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Detailed information of PE_Scaf7946_0.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf7946_0.3	WD REPEAT AND HMG-BOX DNA BINDING PROTEIN	Superscaffold8	553226	566524	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf7946_0.3

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00400	WD40	WD domain, G-beta repeat	Repeat	Interproscan
PF12341	Mcl1_mid	Minichromosome loss protein, Mcl1, middle region	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001680	Repeat	WD40 repeat	Interproscan
IPR015943	Homologous_superfamily	WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily	Interproscan
IPR022100	Domain	Minichromosome loss protein Mcl1, middle region	Interproscan
IPR036322	Homologous_superfamily	WD40-repeat-containing domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR19932	WD REPEAT AND HMG-BOX DNA BINDING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000278	Biological Process	mitotic cell cycle	Interproscan
GO:0003682	Molecular Function	chromatin binding	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0006261	Biological Process	DNA-templated DNA replication	Interproscan
GO:0006281	Biological Process	DNA repair	Interproscan
GO:0043596	Cellular Component	nuclear replication fork	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf7946_0.3 global RNA-seq network