Gene detail

Detailed information of PE_Scaf7575_10.17 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf7575_10.17	N-LINKED OLIGOSACCHARIDE PROCESSING	Superscaffold8	9765768	9788876	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf7575_10.17

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12999	PRKCSH-like	Glucosidase II beta subunit-like	Family	Interproscan
PF13015	PRKCSH_1	Glucosidase II beta subunit-like protein	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
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IPR002172	Repeat	Low-density lipoprotein (LDL) receptor class A repeat	Interproscan
IPR009011	Homologous_superfamily	Mannose-6-phosphate receptor binding domain superfamily	Interproscan
IPR011992	Homologous_superfamily	EF-hand domain pair	Interproscan
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IPR036055	Homologous_superfamily	LDL receptor-like superfamily	Interproscan
IPR036607	Domain	Glucosidase 2 subunit beta-like	Interproscan
IPR039794	Family	Glucosidase II beta subunit-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12630	N-LINKED OLIGOSACCHARIDE PROCESSING	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005509	Molecular Function	calcium ion binding	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0006491	Biological Process	N-glycan processing	Interproscan
GO:0017177	Cellular Component	glucosidase II complex	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
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Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf7575_10.17 global RNA-seq network