Gene detail

Detailed information of PE_Scaf864_1.2 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf864_1.2	FAS-ASSOCIATING DEATH DOMAIN-CONTAINING PROTEIN FADD	Superscaffold13	51657021	51665026	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

PE_Scaf864_1.2

GGAAGTTTTGTTTTCGATGAGCGGAAACGCGATGGAAATTTTTAGTTACGCGGAACATAACTCAAATCTAGACGAAGAGTTAACAACATTGTGAACTAGGTCGTCGGAATGAGTAAATACGGTAAGACTGACACACCAAAGCAGACTGCAAATGTGCTGGTGTTCGATGGTACGTAGTCACGTTGGCCACGATAATGTAATTCTGAGACGTATGTTTTTATAAAACTTATGTTACGTTAATCGTTATGATAGTATGATATATAATTTCATATGGTTATAAATGTGTCAGGTTTATTACTTATTACTACTTATGGTTATGTCTTATGATGGCGCTAAGCCTAATTCCTAGGTTAAGCCAGTGGTAATGGGTCTTAGCCTGAAAAAACAATTAACTTTATATCACTTACAGTAATACAGGTTAATGGGCTGATTTAGCCTAGGCCATTGCCATGGCATTGGCCTTTGTTGGTGCCCATATCCCTGGCTATTCCAGTGCTTGTCGAGTCTAGCCTTAAACTGTGTGACGGTCTTGGCATCTACCACATGTTGTGGGAGCCTGTTCCATTGATCCACGGCTCTAACTGAGAAGTAATTCTTTCTGGCCAGCAGTCTTGTTCTTTGCTTGAATAGCTTTCTCGTGTGTCCTCGTGTTGCTGTACTGTCCCTCTCCTGGAAAAATTGACGAGCTTCAACTTTGTCGATTCCGTTAAGTATTTTGTATGTTTCAATAAAGTCGCCTCTCTGACGTCGGTAATACAACGAATGTAGTTTCAGTTGTTGTAATCGCTGTTCATATGTGAGCTTTGCTACGCTAGTAACCAGCTTTGTTGCTCTTCGCTGTACCTTTTCGAGGATGTCAATGTCCTTTGCCAGATATGGGCACCATGCTTGTAAATAAAACTCGAGGTGTGGACGAACGTATGCCCGGTAGAGTGTCACAAATGATTTCTTGGTCATGTGCTTAAAAGTTCTCTTTACCATGCCAAGAGCTTGCATGGCTTTCTTTGCTGCTTTCTGGCATTGCACTGTTGGTTTTAGGTTGGTTGTCACCCACACCCCAACGTCCTTTTCCTCTTTTGTTGTCTCGAGGTTCACTCTGGCTCCAGTCTGGTGAGTCATAGTGTACGTATTGTGTGGTGGTTTCCCCACTTGCATTAACTTGCATTTCTCAGGGTTGAATTGTAGCAACCACTCTTTACTCCAGTCTTCCAGGGTGTCAATGTCAGTTTGCAGTTGGTCTTGGTCTTCCTGGTTACGGATCGTTGTGTACAGCTTCGTGTCATCGGCAAACATCTTAATGCTGCAGTGAACCAGGTCAGGGATGTCATTCACGTAAAGAATAAAAAGAAGCGGTCCTATGACAGATCCCTGCGGAACTCCACTTGTGACGGGGGCCCACTCTGACTTAGTTCCGTTGAGTACCACCTGCTGAGTTCTGTTAGTCAGGAAAGTTTCCAGCCATCGAACCACTTTGCCTCGAATGCCGTAGGCTTCTAGCTTCTTTACCAGTCTGCAGTGAGGAACTGTGTTGAACGCTTTCTTGTAGTCCAGGTATATGACGTCCAGACCGTATCCCTCGTCCAGTGTTCGTGTCCATTCCTCAAAGGTCTCTAGTAGGTTGGTGAAACAGGACTTTCCTTCAAGAAACCCATGCTGGTTATCGTTGATGATGCTATGTTCCTTGAGAAACTTGATCATGGTTTCTCTGACGATTGCTTCCAGAGTCTTGCAGGGTATGGATGTTAGGCTGATTGGACGGTAGTTTCTGGCCTTCTCTTTAGACCCCTTCTTGAAAATTGGTGTGACTAGGGCTTGTTTCCAGTCTGTAGGGATTTTACTAGTGTCTAATGATTGGCGAAATATCCAGTACATCAGCTTGGCAAGGGTTTTGCTGCACTCTTTCATTACCCATGGGTGCAACCCGTCTGGGCCTGGCGCCTTGTTGGGATGTATACTTTGTAGTTTCTTGCGTACACTCTCTTCTGTAAATATGATGTCGGCTACACACTCGTTTGTTCTTTGTTGAAATTCTGGGATGGTGGACGTATCCTCATTTACAAACACTGACTTGAAAAAGTCACCCAGTACGTTTGCTTTTTCCTGGTCATTTTCTGTTAATCTGCCGTCTTCTGTCTCCAGCTGAGTTACTGTCACCTTTACCTTCTGTTTCGATCTCAGGTAACCGTAGAATATCTTTGGTTCCTTCTTGAAATTGTTGATTAGTTTCTCCTCGTATTCCTTCTGTGCTTGTCTGATCTTGGTGTTCATCTCGTTTCTCTGTTTGACATATGCAGTATAGTCTCTGTCCAGCCCTGAACTTTTGTAGCGTTTGTATAGGTCATACTTTCTCTTCACTGTTCTCAACATTTGTTTACTCCACCAAGGAGGTTTGTTGGCCATCTTGCGTTTCGGTTTCCTGAGAGGGACATTTTCTCTCACTGCCTTTGAGATCTCCTTCTTGAGTTTAGTCCAATTAGTGTTTACACTGTTCCCCTGAAACTTACTCTCCCAGTCAATCTTGCTCAGGGATTCATTGATTGCTTCGTAGTTGCCTTTGGGGTAGTTTCTCGAACCGCTTGGTCTGTTGTTGACTGGTGCTTCTGCGTAGCATGTGTAAGTCCACAGTAAGGACTCATGGTCGCTACACCCCAGTGGTGGTAGATGAGTGACTTTGTCAACCATGTATTGTTCGTTTGAAAACACTAGATCAAGTGTAGAAGGTTGTTGGCCCGGTCTCAGTCTGGTCGGTTTGACAATGTGTTGAATCAGGTAGGCGTCTTGTGTTGCATTAAAAAACTTGGCTGCTGTGGAGTGTTCGCTTCCACTTACTGTGTGGTCTTCCCATTTAATCTCTGGAAAAATGAAGTCTCCCATCAGCAGGATGTGTGAGTATCCATGCATTTCTTGCAAATGTTTTATTGCGTCTATTAGTCTGGTGTTGTTCTCGTCGGTTGTCTTCTGTGTCCTATACACAATTCCTGCTAACAGCTGGTCTTTGTTGTTTAGCTTAACTGACACCCACATTGAGTCTTCTATTTCCAGGTTGTTCATTTCTTGGCAGGGCATAGCTGGTAGGTCTTTGTGTATATACATTAGTACTCCTCCACCAATAGATTCCCTTCTATCACTTCTGAACATATTGTAGGCGCCCAGGTTCATCTCACAGTCACCTATATCTGAACTGCACCATGTTTCTGTGATTCCTATAATTTTCGGTTCGTAACTCTGAATTTGTGCTTGGAACTCGTGGAACTTGTTTTTTATACTTTGTGCATTTGCTTGATAACACTTAAACATGGAACTTTGTGCTTGTGCTTGATTATTTACACTGTTAGTTGTCGGGTTTGGGTGTCTCACTGGCTTGGGGGGGTTTCTTGAGTGCGTACCCTCCTCTGCACTATTCTCCCGTTTTTTATCATATACCTGTTTTCTCCAGAATCAATGTTTTTCTCAGTTAGTTCTGCCCGAAGAGCCTTGTCTTTCTCTCTCTCCTTTGGGGTCATGTCAGGTGTGATGAACACTTTCCTGATGTTGCTGGGGTTGTTTTCATTCCGGAGTTTAGTACAGTTTTTCATGATGGCTGCTTTTTCGGACACCTACATATCATTTTATATATGGTTATAAATGTGTTATGATAGTATGATATATAATTTCATATGGTTATAAATGTGTCAGGCTTATTACTTATTACTATTTATGGTTATGACGGCGCTAAGCCTAATCCTTAGGTTAAGCCAGTGGTAAGGGGTCTTAGCATGAAAAACAATTAACTTGTCTTGATCTTGACTTGAGTCGAGTGCCAGGGAAAAGAGGCCAGGGAATTTTTGGTCTGACAGTGACACTATCCTTCTTCTTCCGTAAATTTAATTTGTTGATCACGTGATAATTATATAGGTGTAGAATACGTGTTGTATATATATGATGTGAAGTTTGGTGACTGTAGGTGTCCGTTTTCATGTTTGTTTTTTGAGGTGCGGGCCTAAACTGCAAAAGTACCTGGTATCCACGGGTATCCGTATCCACTACTGTCATTACCGACGATTTCGTGGATGGTGTGGTGTTTGTTTCGTGAGCTAGGTGTGCAGTGCTGTGAATGTTGATAAAATCATGTGCAAATGCAAGTTAAAAAAACGGGTCACTCTTGTTAGACTTTGTTTGTGGCAGTGTCGGCAAGGCACTGCTTGGAATCATCTAGTCTTCTAGAGTAGGAGATTGAACTGATTGGGCAGTTGGGTTGTTCAAGGGTACTCTTGTGACTAAAGTCACTATAAAAAAGGAATGTTGGAAAGCCTGTGTTCGGGAATGTGGAACCATTAATTGGAATTGATTCCCTCTGTGCCCCTCAGCTAAGAGTTCTGTGGCGCTGTGGGTACGGGCTGGCTTTGTGTATAGGCTGGCAGGAATGTCGATGAGGCCGTCTTGAATTTTATACATCATGTTGAGCCTCGCCATACATCTGCACTGTTCCAGTGACTGCCATTGCAATTGGTGGAGCATGGAGGTTGGGCTGCTGCGGTGCCGCCAGTCACCATAAACGTATCTGGCAGCTCGCCTCTGTACCCTCTCTAGTTTGTCAGTGTTTAGCTTGGTGGCAGGGTCCCAAACGGCAGAAGCATACTCTATATTCTGGGGCAGTTGCTGGTGTTGCATTTAAGGAAGGCAAGGGTGCTATTGCTTATTAGTGATGACGTCCACATGGTGGTTCCAGGACAGTTTGCTATTGATATATGGGAACCTGTGTCTTGGCTTGGACTGTCAAGATGGGGCATTTGGCCAGACAGCAGATAAGTTTTGCTGGACTAGATGGGGACAGTTGACCTGTCAATATTAGATGGGACATTTGGCCTGACACAATTGGGACATTTGGCCTAACAAGATATGAGGACATTTGGCCTGACGGAATTTGGACATATGGCCTGACCGGACAAGGACATTTGGCCTGACAGACTTGGAACATTTGGCCTGACATAATTGGGACATTTGGACTAAGAGGACTAGGACATTTAGCCTGACAGGATTAGGTCATTTGGCCTGACAGGAGGAGGGCATTTGGCCTGACAGAATTGGGACATTTGGTCTGACAGGATGAAGACATTTGGTCTGACAGAATTTGGACATTTGGCCTGACAGGATGAGGACATTTGACCTACCACAGTAGGAGCAGGTCTGCCACAATGGGGGCATTTAGCTAGACATGCTGGGCGGGGGCATTTGGTCTGTCTGCTGGGGCATTACAAGGTGACAGCATTTGGCCTGATAGGATGGGGCATTTAGCTTGGCATTCATGAGAAAACATATAATAAAAATATATACATTTTAGCTGGATCATGTTAACAGCTGTTTCATGATGTTACTAAGAATATATATAGGTTGCATGATGTTGTCCATTGTTGAGATGTGAAAGTTATTGTGCTTTGTTGCAGAGTCTGGAGTAGAGACTAAGGTGCACATTTCTAGTGCAAGTAATGTGCAAATTGGCAATGGTAATGTGATGGTTGTACACTCTCGCAAACGTCCCACAACAACGTCAAAAACCAAGCACAGACCAGAGCCAAGCATAACAGGTACAATTCTCCCACAATGTATATAATTTTATATATAAATTATGTTTGTGTGTGTGTATGCATGCGTGCATGCATACATGTGTGTGTATTATGCAATGTGAAACCATTTTGTGTGGTAAAGTCCAGCATTAATGAAATTATAAAATATTTTGTAAACATATTTAAACAAATGACTTTTGTGACTTTATTTTTTGTGACATTTCTTGCTACACAATTTTTGTCTGTGACTAACTTCAGGTTGTTTGGATCTGCAAATTGCTAGTGCAACTAAATTTATTTATTGGCAAATAGTTTTTTAAATAAATTCAGTGCATTGCTGAGACATACAAATAATGGTAATTGTGGCATCAGTCAGTTTAATTAATTAGATCAAGACTTGTCTCAGTAAGTGTTATTTGTTAATAGGTTGCAGTGAAGTCATCACTGATGAAGACAGTGAATCGGTGGAGCAATATCTCGGCAGATATTGGCCAACAGTCGCCCGCAAACTTGGCTTTGAGGATGGTGAAATTGACGTTATCAAAGACGACAACCAGGGAAATCTGAGAGAACAAATCCATCAGATGTTGCGTCAATGGAAAGCCAGGGAGGAAGCGAATGCCACAGTTGGTTCGCTAGCTAAGGCGATCTTTTCTGTGCCAGAACGTGAAACTGTTCTGAGGTATCTGGAACGAAACCATCAAAATAATGGAGCTAAGCCCAGCTGATTTGCGGCTTTGAGTGAGAATGTGATTAATTGACAAGTAAATATGTATGACTGCAAAGTCATAACAAATTGACACAAAATGTGTCTTTATTGCACACCGATGTTCATGCACTGGGGAGGAGGGTTCAGATGAATAACTCTGACAATGTTGGTCTATACAGGAAGCTAAGATCATGAGACATCATCCTATTGAGTCAAGGGTGGTAGTTGACTAGACACTACCCCTGATAGACATCCTACACAGTGCCCAGAAGTTAGCTGAATCAGTTGTACTTTGTTCTTGCGTGTGTTTGTGCGTTCTGACCGTGAGAACTATACAAATGCCTGCTCCCCATATCAAAGGGCAACTCCAGGGAATCCTATTAATTACCAGTCAGACCATTTCTTGCTAATGCACGTTCTATTAAATATTAAAGTCTACTTCGTGAGCATTACATGTAATATGAGCCACGATTGGCCGAATTTACTGTATCTCAAATGGCATAACGGGCTCAGCTTAACTTGTACATTTTGACAAGGTGATATGCTGTGTGGTACTGAGGCCGATACTATCAGCAGCATCCCGTGGTACACAAGAATATGAGAAACCAATGCTACTTGTTTTTCAGTAGTTTAGATAAAAATAACCCCAGATTTTAATGTGCGATGATGATAGTAAAATTTATAGATTTAGTTTTCTAAAGTTTCTGAAGTTCCTTGCAGAGTTATGATCATTTCCGTTTTAGGAGTTTTTCACCAATCATTACATACACTTTGTAGGATATTTGCAGTAGACAAAAGTGGAACCAGGCACAAGTTTCGCTGTTTGGGGGCTGCTGTGCAACTCCAGTATTCAAATTTAAGTTGCAAAGGTGAATATTCTAATGTATTTTTTTCTAGATTTTTATGTCACATTTTTATTGCCAAGCACATTAAGATCTGTCAAACATGGCAGAAAAATATTTGCTGTGGATGTGGACATCTATATCATTCTTTCATTTTAAAATGTATTTTTGATAACATAAATGGTGCGATTTGGTGACTCTCCATCTCATATATATATATATGTGTATAATATATTATATATATAGAACCTGTGTTTGGCACATTTAAACACAAAAACAGAAACATTATGTATATAATTTTACCAAAAATTGTAATCTATTATTGACATGAACATTTCCCATGAGCTGATATTGTTTAGGATGAGAAGAAACACTGCTGTTGCATCTGAGCACTGGTGTTTCACCCTTTCCTGAAGGGTAATATGCTTAAAACATAATTAATTGTGTATTGGTAATTGAGATAGATTTTATTCTGTGGGTATTATTAGTTTTTTATTACAACCATTATACTGATTGTATTTAAGTGTCCATGATCTCTTCAAAGGACGGAAAATCAGACATGTACAAATAATTTACTCAGCACTGAAATAGTCATCCAAACGCACATGTACAGTAAATATAATCACAAGATATCACACCTGTATGTATATTTGTGCATTTGATATTAAAATGTGAAAATAAACCTGTGTCGTAATTCATGCTACACATATATGTTGCTCTTGTCACAGTTTGGAGGTACCCCCCTCAACTCAACAACTCAACTTAGAACATCTCCAAAGAACAACAGAAGCTATAGTTGTTAGGGGTCGTCCAAAGTTGTCGACATTTCTCGAAGCGTACAAACCGTACGCTAGGGGGGAGGGGTCGGAGGCTTCCGTATGCTTTTTCTTCAGAAAATCAACATTTATTTTT

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00531	Death	Death domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000488	Domain	Death domain	Interproscan
IPR011029	Homologous_superfamily	Death-like domain superfamily	Interproscan
IPR016729	Domain	FADD, death domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR15077	FAS-ASSOCIATING DEATH DOMAIN-CONTAINING PROTEIN FADD	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf864_1.2 global RNA-seq network