTTTGAAAGAGGTGACATTGGAGGACTTCTGTGTCCTGGAGATGAACAACTTAAGGGCACCAGAATATGGCACTGAGACATATGGTGTAGTTCGTGTTCCCCTATTCACCATGGGTGATGGTGTGCGAGGATTTCCAGCATTTTTAGCCAACCATTTCGCAGGCAATGCCCGGGAGGAGCTGTTGATGGCACTAAAACATTGTAACATTTTAACAGTACAGGAAATACAGACTGCACTTGTTTCTTCAGAAGAGTTTGTGACGAGTGTTCGATCTTGAAAGAGTTAACAACTGATTGTTAGGCTGATAGTAACATGTTCAATATAACTGAGAATGAACATGTTTATGTTTGAGTTCATAAAAACTATGAATATTGTTTACTGATTTTACTGATTATGTATTATAGACCGTAATAAAATAAATACTTGATTTTCATACAGATATTTTTCAAAATGGTTGAAAATCAGGGATTTATTTCATTATGGACTTAAAGGCCAACTTGTAATAAATTTTTAACTTTTAAGTTATACAGTTTAAGTCTATTTTACTATCTACTTTGTATTCCCAATAATCAGTAAAACGTGTTATTCCAATATTTGCTTTTATGTAAGCATTGTAAATCGTCTTACAAAATAATTACGCTAAATGTTCCAAACTTTATTCAGCTACAAGGTTGACATTATTATTCATTATGTCACATCATTCGTGATTGTTTTTCTCACTGTTCTAGGATTGTCTTTCCCTTTTAGCCAAAAAGAAGGAAGGAAGGAAATGTTTTATATAATGACGCACTCAATACATTTTATTTATTGTTATATGGCATCGGACATATGGTTAAACACCACACAGATATTGAGAGAGGAAACCTGCTTTCGCCACTTCATGGGCTACTCTTTTTGATTAGCAGCAAGGAATCCTTTATATGCACCATCCCATAGCGAAGGATAGCACATACCATGGCCTTTGATGTCCCAGTCATGGTGCACTGGCTGGAGCAAGAAATAACCCAATGTGCCCACTGATAGGGATCGATCCCAAACTGACCACGCTTTACCACTGGGCTACGTCTCGCCCCCTTTTAGCCAAAAAGCATTTTCAGTTATTTTTATATCATTAAATTAGACTATTGGACTAAAACATTTCTTGTCTTCTTGGTTTATAAAGTTACCTTTTAAAGGTGCAATCTCAGCTCTTCATCGTCATACAGAAATCAACCACAACTAGTGTTTTAATGGGACTGCCATCACTTTGTTGCCACTGCAACATAATCCATGCAACAGAGCCTTTTTAATAACTAAAATCAAATAACTATTAGTGTATATTCAGTGCATTTCATGTCATCCTAATGTTTGTATTAACCCAAACTGAATTTTACACCTTAATAAGATATGTACAAAACAATATATATTATGTAATTAAATGAAGGTTGAGCTACAGTAAACACTGTGATGATCAGAAACACATTGAATACAGACACTGATATTCTAAACAAGAAAATGTATTTACTTTGTAATTATAGTCTTTAACAAATCTCTGTTAGTTGATAAAATCAACAAAACCAGTACATACTTGCAGGATAGCAACAGCCTGTTTTGAAGCAATATTAAACATCTTTTTTATACAGTGTATAACAGTATTACTCATTTAAAGAGCTCCGAAGCAGATAACTTCCACTTTCATACTGGCCAACAAAGTCTTTTTATGTGACTGATTAGAAATAGAAAACATTGTAAATAAACAAAATTTAAAAATGGTGTCATGCAATGAAACGTAACATGAATGATCCATTCTATATAATGAAATATTTAAGATATACTCAACACTACCCCCCCCCCCCCCACCATCACGCACACCAACGCCATACCTAGAGTCTATTCCATGTGGAAAGCCTTTTTTCATGAAATGTGCTACCAGTTATCTATTTCTGAATCGATTATTTTCTAAATTGTACATAAAAATTGTATTTTTTTGGTTATTTCCAAACCACTTTTACTTTTCTTCTTGCATCAAACCAAACTAAAATTATTTACAAAGAACATTTTTGTTGGAAGATGGGAGGGACTATAATTATATGTCTATATTATACAATTAATGAATCATGATCCAGTACCTCGCACAAATTGACACACACACCCCCATCATGACCCATGCAATATATAATGTGTTCTGATGCCGATGTGTGTGTTACAAAGTACATATAAAGTACGTTAGGTCACCTAATAGCCACTTATTAAATCATGTTCATGTTCAGTAAGTATTCCTTTTTTTAAAGTTAACTCCCCTTGACTGCTTTGATTTCATCGTATATTAACGTGAAGATTTTAAGGTTGTCCGGTTTTTCGTCTTAACTCGATACTATGCAGAAACATTCAAATTGGCAAAGCCATTTGGGCCATTCTTCTGGTTTAGAGAATGGAAATAATTCTGAAGATTTAACTTGAAAAGATGCCATTATTCATTTATATATCATACATGGACAGTGAAATGTTATTCAGTGTTAAACTACTAGGCATTTTGTAAAAGGCACAAACTGTACTTGACAATTACGTATTTTTTTCAAAGCATTTTTTCATATGTTAATTTGACTCCATAACTTGTTTTTATACAAATCCTAAGGCATACGTCACATCTGACACCATGTTTGATATGTTGTTATCATTTCAAGATGTTCAATTTCTATAAACTTATATATATATATATATATAAGCGGCCATGATGATAGAGGGGGTGGCAGCTACATCACAGGAACCTGTCATGATAACTACTGTCATATTGCTAGTAAGCTAACACTATGGCCTCCTGTCTAAATGGACATGTTGCTTACAATTATTTGTTCTTTGTAATCAAAGAAAGAAAGAAATGTTTTATTTAACGACACTCAACACATTTTATTTACGGTTATATGGCGTCAGACATATGGTTACTGACTACACAGATTTTGAGAGGAAACCCGCTGTCGCGACTACATGGGCTACTCTTTCCGATTAGCAGCAAGGGATCTTTTATTTGTGCTTCCCACAGGCAGGATAGCACAAACCATGGCCTTTGTTGAACCAGTTATGGATCACTGGTCGGTGTAAGTGGTTTACACCTACCCATTGGTAGGTGTAGCCTTGCGGAGCACTCACTCAGGGTTTGGTGTCGGTATCTGGATTAAAAATCCCATGCCTCGACTGGGATCCGAACCCAGTACCTACCAGCCTGTATACTGATGGCCTAACCACGACGCCACCGAGGCCGGTTCTTTGTAATCGGTGTAGGGCATAGATATAAAGAATAATAAATGAGTGTCCGCTAGATACCATTTATCTTATGAGTTGTAAGATAAATGGTATCTAACGGACACAAATGTATTACTCTATTTCTTACATATTCTCAAAAACAAGGTATTAAGCAAATTTTGACATCTTTTTCGACTCAACGTTATTTACACCCCTTGCACATATGCATCACAGACAAATGATTGTAATGTTAACTATACGTCACAGTGTAATCGATTCCGATCGTTCTGTTTTTTCATTGGTGATGTAATCATCATCTAGGAGCAGCCAGTCGTATGTATTGAAATTGTTAACACATGTACATGTGTAAACAAGTATGTGTTATCAAAAATAACAAATGATGTTCTTACCAACGGGGTGTAAGAAAACAGGGTCATTTTGTTTTGAATAAGAAATCTGGATAAATACATACTTTCCTGATTCTAATACAACTTTCCTTTAGTTTGCTAAGGACTGCCTACTTGAATCATAATTTGATATTTAAAGCTTGAATATAAGTGCAAGTTCACCAAAAGGTAATAAGCTTAATATTAATTTAAAAAAGATCACACACCTCAGCAATCTGGGCTGTCTGTGCAGGACAGTGGTTTAGTGGTTAGTGAGAAAGAAGTCGATTTAGTGGCTTTACACCTACACATTGAGTCGTTAAACTCATTCTGGGTGGGAGCCGGTACCGGGGTGTGAATGGCTTACCTGCTAGAGATGCATGTTATAACCAGTATACTGGTACACATGTAGTCATTAAACATTCATTAATTCATTCGGTATACTGGTATACCTCAATATAAATTTTTAATGATATGTATTGCAATATTTTTCTATCCTATTAGTATCTTACACTTATATATTTTGTACATGTGTTAGTGCACAAGTATTGTATTTTCAAATAAAAACTTCCAGTTTAAGAAAAGAAACAATAGTTTCACATGTTTGGAATGAATTTTGATTGACTGGTGTATTATTGTATTAAATTATACATGAAATTAGAGCACTTTGTAAATTGTAATAATTGAGAATTGGTCTTCACAATATGTCATGGTACGTATCACAATTGAGGTTCCTATGTCGCAGTATTTTGCAATAAGAACATTTTGGCAATACCCATCTGTATTAACCACTACACTACCAAGGTTAGGTATAATCCATTTGTTATTTATACTTCCAACCAGTGCACCACGATCAGTATATCAACGGCCTTGG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Transcript

ctg1009-1.3-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00293	NUDIX	NUDIX domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000086	Domain	NUDIX hydrolase domain	Interproscan
IPR015797	Homologous_superfamily	NUDIX hydrolase-like domain superfamily	Interproscan
IPR020084	Conserved_site	NUDIX hydrolase, conserved site	Interproscan
IPR051894	Family	Nudix hydrolase family, NUDT16 subfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR31699	NUDIX T16 FAMILY MEMBER	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0006402	Biological Process	mRNA catabolic process	Interproscan
GO:0016077	Biological Process	sno(s)RNA catabolic process	Interproscan
GO:0016787	Molecular Function	hydrolase activity	Interproscan
GO:0030515	Molecular Function	snoRNA binding	Interproscan
GO:0050072	Molecular Function	obsolete m7G(5')pppN diphosphatase activity	Interproscan
GO:1990174	Molecular Function	phosphodiesterase decapping endonuclease activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1009-1.3-1 global RNA-seq network