Gene detail

Detailed information of PE_Scaf8559_0.4 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf8559_0.4	CYTOKINE RECEPTOR	Superscaffold8	45102075	45119921	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf8559_0.4

ATGTATGCCAACAAAGCAGTGGATGGAGACATCAGACAGGTAGAAGCTTACTGTGCACATCCATTGGCACCCAACGGCAGTGTTGAAGCCTGGTGGCAGGTGGACTTAGGGGATGTCTACTTCATCAACAGTGTCATCATTGTCAATGGCTATCACGGAGAACCAAACAACTTCCTACATGATATAGACATCAAGATTGGCAACTCGTCCAATGTCATGGGTCACCGTCGATGTGGTGGACAAAGTGATGTGGTTCCTCCAAAGACAAACGTGACAATACCGTGTGAAGATTGGGGAAGTCATGTCAGTATAAGGAAGTCTGGAGGACACAGGAAAGATGCTTTGCTCTTCTGTGAAGTGTTTGTCATCGGATACAAATATATCGATTGCAGAGATGCATGTGATGGCACTTGTGACAAAGTCATCGGCTGTGACAAATGTCAGGCAGGAAGGAAGATGTCGGATTGTAAGCTAGAATGTGATGCTGGTACTTGCGGCGTCAACTGTGCCAATGAGTGTGGTCACTGTGTCCGTCCTGACCAGTGTGACCACATGACCTGCTCTTGCCATGGAGGATGTCAACAGTGGTATGGACTCGACACTTGTACGGCTGAAATCAAGAAAGTTGTTTATCAAGGAACACCAACAAGGCTGTCAGTGACAAATTCCTCAGTGTCTGTGAGTTGGCCACAGTCAGAAGATGTGCCACGTGGACTGGAGAGTCACTACCAGTATGTAGTTGAGGCTGCAGATGGTCACAGCATCAGTAAAGTGACTAGACCATTTGTAGCTGGACAAGCTAGCCAGACTGCCGACATCAAGGGTTTGAAGCACAACACAAAGTATTATGTTAAAGTGAGGATCGATGCCTCACACAAATCAGACACAAAAAAAGGCACTGCTGGACGTTCACTTGAAGTGACAACTTCATGTAAACCACCTGCCAAGCCCAAGAAACCAAGTGTGACTCCCACAGATCCTGAAGACTCTCACCTGGGTAGTCTCCACGTCACCTGGCAGGGTCTTGAAGACAGCGGCTGTGACAACTTCAAGAAGTTGCTAGTTCTGTACAAATTGACATCATCTGGACAGTGGCAGAACAAAGAAGTTGGTGTTAAAAAGACACAGGTGACACTAGACAATCTTCAGTCTGGACACTACAGTGTGCGTTTGTCCGTGACAAACAATGAAGACATCGAGAGTGTCAGTGACACAATTAGATCCACAGTTGGTGATGCAACAACAACTACAACAACGACGACGACGACGACACCAAAAGGAGCAACTACAGGTAAAAGTGCTGACTCCAAGAAGGGAGGTGGTTCCACAGGTATCATCATCGGCGTGGTAGTCAGCCTGGTTGTACTCATCATCCTAGTCATTATTGTCGTCATCTTCAGGTCTAGAAATGGGTCAGTGTGTGGAATGGCATGTCTACGAAAACGTAGCAGGGCTTCCACTCTAGACGCACCAACCAGCCCTACTGTGTCAGCAGCTGACGCTGCGGAGACAGCTGACGACCATGTGTATGAGAAACTACGACTAGAGAGGAACAGTACTCTCATACAGGTGACGGCACTGGAAAGCTTCATCAAAGAGAGAGACAACAGTAACGGCGGCTTTGTGCAAGAGTACAGTAAGCTGTCGCAGACAGAGACGTCCAGTTCGGAGGTGTCAAGTCGACCAGAGAACAAAGACAAAAATCGGTCCAAAAACATTCGTCCATATGATCACAACAGAGTGGTGCTGGACACAGACAATGACAATCCGTCTGACTACGTCAACGCAAGCTACGTTACTGGGCATGGTGGACATAGATACATTGCATGTCAAGGACCGTCGGAAACCACAATGGCTCAAATGTGGCGTATGATTTGGCAACTCAACATCAACCGTATCGTCATGGTTACACAGTTAGAGGAAGGGGGAATGATGAATTGCGACATCTACTGGCCGTTGAGAGTGGGAACTCAGAAAGTCTATGGCCAGGTGGCAGTGACGACCCTCAGTTGTGACGTGTACGCTGACTACACCATCCGCACCTTCTGTATCACCAGTCAGGGCGAGACTCGGTCAGTCTTTCACTTCCAGTTCACATCGTGGACGAACAGGCAGGTGCCCGTTCACACAAACCCTGTACTTGCCTTCCGTCGTCACATCCGCTCATTTGATGACCAAAGCACAGGACCAATGGTTGTCCACTGCAGTGCCGGCGATGGTCAAACCGGAACATTCATTGCACTGGATACTCTACTGGATCAGGGTCACGCTGAAAGTCAGGTGGACGTGTTTGCTTTTGTTAAGGGCATGCGGTCAGAGCGGATGAATATGGTGCAGACTCAGGACCAATACGTGTTCTTGTACCATGCACTGTTGGACGGTCTACAAACAGGACATCTTGCCTATCCCCTGTCACAGTTCAACAGTTTGTACAAGATCCTGTGTGAAGATGATGTCAACTTGACACAACTTCGGGAACAATTCCAGATGCTGGAGAAACTGAAACCGCCTCGTCCTGAACCAAGCTGTGCAGCCTTGCAGAAAACCAACCAAGCAAAGAACCGGAATCTGGACATCGTTCCAGGTTAA

Transcript

PE_Scaf8559_0.4

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00102	Y_phosphatase	Protein-tyrosine phosphatase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
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IPR000387	Domain	Tyrosine-specific protein phosphatases domain	Interproscan
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IPR003961	Domain	Fibronectin type III	Interproscan
IPR008979	Homologous_superfamily	Galactose-binding-like domain superfamily	Interproscan
IPR013783	Homologous_superfamily	Immunoglobulin-like fold	Interproscan
IPR029021	Homologous_superfamily	Protein-tyrosine phosphatase-like	Interproscan
IPR036116	Homologous_superfamily	Fibronectin type III superfamily	Interproscan
IPR050713	Family	Receptor-type Tyrosine-protein Phosphatases/Ushers	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46957	CYTOKINE RECEPTOR	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
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GO:0043235	Cellular Component	receptor complex	Interproscan
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KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf8559_0.4 global RNA-seq network