Gene detail

Detailed information of PE_Scaf8729_0.2 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf8729_0.2	FAST LEU-RICH DOMAIN-CONTAINING	Superscaffold6	6770521	6782261	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf8729_0.2

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Transcript

PE_Scaf8729_0.2

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF08368	FAST_2	FAST kinase-like protein, subdomain 2	Family	Interproscan
PF08373	RAP	RAP domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR013579	Domain	FAST kinase-like protein, subdomain 2	Interproscan
IPR013584	Domain	RAP domain	Interproscan
IPR050870	Family	FAST kinase domain-containing	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR21228	FAST LEU-RICH DOMAIN-CONTAINING	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000963	Biological Process	mitochondrial RNA processing	Interproscan
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0005759	Cellular Component	mitochondrial matrix	Interproscan
GO:0035770	Cellular Component	ribonucleoprotein granule	Interproscan
GO:0044528	Biological Process	regulation of mitochondrial mRNA stability	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf8729_0.2 global RNA-seq network