Gene detail

Detailed information of ctg1-11.5-1 in Gigantopelta aegis Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
ctg1-11.5-1	LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING	chr4	82754455	82762381	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

ctg1-11.5-1

TTGTTAAACAAAACAAACTCACCATCAGCTTTGTGAAAATACATGTTTTTGATAATTGTTTTTGTTGTTGCAGGAGATACCACAGAGTTTGTGGTATTTGTCGGTCACCCTCCACAGACGTCAGCGTCCTTTGTTACAGCTTATGGAACAAGAACTACAGAGAGAGAAAGAAAACAGACTTCCACAGGCTGGTGAAACTTTGTTAAGCCGTTACCTGAGCTGTCACCAGTTTACTGAATTTTACCTGGATAGCATGTTCAAGTATGGAGATGACAACAGACTACCCAGAGAGATATTTAAATGTCCCAATGTGAAGTATTTATCCCTGAAGTACAACAGTTTGGACCATATTCCCGCTGATATTGGTCGGATGTCGAAGCTGGAATACCTGGCCCTGACCAACAACAAACTACAGGTCCACTCCCTGCCACACACCCTCATCTTCTGCAAGAATCTCAAAACCGTTCTTCTGGACAACAACCTGCTGGACGCTCTTCCGGGATTCCTCTTGCAGATGCCTTCCATCGAGACAGTGCATCGTCACGGCAACCACAACTACTTCAAGGCCACGTTTATGTGGTACCACACTGACGTGAACTACCGCATAATCCCGATAGCCGGGAGCATGGACCCGATGTTTCACCACCAGTACGAGAGTCTTCAGTTCTGGGCAGCCAAGACGCTGATCGGCTTCAAGAAGGACTTCTTCAGTGACGAGCGCGTGGCCCATGGCCTGAAGGACTACATCGCCGACATCTACGACATGTTCCACATCTGCCACTACTGCAACAAGGCCTGTCTGGCTCATTTACATGGTTACAAAGTGATTACCTTCAAAAATCCTTATCTCGGAAACACATGTGTTCCATTTCAACACTGGGCATGCTCAAAAGAATGTGCCGAGAAACTGGAAGTTCCTGCTAGGAAGGAACAGATTGCAGCGGCAATGAAACTGGATGAAAAGTATGATGAATATGTAAATGAATGTCAGCTACACTTCCACTCCCATCGGACACGGTTACCCTGTGGTGCAAAGACAATGTACGACGAGTGTCAACCCCCAAGTCAGCATCTTGATGAATCCAGTGCGCAAAACACTCCCAAGAAAAAACACAGCACCAGGTGTGTTTGTGTTGTGTCATAGTATAGGATATGATCTCTCCAGCATTACACAGTGCCTATTTTCATAGTTGGGACTCTTATACATAATAAATAGAACTGTACCCCATTCCTGCCAATATTTTAAGTGTTTTTAGTCAGTAATTTCAGTTTGGCTTGACATTTAAAAAAAACCCCAACTATTTTGCAAATGACAAATATATGCTATTTATAATGCAGGTTGTAATAACATTTGACAATATATAAATAAAACAGCTATGCTTACACATGGTGAAAAATGTCATCTACTCATGAAGTTTGAAGTTATGTTTTCTTGATTAATTTATCCTGTTAAACTCTGTATTTCATTACTAGTTTACTAGATTTGTCTTCTAGTTTGAGATCTGTTTTGTAGAATTGAAAAAAAAGAAGATTTTTTTTTTTTTTTACACTTGATGAGCAGGTGACATTTTATTTATGCCAGGATAATTGTTTTCCCAATTTGTAAATAAAAAATATAACTTTTCTATTTAGACAAACTAAAATTATTGACACAAAGCACTTGAAATATTTGCCGAACTTGGGTACAGTTTGATTTTACTGCAGGTGTCTTCCACTTTTTGCATGTGGCCTCTGCAACATAAAATAGTTTGAATCGGATGTTGAAAATGGGTTGGGTTTTTCAATTTGAATTGGGTCTGCCTTGGACTACAACATGGAACAGCTCCAAGTGAAAATGTATTGCATTTTGAGGTCCATCAGTGTAATTTTGTAGTCAACATTTCATTAATCAGTTACAGTTGTGTAATTATGCACTCTCTACTCAGCCCTCCCTCCAATTACTACCAAAATAGTAGAAGGACTAGTAATCTGTTAATTACCAGTTCGAACAGATAATACTGTTTGAAAGATCTAATCCTTAAAATGATTTGGTTTTAGTGCTTTGTTTTTATAATGATCAATACTGAATATATGTATTGCTCATTATTCACTATTATTATTGTTTTATAGGTATGTCCATATAAATAACTGTACTTACATTACAAACTTTGAAAATAATTGCGGTAATAAAATTTTTGTAGCAGTGGATTGATCGATAAACATATAATTAAATTATAGGAAAAAACTCTGGGTTATATAAGGTAAATCGTCTTCCATATAATTGCACACGAGAGCTATCAGCTGAGCAAAAAGTGATTTGAGACTTTATGTGAAGGTGATTTTGCTGAGTTTTTCTCCTCATGTGGTCATGCAGAAAGTATCTCTCATGTTTGATATTTTTGGCCAAAATAGCACCTTTTGCAGGCTACATTATCTGTCAGCTGAGGTAAATTTTTCACCTGATAAATGGAAACATGAAAATTGTGTGATGTCGTTGTGACAGTCATAAGCCAACTAGTTCAGCACTTAGCATATTGTGTGCAGTGAAATTCTAACAGGTGAGCAGAAAGTCTCAAATAACCTTTTGCTCAGTTGATAGCTCGATCTTGTGTGCGGGAGGCTTAAAATTAGAAACCAAATTAACAAAGGGGTAATATGGTCATTGTGTCCTGGATATAATCATCATTCATTGATCCCCCACCCCTTCCTGCCCCGGAACCACCCACTGGCTATGTCATAGGCTGGACCCGTGGTAGGCATGCCTGAACCTTTATTGGGCACGTAATTAGAGTTCCCATTCCCATCATTCATTGTGTAAAGCATTTTCGCAAGCCACCGTATGATTCCATACAGTATACGACATTACAAAATGAAGTATACTGTATGGAATGGTAGCTTGGCTTGCGAAGATGTGTGTGAAGCTGTGTTACAGTATGATTGGCCCTTGGCTAAGTAAACTGTCTTTTTAAGGCAGACCTTCCAAGCCTGACCACTTTACTCTACCAAACTACTCAGATACAGTGTGAATTATAGCGATTTGTTTTGAAATATACAAACTGAAGTAAGATTGTTCTGAACTTTGACGTAAAACATTGCATTAGGGCCCCATTTTACAAAATGGTCTTAGCACCAAGAAACCGTAAGTGCATAACTACCTTATAGTCTTAAACACTTAAGGTGATCGTAGCACTAAGATCACTTTGTAAAACAGGGCCCAGATCTTTATGTATATACTGTTGTGGATGCTATTTTCTAAACTATATGTTCATAATATACTGTGAAAGCTTTTGTCTTGCTCCATTTTCATCAATGATTAATGAAATTACCAGTAGCTAGTTCCATACACTGTGATATTTGAAAGTCTGTTGATATTTGCTGTACAGATTGTGAATACATGTGCAATTGTATATGTCACGTTTATTGTGTGAATGTTTTGAGTGTGTAAATATTGACTGGGTTGTGTCAGAATGATGTCATAAAAAAAAGATCTCAAATGACTGATGTCTGCTCACTTTGATGAACTGTTTCGATTAGACAAAACTCTTTTCAATTTTTTGTTTTTTTCCCACTTTATTGTGTCAAAACCTGATGTTTTACTTATTCGATAACTTCCTCAAATTAAATTTTATTTTAGTGTACAGGAAGTATTTTGGCATACAAGTGGGTATGTAAATACCAGTTGCTTTGTGTCTTGGTTTTTCAACATTACCTGACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCACCTCAATCATACTTACATGATCATTTATTGTAGATATTTGTAAAATAAATTGCTTTATCATTTTACCCACCTAGGTTGACCCATCCATTACCTCATGAAAAAAAGTAAAAGCAATAAAAAGCAGATCCAAACAATTAGTGATGTTTTACTTTTGTAAAGTTCACTATAAATATGTTACGTTACAACAGAGTCATTTCAAGCAGTTAACAAATATTTCATCATTATGATCTGTTTCTGATTTTGATCATTTTCAATTGTAGTCGAGTGTTTTTTAGTTGTTATAACTTTTACCTTGATTTATCAAAATACCTCTATGTATTGTTTACAGTTTGAATATAAAAAATGTTTAAATCATATGCATTTAAAACTAGATTTGGAATAACAACTAAAAATATTAGATAAAAGTCAAATGTTATTTCAGTACACAAAACTAAGTAGCTATTTTGTGTCTTGTTAAGAACTTCTGTCCTGACAAATCTGCTGGACACTGCTTCTCAAAGTATTGGTTTGAATAAAATTAACATTAATATGTTGATTTACCCATATTTGTAAAATCAGATTTAATAAAATAGCTCATTTGTTACTTGTAATATAGCACTCATAACATGTAAGAAAAGATATTCTCTCATCATCGGGTATATGGGACAGAACTATCCCATGAAAGAAAGCTATATAAGAATTTTGATGGTGATGTGAGGTTATCAGACAACAATTTTAACACAATATTTTGTTACTAAAACCTTCATTTATAAAAGCTACCTTGTTAATTTATAGTGTTAAATTACTTTTAAAACATGAAACAAACATCATGGCAAATACGATAATGTAGTTTATTTATGATAAAATGGTGAAATAAAAAAGTTACTTTTTCAGCCATCTTGGTCTGTTCGTGTAAAATAATAGTTTATTTACTGAATGGTTGAGAGAAAAAGACTCCATCATATGCGGTCATTTGAGATAGAAACAGTATACCCTCAGTGGTGAAAATTTTAAACTTTGGGACTTGGCAAGCCTCATCCTAGGTTGACATTTCCACCACCTTGTGTGTACGTTTCTATTCCACATGACAGCATATGATGGAGTCCTATAATAAATATTTTAATATATAATATTTTTATCATAAAATTCTATAAAGATGTTGATAACTTCAATAGCCCAATGGGCCCACTGACGGGGATCGATCCCAAATCGACCGTGCATAAAGCTAGCCCTTCCCACTGGGCTAAGGCCCACGGCCTCTATATTAGTCAGATACTTATTTATATTTGTACATCATGGAC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Transcript

ctg1-11.5-1

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13855	LRR_8	Leucine rich repeat	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001611	Repeat	Leucine-rich repeat	Interproscan
IPR032675	Homologous_superfamily	Leucine-rich repeat domain superfamily	Interproscan
IPR050715	Family	Leucine-rich repeat and signaling effector domain-containing protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45752	LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for ctg1-11.5-1 global RNA-seq network