Gene detail

Detailed information of RPACG26651.1 in Riftia pachyptila Gene info

Gene ID	Annotation	Contig	Start	End	Strand
RPACG26651.1	ACYL CARRIER PROTEIN	tig00117941	156482	159001	-

Gene Structure

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CDS

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RPACG26651.1

TGTAACACACATGCTTATTAACATTGGTTACCAACAGTGCACGTCTGCTACACACCTTAAATATGTCACTGTAACACACATGCTTATTAACATTGGTTACCAACACTGCATATCTGCTACATACCTTAACCACATGCTTATTAACATTGGTTACCAACAGTGCACGTCTGCTACATACCTTAAATACGTCATTGTAACACACATGCTTATTAACATTGGTTACCAACAGTGCACGTCTGCTACATACCTTAAAGACATCATTGTAACACACATGCTTATTAACATTGGTTACCAACAGTGCACGTCTACTACATACCTTAAAAACATCATTGTAACACACATGCTTATTAACATTGGTTACCAACAGTGCACGTCTGCTTCATACCTTAAAGACATAGTTGTAACACACATGCTTATTAACATTGGTTATAAACATTGCACATCTGCTACATACCTTAAATACATCATTGTAACACACATGCTTATTAACATTGGTTACCAACAATGCACGTCTGCTACATACCTTAAAGACATCATTGTAACACACATGCTTATTAACATTGGTTACCAACAGTGCACGTCTGCTACATACCTTAAAAACATAATTGTAACACACATGCTTATTAACATTGGTTACCAACAGTGCACGTCTGCTACACACCTTAAAGACATCATTGTAACACACATGCTTACTAACATGGGTTATAAACACTGCACGTCTGCTACATACCTTAGCCACATCATTGAAACACACATGCTTATTAACAATACCATTATGTTTTTGGCGTGACTAAATACGTCTGATACATCGATATTGAAAAAAATCCTTAGGTTTGTACAAATTACCGAAGTAACCTCAATCATAGCCCGCTTCCGACGGCACCGGCAAGGCGGCATTCGGAGTTGTCGAGCTGATATCCTCCGCCATTGAAATTCGGCGGTTCTCTTGAAGAAGAGTCTCATGGAGAAAGACTCAAAGCGATCGAAAGCATTGCTGAAGTAGGGCAGCTCCAACTTCGACATGGCGGTGCTGTTGGAGAATTCGCACTTGCCAGACATACAGCCGTTGCTCGTGGGTTCGACATCTCGCTGAACAGCCACAAGCCCTCTATGACCGAAATGGGGCCTTCGTCGTCAAACGTCACACACGTGATACTCCAGCTCGTGGACGTCTGCAAAGAAAACATATCCGTGATTTACATTTACCTAAACGTAATTTCGATCGATTTATATGTTGTTTCTTACTAGAAGTCAAATACTATGGACATTATTCGTTAATATATTCTATAAACTGGTTGCAAGTGATATACACGAAGAACACACTAATTGTAATGTTAGGTCATTTACCATTCATAAATACACGGCCGACTATACTTATCGGTTGAGCCAATAAGCTATATTTTAACTTCTCGTGGGTTATATATGATCGGAATATGCTAATTATTTAGATGTCTTCTCTATGTCTCGTATCACATCGCCAAATATGGCGTGGTTCTAGGTGGTGGCCATCTTATTTTTAAAAATATCTGCCATTTCAGAATATGTCTTGCCACATCTTTATTTGTAAATAACTTATTCTCTTATTATGACATTAGTTTTTGTTGGTTGCATCAACATGTTTCAAATGATTCAGTGTTAGCCTCAGCAATTATACACGTCAGTCATTTAGTTTCTCTCTCTCAAAAATGCCCTCCATATGTTAAAGTAAAAAAATTTGATTGATTTCGCAAGTATCGTTGTTCGTAAAATGCCTTGGTGTCAATCTACATAACATTTATGGCACCATGAATATGTGCTAGCCTCGCTGCAAATATTATTACTACAATGTATTTTCAGTGTTGGAGATACCAGAGAAAAGTTGTAGTTTATGGCAGCTGACATATTGACTGATTCAAATCTACGCTGTAGCAAAATGTTATATCGTTATACACAACATAATGCAGTCGTTACATTTTTACAGCGTTAAAATACATTTGCAACTCGAGCAATACACTTAGTTTGGTGACTGCCGAATTGCTTAAAGGCAATGATTTCTGTCATGCACGCACACACGCACGCACACAGGCATGCGCGCACGCACGTACGCATTCCTTTTTTAGATGTATTCCACGGAATTATATTTGAACAAATTATTGAGTACCAAAGGATATTTTCCTACTCTACAGCTGTGCGTAGCATTCTAATTTTGAAAGTAGATTTTAATGTTCCATTTGAGGGATGGAAACTATAGATTGCAAACATTGTTTCTATGTAAACTGACTTTGCAAACACAATTTGGCGAACATTATGTTTTCAATAATTTATTATTGTAATACAAATTATATATTATTAATTGATTAATTATATATAACTGAATAATTGGTATGAATTTGAATGAATTGGCATGAATAACGACACTGTAATACTCCTTCCCCACCATGTTGACAGACCATCTATTCTTTGGCGTTTTCTGGATTTCCCTTCAATCTTTGTTGTTGTTATTATATAATTATGTTCAAACTTTCGCTTCCTCTATATGTC

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00550	PP-binding	Phosphopantetheine attachment site	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003231	Family	Acyl carrier protein	Interproscan
IPR006162	PTM	Phosphopantetheine attachment site	Interproscan
IPR009081	Domain	Phosphopantetheine binding ACP domain	Interproscan
IPR036736	Homologous_superfamily	ACP-like superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR20863	ACYL CARRIER PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000035	Molecular Function	acyl binding	Interproscan
GO:0000036	Molecular Function	acyl carrier activity	Interproscan
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0005747	Cellular Component	obsolete mitochondrial respiratory chain complex I	Interproscan
GO:0006633	Biological Process	fatty acid biosynthetic process	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for RPACG26651.1 global RNA-seq network