Gene detail

Detailed information of WZF219790 in Chaetoderma shenloong Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
WZF219790	CTX-RELATED TYPE I TRANSMEMBRANE PROTEIN	chr13	113949035	113961501	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

WZF219790.1

GATCAACCACGTGTCTGGTGCGGACCTAATGCCAATCCACCTGGAGCCTTTGTCATGTTTGCTGTAGATGCCAACATGTTTCGTGGTATTCCAATCCTAGAGAATGTAGTTTTTAGCGCGGACGTAGCTGCCTATGGTTTTCTTACGTTTGATGAACTCGATAATGTTGCCGGTATATCACCAAGACAGATCTATGAACAGATACTCCAGAAATTAAAGGATAAAGTAGAAAAGGCATGGACATTTATTCAAACTGAAATTGCTAAGATTATTAACTCACTTACCGAGTTGGTGAAGGATGTTATTCAAAAGCTAAAGGATTTGTGGAACAATTTCAGAGCATTAGTGCAGCAGGCCATTGCAGACCTAATAAATGGACAGTTGCCTTCTCTGGCATCTATTTTAGGTGACGTGGTAAATATGTATACGCAGATTAAAGCTATGTTTGAGCAAGTGAAATCCACTGCACTGATGACATTTGATACAGTAGTCACAGACTTTGTCGCATTTGTAGAACAATGTCTCGAAGAGATGAAGGATTTTATCAAAGATTTGGTTGATAATGTTCGTTCTGATGCACATGATTTGATATCTGGTGATACAAGCTTTGGAGTTAAAGGTCAGATGACGATTACAATTTTAAACACAGAGTTGCCACCGATTGGGGGAGAGTTTGTTGATTCAGATCAACATCTCGCGAGATGCTCCCAGTTTCAATATGCCTACGAAGAGCTTCAAGGTGAGAGGGCATTCAGAATTTATGGAGAATTTATTCTCGCAAAGGAAATGTTCAAAATTTTCGAAGTGGAAAGAGGATATGGATTGGAATTTGCTTTAGCGAAGCAAAGCCGCAAGTGGGTAGTCCGTTTCCATACCAGATGGGTTTTCTTTAGTCTCCGTATTACAGCTGATATATTCCTTACAACCCGTGGACTGTATGGAAAGGCAATGGGTAACATATTTAATGTATTTAGAGCATCATTGGAAGTCACGGCAGATGTAGCTGTTCCAGCAAGTCAGCTAAGATTAAGAATAGCTGGAGAATTACTAGCTGGTGGAGACTCATCTTTTGATGGTAGCTTCCTGGATGCACTCAGAGAGCAAGCTAAGAAACTAGCGGATGATGCTAATGACAGGATTTCGAAAGCACAAGATGCACTGACATCGGCTCAGGGAAAGTTGTCAAATGCACAGAATTGGCTAGAGAAGAAGAAAACCGACATTGATAAAGCAAATGTTGTGTTTGACAAGGGGATTGCTGCACTTGAAAAGGCAAAGCAAAAACTTGAGGCTGCGAAAGGCCCATTCTTGAAAGCAGATGCAAAACTGAAAGCAGCTCAACAGAAGGTTGACAAACTGTGTAAAATTAAGACATGTAATAAGATATGTGTACCTGGTGTAAAATGCAAGATTTGTCATAAGAAGGTCTGGGGTGTGAAGGTGCCATATCCATGCTGCAAATGGACAAGTTGCATGATAAAAGTACCCAATCTAATATGTGAGGCAGCGAATCTAGCATGTAAAGCTGTTCGTGGCTTAGCATATGCAGCTTTAGCTGTTGCCCGTGCTGTGGTTAGACTTCCACTGTTAGCATTAGATGCAGCTAAAGTGGTCCTGAGTTTGGCCCAGATTGTAGTAGACAAAGCACGCATCGTTCTGGACCTTGTAAAACTAGCACTGACGGCAGCACAAGGAGTATTAGAAATAGCAAAAAAAGCACTTGATGTTGCTAAAGGAATTCTAGAGGCTGTTAAATTTGCTGTGAGAGCAGCTTTTTGGGTTTTCAATTTCATTGTACAACATGGACTACAAAACATTATTGACATTAAGAAATGTGGATTTGCGGTAGAGATTTCTGTGGCAAATTGGTTTGAATTTGAAGTTTACTGTGAGATCAATTTATTTAATTTAGGCTGGTCAACCGTGAAATTTAAAATGAATTTTAAAAAGATAGTACAGAGTCTCTGGAATGCTGCAAAGTCAATTGTTGGCAACGCGCTCAAGAAAATAGTTAATGCTATTTTTGGCAGAAAGAAACGAGAAATTGAGTTTGTAGAATATGAGGTTTTTAAGAGAATGAATAAACTTTACCGTGTATTAAGAGATGAAGGACCGACAACACCAGATCCTACCGAGAATCCACCAGAAAATATTACACTAGGGTCCAATACTGAAGAATACTTTGCTAAGAATTGTGCTGAATTCAAACCACTACATGAGTATCTCTTCGAGGCTGCTGACATGCTTGAAAATATCTCAGAAACTATTCTTGAACAGCTAGAGACCTTATGGAATGCATCTGAGGCAAGCTTCCCCGATACATCACAACTTAATGAGACCAGAACCCCAGAGGGTGCGGGAATTAACATAACAGAAGCATTGCTGTCTTTTAATCTCACAGAAGAGCAGATCCGTCTTGTTCTGAATCAAACAGATTTCGAGCAGAGTGAAATGTATTTAGCAATACTCTCTGTCTATGAATCGCTCCAGAATCAAACCAGAGACCAAATAGAAATTGTTGAAAACTTTAATATCCTGGAAGTTTGGAGAGCAAATATGCTGAATTTTACAGCAGAATCATTTCCAGAAGAGGTATGCAGTGGATTTGAAGACTGTGTAATCCATGCCATCACTCAGTTACAGATACTCTATGACCCAATCGACATTCCGGTTGTGAGTGAAATCAAGATGCGTCATCTACCAGCATTACAGACTATCATTCTAGAACTTATCTCCATAGACTCATTGGATGCAGCATCAGCAGTAGCAGCTAGTCAGAAACTGAAGGAGATTCTAGCTCAGTTAGACGGTGAAACAGTGTTTTGTGGGTCAGTTCCAGTATTCGTCACCCAACCTGTAGATGTTCGTGCCCTAAAGGGACACAGTGCAACCTTCCACTGTGAAGCATCAGGAGTACCAAATCCTGTTTATCAATGGTTCAAAGGAATAGATGACAGTTTGATTATCTCCACATCCACAGTTTTAATTGTGGAAAATGTTGCCAACGACGACGAGGGAACTTACACCTGTCGTGCATCAAACCATATAGGAATTGTTGAAGCATCTGTTGAATTATTTGTGGAATATGAACCTACAGTGACATCAGATTTCGAGAACAGATTTGATCTCATCCTTGGAGAGTCTCTTCAGTTGATCTGCTCTGCAGAAGCAAGCCCAGAAGCAACATTTGTGTGGCATTCATCAGCAACTGTCACACCGTTGATCGTTGGGGCAGAATTGAATATTTCCATTGCTAGTGTTGCCATGTCTGGCCTTTATAAATGCGAGGCTCTAAATAAGCACGGAGTCGATATATCTACAGAGATCTCAATTCAAGTATATGAAGGCAATGTTGCATGTCCCAGTGTTTCTCTGACAGCTGGATTTGGCCTGATTCTGTATGGAAATCAAACATTGTTCTCTGATATCCCGGGTGATCTTGATACACGTTTCACAGATTCCGTCAATAGTATCTTTTCTACCAAGGCGACTTCTACAGTTATCATAGAGTTAACTGTCGACAGGGCATCTAACAGATTGAACATGGTCTTGAAACATCAGTGCACTGATCCGTTTGAACTAGATGGCGATATGGCACCCGATCAATTTCAAGAGCGGGCGGATGGACTACAAGCGGGAATTGATGTTCTGATATCAGTGGCTGAGAACCATGACTCTGAGAATACTGCTCTGTTTCAACAAGCGGGTAATGCATATCTTCTTAACTCGGCTACGTTTGATGTTGATACCACAGAGGCAACATGCCCACCTGGCACACATCTGTCCACAAGCAGGGATAAACTATGTCTATCTAACACACCGGATATAACAGTCAGTGCACCATTACATCTGACGTTAACTAACTTGGACCTTAGCTGGGATCCACCGCTACAAGGGAGTGCCTTTGTTCAAGATTACGAGATAACAGCCTCCGACACATCCCCTGGTGGTTCCTCAATTACATTGACAACAAGTAAAATTGCAGCTTCCTTAATGCAAATGCGGCTTTCCAGTGAAATGATAATAAAAGTCCGAGCTCGCACTGAAACAAGCTTTGGACCATGGGCTTCCATCACAGCAGCAACTACAGGTCCAATCCTGCAATACTGTATCGATGGCCAAGATGACGGTGATGGATGTCAGGAGTGCGTACCAGATGAGTTCATCATACATCCCACAGACTGTAGTAGCTACTATCAATGTCTCCCTAATCGAAGGGTTCTTCTAAGGAGGTGCTTTCCTGCAATCCTGCACTTCAATGTGGCTAAAGAACGATGTGATTGGCCATGGATGGTTATGTGTCTGTTTAATTAA

Transcript

WZF219790.1

GTGATCAACCACGTGTCTGGTGCGGACCTAATGCCAATCCACCTGGAGCCTTTGTCATGTTTGCTGTAGATGCCAACATGTTTCGTGGTATTCCAATCCTAGAGAATGTAGTTTTTAGCGCGGACGTAGCTGCCTATGGTTTTCTTACGTTTGATGAACTCGATAATGTTGCCGGTATATCACCAAGACAGATCTATGAACAGATACTCCAGAAATTAAAGGATAAAGTAGAAAAGGCATGGACATTTATTCAAACTGAAATTGCTAAGATTATTAACTCACTTACCGAGTTGGTGAAGGATGTTATTCAAAAGCTAAAGGATTTGTGGAACAATTTCAGAGCATTAGTGCAGCAGGCCATTGCAGACCTAATAAATGGACAGTTGCCTTCTCTGGCATCTATTTTAGGTGACGTGGTAAATATGTATACGCAGATTAAAGCTATGTTTGAGCAAGTGAAATCCACTGCACTGATGACATTTGATACAGTAGTCACAGACTTTGTCGCATTTGTAGAACAATGTCTCGAAGAGATGAAGGATTTTATCAAAGATTTGGTTGATAATGTTCGTTCTGATGCACATGATTTGATATCTGGTGATACAAGCTTTGGAGTTAAAGGTCAGATGACGATTACAATTTTAAACACAGAGTTGCCACCGATTGGGGGAGAGTTTGTTGATTCAGATCAACATCTCGCGAGATGCTCCCAGTTTCAATATGCCTACGAAGAGCTTCAAGGTGAGAGGGCATTCAGAATTTATGGAGAATTTATTCTCGCAAAGGAAATGTTCAAAATTTTCGAAGTGGAAAGAGGATATGGATTGGAATTTGCTTTAGCGAAGCAAAGCCGCAAGTGGGTAGTCCGTTTCCATACCAGATGGGTTTTCTTTAGTCTCCGTATTACAGCTGATATATTCCTTACAACCCGTGGACTGTATGGAAAGGCAATGGGTAACATATTTAATGTATTTAGAGCATCATTGGAAGTCACGGCAGATGTAGCTGTTCCAGCAAGTCAGCTAAGATTAAGAATAGCTGGAGAATTACTAGCTGGTGGAGACTCATCTTTTGATGGTAGCTTCCTGGATGCACTCAGAGAGCAAGCTAAGAAACTAGCGGATGATGCTAATGACAGGATTTCGAAAGCACAAGATGCACTGACATCGGCTCAGGGAAAGTTGTCAAATGCACAGAATTGGCTAGAGAAGAAGAAAACCGACATTGATAAAGCAAATGTTGTGTTTGACAAGGGGATTGCTGCACTTGAAAAGGCAAAGCAAAAACTTGAGGCTGCGAAAGGCCCATTCTTGAAAGCAGATGCAAAACTGAAAGCAGCTCAACAGAAGGTTGACAAACTGTGTAAAATTAAGACATGTAATAAGATATGTGTACCTGGTGTAAAATGCAAGATTTGTCATAAGAAGGTCTGGGGTGTGAAGGTGCCATATCCATGCTGCAAATGGACAAGTTGCATGATAAAAGTACCCAATCTAATATGTGAGGCAGCGAATCTAGCATGTAAAGCTGTTCGTGGCTTAGCATATGCAGCTTTAGCTGTTGCCCGTGCTGTGGTTAGACTTCCACTGTTAGCATTAGATGCAGCTAAAGTGGTCCTGAGTTTGGCCCAGATTGTAGTAGACAAAGCACGCATCGTTCTGGACCTTGTAAAACTAGCACTGACGGCAGCACAAGGAGTATTAGAAATAGCAAAAAAAGCACTTGATGTTGCTAAAGGAATTCTAGAGGCTGTTAAATTTGCTGTGAGAGCAGCTTTTTGGGTTTTCAATTTCATTGTACAACATGGACTACAAAACATTATTGACATTAAGAAATGTGGATTTGCGGTAGAGATTTCTGTGGCAAATTGGTTTGAATTTGAAGTTTACTGTGAGATCAATTTATTTAATTTAGGCTGGTCAACCGTGAAATTTAAAATGAATTTTAAAAAGATAGTACAGAGTCTCTGGAATGCTGCAAAGTCAATTGTTGGCAACGCGCTCAAGAAAATAGTTAATGCTATTTTTGGCAGAAAGAAACGAGAAATTGAGTTTGTAGAATATGAGGTTTTTAAGAGAATGAATAAACTTTACCGTGTATTAAGAGATGAAGGACCGACAACACCAGATCCTACCGAGAATCCACCAGAAAATATTACACTAGGGTCCAATACTGAAGAATACTTTGCTAAGAATTGTGCTGAATTCAAACCACTACATGAGTATCTCTTCGAGGCTGCTGACATGCTTGAAAATATCTCAGAAACTATTCTTGAACAGCTAGAGACCTTATGGAATGCATCTGAGGCAAGCTTCCCCGATACATCACAACTTAATGAGACCAGAACCCCAGAGGGTGCGGGAATTAACATAACAGAAGCATTGCTGTCTTTTAATCTCACAGAAGAGCAGATCCGTCTTGTTCTGAATCAAACAGATTTCGAGCAGAGTGAAATGTATTTAGCAATACTCTCTGTCTATGAATCGCTCCAGAATCAAACCAGAGACCAAATAGAAATTGTTGAAAACTTTAATATCCTGGAAGTTTGGAGAGCAAATATGCTGAATTTTACAGCAGAATCATTTCCAGAAGAGGTATGCAGTGGATTTGAAGACTGTGTAATCCATGCCATCACTCAGTTACAGATACTCTATGACCCAATCGACATTCCGGTTGTGAGTGAAATCAAGATGCGTCATCTACCAGCATTACAGACTATCATTCTAGAACTTATCTCCATAGACTCATTGGATGCAGCATCAGCAGTAGCAGCTAGTCAGAAACTGAAGGAGATTCTAGCTCAGTTAGACGGTGAAACAGTGTTTTGTGGGTCAGTTCCAGTATTCGTCACCCAACCTGTAGATGTTCGTGCCCTAAAGGGACACAGTGCAACCTTCCACTGTGAAGCATCAGGAGTACCAAATCCTGTTTATCAATGGTTCAAAGGAATAGATGACAGTTTGATTATCTCCACATCCACAGTTTTAATTGTGGAAAATGTTGCCAACGACGACGAGGGAACTTACACCTGTCGTGCATCAAACCATATAGGAATTGTTGAAGCATCTGTTGAATTATTTGTGGAATATGAACCTACAGTGACATCAGATTTCGAGAACAGATTTGATCTCATCCTTGGAGAGTCTCTTCAGTTGATCTGCTCTGCAGAAGCAAGCCCAGAAGCAACATTTGTGTGGCATTCATCAGCAACTGTCACACCGTTGATCGTTGGGGCAGAATTGAATATTTCCATTGCTAGTGTTGCCATGTCTGGCCTTTATAAATGCGAGGCTCTAAATAAGCACGGAGTCGATATATCTACAGAGATCTCAATTCAAGTATATGAAGGCAATGTTGCATGTCCCAGTGTTTCTCTGACAGCTGGATTTGGCCTGATTCTGTATGGAAATCAAACATTGTTCTCTGATATCCCGGGTGATCTTGATACACGTTTCACAGATTCCGTCAATAGTATCTTTTCTACCAAGGCGACTTCTACAGTTATCATAGAGTTAACTGTCGACAGGGCATCTAACAGATTGAACATGGTCTTGAAACATCAGTGCACTGATCCGTTTGAACTAGATGGCGATATGGCACCCGATCAATTTCAAGAGCGGGCGGATGGACTACAAGCGGGAATTGATGTTCTGATATCAGTGGCTGAGAACCATGACTCTGAGAATACTGCTCTGTTTCAACAAGCGGGTAATGCATATCTTCTTAACTCGGCTACGTTTGATGTTGATACCACAGAGGCAACATGCCCACCTGGCACACATCTGTCCACAAGCAGGGATAAACTATGTCTATCTAACACACCGGATATAACAGTCAGTGCACCATTACATCTGACGTTAACTAACTTGGACCTTAGCTGGGATCCACCGCTACAAGGGAGTGCCTTTGTTCAAGATTACGAGATAACAGCCTCCGACACATCCCCTGGTGGTTCCTCAATTACATTGACAACAAGTAAAATTGCAGCTTCCTTAATGCAAATGCGGCTTTCCAGTGAAATGATAATAAAAGTCCGAGCTCGCACTGAAACAAGCTTTGGACCATGGGCTTCCATCACAGCAGCAACTACAGGTCCAATCCTGCAATACTGTATCGATGGCCAAGATGACGGTGATGGATGTCAGGAGTGCGTACCAGATGAGTTCATCATACATCCCACAGACTGTAGTAGCTACTATCAATGTCTCCCTAATCGAAGGGTTCTTCTAAGGAGGTGCTTTCCTGCAATCCTGCACTTCAATGTGGCTAAAGAACGATGTGATTGGCCATGGATGGTTATGTGTCTGTTTAATTAATGGCAAATACAGTTTAATATAAAAGATCGCACTGATATTTACAGTACTTTGGTCAGATGGAGATGTAAATAGTTTCAATTAAAACCCGAATACAGCTAAGTTGCTAAAAATGCTGAAACGAATTTGAGATCGACCTGTAACGTTATTGTGGACAGAATATTTCTGATATATGTTAACCCTTTCATGGCTAAGCTGGCCAAAACTGGTTCCTGCTGTCATCGTGAGGAATATCTATTTTGCAGACGATGAGAAAACCATTTTTGAAAATTACCACTATGATGACTGGCTCGGTAAATTGCCTACTCTTGGTCTCCAAATGAACATTCCTTTTCGAGAACATTGAAATTGTCTTGAAGATATTTGATGGTTAAAGGAGAGTTAAAGGGTTAAATGATGTTTCGTCGTTTCCAATAAATTCAAAATGTAAGTCGAGCGAGCCAGTCAGATGTGAGCATTTATTCCATGGAAGATAAGTAAATTATTAATCAGCCATGTTAAATACAGAGCATCACAACTAGTAGTTGCTGCCATGCGCGGTGTTAATACGTTAGACCTGCTAAGACCTATCGGCATACAGCCACAGTGTTCTTAAACAATCAACGTCATATTATACACATGATGGATTTATCGTACAGTATTGTTATATACAAATGTTACTCGTACCATAGGTACAAATATGCGTAT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01607	CBM_14	Chitin binding Peritrophin-A domain	Domain	Interproscan
PF07679	I-set	Immunoglobulin I-set domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002557	Domain	Chitin binding domain	Interproscan
IPR003598	Domain	Immunoglobulin subtype 2	Interproscan
IPR003599	Domain	Immunoglobulin subtype	Interproscan
IPR003961	Domain	Fibronectin type III	Interproscan
IPR007110	Domain	Immunoglobulin-like domain	Interproscan
IPR013098	Domain	Immunoglobulin I-set	Interproscan
IPR013783	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like fold	Interproscan
IPR036116	Homologous_superfamily	Fibronectin type III superfamily	Interproscan
IPR036179	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like domain superfamily	Interproscan
IPR036508	Homologous_superfamily	Chitin binding domain superfamily	Interproscan
IPR051170	Family	Neural and epithelial cell adhesion domain-containing protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12231	CTX-RELATED TYPE I TRANSMEMBRANE PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005576	Cellular Component	extracellular region	Interproscan
GO:0008061	Molecular Function	chitin binding	Interproscan

KEGG pathway

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