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Detailed information of PE_Scaf7807_0.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf7807_0.3	RETINOBLASTOMA-BINDING PROTEIN 6	Superscaffold5	35525134	35539132	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf7807_0.3

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
Ubiquitin Family	E3\|E3 activity RING\|U-box

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04564	U-box	U-box domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001841	Domain	Zinc finger, RING-type	Interproscan
IPR001878	Domain	Zinc finger, CCHC-type	Interproscan
IPR003613	Domain	U-box domain	Interproscan
IPR013083	Homologous_superfamily	Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type	Interproscan
IPR036875	Homologous_superfamily	Zinc finger, CCHC-type superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR15439	RETINOBLASTOMA-BINDING PROTEIN 6	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0004842	Molecular Function	ubiquitin-protein transferase activity	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0006511	Biological Process	ubiquitin-dependent protein catabolic process	Interproscan
GO:0008270	Molecular Function	zinc ion binding	Interproscan
GO:0016567	Biological Process	protein ubiquitination	Interproscan
GO:0061630	Molecular Function	ubiquitin protein ligase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf7807_0.3 global RNA-seq network