Gene detail

Detailed information of WZF223430 in Chaetoderma shenloong Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
WZF223430	CYTOSKELETON-ASSOCIATED PROTEIN 4	chr14	73502855	73745502	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

WZF223430.2

ATGGAGCCTGTAACGAGTTCAAAGATGGCTTCCTATGGAGATCGTCAGTTCATCTACAGCCTGCAGAAACCGCCTGAGCATCGGATGCAGAAGGATTTGGATATAATATACTCATATCTTCATGGAATGGAAGCTCTGGCATGGCTGCGGGAGCCAGCTTTACGAGCGCTATGTCGCACCGTTAGATACGAATTCTATGAGGCAAATGATATTCTTTATTGTCAGGGAGAGTTGAGTACATGTTGGTTCATCCTTCTATCTGGCTCTGTGTTCATTGAGGGTTCCATGTTTCTACCTAGAAGCAGTTTTGGCCGTCGCATATCAGGATGTTCTCGTCGGCCGAGTGAATGTCTTATCTTGGAGCCATCAGAGATGATTGTCGTTGATTATCCTGATGTTCAGATGATGAAGCCGGGGCCTGGCCCTCAGCGACTCACTTTGCCCGCTGCGCCTCCGCCACTACCTCCTGCCCCTTCAGGTGTGGTGGCAGGGGGTAATATCAGCATGAACCTTGACCACTTGAACTCCCTCGAGCAAGAGGACACTAACATGCGAGTGCATCGGTTGCACTCGGACTCCAGCGTGGAACAATATACATATCCGAATGACATTCCGCTTATGTATCAGCGTGACCCATTCATTCGTGGTGAACATTGCATAAAACGTAATTCTCGTGCGAGTGACACGTCAAGTGCTTACTCTGGCTCAGACTTGATGCAATCCTCGCTGGATGACCCGGAGAATGGTGATAATGACCTTAGTGGACTTGTTGAAAGTATGGTTGATTCTGATGAAGAAGAAGGTTATGCGGAATCAACAGAGTCTGCGCGTGATGCTGTGCGAGAGTGCTTGGAAAAAGAGACATCGGAGCGTACTGATGATGACATAGAGATATTACTAGATTTCATGCAGCATTTCCCAGCCTTTGCCAATATGACGTTGGCAATCCGCCGCGCGTTGTGTTCCGTGATGGTGTTTGCTGTTGTGGAGAAAGCATCCACCATTGTAATGAATGACGGCGAAGAGCTGGACTCCTGGTCAGTCATTCTGAATGGTGTTGTGGAGATTACATACTCTGATGGTGTTCATCACCTTCATATGGGAGACAGTTTTGGAATAACTCCTACGATGGAGAAACTGTATCATCAGGGAGTGATGCGGACGTTAGAAGATAATTGCCAGTTTGTCTGCATTACACAATCAGACTATTACAGAATATTACATCAGGGAGAAGAAAATATTAGAAAAGTTGAAGAGAAGGGTGAGGTTGTTATGGTAACTGAGCATAGAGAGTTGGATGGTGGTAACCGACGAGGACATATCGTTATCCGGGGCACCCGCGAGCGTTTAATGCAACACTTAGTCGAGGACCATTCAGTCATAGATCCCACATATGTAGAGGACTTCTTACTTACTTATAGAACATTCTTAGAATCACCGACGTTGTTATCCGAGAAGCTGTTGCAATGGTTCAACGATCCAATGCTCAGATCAAAGGTAACGAGAGTTGTTTTACTATGGGTGAACAATCACTTCAATGACTTTGAGACGGATGCCAATATGTGTGACTTCCTGGAGAAGTTTGAACAGTTACTGGAGCGAGAGAGAATGGGTGGTCAGCTACGTTTGCTGAACATCGCGTGTGCGGCGAAGGCTCGACCACGTACTGTCACACTTACACGTGCGACGAGAGAGGAGATCATGCATTTCTCAATCCTCGGAGGAATGGAGAGAAACTCGGGAATATTTGTGTCAAAAGTCGAGAAACTGTCTAAAGCGTACGAGGCTGGCCTCAAGCGTGGCGATCAGATTCTCGAGGTAAATGGTGTGAATTTTGAGAGTATATCTCATACTCGTGCTTTAGAAGTGCTTAGAGGAACCACACACCTGTCAATAACTGTCAAATCTAATATATTAGCTTTTAAAGAAATGCTTGAGGTTCCAGACCGAAGGGGTGGACATAAATGCAAAAAAGACGAAATAGCTAAGCTTCAGACTGATCCTAAGCAGAGATTATCTGCCCCTGATCTTGAGATTGCTCTACCGCCTGTAATCACTGTTACCAAAGACAAAAAGAATGACAAAAAAGATCGGGGATTTATGTCACTCGGTCATCGTACACGGTTACGGAAAGCACTCATGAAAATCAACATTATACCAAAAAGTTTGAATCCAGATACAAGTATGTACAGCTCTGATGAGAACCTACATGCTAGGCCATCACGAAAATCTTCCACATCATCGTCTTCTTCAACGAGCAATACAAGTGGGCTTCTATCAAATCACCTCAGCGCGAGCAACCCTGATCTTTCTATGGCCTCGTTAAGTATTGACGATGGCCAAACCGACTTCCCAGAACATGTGCTCAAAATTTATCGTTCAGACCAAACATTTAAATATCTTCTTATACATAGAGAGACTACCGCGAGAGAGGTAGTGATGTTAGCTTTAAGAGAATTTGGTATTACAGACCCTAGCAGTAATTATTCCTTGTGTGAAGTAATTGTTGAAAATGAGAACTTTGTCAAGCAAAAGAGGCTTCCTGATCAGTTATGTAATCTACCTGATAGAATCAGTCTGAATGGCAGGTATTATTTAAAAAACATTATGAGTACGGAGACGCTGGTTCCTGATGAGCTAACTGCAGAACTAGTCAAAGAGTACCAGACGAGCTTGATACAGCTTAATAGCGCAGAGATCGCTTCTCAACTTACGCTGGCAGACTTTCGAGTATTTCGTGATATCGAGCAAACAGAATACGTTGACGACTTGTTTGATATTGAATCTGTGTTTGGAATTCCTAACCTGGCTCGATTTGAACAGTCTGTGAATCATGAGATGTTCTGGGTCGTGACTGAAGTATGCAGTGAACCAAATATTGTCAAGCGCATGAAGATACTCAAGCACTTCATCAAAATAGCACGTCATTGTAAAGATTGTAAAAACTTCAACTCCATGTTTGCAATATTGAGTGGTTTAGGTCACGGGTCAGTGTCACGGTTACGGAACACCTGGGAGAAGTTACCACAGAAGTACATCAAGATGTTTGATGATTTACAAGAGTACATGGATCCTTCCAGAAATATGTCCAAGTATAGACAGCTGGTCAACTGCGACCGTACACAACCACCAATGCTTCCACTGTTTCCTGTTGTGAAAAAGGACCTAACATTCATTCATATAGGAAACGACTCATTCGTCAACGGTCTTGTTAATTTTGAAAAATTACGGATGATCGCGAAAGAGATTCGACACGTCTGTAATATGTGCTCTGCAAAATATAATGTCAGCACAATGTATCTGGGTACACCGAGTTATTATGAGAGTGCTACGATATCAGGTGTGGCAACATTGAAGCGGACCAAGAACCGACGTGGCTCAGCCATGCCAAATGGCAAGAAGATGTATGAAGAGTCTCAAATGGTTCGGCGAGTGAAGTCGTACCTGGCTAACACGCACGCGATCAGGGATGAGGAGGAGCTGGAGAAGATGTCATGTAAATGTGAACCGCCTGCCCGTAAGCGTGATCCATCACCGATGGTCAGTGGAGGCATCGCGCATGGTGGGAGCTTGGAGAAAGTGATTACAGGGCCCAAATTTGGTTCGGCTTCTGCTGAGTCTGTTCGCAAGCTCATGGCACTTACGGACAAGGTGCGTCCACATAATCCCAAATATCCTCTACCCCCTGCATCATCGACAAGTGCTTTTTTCGGGGGTCTCCGACGTCCTAACTCCCCTCGCTTGTCACGAGCACTCGCTGTACGCCTGTCACCTGAAAGCTCATCAGTTGTCAGCCTCGGTAATCTTGGCTCACGCAAACCTTTAAGAACTGCTTCTATGGGTTCCTCAGAGTCGGCGAGTCCAACGGGTAGCATCCACAGCTGCCCCGCCCAATACGAGACAGACTCTGGACACAATAGCATCACATCGTCAAACTATGACAGTCGAAGTACGAGTTCAGTCGGCTCCGGCGCAAATTCACCACCATTGGCGAAGCGATTGTTACACCCCAATCAGACAGTTACTTACAATGCCTCCAACCCGCTGCCTTCCTTGCCCCCTCAGCCTCAGTCTCGTCCGCCTCTGCCTCCTTATCACGTAGTCATTCAGAACATGGCTGCTCCTAATGAGAAAGTGACCTCTCGGAGACCTCCTTTGCCTGATTACCACTCGGCTACGCAAATGGCTCAGATGGCTCGTCAGAAGCAGCAGCAACAGCATCAGCAGCACCACCAGGTGTATAGCAATGGAGCTCCTCATTGGCCAATGGAGCGTGCTCACTCGCACGAGGGCGTCATCGGATACTATCACACAGACGATGTCAGTTATGATGTAGTGGAAGAGGAAGAACAAGATGAAGAGCAGGTGTCTGCTGTTTGA

Transcript

WZF223430.2

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00595	PDZ	PDZ domain	Domain	Interproscan
PF00617	RasGEF	RasGEF domain	Family	Interproscan
PF00618	RasGEF_N	RasGEF N-terminal motif	Domain	Interproscan
PF00788	RA	Ras association (RalGDS/AF-6) domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000159	Domain	Ras-associating domain	Interproscan
IPR000595	Domain	Cyclic nucleotide-binding domain	Interproscan
IPR000651	Domain	Ras-like guanine nucleotide exchange factor, N-terminal	Interproscan
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IPR001895	Domain	Ras guanine-nucleotide exchange factors catalytic domain	Interproscan
IPR014710	Homologous_superfamily	RmlC-like jelly roll fold	Interproscan
IPR018490	Homologous_superfamily	Cyclic nucleotide-binding domain superfamily	Interproscan
IPR023578	Homologous_superfamily	Ras guanine nucleotide exchange factor domain superfamily	Interproscan
IPR029071	Homologous_superfamily	Ubiquitin-like domain superfamily	Interproscan
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IPR036964	Homologous_superfamily	Ras guanine-nucleotide exchange factor, catalytic domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
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GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan
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KEGG pathway

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-	-	-	-	-	-