Gene detail

Detailed information of WZF116510 in Chaetoderma shenloong Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
WZF116510	U1 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 70 KD	chr12	149592630	149618783	-

Gene Structure

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CDS

Transcript

WZF116510.1

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00076	RRM_1	RNA recognition motif	Domain	Interproscan
PF00098	zf-CCHC	Zinc knuckle	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000504	Domain	RNA recognition motif domain	Interproscan
IPR001878	Domain	Zinc finger, CCHC-type	Interproscan
IPR012677	Homologous_superfamily	Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily	Interproscan
IPR035979	Homologous_superfamily	RNA-binding domain superfamily	Interproscan
IPR051183	Family	U1 snRNP 70 kDa and U11/U12 snRNP 35 kDa	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13952	U1 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 70 KD	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000398	Biological Process	mRNA splicing, via spliceosome	Interproscan
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0003729	Molecular Function	mRNA binding	Interproscan
GO:0008270	Molecular Function	zinc ion binding	Interproscan
GO:0017069	Molecular Function	snRNA binding	Interproscan
GO:0071011	Cellular Component	precatalytic spliceosome	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-