Gene detail

Detailed information of PE_Scaf8449_0.7 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf8449_0.7	GMP REDUCTASE	Superscaffold7	58922387	58930092	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

PE_Scaf8449_0.7

CCCAGGTATACAAAATGTCTTTTTAAGTTTCTTCCCCTCCAGGTGTATTTTCAGTTCTTTGCTTTGTTGCCCAACCCACAGCACCTCGCTCTTTTTTCTGTAGTATGACCCCTTATGGCTGTTTGGTAAAAATGCGATATCTATTGGTGCCATCTACTGGGTCATGATCGAATATTAAGCCGGCAACTTCCGGTTCCTTTTATCGGCTACGGAGCTGTCAAACAAATCGAGTTTGTACAAGAAGTCGGTCGCGTATTTAACATTTAATTAACGTAAAAAGTTATTCACCATGCCACGAATCGACACGGATATTAAACTCGACTTCAAAGATGTGCTATTTCGCCCGAAACGAAGCACAATTCGCAGTCGAGCTGATGTAAGTTATACAGCAACCAGGCTGCCTCAGTCAGGCTCAGCCTGCCCTCAGGGAGTCAGGGTAGACCCCGTAGACTGTAGAGTAGGGTTCTGGGCCGGGGGTAGCGATTTGCAAGGACACCTTACTTCTTAGCCTTAGGGGTCATGCCCCAGTTATACTTCCTATTTCGTTACAGAGGCAGATTTCCACGTGTGATTATTGAAGCTGTTAACAGTAAAATGGTATACACATATTGGACTTTCTGGAAAATTGGGTTAGGTATTCAGTTCATACATGCCAAATGAGAAAGTGTGTGCAGTGTAGTCTGTAGAGATATGCCAGATTAGAAATTGTCCAATGGCAACAATGAACTACTTACTCATATGGTGGCCTGTCAAGTAGGCTGACACTTGAAATGTGTATAAAAAGCCAAACGTGAATGAATTAAAAAAAAATTGCACAATGTTTGAGATAGGAATGCCTCTAAAATATGTCAATTTCAAAGTGTTTTTCTCCAAAATCACCATGTTTATTTGGGATCATGAGTACTGCCTGCATCCATTCGTAAATATTGATGGGTGTCATACATATAGACATTTTACGAGTGCTAGAAATTAAACTCGACCAGCATGTCAATGAGATGATGATAACAGCAGGTAAGAAGAATTATTGTAGGTCACGTTTTCTTATAATCATACAAAACGCTAACATGGCAATGAATAGGAACAGTAGACTGACCCCTTAGCCTTAAGACTTTTTATGTAACAAAATATTGTAATTATTATTTATGTAGAAGCCACAAATATTGGTGTAAAAGCATAGATGGCATGTCACATAGTGTTTAGGTAGCTGTAGTGTTAACTTGAATTAGTTTATATTTTAATTATTTTTTATTTGGCCCACTGTTTCTACTATTTAGTCTCTAACAGATTCTTGAAGTTATAAACAATGAATACAAAGAAGTATAATTAAGTTGTATTCGTGTTGAATATTATTTAGTTTTAAACATTTAAGTATAACTCTATGCTATCTAACTAGCCTAACAGACCTTTAATTTTTGCCTTTAATTAAACAAAATTACAATATTTACCTGTTCAACTGTAGGTGAAGTTACATAGGGATTATATCTTCCGCAACTCGAAGCAGACGTACGATGGCATTCCTGTCATGGCCTCGAACATGGATACAGTTGGCACATTTGAAATGGCCAAAGTGCTTGGGAAGGTTTGGACATTACATAATTATACTAAAAAACTTGACCACACATCATCTGAATAATTACACAGATGTCTTTTAAATACTAGATTTTAATTTCCTATTGGTGCCTTTTTGAAGTCAATGATTAATTTAGCTTGAACTTAGCATTTTGCTCTCTCATTATGATATATATTAATTAGATTGGTGATGTTTCCCAGCATACTAATTACAACATGTTACAGGTGTATTTTTCAGCATTTAGTTTTTCTTGCATTTGTATTTTAACTTATCCTTACCTCAGGTTTACAGGAAACATTACATGCAATAGAACCAATGCCATCTGGATTACAGATCACTTGCTGTGACTGTCCTCTTCACGCCAAGATAATGAAGTGATTCTTGTAATTTCAGCAAGATGTCTTCACTGTCATACACAAACATTACTCAGTTGATGCGTGGAAACAGTTTGCGAGTGAAAATAAAAGTCTGCTGAAGGTACAAAATTACCTGTATACCAATATAATAGTTGTATCTTGATTATTCATTGTATAAGTAGACTGCGAGAAGCGATCTATAAATAGCTCCCAAACACAAGTGCTTGGTGTAATGAAAGACATGTTTCACATCTCCACGCTGTCACACTGCACATGTATTGTATGCACAATCTGCACTGAATTGAAAGCAACAATATCAAACTGTAGAAAAAGAAATGAATACTGACCCATCAATGGAATAGATTCAGGACTTATTGTGCACTTAAAAGTGTAACATTGATGACATTTTAAACAACACATTTTGATGTTTTATTGGCTGTCATCAGGTGTACGTTATAAAGTCACAAATGTTTTGTTACCATAAATGTACAGGATACTAAATTATAATATTTATTCCAAGATTTGTTTTTTTCTAGCTTTATATATAATGGTGGAATTTCTGATACATGCTTGTTCACAATTGTATTATTTCATAATTACTGTGATGGTACAATCTTCAGTATTTACACCTCATCTAAGCAGATGTCAAATATAAGAGTTGGTTTCTAAAGGCAGTTACATGGTGTAACATATGTTAGGTTGAGTTTGCATTGAGTTTTAAGGTGGCGTCTTTTTGTAGCATGTGGCCGCCAGCGCTGGCATGGCACGTGGAGACCTTGACATGCTCCAAGCGATCCTCAGTGCCGTGCCAGAGGTCAAGTTCATCTGTCTCGATGTCGCAAACGGGTACTCAGAACACTTTGTCGCATTTGTAAAAGAAGTGCGAGCCGTGTTTCCGAGCCATACAATAATGGTAAGTGGATCTCGATATACCTAGGACCAGGTACGTCAGTTTGTTTTTTTGTCAAATTGTCTGATTCTTGTTGTTGTCTTATGGATGAGCATGCTATATTATTCAGCAGTAAGATTCATGTATGGTGTATACAATTACAATTACATATGAAATAACAACAATAATAATTATTAGATAACTGAACGTTCTACAGGATAGTTCTTTTTTAATTGAAAATATGTCATTTTGACATATCCAAACAGTATTTTTACCTTTGCCAGATAAAAGTCTTTACCAGATCAAAATACTGTTTGGATGTGCCAAAATTAAATATTATGAATTGAAAATAAAAACTAATTATTTATCGATAAAGGGTTTTATGCATGAGTTGCTTCCCGATATTGTAGACATGACAACATTAGTAATACAAAGGAATACAGCACGACAATGTATTTGCCAGTATGTTTGTTTAAGTGTTTCAGTGCCAGCCAAAATTGTGTTGACGTACAAAAAGTTCCAAGTCTTTTTTGAGGCTTGCACACCATTCTAAACTTGTATTTTTATGCGTTTAATGCTCAAATATCACCCAGTTAACTATACATTTCCTGAAATGGCAGGTATTTTTCTATTTAGTTCCAAAAACATAATAGTCAGATGACACAACATTACTTACTTTCACTAATATATGTGCTTAGACTGTCTTCCGATGCATTTTCCATGGTAAACATAAAAAAATTTTTTTTTGCCGAACACCTCCCTTTTGTAATGATTAATCTTATTACTCAATTTAAAATGGTGTCATAGACACCAGCCAGTGCCACTACACTTTGTAAGACGAATTCGATGCAATCCGCTTTGTGGCACTTCTTGGCATAACTGGTAATTGGCAGAATCGGCCTTGTGGCACTGAAACGATTAAGATGTTTGTGAAATAAACAGTAGAAGGACTGTTGGAGGTGTGTGTATGTGTGTGTTGGCAGGCTGGGAACGTTGTGACTGGTGAGATGGTGGAGGAACTGCTGCTGGCCGGTGCCGACATCATCAAAGTGGGTATAGGGCCCGGCTCAGTGTGTACCACTCGCAAGAAGACAGGCGTGGGTTACCCCCAGCTGAGCGCCGTCATCGAGTGTTCTGATGCCGCCCATGGCTTGGGCGGACACATTATCTCTGTGAGTGAACCGGGCCTTGCTTTTTGTTGTTTCCAAAATTTTTGTAAACCTTTATATGTCAAATGCGTAGCTTTGCACTGTTAGTGTTGCCTTTGACGACAATGACGAGTGGTCGTTGGTTGTGGCTTCTCGACCGTGCAGTGGCTAATTATAACTACAGGGTATCTGGTCGTCTTGCTGGCAAGAATTGTAAAAAAAAATTGTGGAAGTAACAAAGTTAAAAGTAGTGTTACATTAGATAAATAACTCATAACTATGTTACACATATAATATTATAACTATTTAATATACAAATTCAGTATGATTGATATTTGACCAAATAAAGATACACTTCTTTAGCATCTCTATCTTTGAGAAGTCAGGAACTCTTCTTCATAGGTGCCACAAACCAGAATCATTAAACAATATATTTTTATCATGGACAGGTGCAAGTCATCATCAGAGTAAGGGAGAATTTATGGGGGAAATGCAATTTTTAATAAATGTTTAATTTTGTGTAAAAAGTTGTAATTGTTTCAGATAATTTAAGTGATGTAGAGTTCATTGGGTGCAGCTACCAGGAAAGCATATTTGCCTGGATTATTCTTAGAATAGGAACAAAACGCTGTGCGATGACTTCCTTGTCTACCTACATTCTGTATTTTCTAGATTTGTGTATGGAATATGTGCTTCAGGACGGTGGCTGCACATGTCCCGGAGACGTGGCGAAGGCGTTTGGTGCGGGGGCAGACTTTGTGATGGTGGGGGGTATGTTGGCGGGACATGACGAGTCAGGAGGGGAGGTGATAGAACGCAATGGGAAGAAACTTAAACTGTTCTACGGCATGGCGTCGGCCACAGCCATGAAGATGTACGCAGGTGGCGTCGCAGAGTACAGGTTTGTAATAGTAATAACTGTTTATTTCAGACCAAGTCCGTATACATAAAACATATAAAAATCAAAATATATACATGTCATGAATTAAAAGTGCAAGCAAATAAGATATTCACAGATGTTATGCTTTGTTACATTAGTATAGTAATGATAAGTAAAACACTGATGGCTGATTCTGAGTGACCAAACAGACAACGTCGCTTAAAGGAGTTGATCATTAACAAAATTCAGATTTATTTTATATATCAGGGTGATATAAACTATTTGGAACAAGAACAATTTTGGGCAGTCAGTGTTATAAGAGATCTAATTTTAAAATATTGTGTAACGTGATTTTACAATGAGAAATATGAACATCTTTAATCTAGAGAGAAGAGTGATGAACCAAGTTTTAGAGAAATGTAAATTAATCCACTCGATGGAACTAACGAAATTACACCACTGACACGATCAATTGCAGGGCGTCTGAGGGCAAGTCGGTGGAGATCCCTTACCGTGGCCCCGTCTACAACACGGCCCAGGACATCCTAGGAGGTCTGCGCTCCACCTGTACATACGTCGGTGCTCTGAAGCTGAAGGAACTCAGTAAACGCACAACGTTCATCCGAGTAACTCAGCAGCTCAATGAGGTCTTCTCTGGATCTCGCTGATAAATGCGTGAGTGGGCTCCACCGCGCCATCAGCTGTCATAGGTTGTGTTTACTGTTGCACTCTCTTGCTGCACGCATGTGTTAAAAACATAACACCACTGCTTTAACCTGGGTTTGAAATTTGACTAGACAAGCACAACTGGATTGATGTTTCAGTTATGTGTCACCTCAAGATATTGACACCACGCGAGACCAACGCCATGTCATCTCGACCAAACACAAACCTTTAATTTATTTCAACTTGTGTGCAACTTTGTATTTGCCAGGTGGCATTTCAGCTATCATAATGCAAAACTGCGTGCTACATGTGTACACCTGTGTCAAAGGTCAATGTCTTGAGATGGCATTTTATTGCAGTGGACATGTATAAATGACCTTTAACCTTTGTCAACCGAGTGTAGCATGCGACTTTTATTTAGTTCAAACTGTTTTTCTATTGCTAATCATGATATATAATCAAGAAACATTACGCCGTAATTCATTGTTGAATTATGGCGTAATTATCGAAATAAAACCACATTGACCAGTATACCCTCTAATATTCCGTGTGTGATAACTGTGGCCGAATATTGATTTACATAGAAACTGGCAGAAACCAGAGGGAAAATAATCTAGGGCTACTTGTATGGCACTGGAATCGTTACTCGATTCTATGGGTTCTTCAGCTAAGGAGATTCTTACGTTTTTTAAAAGTTCATGTGACAAATGTAGGCTCCTTAACTGAGTGTTCGTTTCTGATACATATATTACCTGATATTGAAGTTTTGTTTGATTTTACAGAAAGCGTGTAGAAACAATGTCCACGGTGCCATCTTTACAGAATCATTATCAGATGCCAAATACATGTGACAAGGATTTGTAATAAAAATAAAAAATGTATACTATTTTTAATATGCAGAACAGCAAAATTCTGCTTCAGCTTGAATTTTTGATTCAAAATTGAATTTAAACAATGTATTAAACCATGACACTGCAGAGTGCTGCCTACTCTGTGTGGTACTATTTCTATGAAATGAAAATTTGAAGCAACCCCCTTGTTATATGATTGAATCTCTAGATTTGTTTATAATGTATCTGAATCTTTTCCTATAACGATCATGTGAATTATTGGGGCTTTCTACGAGTGTTTTCTAGGTTGTAGCTGGTGTGAAACTACTTTATACAATGTATAATTGTCTATAATTATTTATGCCAATTTTGTGGGACATTATATACCAGGACAAAGTTATAATAAATTGTTTGTTTTACAGTTTGTGTCATTTGTTGCAAAGCCTGGTGTTTGGCATGGAACTTGGTGCAAGTCATACTGATTCTCAGCTGCTGATAATTAACTGGCGCTCTGTTAATTACATCGACATCATTTGTCTCTTGGGTATGCCATTGGCTTGTTTCCATTCTAGAGGAAATACTTCTTTCAGTGACAAGATAATTTTACTATTTTCTTTAGCAGTTTTGGATTATTCTGCCAATTTATGCTGGGAAGATCACATAAATTTTGTCAATTCAACATTTATTATTGTTATTTCTTTCCCTACCCCATATCTACATGACGTTGACTATTTGTTTCTTTAAAATGATCAAGTTGCATTGTGGAGATAAATAACAGATCACATACAATTGAAAACAGCTGTGTTTCATTTAATGCACATTTATTATCAATCTATTAACAACTACATGTTAATTAGAACAGATACAAAGGTGATACAACTTACATGAACATTTATTGCACATGTAAGCCTGCATTTTGTCTCTCCAGCATGAATATTACCTATAATAAACACTGATACTAAACATAACTGGGAAACAAGTCTGTAATTAAACTTATGAAATAACCAACTGAAGATATACATTTATGCAGTTACTTAGGCCTTTGCTTCATTGCCAGTTTAAAAGCAAAGTGATGTATAGTTTTCCAAAATAACTTATTCATTGATGGTGGCCAAAGATGTGAGACATGATGTCATCACTCAACCTTCGGTCGGGTGATCTTGATGAGTGTTTCTGGAGATCGATAAAGGAAGATAAGTTTGGCAAAGAGCTCCTCTTCGAGGGCCATGTCTCCATTCTCGCGCACCAGATATATGTCCTGGCACAGATGCAAGATGCGGCCCACATACGGCATCTCCGTGTAGATGACACTATGTGACAGGTTCTCTGTCATCATCCGCACCAACTTGCCCACCATAAACACCAAC

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001093	Domain	IMP dehydrogenase/GMP reductase	Interproscan
IPR005993	Family	GMP reductase	Interproscan
IPR013785	Homologous_superfamily	Aldolase-type TIM barrel	Interproscan
IPR015875	Conserved_site	IMP dehydrogenase / GMP reductase, conserved site	Interproscan
IPR050139	Family	Guanosine monophosphate reductase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR43170	GMP REDUCTASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003824	Molecular Function	catalytic activity	Interproscan
GO:0003920	Molecular Function	GMP reductase activity	Interproscan
GO:0009117	Biological Process	nucleotide metabolic process	Interproscan
GO:0016491	Molecular Function	oxidoreductase activity	Interproscan
GO:1902560	Cellular Component	GMP reductase complex	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf8449_0.7 global RNA-seq network