Gene detail

Detailed information of PE_Scaf8642_0.6 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf8642_0.6	30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 PROKARYOTIC AND ORGANELLAR	Superscaffold10	62045730	62053635	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf8642_0.6

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00318	Ribosomal_S2	Ribosomal protein S2	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001865	Family	Small ribosomal subunit protein uS2	Interproscan
IPR005706	Family	Small ribosomal subunit protein uS2, bacteria/mitochondria/plastid	Interproscan
IPR018130	Conserved_site	Small ribosomal subunit protein uS2, conserved site	Interproscan
IPR023591	Homologous_superfamily	Small ribosomal subunit protein uS2, flavodoxin-like domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12534	30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 PROKARYOTIC AND ORGANELLAR	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003735	Molecular Function	structural constituent of ribosome	Interproscan
GO:0005763	Cellular Component	mitochondrial small ribosomal subunit	Interproscan
GO:0005840	Cellular Component	ribosome	Interproscan
GO:0006412	Biological Process	translation	Interproscan
GO:0015935	Cellular Component	small ribosomal subunit	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf8642_0.6 global RNA-seq network