Gene detail

Detailed information of Paelopatides57941 in Paelopatides sp. Yap Gene info

Gene ID	Annotation	Contig	Start	End	Strand
Paelopatides57941	SPARC OSTEONECTIN	utg73832	212439	253474	-

Gene Structure

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CDS

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Paelopatides57941

ATGAGATCAAGTGATGTTCACTCTCTCCTAGAAGATCAAGCAATAGCCATCCAGTGGCCGCCAGATGCAGATATTTGCAGGGATGTGATTTGCAAAAAGCCAAAGGGTTCTTGGTGCACTCCGAAGCAGAAAAAAGGAGGATTGAAAGCTGTCTGTGAATGTCCAGAGTACTGCCCGGACGTCTACCAGCCGGTCTGCAGTGTGTATGGCAGACAGTACGACAACCTCTGTAAGCTCCACCTGCACACATGCAAGAAGGGCAAGAACATTCCCATGGCTTACAATGGAATATGCATCGCTTCACAGAAGAAATGTAAGGGGGAAGAACTTCAACAGTTTCCAATCCGGCTCCTCGACTGGTTTCTCCACCTTCATGAAATAGAGGAGAATGGCAGACTTGACCCTAACACCAACATTAAACAAAAGACTCCTGAGGAGCGTTTCATGTATGCCCAAATACAGTGCTCCATAGGCCCTGCACCCTACTCCAGGTACAGTGATTCACAGGCCCCTGGACCTCATTTTAGTTACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGGTATACAGTGCTTCACATGCCCTTGGACCCGATGCTATAGAGTGGAAGTTCAACCTACTGGATGATAACGGTGACGGTAAGCTGGATAAACGAGATTTGCTCAACTTCCGGTACTCCTTGATGCCCCTGGAACATTGTGCCGATCAATTCTTTAAGTCATGTGCCACCAGAAAAACGAAGAAGATCAGTCTAGAAGGATGGGTACAATGTCTGAAGGTCTATGATACTCTCGAGTATCCCCATGACGAGGAATGGATTGAGGAGCAGGATGAAGATATTGATGATGATGATATTGAAGACTTCTTTGGAGATTTCGACGAAGAAGATTAAGAGAAGGGTGAATTGAAAGATGAAGGCCGACATTAATATGCTGCAAAATATATTTTGTATTTTCTTACGGTGAAAGGATCCATAAGTAGCTTTTTCTACTTCCCTTGTTGGTTAATTTGACACAACTTAGGCTTTGTTTTATTAAGTTTTACAGGTTTTATATTTTTTTTATAACAATTTCTTGAATTTTGTGTGCTAAACAGCCTTGGGTATTAAAAGAACACTACCTTCATTGTATCATTTATATTGAAATATTAATTTTGTGTTAAATTGTTTTTAATGCTTTTAAGGTTTAAATTATGAAAAGAATGTTACTCTTGCATGAAACATGGAATTGGACCAATTTCTTCTCCCTTGGATTAAAAAAATATATAGATTATTCTCCCATTTTGGAATTAATTGAGAATAATGCTGCAACTGTTTGAGATTAGGATTGTATAAATTTGGAAAGGACATGAAAAGAGAACAGAATAATGGAGGAGTGGTAAATACTGCTATCTATATATACTGCCATCTATTTATACTATGCGGTCATATATTTGAAGAGGATTCAAAGGAATACCAAAATCTCAAATTAAAAAATATTTATAGAGCATGTAAATAGAACCTCATTGGTCTCACTGCTCATCATTATAGAGTGATTTGTTGCTGCTGAGAATTAAAATACTAAATTGTATTTATTTTATCCGTAAGAGTTTATTGTGTAATAATCTGTCATGGTGATGTCATATATGGATAACACCAAGAATTGCTTTTGTTGTTTACAATTGAAATAATAATATAACTGTATGAAGACATGTTATAGTATGCTGATCAGGTATGTCACTCCATCCAAATTTTATATGTTTTATATGGTGATTAAAACCAGGAAGGATTCTAATTAGGTAAATAAGTTTCAAATCATGAAGGATTTTAATCACATAATTGGTGATTAAAATTGTGAAGGATTATAATTAGTTAGGTAAATGGTGAATAAAATCATGAAGGTGTTCTAATTACATAAATGGTGATTAAATTCATGAATGATTCTAATTGTCAATGTTGAATTGAAACCATGAATGGATTTGAATTATGTAAATGGTGATTAAAATCATGAATGATTCTAATTAGGTAAACTGATTGAAACCATGAATGGGTTCTAATTACACAAATGGGGATTAAAATCATAAAGGATTCTAATTACATTAACAGTGATTAAAATCATGAATGATTCTAATTACTTAAAAGGTGATTAAAATCATGAATGATTCTAATTACATTAACAGTGATTAAAATCATGAATGATTCTAATTACATTAACAGTGATTAAAATCATGAATGATTCTAATTACATAAACGGTGATTAAAATCATGAATGATTCTAATTATATAAATGGCGATTCAAGAACATATGACATCACAGATTATTATGAAATTTAGTCTCTAAATAAATTTCAATGTTTTATTTATATCTCAGCAACAGTAGAAGCCATGATTTGGACCAATGAGTTTCACTATGATCTATATAATATAGTTGATCAACATTCATACTTGTTTAGTGGCACAATGCAAGTTACTATAAGAGTGGATTTATTTTATTGGAAGACTACATCAATATGTTTTGATTACAGGTGTCTATATGATTACAATTTATCCTGGAAAATAAAACAAAATAAACTGTTGAAGATAACTTTTCAAGCTATAGCCTGTCAAGATAGAGAAATGTTTAGGAAAAACATTGTGCTTATTAAGAACTGTGAGAAACTTGGACAGTGTTGTTTTCAAGTTTTTGAAAACGAAAGTTAGAAATATCAGTGGAGTATTTGACATGGATTATAACATTTGTTGTCATTAGGTTAAACTAATATGCTTGGAAAGAAACATAATTTGTACCCAAAGAATGGCCTTCCATGGAAGCTAGTAATCCAAACAACAGCTTACATGTAAAGATAATGTTATATCTGCAAATGCCACATTAATAATCAGACACAATGCAAACTCCAAACGACAGCTTACATGTAAAGATAATGTTATATCTGCAATGCCACATTAATAATCAGACACAATGCAAACATTTTTAATAAAATTTCTGAAATAACTTTTTTCCAAATATTGTATAGACTTAAAAGAGATAGTTGATATAAATGAGAGACCAGTATAATTGAATTTATTAGTTGGCAGTGTAGAATTGATTACGGACTGCTCGATTGATGGAATGCTTGATTGATCGATTGGTTGATTTATTGATTGATTGACAATTAATTAACTGTTTAATTGATTAATTAATTGATTGACAGTTTAATTGAGTGTTTGATTGATTGACTGCTTGTTTGGCTGACAGTTTGATTGATTGACCGTTTAAAAATTAATTGACTGTTTGATTTACTGCTTGAATGACCGTTTAATTAATTGACAGTTCGATTGATTGATTGACTGTTCGTTCGTTCAATTAGCTGTTTGATTGACAAACTGCTTGATTAACTTTTGATTGATTGATTCATTGACCGTTGATTTATTGGCTGACTGTTTGATCGTTTGGCTTGACAGTTTGATAACCGTTTAATGAATTGGCTGTTGATTGACTGTTTTATTGACTGTGATTGGTTGGCTGTTTGATTCACAGACTGACTGTTTATTGACAGTTGATTGAACTGTTCTGCAATTAAAGAAAGTCTTGTTCCTTGATGACAACCAATAAAATGAGCTATCAGCATCCTTTGCAATCCCT

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07648	Kazal_2	Kazal-type serine protease inhibitor domain	Domain	Interproscan
PF10591	SPARC_Ca_bdg	Secreted protein acidic and rich in cysteine Ca binding region	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002048	Domain	EF-hand domain	Interproscan
IPR002350	Domain	Kazal domain	Interproscan
IPR011049	Homologous_superfamily	Serralysin-like metalloprotease, C-terminal	Interproscan
IPR011992	Homologous_superfamily	EF-hand domain pair	Interproscan
IPR018247	Binding_site	EF-Hand 1, calcium-binding site	Interproscan
IPR019577	Domain	SPARC/Testican, calcium-binding domain	Interproscan
IPR036058	Homologous_superfamily	Kazal domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR13866	SPARC OSTEONECTIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005509	Molecular Function	calcium ion binding	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005518	Molecular Function	collagen binding	Interproscan
GO:0005615	Cellular Component	extracellular space	Interproscan
GO:0048856	Biological Process	anatomical structure development	Interproscan
GO:0050840	Molecular Function	extracellular matrix binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
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