Gene detail

Detailed information of ctg1-14.7-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1-14.7-1	SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 2A REGULATORY SUBUNIT B'' SUBUNIT GAMMA	chr4	82567609	82588824	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1-14.7-1

ACTGGAAAATACAAAATGGAGGAGTAAACACAAAAAAGTTTATTGATGGTGCCGATTTATGCAAATATGAATTGAGTTATATTGTTACGACAGTAAAATAGTGGCATGAAATACAAAATGGAGTGGAATCAAACATTACGGAAATATTTAAGTTCTAAACAAGGTGCGATTCGTCCATCATCTTAGTTTAAGCCATTTGCTTGGAAGGTATCGGGTGCCTGGCCCCAGTTTCAATATATTTAGTTTTTGTTCTTTATTTCCTTTAAATTCGCAATTAGTGTAATCTTTAGAAATCTCAAGAATATAGCAGATTGTTAATATCCCTCAGCTTTGAAGAAAAAAATATGTTTGCAATTAAGAATTTATCAAAAGAAGTTGACAGTGAAGAGGATATCTTTACTGAGTTGTACAAGAAGTACAAAGGACTGGCCAATGATTTCCAGAATGTCCCCAGCTTGTATGTAAAGCTTCCTACAGAGGATGAGCCTATATTGTTGAAACTGAGAGAGGAGTCTAGGGCAATATTTTTGCAAAGAAGGAGTCGTGAACTGTTAGACAATGACGAATTACAGAAATTGTGGTATTTGTTGGACAAGCATCATACCCAACCTTTGTTTGGGGAGGAGCAGATGATTAACTATGGAGATTTTGTGAAAGTTGGTGAAGAAGCTGGTTACAAATGTCGCCCTTTCTTCAGAGCTGTAGTGTTTGGCAAATTACTTCAAACAGATCCATATGGCAGAATATCAATCATGCAGTTTTTCAACTATGTAATGAGAAAGGTTTGGTTGCACCAGACAAGAATAGGGTTGTCACTCTATGATGTTGCTGGTCAAGGATATTTAAAAGAGTGTGATCTAGAAAATTATATCTTAGAACTCATTCCTACACTGCCTCAGCTGAATGGTTTAGAGAAGTCTTTCTACTCATTTTATGTGTGTACTGCTGTCCGGAAGTTCTTTTTTTTCCTCGACCCATTACGAACTGGCAAGATAAAGATCCAGGATATACTTGCCTGTAGTTTCTTAGATGATCTGTTGGAGTTACGTGATGAAGAGCTGTCTAAAGAGATGCAAGAGTCAAACTGGTTCTCTGCTCCATCAGCTCTCCGAGTGTACGGCCAATATCTGAACCTGGACAGAGATCGCAATGGTATGCTCAGCAAAGAAGAATTGGCCAGGTATGGTACAAGTACACTCACCGATGTTTTCTTGGATCGTGTATTCCAGGAATGCTTGACCTATGAAGGTGAAATGGACTATAAGACATACCTGGATTTCATTTTGGCCATGGAGAATCGACGCGAACCTCAAGCACTTAGATATCTGTTCCGAATCCTTGATTTAGAGCACAAAGGATATCTGAATGTGTTTTCTCTCAACTTCTTCTTTAGGGCAATACAAGAACAGATGAAGTTACATGGTCAGGAACCCGTGTCTTTTCATGATGTGAAGGATGAGATATTTGATATGGTGAAACCAGATGACCCATTTAAACTGACACTACAAGATTTAATCAATAGTCCCTCCACCGCCGGGGTTTCCAGCAAGACCGGGCTTTGGACCAGTTTGCAGATTCGGCCGGTCCGCATCGTCCTGCCCATGCAGTTTCGTTTCCGTTACGGTCAGCGCATGGCGCATCGTTTGAAAAAATTTCTTCTTCGGAAGAGGATTTTCCCTCCTAATCAGTGTGTGGTTCGGGGGAAGGGTCGGCGCCAGGTTCGGTGCTATGAGATTCCCAATTGGGCCGATGGTACGCCAGACGGCGATTATGATTACCAGGCAGTTCTTGGTTTTGTACGGGAACAGGTCCGACTGGTGTGCGCGGATGCAATTCCGTCGGAGGAGGCTGTTCAGTCTTACAAGGGTGTTTCGTTTGGAAACCGGCCTTTAGCGACGGACGCTCTGCGGAAGGATTTCGGCTTGCCGTTAGCGCACGAGGCGCATGAATCTCTTGCGGAGATTGATGCTTTGATTGCAGGTAGCGGTCGTATTTTGGGGGCGGTGGTGGAAGAGTTTCCGGTAGCGTTAGCTACCGGGAAACTGTTGTCTGCGGCAAAGGATTTGTCCACGTGTTCATATAAGACATTGGGAGCTTCCTTCCTTTCACATCCAGCGGTCGTTTCCACTAGGGTGAAGGCAGACTGCCACCCATCTCCTAATGTCAGTGTGCCACTCATGGATTTAGAGACTTTGGAGAGGTTATCTAAACTTCTTTTTCAAGTCAACCATTTAGAGACTGCGTTGGACAGAGTGGCATCCGAAGCCGGAGGTTTTCCGACTTCACGCATGGCGGTTGTCGGGGAAACCGAGGCTTTTCTAAACGGGTTGCTGAGCTCGTCTCCTCTTCGAAGCGCCAGTCTACGGAGAGGGTCTACCAGTGTCACTGGCGCGCTTGGTGGCAAAGGTGATACAGTTGTCAGTATTCTGATAGACTTAAATGACTTTTGGACATATGAAAACCGCGAGTATCTGGCCCCAGAGATGACTGACGAAGCAGAAATCTGAACAAAGCAATATTAAATCAATACGTGTTTTCTTATGAGTTTACTCATTGTGAAATAGTTGCAAAGCATTACTGCCATTGGAAGGTTTACAAAACACAAGACAATCAGGATGTACTGATGTGATATTTGTGTGAGACTTGTCTCATGTTTTAACATGTATTTTATTGTTTAATAGCACTCTGTGAGCATAGCATAAAATATGGAAGTACTAGCCAAAAAAATGTGATCATGTTTTATTATGTAAATTTTAGTTTGTGGGAGCAAACCATGGTGCTACAAATAGTTCAATGCAGACGGTAAAAGCACAAGTATATTAAACAGCTAATGTGGTTAATCTGCTTCTGAAAAATTGTTGCCGATTTTATCATAAAGAAGTAACTTAGCTGTTAATATATTTGTAACATCTTTCCACAAATTTTGTGGTTAAGTCATTACAATAGCTAAAGAATCGACTACAGTTTGTAGTACTCACTATCATTCCCTATTCTAACCAGTGTTTTACATCTGACATGTGCTATTCAGTCTGTAAGAAAATTCATATAACTCATCTCTTGTGACCAACCAGTAGTGTCTTGTGGCAAGCAGGATTCTTCTCTCATTATCTAGACAATGTTTGTCTATAAATTAACATACCTCATGCAAGTGATGAAAGAACCCCCTTTTGTCAGTTAATTTCCTTCTTTTTTCCACCTTGAAATAATTAGCCATAAAATGTACTAGTTCATTATGAAAATAAACACCCTTGAAAAATTCTTGATGACAAACATGGCATTGATATTCTAAAGGCAAAATTTATGCAAAATTGTTTATAAAAATATATACTTTTTTACATTTATGTTGGATTATGTTAAATAGCTTAATCCTGTATAGATACTTGAACTTCATAGCTCGGTTACGGAAAGCTTGCATGGATATTTTATAGCACTTAATTGTGATAAAACCTATGTGATTGTCTTCTTTTTTTTAATCCAAATCTAATGATTCAGTATTTTGATATGCAGTGACTAGTACACTCCAGGGCTATGTTTTATGAAGCAATTTTAGTATTAAAATCACCTGAAGTGTCTACGGTAGTGACCATAATGTTTTCCTACAATCTACTAAATGACTACAATCTAATTTTAATATTGCGAGTGCATATTAACACCCAGATATCAAAATGGCAAATTTAATTTTGCTATGCCAGGAACATTTATATTGTGATAGAAGCATGCATATAGCTACTCAAGGAACTAATATCACATATTGGATGCCACAGCATGCTATTATGCAACTGTTGCACAGGTTTTGGGCAGATTTGGAGTCGATGTCCAACTGCTCACCAAAATTATTTTCCTAGATCAGTTCGCCATGATAAAAAAAGCTATTTGCTAAACAAACCTACAAAGTCTGGTTAATATTTACAAATCATACTAAGATCTTCCTAACAGCAATGTGTGCTTCAAAGGAAAATAACTCTTTAAGTGGTTACTACTAAAAAAAATTTATTTCAATTCAAAGATTTTAACCTTAGAATCATTATTGTAGTAAGTTGGCATTTACAATTGCATTAAAATCACCAAGTTTGATAGTACCTAAAATTGTTTTATAAAACAGGGCCTTGGTTTTACATTTCTTTATAATACTGTATTGTGAATTTGTATGTATACAAAGGATAATAATTTCAGTGAAAAAAAATTTAACAGTTATGAGCTTTAGCAAGTGACAAATGAAAATAATTTCACTTGGGATATAATGTTAAAAAAAAAGTGTCAACTGACATGATTATAACCTACAGCACCAATTCACATGTCATTTAACAGACCATGACTTTAACATCTTGTCTACCAGGACATTACTTAGGTTTAACAATAACTGGTACCAGGGCCCATGCTTTTAAAACTTTTAAGAGTCCAGACTCAATCTCAAATGATGTCACATGAATGCAATTTGTATGGCGTTGCCGTGATGTTACTGTCCCAGACTCTATTAGTCTCAAGTCTAGACTCTAAAAAATTATACGCACCAGGCCAGGTTTATTTTCTGTTTATTATCCAGACATTTATGTTTCCTTAAATTATATTTATGTTTACTATATAGAAACTCAAAATTAATCTACATATTAAGTGGTATTTCTAACTTGTGATTTGTTCATGTTCAAAGTCGGGTTTTTTTTTAACCCAGAGTCTGTTTATTAAATTAAAGAAATAGGTAAAAGAAAGAAAAAACACTCCAATAACTCCCATTTTGTTATCGGGTTAGCATTGGCAATAGACTAGTAAATGAAATACATAATATGTTTACAGTGTGGGGTTTGGTGTTACTCAGTGGTCAATTGGCCTTAGTGGATCCATCAGCATTTCCCCTATCCCAAATGGTGCCCTATAGCTGGCATGTCAAAGACCATGGTATGTGTTGTCCTATCTATAGGTAAGTATATAAAAATCACTTGCTGCAATTTGATGCAACAGGTTTGTACTCTTAATTATACCAAATGCCATAGCTTAAAAAGTGA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Transcript

ctg1-14.7-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
--	--	--	--	--

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011992	Homologous_superfamily	EF-hand domain pair	Interproscan
IPR018247	Binding_site	EF-Hand 1, calcium-binding site	Interproscan
IPR039865	Family	Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit gamma	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12085	SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 2A REGULATORY SUBUNIT B'' SUBUNIT GAMMA	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000226	Biological Process	microtubule cytoskeleton organization	Interproscan
GO:0001782	Biological Process	B cell homeostasis	Interproscan
GO:0005813	Cellular Component	centrosome	Interproscan
GO:0005819	Cellular Component	spindle	Interproscan
GO:0030865	Biological Process	cortical cytoskeleton organization	Interproscan
GO:0035303	Biological Process	regulation of dephosphorylation	Interproscan
GO:0043029	Biological Process	T cell homeostasis	Interproscan
GO:0045579	Biological Process	positive regulation of B cell differentiation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1-14.7-1 global RNA-seq network