Gene detail

Detailed information of WZF004010 in Chaetoderma shenloong Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
WZF004010	RIBOSOMAL PROTEIN L2	chr13	140511823	140517593	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

WZF004010.1

GGAATAGCTAAAACTGGATTACTCCATTAACATTTGCTCAACTCTTTCAGAAAAATTTTATCAGACTTTTATTATAAATCTTATATCCAAGTAAAATAATTGTCCTATTGTTTTTCAATTACTCATGTATTTAACAGTCGCACAATATTCTAAATACCAGACAGAATAGGATGGTACAATTTCTAACCTGTTAAACCAATCTTTTTAGTCATCAAGAAAATCAAAAAAATTGCGCAGTCGATGTCCATTTACAGGCAAAAAGAAAACTATTTTTAAGAATTTATCAGTGGAATGACTGAGTTACTAAACCAGCTATTCCAATGGTAAATTTCCAAAAATATTCTGCCTTGTGAATGCACATTTTCCCAAATCTCTGCAAGCGTCCTCCCTGAACGATTTTGGATGTATCGATGCTCTTAGAAAGCCTCTCATGTATTTCTGGAAGCAAATATGTTGGCCTACCTTCAGCTGGCTATGAAGCTATCTGATTCTTGTTGATCCATTTTCTCTTGTGTTTTAAAAAGTACACCACAAATCATAAGGGGGTTGGGATGGGCATTTGCGCCCCTGCAAGCTACGACCCTGATTAAAGTGTCAACGCATTTATGCATAGAGATACATAATGTTAAAGATAAAATATTCTTATTCAATATCATGTCTATTTCCAGTTCGTGCCCAGGAGGGCGATGCCCATCCAGCTGGTGCTCTCCCTGTCGGAACACTGGTACACAATGTTGAGCTATTTCCAGGGGAGGGTGGTAAGTTTGTCCGCGCAGCTGGAACTACCGCTCAGATCCTGAGGAAAGTTGGCGATAGAGTGATACTAAAGATTCCTTCAAAGCGTGAAATCAATATTGCGCAAGAGTGTATGGTTACTGTCGGACGCGTATCAAACATTGATCATAACAAGCAGCATATCGGCTCTCCAAACAGAATGCGCTGGTTGGGAATTCGTCCACGTAGCGGCCTTTGGCATCGGAAGACTGGTTATAATGGGAGAAAGATTCGGCCGATTCCACCGATGAGGACATTTACTAAACCTCCGCCCCCCATACCTGCTGTGTATAGAGATACACAGTGATTGTCAATAGATGGATTCAATTCTAGCTGTGCCACACCCAGTTGTAGCTATGCCACGCCCTCATTTTACACATGTTGGAGACAATTTGAAACTTTGTAACCTGAATTGCCAGAATCTAGATTTCAAGGTAACTATACAGGTAAGCTGTTCGATATTTTGAAACTAATTTGACTGGGAACTATTGCTGCCACAGGCAGCAATAGTTTCCAGTCAGATTAGTTTCCAATTATTCAACATAATGTGTATTAAATTATAAATTCATCAGGCTTGGATATTCATGCTAGGGCTATAGGCCATTATGATGTAAGCTAACTAGTGGCGTACGTGATTATGACGTCAGATACTTGAGTGACAAATTTGATCTTTCCATTGTGAGCCTCATTCTGATAACTTGTATCTGTCTTAACCATTTGTCGGTGCGTATTGCAGCAGCAGCTTAATTAGTCTCAAAATAATCAAGTAGCAGCTTTCCTGACACTGGCATTTCAATAGGTACGGGTTAACCCTTTAGCACTCAAGCTGAAAGTTTATGAAAGTTTATAATACAATTATTACTGGAAAATGTGTGGCGCTATTGTTTAACCCGTACAGCACTGATATATTTCACCTTCATTCAATTCAAAATGATAATTGAAACCTTTTAACTCATTGCCCCAAAATTTATTCAAGAAAATGTCCATTTGCAGACCAAGAGAAGACTATTTTTGAAAATTGATCACTGGAATGACTGGCTCAGTTATCGAGCTAGCCATGCCAGTGATAAATTTTCAAAATTAATCTTTTCGTTGTCTGCAAATTGACAGTTCCAAAGATCACTGGAGAAGGCATTTTTGGCCTGTGTGAGGGTTAAACGGTTATGTGCAGAGAAAGTGTCAAATTCAGCGTCTAATATGTCTGTTGTTTACTTTATGAGACCTACGTAAGTCACAAACCCTACCTTAATGTTACGGCCACGGGTGTTCATTCTGCAAACAATGTTGTTGTAAACTGTTTCCATTTAACTCTTTAATGGCTAGATTTTGTCCGGAAAATCAAAATATTGACTTAATGAATGTCAATTTGCAGGCCAAGAGAAGACTATTTTTAAACATTTACCCCACGAATAAAGGGCTTGATTATTGAACCTAAGAATTCAAATGATACATTAAACAAAATAGTCTTATCTTGGCCTGCAAATATACTTTTTGCGTGATGACTACAGAAGCCATTTTGGTTGGTTTGAGGCTCATGCACTAGACATCGTTCACAGTGTACAGAATATATCCACATATGATTCAGTTGTAAATTGGCTATTACGGTAAAATATCCCGTAAAGAAATTTTAATAGCTAGCTATTACTATTAATCCTCATTGTTATTAACATATTATTTTTGGTGAAAGAATATTAATTACAAGATTTCCAATGTTTCATAGATGGTGGTACAGTTTTAGGCACAAATTTTAGTCAACTGGTTCTGAAGAAAATGAGCAGAATCCTATTGATATCCTGGAGGAGATATCATCTGAATACCATAGATATATAGAATATAGAATGTCACTGAAACCTAGAATAGAATAGTTATTTCCAATTATGGCCTCATCAAAGGGCAACCTGAGTATCAACAGTACATGTTACTGTAAAAGAAAGCATTTAATTGATAGAAGAACAGTAATAAAGATAATGAAATATTAACTCTTACCACTCTGATGTCAATATTCTATCTTTTACTGTGTCAATTGCAAAGAAACTGGTGTTCCTTTTTCAACAATTTTGGTGGACGATGTTGCTGTCTACGACAGCACCATCTCCCACCAAATTTGTTGAAAAATGAACACCGGTTCATCCTTTAGTTTAATTTGAAAAATTAATATTTTAACATCAGAGTGCTAAGGGTTAAACACTTAGGTATAACCAGCCACTACATCCACTTTCCACAGACATGACAGATGCATAGATAGCAAAACATTTGGTTGACAGCGGTGCTCACTCCGAATGTTGGAAAAATCATAAACAGAATGAATTTCAACTGATATCGAATTCACAAGTTATACAAGTCTTCGTGACATTACAGTATATTAGCATTGACAGGGAATTGAACCCACAACTGGTGAATGCACCGAGCATCATAGCCAACGAACGCTTCCACCCGAACAATGCCACAAGAAGAATCTTGCTTTGCTGGGGAGGCTTTCACCAATCAAAAGATGTCACACTTTACCGGACGTCACGTGTTATCTGACGTCACCATCAAAGTATGTCGATCTGACAAGTGGGTAGAATTCACTTTTCCAGCTATGCCTCGTCCATCCCTAGTTAAGCTCCACCCATGCTTCGCCCGTGTTGTGATCGATCGATCCATGAACTATCAATTTCCAGAAAACTATCCATGTAAGCTGTTGAATATTTTGAAACTATTAGTGTCAAAATATTCAACAGCATATTTATTAGTCCCTACCGGTAAAACCTAAGACTAGGTTTGCACTCCGTCTGTCCCTCTGTCGCAGTTGGTTTTCCTCACCTTTTTTTGCAGTCCTTCAAGGTATGCAACTGAGAATTGGTTTATTGCTTTGTTATGACAAGTTACAGACCTAGTTCGAGTTTCAGGCGTATACACCAGTTTTTGATGGTGTTATGCCCCGTTTCGACTTAGAAAATATGAAAAATATCAGCTTTCCCCACTTTTTTTTTTGCACTCCTTCAAGATATTTATGCCAAAATTGGTACATCGCTTTAGTATAAGGAGTTATAGAGCAACTTCTAGTTTCAGACATTTTCGTCAATTTCCAATGGAGTTATGTCCCCTGTTGACTTATAAAATTCGAAAAATATTAGTTTTCCGTACTTTTTGTCGCAGATCTTTCAAGATCTTCAACTGAGAATTGGTACTTTGCTTTGTTATGAGAAATTACAGATCAAGTTCGAGTTTCAGGAGTTTGCATCAATTTTGCGTGGAGTTGCGTCCCCTTTCGACATGAAATACAAAAATTATCCGTTTACAATTTTTCACGCTCATTCAAGGGATTCAACTGAGAATTGGTAGGTTTCTTTATTATAGGGAGTTACAGAGCAAGTTCAAGTTTCAGACATTTTCATCAATTTTCCATGGCCCCCTTTCAACTTATGAAATACAATAAATATTAGTTTTCCACACTATTTTTCTCAGTTTTTTCAAGATATACAACTGAGAATTGGTACATTGCTTTGTTATGAGAAATTACAGAGCAAGTTCGAGTTTCAGGATTTTGCGTCATTTTTAATGGAGGTACGTCCCCTTTCAACTTACGAATTACGAAAACTATCCGTTTTCTGCACTTTTTTCGCACTCATTCAAGGGATTCAATGAGAATTGGTAGGTTGCTTTATTATAGGGCGTTATAGAGCAGCTTTCAGTTTCAGATGTTTTCGTCAATTTTCCCCCATTTCGACTTATGAAATACAAAAAATATTAGTTTTCCACAATTTTTTTCGCAGCCCTTCAAGATATTCAACTGAGAATTGGTACATTGCTTTGTTGTGAGAAATTACAGAGCAAGTTCGAGTTTCAGACATTTGCGTCAATTTTTGATATGTCCCCTTTCGACTTATGAAATACAAACATTATATCAACTCTCAAGACGTTTTCGTTGTCCTTCACCATATATAACTGAAACTTGGTTTACTGCTTTGTTGTGAGAAGTTACAGAGCAAGTTCGAGTTTCAGCTGTTTCTGTTAATTTTTAATGGAGTTTTTGACTCATTCTCTAAAGAGTTACAGAATGCTTGTTAAATAGTAAAGACGTACAATTCATACAACCTGACGGACTATTAAACATTTAAGATGGACGAAATTTAATCATTCATGACGTAATGATTATGATGTCATCCTACACCTCATTTGGTTGATTATGATGTCATATGATTGACTGAGGAAATGGATTCATGAATTGTATATCAGTTTTC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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03947	Ribosomal_L2_C	Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002171	Family	Large ribosomal subunit protein uL2	Interproscan
IPR008991	Homologous_superfamily	Translation protein SH3-like domain superfamily	Interproscan
IPR014722	Homologous_superfamily	Large ribosomal subunit protein uL2, domain 2	Interproscan
IPR022669	Domain	Large ribosomal subunit protein uL2, C-terminal	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13691	RIBOSOMAL PROTEIN L2	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0003735	Molecular Function	structural constituent of ribosome	Interproscan
GO:0005762	Cellular Component	mitochondrial large ribosomal subunit	Interproscan
GO:0005840	Cellular Component	ribosome	Interproscan
GO:0006412	Biological Process	translation	Interproscan
GO:0032543	Biological Process	mitochondrial translation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
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