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Detailed information of PMEG.utg000367l.2 in Placopecten magellanicus Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PMEG.utg000367l.2	HELICASE WITH DEATH DOMAIN-RELATED	chrom19	912373	920841	+

Gene Structure

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CDS

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PMEG.utg000367l.2

CAACAGAACTTGCGGAAGCTGGACCCGACAGCAACGGACACTTTTCCCTTCGTACTTACCAGACAGAAATAGCACAAGACGGTCTAATGGGAGATAACTCAATCATCTGGGCGGGAACTGGATCAGGGAAGACCAGAGTGGCCGTATACATTATGAAGAACCACCTGGACAAAAACCCGACAGGTACAGTCTCGCTGAGGTCTCTAACATGTGTTAGACTATCATGAGTAAATAATAGAAACCCACTTTCGATCAATCTTACGCACACTTCGAATGTGATGCGATTAGACATTAGTGTACCCATTAGTAAAGAAAACATCCGGAAATCAAGGGGCCCAACACGTCCTTTTTGACACACGTCACGTGATATGAAGGTCATTCTCAAAACCTAGACAGCTATCTTGTTTGTTATCTCCATATCAGAGGAAATATGATAGGTATCATCCTCACAATTCGTGTCAGTTGCCCAGTCATTAGATGTGCAAGTTTAATTTTGAGACTGATTAGGAAAATGAGATGCCGCATCTTGAATTGTGACAGTTTTTAGCCTACCATCATCAGATGGTGGGCTATTCAAATCCCCCTACGTCCGTGGTCCGTCGTCCGTCGTCCGTCCTTAAATAATTCTTGTTACCGTTCGTTCTCCAAAATACTGGAGGGATCTTTCTCAAACTTCAGATGTAGGTTGTCCTTGGTCGCTAGTTGTGCACTAACATTTTGAAACTGGTGAGTAAAAGCAAGATGGCCACCAGTTGGCCATCTTAGATTTTGACTGTTAATGTTTGTTACCGCTGTTTATCACAAAGTACTCGAGGAATCTTTCTCGAATTGCATATGTAAGTTGCCCTTGGTCCCTAGTTGTGCCTAGTTGTGCACTAACATTTTGAAACTGGTGAGTAAAAGCATGATGGCCGCCCATCGGCCATCTTAGATTTTGACTGTTAATGTTTGTTACCGCTATTTCTCACAAAGTACTGGAGAGATCTTTCTCGAATTGCATATGTAGGTTGTTCTTGGTCCCTAGTTGTGCACTAACATTTTGAAACTGGTCAGAAAAATACAATATGGCCGCCAGTCGGCCATCTTAGATTTTGACTGTTAAAGTGTGTTACCGCTATTTCTCACATGATCCTAAGAGGCGACTAAACTTGGGAATCTTATCTTTTCTCTTCTTAACTCTTTCTCTTTCCTTATGTCTCCATTGACACAGCCTCACTTTTGGCCTTTTGAGTTGAGCGCTCGCCCCTGTGAGGAAGGCTCTGTACCCTGTCCCCAGGCCGTGACATACCAAAGTCTTTAAAAATGGTAGTCGCTAATCCCTGCTTAGCGTTCAGCATATAAGGGTGTGTGACGACTATACTGGTTAGCCCGTTGTCAGTATAATGTGACCGGGTGTTGTATGGTGCTGGGTGCCGTCGGCATTATACTTCTAGTGAGGTAGCACTATAAAGTGGCCATCAGTGCACGCTATCGCAAAGAGGAATTACACGAAACTACCGCAGTCTCCCAAAGACACATGCATGCAACACACACACCCACATCGCATACATGGGAGGCCGTCCTTAAATGACCTCAGCTGTTAATAGGACGTAAAACCCCAACCAAACCAAACCAAACCAAACCCTAGTTGTGCACTAACATTTCGAATCTGGTCTGAAAAGTACAATATGGCCGCCATTCGGCCATCTTAGATTTTTGCTATTAAAGTTTGTTACCGTTATTTCTCACTAAGTACTGGAGGGATCTTTCTCAAATTTCGTATATAGGGTGCCCTTTGTCCCTAGTTGTGCACTAACATTTTGAAACTGGTCAGAAAAACAAGATGGCCGACAGTCGGCCATCTTAGATTTTGACTGTTTAAGTTTGTTACCGCTATTGCTCATAAAATACCGGGGAGATCTTTCTCAAATTTCATATGTAAGTTGCCCTTGGTCCTTAGTGGTGCACTAACATTTTGAAACTGGTCAGGAAAAAACAAAATGGCCGCCAGTCACCCATCTTAGATATTGACTTTTAAAGTTTGTTAACGCTATTTCTCACAAAGTACTGTTGGGATCTTTCTCAAATTGCATATGTAGGTTATCCTAGGTCCATATTTCAATTCCTTGAAAGAGAGATGACCATAAGGGGTCATGGGACCTCTTGTTACACATTGCTGTTCTAGTCAATAGGTCCAACGACAACTTTTTTATTTGATTTAAGTAACCACATGATGGTTTTACTGTTGAAATGACATAAACAGTTAGAAAAGAAGAGAAAAGAAGCGAAAGAAGGGAACAGATCAATCTTACATAGAACTAACTAAAATCTTACAATGGTGGGCGCCAAGATCCCTCTTGTTTTAACTACTTCTCAGAAAGTGCTGCAGGAATCGTTGGGGTTGTTATCGCTATTCCTCTAGAAATACTGGAAAGATCTTTCGAGGCCCCTGCAGGTAGGGCGTTAAGAAGTGTACCTGCTGTCCCTATTGCAAGATCGTACAAGGTGACTAAATTTGGGATATTTTTCTTTTCTCTTCTTTCCTAATGTCTCCCCTGACAAGCCTCACGTTTGGCCTTGCAGTTCAGCGTTCGCGCCTGTGAGGAAGGCTATGGGTTCTGTCACCAAGCCGGACATACCAAAGTCTTTAAAAATGGTATTTGCTGCTCCCTGCTTAACGCTTAGCATTTGGGGAGTCTACAACGACTGGTTTACTCGGTGTCAGTATAATGTGAATGGGTGGGATATCATGCTGGTTGCCTCCGGCATGTTATTTCAGTGGGATAGCACTATAAAGTCGGTTTGGTTTGATTTCATAGGGTTAAACGTCCTATTAACAGGTCGGCGCTATCACAGGGAGACATACACGAACATCTTGCAGTATCCCGAAAACACACGCACTCAACACACACAATCACCTCGCATGCATATGAAGGCCGTCGTTAAATGGCCTTAGGTGTAAATAAGACGGTAAACCCTATCAAACCAAACCAAATCTTTCGCATATTTCATACATAGGTTCCTCTGTGTCGTCCTTAGGTGTGCTTGTGAAATTTTGATCGAAAGAATAAGATGGCCACCAGGTGGCCGTCCTGGATTTTTATCCCGTTCACTCGGATAAGATTGGATCTTCAAATGTAGGTTCCCCTTAATATTATTTCGGTAAATATAAAATGAACTATTTCAGCTGACAACTGATGCTTAAGAGTCTCGTTAAACATGGCACGCATGAAAAATGGTTTAATTCGTTGAAGTCAGACTACCTAAAGGACCCCTCAGACCTCTTGTTTACACTATCCTACTCAATAGATCAAACAGCAATAAGAAGTGTCGATCAAAGTTGCCCAAGTTGGTTCTCTTTTGACATGACTATCTATCCAACAGATAACCAGAACAATATATATCACACTTGCATAGAATTTATGGTGGGCGCCAAGATCCCACTGCAAGCTATCGTTTATTTATTGTAAACATGTCTGAACAGAAAAAAATCTGTTCATAAATTACTTCACAAAAAGATACTTTCATGTTTATAGGACTTTCCCAAAAGTGTTGTTATCCCCCTTGATCTGCTACAAGGTGGCTACATTAGGAAGTGTATTTGAAACAAATTGGCGCCATGTAATTATGATGTCATAAACGGGAAACGTCATCCGATTGTGACATAGCGCCAAATCGTCTCAAAATCACTTCCCGGAAGTCCATTTTGTATGCACTATTGTGGCAGATTAAGGGGGATAACAAGACTTTTGGGAAAGTCCTATACTATTCACATTACCGCCTTTCACGAAGAACATTTTCAGATTTCGAAACGATACCCTTGAAATATTCATTTCTATTTCAGGGAGGATTGCATTTTTCAGCACAACATTGACGCTTTTGGACCAGCAGTATGAAGTGATAAGGAGATTTTTACCTAAGTATAAGGTAGGCATATAATTAGTCCATTAGGCTGGCGGCCGTCAAAAGTTGGTCACCAGCAAGATGTTCATCATTATTGATAGCAATGGTTACATCATTAGAGTCTGATGATGACATCAAATTTTCTGAAAAAATACCTGGCACATAAAACGAATGCCAAATTAAAACCGGGCAGTTACTCTTTGCTTTGTAGACGTAAAAATTGCTATCCCAAAGCGTTTAGTTTCAAACATTGACTTGACAGGTAAGATTTGGTTAAACCTAAATTCTGTTTTACTTAAAATGTTAATACATTTTTGTACTTAAGGTGTTACAACCGATATTGTTTATATGTATGTTTGAGGGGAATTCATTACGTATTACATTACATATAAAACATGCATGCACACAATTAACAGTATTCCAAATGTTACTAACACATTTGTTATACATACATGTATAGGTAAAACCGTAATTCGAAACTCAATGGATATCGGGGAAATAGGAATAAAAGAACGATCTTTGAAAAAGTACAAAAGTACAAGGAAAATGAGACCCGGTGTTCCATAAGAGTAAACGTATTCTGCTTCATTGTCGACATCCACAAAGTAAATATGAGGTCAAATTCAAAATCAAAAAAGTGTCACGCTCTGAAAGTGCGAATCGAAGGAACCCCAATGTGAACTAATAAGCAGAATTTAAAATGTCGATATACAATTGTACATGGACATACAATATTTTCAATCATGATGGCGATCATAAAACATTGATCCATAGATATGGAAGTACCATCACCTCCAGACGTACCGCATGCACCCCCTCCCCCCTACAACATTGTTATAAAGACCTACATTTAATCATCTAATCAGTTAAACAAATTATACCGACAACTTGTTTAGTCATATTTTTAATGTATTTTCGACGAGAAACTGTTTAAAATGACACCATAATATATATATATATATATTGTCTGGTATCATGACATGATTCCTAGAAATAATTAACAATATCTTCAGTTTCTTTTTTGTAGACATCAACAGAAACAACATTTACAGAATATATAGGGAAATATCAATTTAATTACAATAGACAATACCTTCTAGGAAACAAAAGCCTGAGAT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00270	DEAD	DEAD/DEAH box helicase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011545	Domain	DEAD/DEAH box helicase domain	Interproscan
IPR014001	Domain	Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR051363	Family	RIG-I-like Receptor (RLR) Helicase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR14074	HELICASE WITH DEATH DOMAIN-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003725	Molecular Function	double-stranded RNA binding	Interproscan
GO:0003727	Molecular Function	single-stranded RNA binding	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0008270	Molecular Function	zinc ion binding	Interproscan
GO:0039528	Biological Process	cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway	Interproscan
GO:0140374	Biological Process	antiviral innate immune response	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
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